EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000012918 (Gene tree)
Gene ID: 102347725
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 49615 bases
Position: chrJH127159.1:782307-831921
Accession: 102347725
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000014679	GTP_EFTU	PF00009.27	7e-44	1	1
ENSLACP00000014679	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1.4e-12	1	1
ENSLACP00000014679	EFG_IV	PF03764.18	6.2e-25	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000014781	EFTUD2-201	6367	XM_006000321	ENSLACP00000014679	971 (aa)	XP_006000383	H3AYF8

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000012918's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm03040	Spliceosome	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000012918's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000012918	EFTUD2	86	39.145	ENSLACG00000004710	-	98	39.145
ENSLACG00000012918	EFTUD2	58	32.593	ENSLACG00000004622	GFM2	66	32.593
ENSLACG00000012918	EFTUD2	84	34.965	ENSLACG00000016121	EFL1	84	34.965
ENSLACG00000012918	EFTUD2	86	38.594	ENSLACG00000011124	-	99	38.594

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSG00000108883	EFTUD2	100	97.015	Homo_sapiens
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.409	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	93.409	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	94.239	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	89.907	ENSACIG00000009096	eftud2	100	89.907	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	88	89.176	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	89.176	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.409	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	93.409	Amphiprion_percula
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.718	ENSATEG00000000457	eftud2	100	93.718	Anabas_testudineus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	99	90.432	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	90.731	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.650	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	94.342	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	94.342	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.203	ENSACLG00000001296	eftud2	100	93.203	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.016	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	92.016	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.656	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	94.033	Bos_taurus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	99	70.145	WBGene00001166	eftu-2	99	70.351	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	94.342	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	94.239	Canis_familiaris
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	94.239	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.656	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	94.033	Capra_hircus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	94.239	Carlito_syrichta
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	93.930	Cavia_aperea
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	93.930	Cavia_porcellus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	94.342	Cebus_capucinus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	94.342	Cercocebus_atys
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	94.136	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	94.342	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	91	83.108	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	83.108	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.964	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	94.444	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	78.106	ENSCING00000009372	-	100	78.337	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	99	78.345	ENSCSAVG00000004985	-	100	80.094	Ciona_savignyi
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	94.342	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	93.930	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	93.930	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.100	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	93.100	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.997	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	92.997	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.189	ENSDARG00000012261	eftud2	100	92.276	Danio_rerio
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	93.930	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	94.033	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	75.282	FBgn0039566	CG4849	100	75.077	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000012918	EFTUD2	92	97.283	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	97.283	Echinops_telfairi
ENSLACG00000012918	EFTUD2	74	94.527	ENSEBUG00000004047	-	96	88.734	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	94.239	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	94.342	Equus_caballus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	83	97.458	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	97.458	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.585	ENSELUG00000017169	eftud2	100	92.379	Esox_lucius
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.656	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	94.136	Felis_catus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	94.239	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	94.033	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.894	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.894	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.688	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	92.688	Gadus_morhua
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSGALG00000000988	EFTUD2	99	96.091	Gallus_gallus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.894	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.894	Gambusia_affinis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.894	ENSGACG00000009163	eftud2	100	92.894	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	94.342	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.100	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	93.100	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	93.827	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	93.827	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.387	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	92.387	Hippocampus_comes
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.379	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	92.379	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	91	95.383	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	99	93.115	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	95	95.874	ENSJJAG00000018268	Eftud2	98	95.874	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.688	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	92.688	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	95	92.765	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	93.647	Labrus_bergylta
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.512	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	93.512	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.347	ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	93.827	Loxodonta_africana
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	94.342	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	97.015	Macaca_mulatta
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	94.342	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	94.342	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.615	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	93.615	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.203	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	93.203	Maylandia_zebra
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.564	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	94.045	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	94.033	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	94.342	Microcebus_murinus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	ENSMOCG00000009039	-	100	94.033	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000012918	EFTUD2	92	78.451	ENSMOCG00000017653	-	90	77.865	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000012918	EFTUD2	88	95.059	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	95.059	Mola_mola
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	94.342	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000012918	EFTUD2	88	93.412	ENSMALG00000014501	eftud2	100	93.412	Monopterus_albus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.245	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	93.724	Mus_caroli
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.245	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	94.027	Mus_musculus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.245	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	93.724	Mus_pahari
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.245	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	93.724	Mus_spretus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	97	94.497	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	93.962	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	99	94.239	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	93.930	Nannospalax_galili
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.100	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	93.100	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000012918	EFTUD2	97	92.994	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	92.455	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	91.264	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	90.741	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	86.639	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	86.111	Ochotona_princeps
ENSLACG00000012918	EFTUD2	93	77.299	ENSODEG00000003385	-	100	77.299	Octodon_degus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.245	ENSODEG00000018041	-	100	93.724	Octodon_degus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.203	ENSONIG00000000912	eftud2	100	93.203	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	94.239	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.585	ENSORLG00000003109	eftud2	100	92.585	Oryzias_latipes
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.482	ENSORLG00020009865	eftud2	100	92.482	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.379	ENSORLG00015002611	eftud2	100	94.227	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.011	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	92.490	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.656	ENSOARG00000009078	EFTUD2	97	94.033	Ovis_aries
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	94.342	Pan_paniscus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	94.239	Panthera_pardus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	94.239	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	94.342	Pan_troglodytes
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	94.342	Papio_anubis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	93	93.502	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	92.944	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	85.376	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	85.376	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	93.930	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	94.342	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.894	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.894	Poecilia_formosa
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.894	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.894	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.894	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.894	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.525	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	93.004	Pongo_abelii
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	90.853	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	90.329	Procavia_capensis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	94.342	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	90.442	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	89.918	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.100	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	93.100	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.482	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.482	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.130	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	94.130	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	94.239	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	94.239	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000012918	EFTUD2	97	34.026	YKL173W	SNU114	91	34.567	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.861	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	94.342	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	95	95.874	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	98	95.874	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.482	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	92.276	Scleropages_formosus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.203	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	93.203	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.306	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	93.306	Seriola_dumerili
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.409	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	93.409	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	86.434	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	86.434	Sorex_araneus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.450	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	94.033	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.306	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	93.306	Stegastes_partitus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.553	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	94.033	Sus_scrofa
ENSLACG00000012918	EFTUD2	83	95.404	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	98	95.404	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.585	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	92.585	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	88.000	ENSTNIG00000005346	eftud2	99	88.000	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	89.414	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	88.889	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000012918	EFTUD2	91	92.168	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	91	92.168	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	93.641	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	93.121	Ursus_americanus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	94.239	Ursus_maritimus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	88	97.015	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	97.015	Vicugna_pacos
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.758	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	94.239	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000012918	EFTUD2	96	93.376	ENSXETG00000003394	eftud2	98	94.124	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000012918	EFTUD2	81	94.770	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	94.770	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	92.894	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.894	Xiphophorus_maculatus