EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000012399 (Gene tree)
Gene ID: 102350415
Gene Symbol: REXO4
Alias: XPMC2H|hPMC2
Full Name: REX4 homolog%2C 3'-5' exonuclease
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 17453 bases
Position: chrJH126633.1:711915-729367
Accession: 102350415
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000014087	RNase_T	PF00929.24	8.5e-21	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000014186	REXO4-201	6559	XM_005990609	ENSLACP00000014087	425 (aa)	XP_005990671	H3AWR6

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.388	ENSG00000148300	REXO4	87	52.442	Homo_sapiens
ENSLACG00000012399	REXO4	86	54.301	ENSAPOG00000019264	rexo4	85	55.108	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000012399	REXO4	90	52.672	ENSAMEG00000011649	REXO4	91	52.672	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000012399	REXO4	86	55.376	ENSAOCG00000004087	rexo4	88	54.167	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000012399	REXO4	89	53.906	ENSAPEG00000009106	rexo4	88	53.906	Amphiprion_percula
ENSLACG00000012399	REXO4	85	51.604	ENSATEG00000017662	rexo4	84	51.604	Anabas_testudineus
ENSLACG00000012399	REXO4	81	58.974	ENSAPLG00000005865	REXO4	99	58.974	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000012399	REXO4	84	52.575	ENSANAG00000028404	REXO4	88	51.421	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000012399	REXO4	83	55.372	ENSACLG00000006007	rexo4	82	55.372	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000012399	REXO4	89	50.510	ENSAMXG00000013291	rexo4	86	51.538	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000012399	REXO4	83	50.559	ENSBTAG00000019721	REXO4	84	51.532	Bos_taurus
ENSLACG00000012399	REXO4	84	53.297	ENSCJAG00000009774	REXO4	88	52.219	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000012399	REXO4	92	48.775	ENSCAFG00000019767	REXO4	92	48.744	Canis_familiaris
ENSLACG00000012399	REXO4	92	49.510	ENSCAFG00020000983	-	89	49.497	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000012399	REXO4	83	50.838	ENSCHIG00000009517	REXO4	88	49.468	Capra_hircus
ENSLACG00000012399	REXO4	86	53.846	ENSTSYG00000027492	REXO4	87	53.385	Carlito_syrichta
ENSLACG00000012399	REXO4	55	65.272	ENSCAPG00000014583	REXO4	68	66.946	Cavia_aperea
ENSLACG00000012399	REXO4	85	50.789	ENSCPOG00000001386	REXO4	88	50.253	Cavia_porcellus
ENSLACG00000012399	REXO4	83	46.518	ENSCCAG00000027049	REXO4	82	46.389	Cebus_capucinus
ENSLACG00000012399	REXO4	83	54.447	ENSCATG00000028646	REXO4	87	53.728	Cercocebus_atys
ENSLACG00000012399	REXO4	60	62.835	ENSCLAG00000006919	REXO4	76	63.602	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.804	ENSCSAG00000015280	REXO4	87	53.109	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000012399	REXO4	97	55.238	ENSCPBG00000021152	REXO4	91	58.486	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000012399	REXO4	54	55.844	ENSCING00000010751	-	84	54.852	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.659	ENSCANG00000029855	REXO4	87	52.972	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000012399	REXO4	85	52.267	ENSCGRG00001013126	Rexo4	84	51.733	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000012399	REXO4	85	52.267	ENSCGRG00000009819	Rexo4	87	51.733	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000012399	REXO4	85	52.846	ENSCSEG00000019343	rexo4	82	53.846	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000012399	REXO4	86	46.316	ENSCVAG00000014963	rexo4	86	46.316	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000012399	REXO4	88	50.255	ENSDARG00000088619	rexo4	81	69.683	Danio_rerio
ENSLACG00000012399	REXO4	87	46.172	ENSDNOG00000002429	REXO4	88	46.172	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000012399	REXO4	58	64.822	ENSDORG00000006190	Rexo4	72	64.822	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.911	ENSECAG00000007896	REXO4	80	53.067	Equus_caballus
ENSLACG00000012399	REXO4	85	51.169	ENSELUG00000003539	rexo4	84	51.163	Esox_lucius
ENSLACG00000012399	REXO4	85	50.275	ENSFCAG00000011652	REXO4	86	48.556	Felis_catus
ENSLACG00000012399	REXO4	83	55.989	ENSFALG00000001520	REXO4	88	55.163	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000012399	REXO4	89	50.630	ENSFDAG00000016050	REXO4	89	51.515	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000012399	REXO4	83	52.542	ENSFHEG00000002413	rexo4	85	52.247	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000012399	REXO4	52	57.273	ENSGMOG00000012876	rexo4	66	57.273	Gadus_morhua
ENSLACG00000012399	REXO4	66	46.528	ENSGAFG00000015404	-	83	46.528	Gambusia_affinis
ENSLACG00000012399	REXO4	99	47.887	ENSGACG00000008065	rexo4	86	50.398	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000012399	REXO4	87	58.760	ENSGAGG00000010260	REXO4	91	58.466	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.388	ENSGGOG00000014508	REXO4	87	52.442	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000012399	REXO4	83	54.821	ENSHBUG00000000542	rexo4	82	54.821	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000012399	REXO4	86	50.933	ENSHGLG00000016901	REXO4	90	49.872	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000012399	REXO4	86	50.933	ENSHGLG00100017444	REXO4	90	49.872	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000012399	REXO4	52	63.801	ENSHCOG00000018196	rexo4	56	63.801	Hippocampus_comes
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.631	ENSIPUG00000021084	rexo4	81	53.631	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000012399	REXO4	89	52.941	ENSSTOG00000003754	REXO4	82	54.318	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000012399	REXO4	86	51.613	ENSJJAG00000013002	Rexo4	83	51.613	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000012399	REXO4	85	51.323	ENSKMAG00000015039	rexo4	85	51.323	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000012399	REXO4	85	52.151	ENSLBEG00000025570	rexo4	84	52.139	Labrus_bergylta
ENSLACG00000012399	REXO4	85	54.496	ENSLOCG00000003577	rexo4	82	54.768	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000012399	REXO4	85	49.868	ENSLAFG00000011274	REXO4	92	49.000	Loxodonta_africana
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.369	ENSMFAG00000042425	REXO4	87	53.230	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.740	ENSMMUG00000000935	REXO4	87	53.034	Macaca_mulatta
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.591	ENSMNEG00000031604	REXO4	87	52.895	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000012399	REXO4	83	54.717	ENSMLEG00000037716	REXO4	87	53.985	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000012399	REXO4	85	49.733	ENSMAMG00000011251	rexo4	88	50.777	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000012399	REXO4	86	52.880	ENSMZEG00005012336	rexo4	86	52.880	Maylandia_zebra
ENSLACG00000012399	REXO4	83	56.793	ENSMGAG00000006521	REXO4	99	56.793	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000012399	REXO4	83	52.617	ENSMAUG00000015137	Rexo4	81	52.762	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.151	ENSMICG00000008422	REXO4	87	51.958	Microcebus_murinus
ENSLACG00000012399	REXO4	86	52.083	ENSMOCG00000020607	Rexo4	88	51.250	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000012399	REXO4	85	54.667	ENSMODG00000012817	REXO4	84	54.667	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000012399	REXO4	84	53.782	ENSMALG00000019705	rexo4	82	53.782	Monopterus_albus
ENSLACG00000012399	REXO4	85	51.213	MGP_CAROLIEiJ_G0023332	-	87	51.213	Mus_caroli
ENSLACG00000012399	REXO4	83	51.515	ENSMUSG00000052406	Rexo4	85	51.515	Mus_musculus
ENSLACG00000012399	REXO4	85	50.267	MGP_PahariEiJ_G0024789	Rexo4	87	50.802	Mus_pahari
ENSLACG00000012399	REXO4	83	52.066	MGP_SPRETEiJ_G0024249	-	85	52.066	Mus_spretus
ENSLACG00000012399	REXO4	58	63.095	ENSMPUG00000012315	REXO4	70	63.095	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000012399	REXO4	84	52.222	ENSNGAG00000010700	Rexo4	84	52.528	Nannospalax_galili
ENSLACG00000012399	REXO4	86	53.125	ENSNBRG00000011712	rexo4	86	53.125	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.514	ENSNLEG00000013130	-	87	53.333	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000012399	REXO4	58	61.355	ENSNLEG00000007556	-	60	61.355	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000012399	REXO4	84	42.318	ENSMEUG00000006513	-	85	42.318	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000012399	REXO4	56	65.432	ENSODEG00000015721	REXO4	68	65.432	Octodon_degus
ENSLACG00000012399	REXO4	84	55.616	ENSONIG00000020052	rexo4	83	55.616	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000012399	REXO4	85	56.878	ENSOANG00000002453	REXO4	95	57.029	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000012399	REXO4	97	50.966	ENSORLG00000006904	rexo4	82	54.902	Oryzias_latipes
ENSLACG00000012399	REXO4	97	50.966	ENSORLG00020013768	rexo4	82	54.902	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000012399	REXO4	97	50.725	ENSORLG00015012070	rexo4	82	54.622	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000012399	REXO4	93	51.889	ENSOMEG00000018327	rexo4	87	52.493	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000012399	REXO4	91	51.908	ENSOGAG00000014040	REXO4	89	51.938	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.056	ENSPPAG00000027911	REXO4	87	52.368	Pan_paniscus
ENSLACG00000012399	REXO4	92	50.380	ENSPPRG00000002894	REXO4	91	50.656	Panthera_pardus
ENSLACG00000012399	REXO4	93	43.142	ENSPTIG00000012007	REXO4	89	43.782	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.117	ENSPTRG00000023363	REXO4	87	52.185	Pan_troglodytes
ENSLACG00000012399	REXO4	83	54.447	ENSPANG00000026040	REXO4	87	53.728	Papio_anubis
ENSLACG00000012399	REXO4	85	54.348	ENSPKIG00000024761	rexo4	84	54.348	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000012399	REXO4	90	57.513	ENSPSIG00000016908	REXO4	92	57.513	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000012399	REXO4	84	49.593	ENSPMGG00000005312	rexo4	84	48.819	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000012399	REXO4	89	50.769	ENSPEMG00000017982	Rexo4	91	50.895	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000012399	REXO4	93	51.589	ENSPCIG00000017379	REXO4	85	54.011	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000012399	REXO4	83	49.157	ENSPFOG00000017751	rexo4	86	48.229	Poecilia_formosa
ENSLACG00000012399	REXO4	83	49.721	ENSPLAG00000010487	rexo4	85	48.780	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000012399	REXO4	83	49.861	ENSPMEG00000020767	rexo4	86	49.194	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000012399	REXO4	83	48.378	ENSPREG00000021841	rexo4	85	48.919	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.117	ENSPPYG00000019735	REXO4	87	52.185	Pongo_abelii
ENSLACG00000012399	REXO4	88	50.794	ENSPCAG00000010581	REXO4	88	50.794	Procavia_capensis
ENSLACG00000012399	REXO4	83	52.815	ENSPCOG00000025466	REXO4	87	51.407	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000012399	REXO4	90	45.802	ENSPVAG00000001429	REXO4	89	46.410	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000012399	REXO4	83	54.821	ENSPNYG00000013712	rexo4	82	54.821	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000012399	REXO4	89	50.633	ENSPNAG00000019227	rexo4	85	51.823	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000012399	REXO4	85	50.529	ENSRNOG00000027867	Rexo4	87	50.529	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000012399	REXO4	87	53.213	ENSRBIG00000037515	REXO4	87	53.213	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000012399	REXO4	87	52.956	ENSRROG00000028864	REXO4	87	52.956	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000012399	REXO4	83	42.222	ENSSBOG00000032587	REXO4	85	42.440	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000012399	REXO4	84	56.630	ENSSHAG00000005827	REXO4	90	56.319	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000012399	REXO4	52	73.059	ENSSFOG00015017394	rexo4	60	73.059	Scleropages_formosus
ENSLACG00000012399	REXO4	87	50.904	ENSSMAG00000015441	rexo4	85	50.904	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000012399	REXO4	83	52.703	ENSSDUG00000023346	rexo4	80	52.703	Seriola_dumerili
ENSLACG00000012399	REXO4	83	53.740	ENSSLDG00000011085	rexo4	81	53.463	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000012399	REXO4	98	52.459	ENSSPUG00000015868	REXO4	90	54.872	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000012399	REXO4	83	56.425	ENSSPAG00000007221	rexo4	82	56.267	Stegastes_partitus
ENSLACG00000012399	REXO4	93	49.633	ENSSSCG00000023173	REXO4	90	50.127	Sus_scrofa
ENSLACG00000012399	REXO4	83	57.022	ENSTGUG00000005537	REXO4	91	56.403	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000012399	REXO4	83	55.249	ENSTRUG00000013225	rexo4	88	54.424	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000012399	REXO4	84	55.556	ENSTNIG00000005873	rexo4	96	55.278	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000012399	REXO4	90	51.399	ENSUAMG00000018676	REXO4	89	51.399	Ursus_americanus
ENSLACG00000012399	REXO4	84	46.757	ENSUMAG00000023164	REXO4	96	46.757	Ursus_maritimus
ENSLACG00000012399	REXO4	92	49.510	ENSVVUG00000027337	REXO4	89	49.497	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000012399	REXO4	77	49.693	ENSXETG00000023096	rexo4	84	51.961	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000012399	REXO4	83	50.279	ENSXMAG00000013686	rexo4	89	49.322	Xiphophorus_maculatus