EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000012357 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1115 bases
Position: chrJH126930.1:706269-707383
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000014038	Transposase_22	PF02994.14	2.4e-06	1	1
ENSLACP00000014039	Transposase_22	PF02994.14	2.5e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000014137	-	729	-	ENSLACP00000014038	243 (aa)	-	H3AWL7
ENSLACT00000014138	-	714	-	ENSLACP00000014039	237 (aa)	-	H3AWL8

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000012357's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000012357's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000012357	-	68	50.000	ENSLACG00000007535	-	94	50.311
ENSLACG00000012357	-	91	46.047	ENSLACG00000005266	-	75	46.047
ENSLACG00000012357	-	89	32.394	ENSLACG00000009013	-	64	32.394
ENSLACG00000012357	-	72	31.765	ENSLACG00000002891	-	78	31.765
ENSLACG00000012357	-	83	34.906	ENSLACG00000010569	-	84	37.173
ENSLACG00000012357	-	90	38.182	ENSLACG00000001298	-	93	38.009
ENSLACG00000012357	-	78	46.486	ENSLACG00000001295	-	78	46.486
ENSLACG00000012357	-	98	34.335	ENSLACG00000007821	-	78	34.335
ENSLACG00000012357	-	89	33.649	ENSLACG00000002651	-	86	34.123
ENSLACG00000012357	-	83	38.071	ENSLACG00000011580	-	78	37.563
ENSLACG00000012357	-	80	41.969	ENSLACG00000013987	-	60	45.062
ENSLACG00000012357	-	83	45.408	ENSLACG00000013090	-	93	45.408
ENSLACG00000012357	-	95	34.222	ENSLACG00000010346	-	77	34.211
ENSLACG00000012357	-	93	37.500	ENSLACG00000010859	-	87	37.131
ENSLACG00000012357	-	71	46.746	ENSLACG00000008643	-	98	46.746
ENSLACG00000012357	-	83	36.318	ENSLACG00000005009	-	78	39.011
ENSLACG00000012357	-	92	35.683	ENSLACG00000001559	-	79	35.065
ENSLACG00000012357	-	92	35.088	ENSLACG00000001077	-	94	35.371
ENSLACG00000012357	-	91	33.945	ENSLACG00000006865	-	91	34.862
ENSLACG00000012357	-	89	36.150	ENSLACG00000008859	-	81	36.150
ENSLACG00000012357	-	88	36.364	ENSLACG00000003451	-	92	36.364
ENSLACG00000012357	-	95	35.111	ENSLACG00000002471	-	77	35.088
ENSLACG00000012357	-	91	40.529	ENSLACG00000003957	-	80	37.872
ENSLACG00000012357	-	78	42.246	ENSLACG00000013072	-	66	45.342
ENSLACG00000012357	-	69	44.785	ENSLACG00000010633	-	93	44.785
ENSLACG00000012357	-	77	41.799	ENSLACG00000011552	-	60	44.848
ENSLACG00000012357	-	94	44.144	ENSLACG00000006813	-	87	44.000
ENSLACG00000012357	-	95	35.556	ENSLACG00000010900	-	86	35.526
ENSLACG00000012357	-	92	35.088	ENSLACG00000003217	-	84	34.483
ENSLACG00000012357	-	93	34.389	ENSLACG00000011150	-	80	34.389
ENSLACG00000012357	-	78	40.104	ENSLACG00000000465	-	64	43.827
ENSLACG00000012357	-	81	38.660	ENSLACG00000000668	-	53	42.767
ENSLACG00000012357	-	84	33.333	ENSLACG00000016319	-	73	32.338
ENSLACG00000012357	-	93	68.326	ENSLACG00000000369	-	79	68.000
ENSLACG00000012357	-	96	37.143	ENSLACG00000016396	-	85	37.190
ENSLACG00000012357	-	97	70.996	ENSLACG00000014189	-	79	72.368
ENSLACG00000012357	-	93	40.909	ENSLACG00000000876	-	98	40.359
ENSLACG00000012357	-	93	35.193	ENSLACG00000011390	-	90	34.894
ENSLACG00000012357	-	84	37.688	ENSLACG00000017727	-	82	37.186
ENSLACG00000012357	-	90	46.262	ENSLACG00000002451	-	78	46.262
ENSLACG00000012357	-	70	39.645	ENSLACG00000017411	-	80	39.645
ENSLACG00000012357	-	82	34.694	ENSLACG00000010092	-	93	33.937
ENSLACG00000012357	-	94	33.778	ENSLACG00000009806	-	82	33.778
ENSLACG00000012357	-	78	42.708	ENSLACG00000006110	-	74	45.238
ENSLACG00000012357	-	78	36.757	ENSLACG00000002135	-	83	36.757
ENSLACG00000012357	-	94	35.242	ENSLACG00000010019	-	95	35.088
ENSLACG00000012357	-	86	33.659	ENSLACG00000013538	-	94	33.333
ENSLACG00000012357	-	86	35.514	ENSLACG00000016955	-	83	35.514
ENSLACG00000012357	-	85	49.254	ENSLACG00000000907	-	94	48.293
ENSLACG00000012357	-	73	36.364	ENSLACG00000000903	-	81	35.714
ENSLACG00000012357	-	93	36.709	ENSLACG00000005344	-	85	36.709
ENSLACG00000012357	-	80	38.889	ENSLACG00000012198	-	70	43.558
ENSLACG00000012357	-	91	30.137	ENSLACG00000007888	-	90	30.137
ENSLACG00000012357	-	82	46.392	ENSLACG00000010144	-	71	46.392
ENSLACG00000012357	-	94	33.036	ENSLACG00000014493	-	75	33.036
ENSLACG00000012357	-	97	35.470	ENSLACG00000009393	-	92	35.470
ENSLACG00000012357	-	95	33.778	ENSLACG00000006473	-	87	34.222
ENSLACG00000012357	-	92	35.747	ENSLACG00000002189	-	93	35.747
ENSLACG00000012357	-	81	39.896	ENSLACG00000006210	-	63	44.099
ENSLACG00000012357	-	87	41.935	ENSLACG00000013472	-	85	41.935
ENSLACG00000012357	-	90	43.891	ENSLACG00000000643	-	91	43.891
ENSLACG00000012357	-	78	38.542	ENSLACG00000007340	-	70	40.476
ENSLACG00000012357	-	66	43.210	ENSLACG00000007342	-	77	43.210
ENSLACG00000012357	-	81	45.026	ENSLACG00000001384	-	95	42.784
ENSLACG00000012357	-	85	35.149	ENSLACG00000010705	-	83	35.149
ENSLACG00000012357	-	96	36.522	ENSLACG00000000077	-	80	35.652
ENSLACG00000012357	-	92	34.728	ENSLACG00000006820	-	88	34.728
ENSLACG00000012357	-	92	33.476	ENSLACG00000000534	-	83	35.897
ENSLACG00000012357	-	80	41.327	ENSLACG00000012229	-	65	45.455
ENSLACG00000012357	-	84	36.453	ENSLACG00000000848	-	86	33.641
ENSLACG00000012357	-	88	45.192	ENSLACG00000000673	-	81	45.192
ENSLACG00000012357	-	83	71.066	ENSLACG00000005368	-	93	71.066
ENSLACG00000012357	-	89	92.891	ENSLACG00000014732	-	94	92.891
ENSLACG00000012357	-	95	70.742	ENSLACG00000002051	-	84	70.996
ENSLACG00000012357	-	92	82.488	ENSLACG00000010165	-	83	82.488
ENSLACG00000012357	-	93	45.701	ENSLACG00000014474	-	84	45.701
ENSLACG00000012357	-	76	41.848	ENSLACG00000013182	-	79	41.848
ENSLACG00000012357	-	66	46.914	ENSLACG00000010080	-	68	46.914
ENSLACG00000012357	-	79	35.602	ENSLACG00000000425	-	94	33.684
ENSLACG00000012357	-	92	37.220	ENSLACG00000011265	-	89	36.771
ENSLACG00000012357	-	88	35.407	ENSLACG00000004272	-	99	35.407
ENSLACG00000012357	-	87	46.602	ENSLACG00000001055	-	74	53.254
ENSLACG00000012357	-	93	37.553	ENSLACG00000014952	-	79	37.395
ENSLACG00000012357	-	87	80.193	ENSLACG00000014769	-	99	80.392
ENSLACG00000012357	-	92	36.797	ENSLACG00000004508	-	59	45.062
ENSLACG00000012357	-	83	36.816	ENSLACG00000003145	-	90	36.318
ENSLACG00000012357	-	74	36.667	ENSLACG00000018384	-	95	36.667
ENSLACG00000012357	-	86	33.659	ENSLACG00000016517	-	96	33.659

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000012357	-	87	35.514	ENSACIG00000013512	-	64	36.058	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000012357	-	91	30.455	ENSAPEG00000002130	-	65	30.455	Amphiprion_percula
ENSLACG00000012357	-	91	30.876	ENSAPEG00000013155	-	67	30.876	Amphiprion_percula
ENSLACG00000012357	-	86	30.396	ENSCVAG00000022290	-	51	31.148	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000012357	-	92	38.182	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	79	38.009	Danio_rerio
ENSLACG00000012357	-	88	31.628	ENSFHEG00000006296	-	65	31.628	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000012357	-	76	36.313	ENSKMAG00000012954	-	59	33.846	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000012357	-	94	30.493	ENSLBEG00000017145	-	67	30.493	Labrus_bergylta
ENSLACG00000012357	-	86	30.583	ENSONIG00000020618	-	83	30.583	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000012357	-	68	31.902	ENSONIG00000021329	-	71	31.902	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000012357	-	90	38.009	ENSORLG00000020512	-	73	38.009	Oryzias_latipes
ENSLACG00000012357	-	90	33.953	ENSPKIG00000009100	-	63	33.953	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000012357	-	86	36.098	ENSPKIG00000001458	-	76	36.232	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000012357	-	77	30.688	ENSPMGG00000001874	-	53	32.895	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000012357	-	89	31.507	ENSPFOG00000020071	-	83	31.507	Poecilia_formosa
ENSLACG00000012357	-	86	35.294	ENSPFOG00000020560	-	76	35.294	Poecilia_formosa
ENSLACG00000012357	-	89	33.790	ENSPFOG00000020665	-	78	33.790	Poecilia_formosa
ENSLACG00000012357	-	91	33.040	ENSPFOG00000020584	-	84	33.040	Poecilia_formosa
ENSLACG00000012357	-	65	31.818	ENSPLAG00000016026	-	56	31.818	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000012357	-	89	33.486	ENSPMEG00000014224	-	74	33.486	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000012357	-	85	34.450	ENSPMEG00000022872	-	52	35.928	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000012357	-	93	37.104	ENSPNYG00000003325	-	69	37.054	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000012357	-	97	34.177	ENSPNAG00000017685	-	61	34.842	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000012357	-	94	37.281	ENSSLDG00000008663	-	86	36.441	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000012357	-	79	32.812	ENSXMAG00000029285	-	64	32.812	Xiphophorus_maculatus