EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000012199 (Gene tree)
Gene ID: 102364040
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 70170 bases
Position: chrJH127037.1:688414-758583
Accession: 102364040
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000013856	IBN_N	PF03810.19	4.7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000013953	TNPO1-201	2580	XM_005998778	ENSLACP00000013856	859 (aa)	-	H3AW35

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	79.419	ENSLACG00000012322	TNPO2	96	79.419

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSG00000083312	TNPO1	96	89.186	Homo_sapiens
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.326	ENSAPOG00000003453	tnpo1	96	87.326	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.249	ENSAMEG00000007147	TNPO1	95	88.364	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000012199	TNPO1	86	90.848	ENSACIG00000003711	tnpo1	95	90.848	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	ENSAOCG00000008154	tnpo1	96	87.442	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	ENSAPEG00000001112	tnpo1	96	87.442	Amphiprion_percula
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.093	ENSATEG00000010408	tnpo1	96	87.093	Anabas_testudineus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.851	ENSAPLG00000009619	-	96	86.736	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	ENSACAG00000009599	TNPO1	96	89.070	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000012199	TNPO1	90	70.161	ENSANAG00000027118	-	97	59.357	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.721	ENSANAG00000022453	-	95	88.721	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	81.395	ENSANAG00000025351	-	95	81.395	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.349	ENSACLG00000027223	tnpo1	96	85.349	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.239	ENSAMXG00000009842	tnpo1	96	87.239	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	ENSBTAG00000007979	TNPO1	95	89.070	Bos_taurus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.837	ENSCJAG00000016409	TNPO1	95	88.837	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000012199	TNPO1	99	89.082	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	89.082	Canis_familiaris
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.628	ENSCAFG00020017397	TNPO1	96	86.628	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.953	ENSCHIG00000023462	TNPO1	95	88.953	Capra_hircus
ENSLACG00000012199	TNPO1	99	87.893	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	87.893	Carlito_syrichta
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.721	ENSCCAG00000026472	TNPO1	96	88.721	Cebus_capucinus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSCATG00000043792	TNPO1	96	89.186	Cercocebus_atys
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.953	ENSCLAG00000016191	TNPO1	96	88.953	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSCSAG00000015616	TNPO1	95	89.186	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000012199	TNPO1	94	79.529	ENSCHOG00000001746	TNPO1	95	79.529	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.884	ENSCPBG00000000260	TNPO1	91	89.884	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	72.486	ENSCSAVG00000010981	-	96	72.486	Ciona_savignyi
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSCANG00000004353	TNPO1	95	89.186	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	95	89.419	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000012199	TNPO1	99	89.523	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	89.523	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.860	ENSCSEG00000012674	tnpo1	96	86.860	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	ENSCVAG00000001010	tnpo1	96	87.442	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.456	ENSDARG00000035390	tnpo1	96	87.456	Danio_rerio
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	83.546	ENSDNOG00000006647	TNPO1	96	83.546	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000012199	TNPO1	97	88.969	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	88.956	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000012199	TNPO1	97	56.563	FBgn0035693	CG8219	96	56.325	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000012199	TNPO1	85	80.608	ENSETEG00000017805	TNPO1	84	80.608	Echinops_telfairi
ENSLACG00000012199	TNPO1	98	80.450	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	80.450	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSEASG00005018055	TNPO1	96	89.186	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.302	ENSECAG00000024424	TNPO1	95	89.302	Equus_caballus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	81.306	ENSELUG00000002821	tnpo1	96	81.306	Esox_lucius
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSFCAG00000013181	TNPO1	96	89.186	Felis_catus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.535	ENSFALG00000010292	TNPO1	96	89.535	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.837	ENSFDAG00000013345	TNPO1	95	88.837	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.456	ENSFHEG00000019234	tnpo1	96	87.456	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.284	ENSGMOG00000000347	tnpo1	96	85.284	Gadus_morhua
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.837	ENSGALG00000015014	TNPO1	96	88.837	Gallus_gallus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.123	ENSGAFG00000000943	tnpo1	96	87.123	Gambusia_affinis
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.395	ENSGACG00000015841	tnpo1	96	86.395	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.884	ENSGAGG00000013419	TNPO1	96	89.884	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000012199	TNPO1	99	73.984	ENSGGOG00000022535	-	95	73.984	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSGGOG00000026800	TNPO1	96	89.186	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.977	ENSHBUG00000008068	tnpo1	96	86.977	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.721	ENSHGLG00000000970	-	95	88.721	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	69.965	ENSHGLG00100000963	-	98	69.849	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.721	ENSHGLG00100017090	-	99	88.721	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.302	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	93	89.302	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.326	ENSKMAG00000018195	tnpo1	96	87.326	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000012199	TNPO1	86	91.129	ENSLBEG00000009521	tnpo1	89	91.129	Labrus_bergylta
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSLOCG00000011092	tnpo1	93	89.186	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000012199	TNPO1	99	89.057	ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	89.057	Loxodonta_africana
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSMFAG00000003636	TNPO1	95	89.186	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	ENSMMUG00000020923	TNPO1	96	89.070	Macaca_mulatta
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSMNEG00000044581	TNPO1	95	89.186	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSMLEG00000030740	TNPO1	95	89.186	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.093	ENSMAMG00000001357	tnpo1	96	87.093	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.744	ENSMZEG00005004913	tnpo1	96	86.744	Maylandia_zebra
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	95	89.419	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.581	ENSMICG00000008468	TNPO1	96	85.581	Microcebus_murinus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	95	89.419	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000012199	TNPO1	86	90.604	ENSMMOG00000005551	tnpo1	95	90.604	Mola_mola
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.565	ENSMODG00000001721	TNPO1	77	86.624	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.930	ENSMALG00000009782	tnpo1	96	85.930	Monopterus_albus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	96	90.991	Mus_caroli
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	96	91.248	Mus_musculus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.302	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	96	91.120	Mus_pahari
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	96	91.248	Mus_spretus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.302	ENSMPUG00000014387	TNPO1	95	89.302	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000012199	TNPO1	99	88.644	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	88.644	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	96	89.419	Nannospalax_galili
ENSLACG00000012199	TNPO1	86	90.579	ENSNBRG00000009998	tnpo1	95	90.579	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSNLEG00000004572	TNPO1	96	89.186	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000012199	TNPO1	90	87.413	ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	87.413	Ochotona_princeps
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.721	ENSODEG00000001771	TNPO1	95	88.721	Octodon_degus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.143	ENSONIG00000011151	tnpo1	95	86.259	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000012199	TNPO1	95	90.122	ENSOANG00000015785	TNPO1	99	90.122	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000012199	TNPO1	99	82.791	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	82.558	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000012199	TNPO1	86	90.713	ENSORLG00000003182	tnpo1	95	90.713	Oryzias_latipes
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.093	ENSORLG00020011559	tnpo1	96	87.093	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.209	ENSORLG00015019113	tnpo1	96	87.209	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.209	ENSOMEG00000014567	tnpo1	96	87.209	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSOGAG00000000808	TNPO1	95	89.186	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	ENSOARG00000005038	TNPO1	80	89.070	Ovis_aries
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSPPAG00000042518	TNPO1	95	89.186	Pan_paniscus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSPPRG00000022336	TNPO1	96	89.186	Panthera_pardus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSPTIG00000018839	TNPO1	96	89.186	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000012199	TNPO1	90	82.107	ENSPTRG00000047731	-	96	82.107	Pan_troglodytes
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSPTRG00000016972	TNPO1	95	89.186	Pan_troglodytes
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSPANG00000006074	TNPO1	95	89.186	Papio_anubis
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	84.535	ENSPKIG00000019795	tnpo1	96	84.535	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.767	ENSPSIG00000014366	TNPO1	96	89.767	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	84.785	ENSPMGG00000017014	tnpo1	96	84.785	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	89.523	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.884	ENSPCIG00000026080	TNPO1	96	89.884	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.022	ENSPFOG00000011447	tnpo1	96	87.022	Poecilia_formosa
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.022	ENSPLAG00000018696	tnpo1	96	87.022	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	ENSPMEG00000024121	tnpo1	96	87.442	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.355	ENSPREG00000020705	tnpo1	96	87.355	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	ENSPPYG00000015545	TNPO1	95	89.070	Pongo_abelii
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSPCOG00000004254	TNPO1	95	89.186	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	ENSPVAG00000013051	TNPO1	95	89.070	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.760	ENSPNYG00000001522	tnpo1	96	86.760	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.311	ENSPNAG00000021484	tnpo1	96	87.123	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.419	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	96	89.419	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSRBIG00000021642	TNPO1	96	89.186	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSRROG00000035271	TNPO1	95	89.186	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.837	ENSSBOG00000029256	TNPO1	96	88.837	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000012199	TNPO1	99	89.988	ENSSHAG00000007120	TNPO1	99	89.988	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	88.850	ENSSFOG00015015448	tnpo1	96	88.850	Scleropages_formosus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.860	ENSSMAG00000011202	tnpo1	97	86.860	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.326	ENSSDUG00000007943	tnpo1	96	87.326	Seriola_dumerili
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.326	ENSSLDG00000014578	tnpo1	96	87.326	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.070	ENSSPUG00000000149	TNPO1	96	89.070	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	ENSSPAG00000000258	tnpo1	96	87.442	Stegastes_partitus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSSSCG00000027293	TNPO1	96	89.186	Sus_scrofa
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.917	ENSTGUG00000005729	TNPO1	97	87.917	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	ENSTRUG00000018491	tnpo1	96	87.442	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000012199	TNPO1	68	88.014	ENSTNIG00000007483	tnpo1	94	88.014	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000012199	TNPO1	84	94.667	ENSTBEG00000007848	TNPO1	80	94.667	Tupaia_belangeri
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ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSUMAG00000007635	TNPO1	96	89.186	Ursus_maritimus
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	85.000	ENSVPAG00000009601	TNPO1	95	85.000	Vicugna_pacos
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	89.186	ENSVVUG00000007338	TNPO1	96	89.186	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	87.442	ENSXETG00000016812	tnpo1	95	87.442	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000012199	TNPO1	100	86.992	ENSXMAG00000005440	tnpo1	96	86.992	Xiphophorus_maculatus