EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000013137 (Gene tree)
Gene ID: 102352656
Gene Symbol: EEFSEC
Alias: EFSEC|SELB|eEFSec
Full Name: eukaryotic elongation factor%2C selenocysteine-tRNA specific
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 109068 bases
Position: chrJH126690.1:813696-922763
Accession: 102352656
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000014928	GTP_EFTU	PF00009.27	8.3e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000015032	EEFSEC-201	3164	XM_005992541	ENSLACP00000014928	515 (aa)	XP_005992603	H3AZ57

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000013137's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000013137's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.369	ENSG00000132394	EEFSEC	85	68.369	Homo_sapiens
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	72.709	ENSAPOG00000015931	eefsec	85	73.171	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	82	72.454	ENSAMEG00000015165	EEFSEC	87	72.454	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000013137	EEFSEC	55	81.395	ENSACIG00000022407	eefsec	77	81.395	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	72.301	ENSAOCG00000008603	eefsec	85	72.764	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.099	ENSAPEG00000017090	eefsec	85	70.553	Amphiprion_percula
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.751	ENSATEG00000002753	eefsec	85	71.146	Anabas_testudineus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	82	77.518	ENSAPLG00000006745	EEFSEC	100	77.518	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	67.780	ENSANAG00000032691	EEFSEC	85	67.780	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	70.254	ENSACLG00000024565	eefsec	77	79.429	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	68.327	ENSAMXG00000002260	eefsec	84	68.924	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	67.717	ENSBTAG00000030962	EEFSEC	78	77.966	Bos_taurus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	87	32.450	WBGene00008133	efsc-1	79	32.802	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	67.255	ENSCJAG00000005387	EEFSEC	85	67.255	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.369	ENSCAFG00000004135	EEFSEC	71	66.667	Canis_familiaris
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.369	ENSCAFG00020004811	EEFSEC	88	66.667	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	67.787	ENSCHIG00000021838	EEFSEC	89	67.984	Capra_hircus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	99	67.614	ENSTSYG00000012922	EEFSEC	88	67.614	Carlito_syrichta
ENSLACG00000013137	EEFSEC	92	62.168	ENSCAPG00000000084	EEFSEC	98	62.168	Cavia_aperea
ENSLACG00000013137	EEFSEC	98	66.795	ENSCPOG00000024352	EEFSEC	89	66.795	Cavia_porcellus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.039	ENSCCAG00000031336	EEFSEC	85	68.039	Cebus_capucinus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.566	ENSCATG00000019414	EEFSEC	99	67.702	Cercocebus_atys
ENSLACG00000013137	EEFSEC	98	67.118	ENSCLAG00000006973	EEFSEC	89	67.118	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.566	ENSCSAG00000008599	EEFSEC	85	68.566	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	76.143	ENSCPBG00000014356	EEFSEC	76	76.861	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000013137	EEFSEC	99	53.359	ENSCSAVG00000002208	-	95	53.551	Ciona_savignyi
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.566	ENSCANG00000031492	EEFSEC	85	68.566	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.885	ENSCGRG00001018089	Eefsec	87	68.885	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.885	ENSCGRG00000010063	Eefsec	87	68.885	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.866	ENSCSEG00000003008	eefsec	78	78.857	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	72.144	ENSCVAG00000005381	eefsec	85	72.545	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.515	ENSDARG00000004696	eefsec	86	69.109	Danio_rerio
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	67.258	ENSDNOG00000008925	EEFSEC	86	68.047	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	92	58.111	ENSDORG00000000264	Eefsec	99	76.289	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	44.376	FBgn0034627	eEFSec	86	44.376	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	60.947	ENSETEG00000007406	EEFSEC	86	60.947	Echinops_telfairi
ENSLACG00000013137	EEFSEC	62	58.769	ENSEBUG00000015029	eefsec	80	49.550	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	69.352	ENSEASG00005006786	EEFSEC	86	69.352	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	69.745	ENSECAG00000016565	EEFSEC	86	69.745	Equus_caballus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	69.583	ENSELUG00000016632	eefsec	84	69.583	Esox_lucius
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	69.745	ENSFCAG00000006153	EEFSEC	85	69.745	Felis_catus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	92	75.155	ENSFALG00000007901	EEFSEC	99	75.155	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	92	68.303	ENSFDAG00000010243	EEFSEC	99	80.000	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.743	ENSFHEG00000007155	eefsec	85	72.345	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	66.667	ENSGMOG00000007705	eefsec	84	67.076	Gadus_morhua
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	76.258	ENSGALG00000038684	EEFSEC	86	76.258	Gallus_gallus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.888	ENSGAFG00000021692	eefsec	85	71.888	Gambusia_affinis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.169	ENSGACG00000000793	eefsec	86	70.099	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	75.746	ENSGAGG00000002059	EEFSEC	86	75.746	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.566	ENSGGOG00000001445	EEFSEC	98	68.566	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	72.323	ENSHBUG00000008917	eefsec	85	72.525	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000013137	EEFSEC	98	67.761	ENSHGLG00000000094	EEFSEC	99	80.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000013137	EEFSEC	98	67.761	ENSHGLG00100011393	EEFSEC	85	67.761	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.541	ENSHCOG00000004193	eefsec	85	71.486	Hippocampus_comes
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	67.600	ENSIPUG00000017291	eefsec	83	69.388	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	92	69.342	ENSSTOG00000019802	EEFSEC	99	80.667	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.200	ENSKMAG00000019907	eefsec	85	71.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.120	ENSLBEG00000017908	eefsec	85	70.717	Labrus_bergylta
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.084	ENSLOCG00000014535	eefsec	84	71.084	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	65.619	ENSLAFG00000001997	EEFSEC	88	66.208	Loxodonta_africana
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.762	ENSMFAG00000042128	EEFSEC	85	68.762	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	91	67.702	ENSMMUG00000018663	EEFSEC	99	67.702	Macaca_mulatta
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.566	ENSMNEG00000028574	EEFSEC	85	68.566	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000013137	EEFSEC	93	67.814	ENSMLEG00000041771	EEFSEC	93	67.814	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	69.428	ENSMAMG00000023964	eefsec	78	78.857	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	56	79.429	ENSMZEG00005009380	eefsec	77	79.429	Maylandia_zebra
ENSLACG00000013137	EEFSEC	73	74.935	ENSMGAG00000007243	EEFSEC	100	74.935	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000013137	EEFSEC	85	72.768	ENSMAUG00000011197	Eefsec	84	72.768	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.359	ENSMOCG00000017748	Eefsec	87	68.359	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000013137	EEFSEC	56	78.857	ENSMMOG00000021820	eefsec	77	78.857	Mola_mola
ENSLACG00000013137	EEFSEC	87	73.465	ENSMODG00000008034	EEFSEC	79	73.465	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000013137	EEFSEC	93	70.243	ENSMALG00000016211	eefsec	83	72.707	Monopterus_albus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	69.276	MGP_CAROLIEiJ_G0028627	Eefsec	99	79.470	Mus_caroli
ENSLACG00000013137	EEFSEC	97	68.665	ENSMUSG00000033216	Eefsec	99	79.470	Mus_musculus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.885	MGP_PahariEiJ_G0022366	Eefsec	99	79.470	Mus_pahari
ENSLACG00000013137	EEFSEC	97	68.665	MGP_SPRETEiJ_G0029640	Eefsec	99	79.470	Mus_spretus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.898	ENSMPUG00000017340	EEFSEC	82	68.898	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000013137	EEFSEC	93	67.004	ENSMLUG00000004261	EEFSEC	99	67.004	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	70.254	ENSNBRG00000002387	eefsec	77	80.000	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	67.780	ENSNLEG00000014303	EEFSEC	85	67.780	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000013137	EEFSEC	92	72.464	ENSMEUG00000005747	EEFSEC	99	72.464	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.369	ENSOPRG00000011276	EEFSEC	86	68.369	Ochotona_princeps
ENSLACG00000013137	EEFSEC	98	67.375	ENSODEG00000002928	EEFSEC	92	66.801	Octodon_degus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	91	69.753	ENSONIG00000019038	eefsec	100	69.959	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	91	73.904	ENSOANG00000009108	EEFSEC	99	73.904	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.288	ENSOCUG00000016517	EEFSEC	86	68.288	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.142	ENSORLG00000001377	eefsec	85	71.543	Oryzias_latipes
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.942	ENSORLG00020000729	eefsec	85	71.343	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.142	ENSORLG00015001986	eefsec	85	71.543	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000013137	EEFSEC	93	69.325	ENSOMEG00000010071	eefsec	89	70.000	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000013137	EEFSEC	82	71.954	ENSOGAG00000014084	EEFSEC	97	71.954	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000013137	EEFSEC	71	70.933	ENSOARG00000004600	EEFSEC	100	71.390	Ovis_aries
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.369	ENSPPAG00000030936	EEFSEC	85	68.369	Pan_paniscus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	69.745	ENSPPRG00000002846	EEFSEC	85	69.745	Panthera_pardus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	99	66.229	ENSPTIG00000013855	EEFSEC	96	66.229	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.369	ENSPTRG00000015353	EEFSEC	85	68.369	Pan_troglodytes
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.959	ENSPANG00000017041	EEFSEC	85	68.959	Papio_anubis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.945	ENSPKIG00000005220	eefsec	85	69.625	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000013137	EEFSEC	85	77.602	ENSPSIG00000015135	EEFSEC	84	77.602	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	71.116	ENSPMGG00000020300	eefsec	86	70.916	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.885	ENSPEMG00000013677	Eefsec	87	68.885	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000013137	EEFSEC	85	68.904	ENSPMAG00000006779	eefsec	84	69.351	Petromyzon_marinus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	91	70.833	ENSPCIG00000020494	EEFSEC	99	71.250	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.888	ENSPFOG00000003748	eefsec	85	71.888	Poecilia_formosa
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.888	ENSPLAG00000018012	eefsec	85	71.888	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	72.088	ENSPMEG00000001202	eefsec	85	72.088	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.888	ENSPREG00000012235	eefsec	85	71.888	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	67.976	ENSPPYG00000013436	EEFSEC	85	67.976	Pongo_abelii
ENSLACG00000013137	EEFSEC	85	62.247	ENSPCAG00000005883	EEFSEC	84	62.247	Procavia_capensis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	66.601	ENSPCOG00000023432	EEFSEC	86	66.601	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000013137	EEFSEC	58	77.841	ENSPVAG00000007070	EEFSEC	51	77.841	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	70.059	ENSPNYG00000005726	eefsec	77	79.429	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.317	ENSPNAG00000016724	eefsec	86	68.317	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.824	ENSRNOG00000012954	Eefsec	80	80.226	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	68.566	ENSRBIG00000032635	EEFSEC	85	68.566	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000013137	EEFSEC	91	66.736	ENSSBOG00000031478	EEFSEC	99	66.736	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	91	72.443	ENSSHAG00000014760	EEFSEC	99	72.443	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	68.980	ENSSFOG00015021109	eefsec	85	68.665	Scleropages_formosus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	69.368	ENSSMAG00000001454	eefsec	85	70.158	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.356	ENSSDUG00000007924	eefsec	79	80.233	Seriola_dumerili
ENSLACG00000013137	EEFSEC	93	69.838	ENSSLDG00000024985	eefsec	85	70.243	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	91	73.474	ENSSPUG00000004191	EEFSEC	100	73.474	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	69.703	ENSSPAG00000001320	eefsec	77	79.651	Stegastes_partitus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	99	67.608	ENSSSCG00000011619	EEFSEC	78	79.661	Sus_scrofa
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	74.950	ENSTGUG00000007895	EEFSEC	88	74.950	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.319	ENSTRUG00000010327	eefsec	85	70.717	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	70.099	ENSTNIG00000003225	eefsec	85	70.099	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	69.822	ENSTTRG00000000994	EEFSEC	86	69.822	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	96	70.334	ENSUAMG00000017283	EEFSEC	85	70.334	Ursus_americanus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	82	72.454	ENSVVUG00000018372	EEFSEC	91	72.454	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000013137	EEFSEC	74	76.289	ENSXETG00000002066	eefsec	83	76.289	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	71.888	ENSXCOG00000019916	eefsec	85	72.088	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000013137	EEFSEC	95	72.088	ENSXMAG00000001839	eefsec	85	72.289	Xiphophorus_maculatus