EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000013713 (Gene tree)
Gene ID: 102348161
Gene Symbol: TRMU
Alias: FLJ10140|MTO2|TRMT
Full Name: tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridylate methyltransferase
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 18390 bases
Position: chrJH127361.1:899605-917994
Accession: 102348161
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000015576	tRNA_Me_trans	PF03054.16	3.3e-138	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000015684	TRMU-201	2733	XM_006002434	ENSLACP00000015576	419 (aa)	XP_006002496	H3B105

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.445	ENSG00000100416	TRMU	99	78.667	Homo_sapiens
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.798	ENSAPOG00000014458	trmu	99	73.798	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000013713	TRMU	96	74.564	ENSAMEG00000003319	TRMU	96	74.564	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000013713	TRMU	96	74.938	ENSACIG00000002101	trmu	97	74.938	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.279	ENSAOCG00000013155	trmu	99	74.279	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.038	ENSAPEG00000013350	trmu	99	74.038	Amphiprion_percula
ENSLACG00000013713	TRMU	95	75.819	ENSATEG00000007814	trmu	97	75.819	Anabas_testudineus
ENSLACG00000013713	TRMU	93	76.982	ENSAPLG00000016380	TRMU	99	76.982	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.155	ENSACAG00000007720	TRMU	99	74.155	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.494	ENSANAG00000038053	TRMU	98	73.494	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000013713	TRMU	96	76.923	ENSACLG00000005395	trmu	97	77.929	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000013713	TRMU	94	76.531	ENSAMXG00000005282	trmu	95	76.531	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000013713	TRMU	95	75.758	ENSBTAG00000005595	TRMU	95	75.758	Bos_taurus
ENSLACG00000013713	TRMU	92	40.806	WBGene00007114	mttu-1	100	40.806	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.315	ENSCJAG00000000198	TRMU	99	72.315	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000013713	TRMU	98	73.544	ENSCAFG00000000779	TRMU	98	73.381	Canis_familiaris
ENSLACG00000013713	TRMU	98	73.544	ENSCAFG00020009184	TRMU	98	73.381	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.662	ENSCHIG00000017074	TRMU	99	72.662	Capra_hircus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.558	ENSTSYG00000003853	TRMU	99	73.558	Carlito_syrichta
ENSLACG00000013713	TRMU	95	68.421	ENSCAPG00000013034	TRMU	98	68.421	Cavia_aperea
ENSLACG00000013713	TRMU	99	71.942	ENSCPOG00000020780	TRMU	99	71.942	Cavia_porcellus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.317	ENSCCAG00000021641	TRMU	99	73.317	Cebus_capucinus
ENSLACG00000013713	TRMU	95	75.250	ENSCATG00000032800	TRMU	95	75.250	Cercocebus_atys
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.077	ENSCLAG00000017269	TRMU	99	73.077	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000013713	TRMU	95	75.500	ENSCSAG00000005279	TRMU	95	75.500	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000013713	TRMU	93	76.726	ENSCPBG00000011621	TRMU	98	76.726	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000013713	TRMU	95	46.851	ENSCING00000019371	-	97	46.851	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.857	ENSCANG00000041645	TRMU	99	72.857	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000013713	TRMU	97	74.138	ENSCGRG00001001739	Trmu	97	74.138	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000013713	TRMU	97	68.719	ENSCGRG00000002781	Trmu	97	68.719	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000013713	TRMU	99	71.635	ENSCSEG00000012382	trmu	99	71.635	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.217	ENSCVAG00000001366	trmu	98	74.217	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000013713	TRMU	95	73.485	ENSDARG00000043734	trmu	95	73.485	Danio_rerio
ENSLACG00000013713	TRMU	53	68.610	ENSDNOG00000047245	-	83	65.145	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000013713	TRMU	95	76.131	ENSDORG00000007455	Trmu	97	76.131	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000013713	TRMU	92	43.264	FBgn0040337	CG3021	95	43.264	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000013713	TRMU	94	57.179	ENSEBUG00000007454	trmu	98	57.179	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000013713	TRMU	97	75.309	ENSEASG00005021725	TRMU	99	74.101	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000013713	TRMU	97	74.755	ENSECAG00000000467	TRMU	99	74.101	Equus_caballus
ENSLACG00000013713	TRMU	71	55.518	ENSEEUG00000000074	-	71	55.518	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.381	ENSELUG00000009464	trmu	99	75.683	Esox_lucius
ENSLACG00000013713	TRMU	95	76.131	ENSFCAG00000006533	TRMU	99	73.798	Felis_catus
ENSLACG00000013713	TRMU	89	78.421	ENSFALG00000010035	TRMU	96	78.421	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000013713	TRMU	93	72.751	ENSFDAG00000017472	TRMU	99	72.751	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.279	ENSFHEG00000003162	trmu	97	76.986	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000013713	TRMU	96	65.926	ENSGMOG00000001323	trmu	99	65.926	Gadus_morhua
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.408	ENSGALG00000031922	TRMU	99	74.408	Gallus_gallus
ENSLACG00000013713	TRMU	97	75.430	ENSGAFG00000013331	trmu	98	75.430	Gambusia_affinis
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.050	ENSGACG00000019024	trmu	99	73.050	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.810	ENSGGOG00000000203	TRMU	99	73.810	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000013713	TRMU	96	76.923	ENSHBUG00000023421	trmu	97	77.929	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.115	ENSHGLG00000009278	TRMU	99	72.115	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.115	ENSHGLG00100018863	TRMU	99	72.115	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000013713	TRMU	99	76.386	ENSHCOG00000013459	trmu	99	76.386	Hippocampus_comes
ENSLACG00000013713	TRMU	96	74.876	ENSIPUG00000009785	trmu	99	74.876	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.334	ENSSTOG00000010993	TRMU	98	74.334	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.464	ENSJJAG00000000667	Trmu	99	72.464	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.038	ENSKMAG00000008516	trmu	99	74.038	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.317	ENSLBEG00000018831	trmu	99	73.317	Labrus_bergylta
ENSLACG00000013713	TRMU	99	79.469	ENSLOCG00000016066	trmu	99	79.469	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	65.144	ENSLAFG00000005129	TRMU	99	65.144	Loxodonta_africana
ENSLACG00000013713	TRMU	95	75.500	ENSMFAG00000039767	TRMU	95	75.500	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000013713	TRMU	95	75.500	ENSMMUG00000000807	TRMU	95	75.500	Macaca_mulatta
ENSLACG00000013713	TRMU	95	75.500	ENSMNEG00000028164	TRMU	95	75.500	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000013713	TRMU	95	75.250	ENSMLEG00000033884	TRMU	95	75.250	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.279	ENSMAMG00000004717	trmu	99	74.279	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000013713	TRMU	96	77.171	ENSMZEG00005015797	trmu	97	77.171	Maylandia_zebra
ENSLACG00000013713	TRMU	80	73.913	ENSMGAG00000007550	TRMU	100	73.913	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000013713	TRMU	97	73.399	ENSMAUG00000022282	Trmu	97	73.399	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000013713	TRMU	94	77.215	ENSMICG00000029046	TRMU	96	77.215	Microcebus_murinus
ENSLACG00000013713	TRMU	97	73.892	ENSMOCG00000014641	Trmu	97	73.892	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000013713	TRMU	98	73.544	ENSMMOG00000007229	trmu	99	73.544	Mola_mola
ENSLACG00000013713	TRMU	97	71.499	ENSMODG00000007433	TRMU	95	71.499	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.558	ENSMALG00000007721	trmu	99	73.558	Monopterus_albus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.289	MGP_CAROLIEiJ_G0020134	Trmu	99	72.289	Mus_caroli
ENSLACG00000013713	TRMU	97	73.399	ENSMUSG00000022386	Trmu	97	73.399	Mus_musculus
ENSLACG00000013713	TRMU	97	72.906	MGP_PahariEiJ_G0020139	Trmu	97	72.906	Mus_pahari
ENSLACG00000013713	TRMU	97	73.399	MGP_SPRETEiJ_G0021031	Trmu	97	73.399	Mus_spretus
ENSLACG00000013713	TRMU	95	74.874	ENSMPUG00000002523	TRMU	95	74.874	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000013713	TRMU	98	73.058	ENSNGAG00000005132	Trmu	99	73.058	Nannospalax_galili
ENSLACG00000013713	TRMU	96	76.675	ENSNBRG00000022690	trmu	99	76.675	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.810	ENSNLEG00000015773	TRMU	99	73.810	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000013713	TRMU	78	63.804	ENSMEUG00000000216	TRMU	98	63.804	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000013713	TRMU	99	71.913	ENSODEG00000014745	TRMU	98	71.913	Octodon_degus
ENSLACG00000013713	TRMU	96	77.419	ENSONIG00000009821	trmu	97	77.419	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000013713	TRMU	92	71.134	ENSOANG00000001891	TRMU	98	71.134	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000013713	TRMU	91	74.346	ENSOCUG00000003664	TRMU	96	73.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000013713	TRMU	96	72.208	ENSORLG00000019015	trmu	97	72.208	Oryzias_latipes
ENSLACG00000013713	TRMU	96	72.208	ENSORLG00020006830	trmu	97	72.208	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000013713	TRMU	96	72.208	ENSORLG00015003907	trmu	97	72.208	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000013713	TRMU	57	72.689	ENSOMEG00000015541	trmu	86	72.689	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000013713	TRMU	97	74.447	ENSOGAG00000008096	TRMU	98	74.447	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000013713	TRMU	90	70.899	ENSOARG00000019475	TRMU	92	70.899	Ovis_aries
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.571	ENSPPAG00000033944	TRMU	99	73.571	Pan_paniscus
ENSLACG00000013713	TRMU	95	76.382	ENSPPRG00000004197	TRMU	95	76.382	Panthera_pardus
ENSLACG00000013713	TRMU	64	75.836	ENSPTIG00000014122	TRMU	97	76.136	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.571	ENSPTRG00000014510	TRMU	99	73.571	Pan_troglodytes
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.837	ENSPANG00000023074	TRMU	97	72.404	Papio_anubis
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.558	ENSPKIG00000002849	trmu	99	73.558	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000013713	TRMU	91	77.285	ENSPSIG00000013020	TRMU	100	77.285	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000013713	TRMU	99	75.000	ENSPMGG00000004083	trmu	99	75.000	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000013713	TRMU	97	73.892	ENSPEMG00000014007	Trmu	97	73.892	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000013713	TRMU	93	73.657	ENSPCIG00000009923	TRMU	95	71.990	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000013713	TRMU	94	72.449	ENSPFOG00000008197	trmu	86	72.449	Poecilia_formosa
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.188	ENSPLAG00000008414	trmu	98	73.188	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.430	ENSPMEG00000004326	trmu	98	73.430	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.430	ENSPREG00000007980	trmu	98	73.430	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.048	ENSPPYG00000011949	TRMU	99	74.048	Pongo_abelii
ENSLACG00000013713	TRMU	91	66.841	ENSPCAG00000013462	TRMU	98	66.841	Procavia_capensis
ENSLACG00000013713	TRMU	94	76.962	ENSPCOG00000016539	TRMU	95	76.962	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000013713	TRMU	94	69.367	ENSPVAG00000013202	TRMU	99	68.039	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000013713	TRMU	96	76.923	ENSPNYG00000005629	trmu	97	76.923	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000013713	TRMU	99	73.798	ENSPNAG00000006339	trmu	96	73.798	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000013713	TRMU	97	72.906	ENSRNOG00000016465	Trmu	97	72.906	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000013713	TRMU	95	74.750	ENSRBIG00000038973	TRMU	99	71.011	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000013713	TRMU	95	75.000	ENSRROG00000004267	TRMU	99	71.011	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000013713	TRMU	90	31.762	YDL033C	SLM3	91	31.762	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.554	ENSSBOG00000030184	TRMU	99	72.554	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000013713	TRMU	88	76.757	ENSSFOG00015020664	trmu	97	76.757	Scleropages_formosus
ENSLACG00000013713	TRMU	96	74.442	ENSSMAG00000019450	trmu	97	74.442	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.940	ENSSDUG00000011913	trmu	99	74.940	Seriola_dumerili
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.699	ENSSLDG00000011684	trmu	99	74.699	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000013713	TRMU	99	65.459	ENSSPUG00000017123	TRMU	98	65.459	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.837	ENSSPAG00000021875	trmu	99	72.837	Stegastes_partitus
ENSLACG00000013713	TRMU	97	73.956	ENSSSCG00000000007	TRMU	99	73.077	Sus_scrofa
ENSLACG00000013713	TRMU	89	79.357	ENSTGUG00000003663	-	100	79.357	Taeniopygia_guttata
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ENSLACG00000013713	TRMU	76	55.446	ENSTBEG00000011276	-	82	55.446	Tupaia_belangeri
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ENSLACG00000013713	TRMU	69	74.570	ENSUAMG00000024825	TRMU	97	74.570	Ursus_americanus
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ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.662	ENSVVUG00000024963	TRMU	98	72.662	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000013713	TRMU	99	77.458	ENSXETG00000023304	trmu	98	77.458	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000013713	TRMU	99	72.182	ENSXCOG00000015105	trmu	98	72.182	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000013713	TRMU	99	74.155	ENSXMAG00000006697	trmu	98	74.155	Xiphophorus_maculatus