EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000013686 (Gene tree)
Gene ID: 102365405
Gene Symbol: POLR2E
Alias: RPABC1|RPB5|XAP4|hRPB25|hsRPB5
Full Name: RNA polymerase II subunit E
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11228 bases
Position: chrJH126867.1:895758-906985
Accession: 102365405
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000015549	RNA_pol_Rpb5_N	PF03871.14	3.7e-34	1	1
ENSLACP00000015549	RNA_pol_Rpb5_C	PF01191.19	1.4e-34	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000015657	POLR2E-201	2617	XM_005996327	ENSLACP00000015549	210 (aa)	XP_005996389	H3B0X8

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000013686's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm03020	RNA polymerase	KEGG
lcm04623	Cytosolic DNA-sensing pathway	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000013686's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	ENSG00000099817	POLR2E	100	95.238	Homo_sapiens
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSAPOG00000002935	polr2eb	100	96.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSAMEG00000003159	POLR2E	100	95.714	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	84.286	ENSACIG00000024371	polr2eb	100	84.286	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSAOCG00000018166	polr2eb	100	96.667	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSAPEG00000009000	polr2eb	100	96.667	Amphiprion_percula
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSATEG00000023760	polr2eb	100	96.667	Anabas_testudineus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSANAG00000038488	POLR2E	100	95.714	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSACLG00000005254	polr2eb	100	97.143	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.190	ENSAMXG00000018915	POLR2E	100	96.190	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSBTAG00000020776	POLR2E	100	95.714	Bos_taurus
ENSLACG00000013686	POLR2E	99	79.808	WBGene00019246	rpb-5	99	79.808	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000013686	POLR2E	67	91.429	ENSCJAG00000007666	-	77	91.429	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	92.857	ENSCAFG00000019546	POLR2E	100	92.857	Canis_familiaris
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSCAFG00020017111	POLR2E	100	95.714	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSCHIG00000014151	POLR2E	100	95.714	Capra_hircus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	78.605	ENSTSYG00000026377	POLR2E	100	78.605	Carlito_syrichta
ENSLACG00000013686	POLR2E	91	95.312	ENSCAPG00000010843	POLR2E	93	95.312	Cavia_aperea
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSCPOG00000001542	POLR2E	100	95.714	Cavia_porcellus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSCCAG00000025658	POLR2E	100	95.714	Cebus_capucinus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSCATG00000008926	POLR2E	100	95.714	Cercocebus_atys
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	ENSCLAG00000014874	-	100	95.238	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000013686	POLR2E	98	73.171	ENSCLAG00000009238	-	100	73.171	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSCSAG00000012336	POLR2E	100	95.714	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.190	ENSCPBG00000009702	POLR2E	100	96.190	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	86.667	ENSCING00000024933	-	99	86.667	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSCANG00000025560	POLR2E	100	95.714	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSCGRG00001022927	Polr2e	100	95.714	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	89.302	ENSCGRG00000016441	Polr2e	100	89.302	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSCSEG00000007107	polr2eb	92	95.714	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSCVAG00000019940	polr2eb	100	96.667	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.190	ENSDARG00000026183	polr2eb	100	96.190	Danio_rerio
ENSLACG00000013686	POLR2E	90	95.263	ENSDNOG00000044994	POLR2E	84	95.263	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSDORG00000001154	Polr2e	100	95.714	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000013686	POLR2E	99	86.603	FBgn0033571	Rpb5	99	86.603	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000013686	POLR2E	75	92.357	ENSEBUG00000010159	-	76	92.357	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000013686	POLR2E	69	89.655	ENSEASG00005021615	POLR2E	67	83.951	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000013686	POLR2E	91	94.241	ENSECAG00000011124	POLR2E	100	82.857	Equus_caballus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	94.762	ENSELUG00000005815	POLR2E	100	94.762	Esox_lucius
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	93.810	ENSELUG00000020646	polr2e	100	93.810	Esox_lucius
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	ENSFCAG00000007318	POLR2E	100	95.238	Felis_catus
ENSLACG00000013686	POLR2E	91	95.833	ENSFALG00000013986	POLR2E	99	95.833	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSFDAG00000014539	POLR2E	100	95.714	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSFHEG00000022398	polr2eb	100	96.667	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	ENSGMOG00000007615	polr2eb	100	95.238	Gadus_morhua
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.190	ENSGALG00000002591	POLR2E	100	96.190	Gallus_gallus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSGAFG00000005087	polr2eb	100	97.143	Gambusia_affinis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	ENSGACG00000013247	polr2eb	100	95.238	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.190	ENSGAGG00000008356	POLR2E	100	96.190	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSGGOG00000011267	POLR2E	100	95.714	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000013686	POLR2E	68	92.958	ENSHBUG00000011099	polr2eb	100	92.958	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	ENSHGLG00000013330	POLR2E	100	95.238	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	ENSHGLG00100011014	POLR2E	100	95.238	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000013686	POLR2E	53	93.750	ENSHCOG00000012099	-	88	93.750	Hippocampus_comes
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.190	ENSHCOG00000000906	polr2eb	100	96.190	Hippocampus_comes
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSIPUG00000019801	polr2e	100	96.667	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSSTOG00000002853	POLR2E	100	95.714	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	77	77.640	ENSJJAG00000015812	-	100	77.640	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	77.143	ENSJJAG00000003145	-	100	77.143	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSJJAG00000016595	-	100	95.714	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSKMAG00000005954	polr2eb	100	96.667	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSLBEG00000024802	polr2eb	100	96.667	Labrus_bergylta
ENSLACG00000013686	POLR2E	77	96.296	ENSLOCG00000004599	POLR2E	100	96.296	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	76.887	ENSLAFG00000025587	POLR2E	100	76.887	Loxodonta_africana
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSMFAG00000002884	POLR2E	100	95.714	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSMMUG00000013927	POLR2E	100	95.714	Macaca_mulatta
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	63.981	ENSMNEG00000033452	-	100	63.981	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSMNEG00000034046	-	100	95.714	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000013686	POLR2E	92	77.720	ENSMLEG00000012405	POLR2E	94	77.720	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSMAMG00000018703	polr2eb	100	96.667	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	90	96.842	ENSMZEG00005010796	polr2eb	96	96.842	Maylandia_zebra
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.735	ENSMGAG00000003769	POLR2E	100	95.735	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000013686	POLR2E	92	94.819	ENSMAUG00000010125	-	100	95.288	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	65.238	ENSMAUG00000011003	-	100	65.238	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSMICG00000013063	POLR2E	100	95.714	Microcebus_murinus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSMOCG00000013414	Polr2e	100	95.714	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	81.905	ENSMMOG00000001161	polr2eb	100	81.905	Mola_mola
ENSLACG00000013686	POLR2E	91	86.911	ENSMMOG00000001167	polr2eb	88	86.911	Mola_mola
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.190	ENSMODG00000005494	POLR2E	100	96.190	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSMALG00000021888	polr2eb	100	97.143	Monopterus_albus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	MGP_CAROLIEiJ_G0015561	Polr2e	100	95.714	Mus_caroli
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSMUSG00000004667	Polr2e	100	95.714	Mus_musculus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	MGP_PahariEiJ_G0030974	Polr2e	100	95.714	Mus_pahari
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	MGP_SPRETEiJ_G0016379	Polr2e	100	95.714	Mus_spretus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	94.762	ENSMPUG00000008953	POLR2E	100	94.762	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000013686	POLR2E	66	90.580	ENSMLUG00000006376	-	100	79.630	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSMLUG00000013193	POLR2E	100	95.714	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000013686	POLR2E	85	72.067	ENSNGAG00000017344	-	96	72.067	Nannospalax_galili
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSNGAG00000001147	Polr2e	100	95.714	Nannospalax_galili
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	84.286	ENSNBRG00000022772	polr2eb	100	84.286	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	72.857	ENSNLEG00000031364	-	100	72.857	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	91.943	ENSNLEG00000001207	-	100	91.943	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	83.810	ENSOPRG00000008331	POLR2E	100	83.810	Ochotona_princeps
ENSLACG00000013686	POLR2E	89	85.484	ENSODEG00000007985	-	100	85.484	Octodon_degus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	70.000	ENSODEG00000011490	-	100	70.000	Octodon_degus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSODEG00000013230	-	100	95.714	Octodon_degus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSONIG00000002519	polr2eb	100	96.667	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSORLG00000015346	polr2eb	100	97.143	Oryzias_latipes
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSORLG00020020700	polr2e	100	97.143	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSORLG00015016842	polr2e	100	97.143	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSOMEG00000002709	polr2eb	100	96.667	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSOGAG00000012311	POLR2E	100	95.714	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSOARG00000010994	POLR2E	100	95.714	Ovis_aries
ENSLACG00000013686	POLR2E	91	95.288	ENSPPAG00000003145	POLR2E	100	95.288	Pan_paniscus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	ENSPPRG00000000777	POLR2E	100	95.238	Panthera_pardus
ENSLACG00000013686	POLR2E	91	73.438	ENSPTIG00000012237	POLR2E	98	90.132	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSPTRG00000010183	POLR2E	100	95.714	Pan_troglodytes
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSPANG00000018011	POLR2E	100	95.714	Papio_anubis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.190	ENSPKIG00000024123	POLR2E	100	96.190	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSPKIG00000009607	POLR2E	100	95.714	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000013686	POLR2E	98	92.195	ENSPSIG00000002870	POLR2E	99	92.195	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	83.810	ENSPMGG00000014354	polr2eb	100	83.810	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSPEMG00000023261	Polr2e	100	95.714	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000013686	POLR2E	90	95.767	ENSPCIG00000007312	POLR2E	75	95.767	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSPFOG00000005734	polr2eb	100	97.143	Poecilia_formosa
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSPLAG00000014496	polr2eb	100	97.143	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSPMEG00000008053	polr2eb	100	97.143	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSPREG00000006489	polr2eb	100	97.143	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	88.626	ENSPPYG00000009305	POLR2E	100	88.626	Pongo_abelii
ENSLACG00000013686	POLR2E	53	94.595	ENSPCAG00000016605	POLR2E	100	94.595	Procavia_capensis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSPCOG00000014491	POLR2E	100	95.714	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000013686	POLR2E	65	100.000	ENSPVAG00000007718	-	65	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000013686	POLR2E	90	96.842	ENSPNYG00000019797	polr2eb	96	96.842	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSPNAG00000026263	POLR2E	100	95.714	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSRNOG00000013545	Polr2e	100	95.714	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSRBIG00000028726	-	100	95.714	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	70.616	ENSRBIG00000027259	-	100	70.616	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSRROG00000043763	POLR2E	100	95.714	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000013686	POLR2E	99	45.872	YBR154C	RPB5	98	45.872	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSSBOG00000027241	POLR2E	100	95.714	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.190	ENSSHAG00000010690	POLR2E	100	96.190	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSSFOG00015006073	polr2e	100	96.667	Scleropages_formosus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSSMAG00000012782	polr2eb	100	96.667	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSSDUG00000003352	polr2eb	100	96.667	Seriola_dumerili
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSSLDG00000004965	polr2eb	100	96.667	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSSPUG00000006114	POLR2E	100	95.714	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSSPAG00000017556	polr2eb	100	96.667	Stegastes_partitus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSSSCG00000021472	POLR2E	100	95.714	Sus_scrofa
ENSLACG00000013686	POLR2E	66	87.857	ENSTGUG00000000922	POLR2E	99	87.857	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000013686	POLR2E	96	92.040	ENSTRUG00000018238	polr2eb	100	83.810	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	96.667	ENSTNIG00000013187	polr2eb	100	96.667	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.238	ENSTTRG00000001484	POLR2E	100	95.238	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000013686	POLR2E	92	92.268	ENSUAMG00000009166	POLR2E	100	82.381	Ursus_americanus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	95.714	ENSVVUG00000022818	POLR2E	54	95.714	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSXETG00000003291	polr2e	100	97.143	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	84.286	ENSXCOG00000009197	polr2eb	100	84.286	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000013686	POLR2E	100	97.143	ENSXMAG00000026495	polr2eb	100	97.143	Xiphophorus_maculatus