EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000013921 (Gene tree)
Gene ID: 102353196
Gene Symbol: NRDE2
Alias: C14orf102|FLJ14051
Full Name: NRDE-2%2C necessary for RNA interference%2C domain containing
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14906 bases
Position: chrJH126696.1:929608-944513
Accession: 102353196
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000015808	NRDE-2	PF08424.10	5.3e-89	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000015918	NRDE2-201	3279	XM_005992725	ENSLACP00000015808	825 (aa)	-	H3B1N7

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000013921's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000013921's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.765	ENSG00000119720	NRDE2	100	66.667	Homo_sapiens
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.468	ENSAPOG00000009202	nrde2	71	50.351	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	58.709	ENSAMEG00000001807	NRDE2	71	59.277	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	53.519	ENSACIG00000014783	nrde2	89	51.526	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.825	ENSAOCG00000015576	nrde2	70	50.590	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.249	ENSAPEG00000001711	nrde2	70	51.011	Amphiprion_percula
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	49.942	ENSATEG00000010247	nrde2	71	50.469	Anabas_testudineus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.662	ENSAPLG00000015870	NRDE2	72	60.024	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000013921	NRDE2	98	56.757	ENSACAG00000014571	NRDE2	69	56.987	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	58.080	ENSANAG00000025313	NRDE2	71	58.323	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.119	ENSACLG00000025154	nrde2	71	50.119	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000013921	NRDE2	91	66.667	ENSAMXG00000034642	nrde2	71	45.477	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.417	ENSBTAG00000005427	NRDE2	68	68.333	Bos_taurus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.341	ENSCJAG00000017711	NRDE2	71	61.538	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	57.978	ENSCAFG00000017515	NRDE2	72	58.313	Canis_familiaris
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.000	ENSCAFG00020016346	NRDE2	71	60.314	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.804	ENSCHIG00000005876	NRDE2	71	60.097	Capra_hircus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.634	ENSTSYG00000000161	NRDE2	71	59.856	Carlito_syrichta
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.539	ENSCAPG00000012039	NRDE2	72	60.749	Cavia_aperea
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.539	ENSCPOG00000002428	NRDE2	71	60.749	Cavia_porcellus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.585	ENSCCAG00000024917	NRDE2	71	61.779	Cebus_capucinus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.417	ENSCLAG00000015185	NRDE2	71	60.628	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.887	ENSCSAG00000011451	NRDE2	71	62.077	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000013921	NRDE2	83	56.706	ENSCHOG00000006165	NRDE2	59	57.122	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	62.515	ENSCPBG00000008537	NRDE2	69	62.802	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	62.132	ENSCANG00000029067	NRDE2	71	62.319	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.364	ENSCGRG00001015658	Nrde2	71	60.215	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.029	ENSCGRG00000005062	Nrde2	71	61.232	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000013921	NRDE2	97	51.114	ENSCSEG00000000089	nrde2	89	50.484	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.429	ENSCVAG00000023105	nrde2	71	51.429	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	56.015	ENSDARG00000074726	nrde2	71	56.015	Danio_rerio
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.562	ENSDNOG00000024057	NRDE2	71	60.870	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000013921	NRDE2	95	59.466	ENSDORG00000003197	Nrde2	88	59.855	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000013921	NRDE2	83	55.182	ENSETEG00000000198	NRDE2	60	55.524	Echinops_telfairi
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	43.675	ENSEBUG00000014552	nrde2	70	43.541	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.341	ENSEASG00005020675	NRDE2	71	61.538	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.661	ENSECAG00000003862	NRDE2	71	61.957	Equus_caballus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	56.647	ENSELUG00000005973	nrde2	71	56.647	Esox_lucius
ENSLACG00000013921	NRDE2	100	59.783	ENSFCAG00000011312	NRDE2	71	59.783	Felis_catus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.412	ENSFALG00000012260	NRDE2	71	60.412	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.049	ENSFDAG00000021350	NRDE2	71	60.266	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	52.138	ENSFHEG00000021385	nrde2	70	52.138	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000013921	NRDE2	90	52.795	ENSGMOG00000015815	nrde2	91	52.869	Gadus_morhua
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.492	ENSGALG00000010677	NRDE2	71	59.855	Gallus_gallus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.749	ENSGAFG00000019546	nrde2	90	51.749	Gambusia_affinis
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.824	ENSGACG00000012619	nrde2	71	50.588	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.905	ENSGAGG00000003252	NRDE2	71	62.198	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.520	ENSGGOG00000008835	NRDE2	72	61.715	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.119	ENSHBUG00000016736	nrde2	71	50.119	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.029	ENSHGLG00000006731	NRDE2	72	61.232	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.029	ENSHGLG00100017736	NRDE2	72	61.232	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	45.258	ENSHCOG00000009559	nrde2	75	45.258	Hippocampus_comes
ENSLACG00000013921	NRDE2	97	51.589	ENSIPUG00000016129	nrde2	70	51.467	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.029	ENSSTOG00000001678	NRDE2	71	61.232	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.413	ENSJJAG00000000907	Nrde2	71	59.662	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.699	ENSKMAG00000008647	nrde2	71	50.871	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	49.464	ENSLBEG00000021428	nrde2	74	49.464	Labrus_bergylta
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	63.126	ENSLOCG00000009037	nrde2	70	63.248	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.928	ENSLAFG00000004966	NRDE2	73	61.232	Loxodonta_africana
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.765	ENSMMUG00000010442	NRDE2	100	66.176	Macaca_mulatta
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.058	ENSMAMG00000013452	nrde2	71	50.350	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.594	ENSMZEG00005008319	nrde2	71	50.237	Maylandia_zebra
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.008	ENSMGAG00000013052	NRDE2	84	59.008	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.662	ENSMAUG00000018578	Nrde2	71	60.870	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.765	ENSMICG00000016741	NRDE2	71	61.957	Microcebus_murinus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	57.475	ENSMOCG00000014472	Nrde2	70	57.488	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000013921	NRDE2	91	49.805	ENSMMOG00000004703	nrde2	82	49.805	Mola_mola
ENSLACG00000013921	NRDE2	92	60.211	ENSMODG00000002711	NRDE2	67	60.211	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	49.460	ENSMALG00000021869	nrde2	73	49.460	Monopterus_albus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.172	MGP_CAROLIEiJ_G0018020	Nrde2	71	60.386	Mus_caroli
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.662	ENSMUSG00000021179	Nrde2	70	60.870	Mus_musculus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.662	MGP_PahariEiJ_G0029778	Nrde2	71	60.870	Mus_pahari
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.417	MGP_SPRETEiJ_G0018865	Nrde2	98	65.556	Mus_spretus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	57.824	ENSMPUG00000008135	NRDE2	71	57.952	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.049	ENSMLUG00000007484	NRDE2	71	60.266	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.681	ENSNGAG00000002993	Nrde2	71	59.903	Nannospalax_galili
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.946	ENSNBRG00000010184	nrde2	87	51.946	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.300	ENSNLEG00000017032	NRDE2	70	60.864	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000013921	NRDE2	100	51.449	ENSMEUG00000011097	NRDE2	72	51.449	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.681	ENSODEG00000012422	NRDE2	72	59.903	Octodon_degus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.628	ENSONIG00000019512	nrde2	70	51.870	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.902	ENSOCUG00000010083	NRDE2	71	60.072	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000013921	NRDE2	98	51.345	ENSORLG00000017730	nrde2	81	48.118	Oryzias_latipes
ENSLACG00000013921	NRDE2	98	49.882	ENSORLG00020015965	nrde2	75	49.653	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	49.766	ENSORLG00015012437	nrde2	74	49.766	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000013921	NRDE2	98	52.189	ENSOMEG00000010890	nrde2	71	52.459	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.636	ENSOGAG00000006624	NRDE2	71	60.723	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000013921	NRDE2	98	57.337	ENSOARG00000003475	NRDE2	71	57.337	Ovis_aries
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.887	ENSPPAG00000034133	NRDE2	89	62.077	Pan_paniscus
ENSLACG00000013921	NRDE2	100	59.903	ENSPPRG00000006422	NRDE2	71	59.903	Panthera_pardus
ENSLACG00000013921	NRDE2	100	59.783	ENSPTIG00000009989	NRDE2	71	59.783	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.887	ENSPTRG00000023399	NRDE2	72	62.077	Pan_troglodytes
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	55.501	ENSPKIG00000009331	nrde2	70	55.678	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	62.241	ENSPSIG00000005588	NRDE2	71	62.530	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	49.338	ENSPMGG00000024089	nrde2	75	48.687	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	59.804	ENSPEMG00000023707	Nrde2	76	59.903	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.584	ENSPCIG00000018567	NRDE2	76	60.843	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.000	ENSPFOG00000013217	nrde2	69	50.119	Poecilia_formosa
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.587	ENSPLAG00000022350	nrde2	70	50.703	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.587	ENSPMEG00000000778	nrde2	70	50.704	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.529	ENSPREG00000009066	nrde2	70	50.529	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.172	ENSPPYG00000006245	NRDE2	84	60.386	Pongo_abelii
ENSLACG00000013921	NRDE2	73	84.615	ENSPCAG00000016399	NRDE2	52	84.615	Procavia_capensis
ENSLACG00000013921	NRDE2	92	58.661	ENSPCOG00000024684	NRDE2	69	58.661	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000013921	NRDE2	95	56.544	ENSPVAG00000010023	NRDE2	70	56.544	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.157	ENSPNYG00000022833	nrde2	85	51.157	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	53.949	ENSPNAG00000015807	nrde2	74	53.827	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000013921	NRDE2	87	58.856	ENSRNOG00000004004	Nrde2	68	58.856	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.397	ENSSBOG00000024346	NRDE2	71	61.594	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.440	ENSSHAG00000016736	NRDE2	69	60.749	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	57.875	ENSSFOG00015011794	nrde2	69	57.875	Scleropages_formosus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	49.711	ENSSMAG00000011671	nrde2	71	49.827	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	50.928	ENSSDUG00000017948	nrde2	71	50.812	Seriola_dumerili
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	52.237	ENSSLDG00000023798	nrde2	89	50.725	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000013921	NRDE2	98	62.082	ENSSPUG00000006348	NRDE2	77	62.331	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.582	ENSSPAG00000000539	nrde2	89	50.487	Stegastes_partitus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.588	ENSSSCG00000002434	NRDE2	71	61.037	Sus_scrofa
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	61.259	ENSTGUG00000012462	-	72	61.259	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000013921	NRDE2	98	50.487	ENSTRUG00000002798	nrde2	87	50.487	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000013921	NRDE2	91	68.519	ENSTBEG00000011834	NRDE2	65	68.519	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.294	ENSTTRG00000013583	NRDE2	71	60.507	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	58.364	ENSUAMG00000004159	NRDE2	75	58.696	Ursus_americanus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	57.387	ENSUMAG00000006393	NRDE2	72	57.729	Ursus_maritimus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	60.122	ENSVVUG00000018202	NRDE2	70	60.434	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	57.265	ENSXETG00000015708	nrde2	72	57.419	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.453	ENSXCOG00000013298	nrde2	77	51.453	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000013921	NRDE2	99	51.116	ENSXMAG00000009320	nrde2	70	51.116	Xiphophorus_maculatus