EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000014189 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1230 bases
Position: chrJH127329.1:980508-981737
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000016110	Transposase_22	PF02994.14	6.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000016222	-	861	-	ENSLACP00000016110	287 (aa)	-	H3B2I9

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000014189's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000014189's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000014189	-	58	36.686	ENSLACG00000017411	-	80	36.686
ENSLACG00000014189	-	81	39.485	ENSLACG00000001384	-	94	43.005
ENSLACG00000014189	-	72	40.952	ENSLACG00000006110	-	90	40.758
ENSLACG00000014189	-	74	36.321	ENSLACG00000003451	-	90	36.321
ENSLACG00000014189	-	80	34.728	ENSLACG00000004508	-	89	34.728
ENSLACG00000014189	-	80	43.668	ENSLACG00000000643	-	94	43.668
ENSLACG00000014189	-	84	34.025	ENSLACG00000010900	-	88	34.025
ENSLACG00000014189	-	57	33.537	ENSLACG00000008432	-	53	33.537
ENSLACG00000014189	-	77	38.393	ENSLACG00000011265	-	90	38.393
ENSLACG00000014189	-	51	39.726	ENSLACG00000018384	-	80	39.726
ENSLACG00000014189	-	74	33.962	ENSLACG00000006473	-	82	34.906
ENSLACG00000014189	-	75	42.791	ENSLACG00000013090	-	97	43.128
ENSLACG00000014189	-	57	44.172	ENSLACG00000010633	-	93	43.902
ENSLACG00000014189	-	84	35.857	ENSLACG00000010080	-	87	36.087
ENSLACG00000014189	-	61	42.857	ENSLACG00000007342	-	87	42.857
ENSLACG00000014189	-	67	36.181	ENSLACG00000007340	-	80	36.181
ENSLACG00000014189	-	81	36.170	ENSLACG00000006210	-	89	36.170
ENSLACG00000014189	-	65	32.990	ENSLACG00000000425	-	100	33.505
ENSLACG00000014189	-	57	50.920	ENSLACG00000007535	-	95	50.920
ENSLACG00000014189	-	74	36.150	ENSLACG00000008859	-	81	36.150
ENSLACG00000014189	-	80	36.638	ENSLACG00000010859	-	83	36.957
ENSLACG00000014189	-	83	30.962	ENSLACG00000006865	-	89	33.796
ENSLACG00000014189	-	81	40.086	ENSLACG00000000876	-	99	40.086
ENSLACG00000014189	-	87	36.187	ENSLACG00000005344	-	92	33.463
ENSLACG00000014189	-	57	51.534	ENSLACG00000008643	-	95	51.534
ENSLACG00000014189	-	82	43.404	ENSLACG00000010144	-	85	43.404
ENSLACG00000014189	-	76	42.466	ENSLACG00000005266	-	76	42.466
ENSLACG00000014189	-	82	35.146	ENSLACG00000002189	-	93	36.199
ENSLACG00000014189	-	86	33.463	ENSLACG00000000534	-	92	33.725
ENSLACG00000014189	-	78	34.513	ENSLACG00000011150	-	81	34.513
ENSLACG00000014189	-	90	40.698	ENSLACG00000002451	-	82	42.489
ENSLACG00000014189	-	73	70.335	ENSLACG00000014769	-	99	70.588
ENSLACG00000014189	-	72	38.095	ENSLACG00000000848	-	85	38.095
ENSLACG00000014189	-	81	43.777	ENSLACG00000000673	-	90	43.777
ENSLACG00000014189	-	76	36.889	ENSLACG00000012229	-	87	36.889
ENSLACG00000014189	-	89	31.907	ENSLACG00000009013	-	64	33.962
ENSLACG00000014189	-	76	70.507	ENSLACG00000010165	-	83	70.833
ENSLACG00000014189	-	84	31.535	ENSLACG00000007821	-	81	31.535
ENSLACG00000014189	-	73	33.493	ENSLACG00000004272	-	99	33.493
ENSLACG00000014189	-	79	72.368	ENSLACG00000012357	-	97	70.996
ENSLACG00000014189	-	70	36.765	ENSLACG00000010019	-	85	36.765
ENSLACG00000014189	-	74	48.341	ENSLACG00000000907	-	97	48.341
ENSLACG00000014189	-	68	39.216	ENSLACG00000012198	-	88	39.216
ENSLACG00000014189	-	73	70.476	ENSLACG00000014732	-	94	70.142
ENSLACG00000014189	-	88	33.206	ENSLACG00000016955	-	72	37.500
ENSLACG00000014189	-	97	37.011	ENSLACG00000001559	-	82	38.153
ENSLACG00000014189	-	79	38.428	ENSLACG00000017727	-	96	38.428
ENSLACG00000014189	-	70	41.262	ENSLACG00000000077	-	93	37.097
ENSLACG00000014189	-	69	71.212	ENSLACG00000005368	-	94	71.212
ENSLACG00000014189	-	65	40.642	ENSLACG00000005009	-	78	40.642
ENSLACG00000014189	-	82	49.576	ENSLACG00000014474	-	86	50.000
ENSLACG00000014189	-	62	37.430	ENSLACG00000016319	-	67	37.430
ENSLACG00000014189	-	63	33.508	ENSLACG00000000903	-	84	32.447
ENSLACG00000014189	-	74	38.053	ENSLACG00000013987	-	84	38.053
ENSLACG00000014189	-	83	41.772	ENSLACG00000006813	-	90	42.241
ENSLACG00000014189	-	89	40.392	ENSLACG00000001055	-	89	42.609
ENSLACG00000014189	-	69	46.701	ENSLACG00000001295	-	80	46.939
ENSLACG00000014189	-	80	33.906	ENSLACG00000001298	-	94	33.929
ENSLACG00000014189	-	78	31.140	ENSLACG00000007888	-	94	31.140
ENSLACG00000014189	-	80	40.171	ENSLACG00000013472	-	85	40.171
ENSLACG00000014189	-	89	59.387	ENSLACG00000002051	-	86	61.441
ENSLACG00000014189	-	93	61.194	ENSLACG00000000369	-	81	66.667
ENSLACG00000014189	-	74	33.790	ENSLACG00000013538	-	100	33.790
ENSLACG00000014189	-	81	35.685	ENSLACG00000016396	-	85	35.685
ENSLACG00000014189	-	62	39.891	ENSLACG00000000465	-	73	39.891
ENSLACG00000014189	-	74	33.019	ENSLACG00000002651	-	85	33.019
ENSLACG00000014189	-	80	37.069	ENSLACG00000011552	-	83	37.391
ENSLACG00000014189	-	75	33.486	ENSLACG00000009806	-	78	33.486
ENSLACG00000014189	-	80	36.207	ENSLACG00000006820	-	82	36.245
ENSLACG00000014189	-	87	36.364	ENSLACG00000003217	-	84	36.709
ENSLACG00000014189	-	79	33.766	ENSLACG00000010705	-	82	34.466
ENSLACG00000014189	-	92	33.955	ENSLACG00000000668	-	76	35.319
ENSLACG00000014189	-	70	32.338	ENSLACG00000016517	-	96	32.338
ENSLACG00000014189	-	80	35.146	ENSLACG00000003957	-	82	35.021
ENSLACG00000014189	-	66	39.153	ENSLACG00000013182	-	93	37.209
ENSLACG00000014189	-	79	37.445	ENSLACG00000011580	-	92	37.445
ENSLACG00000014189	-	63	42.246	ENSLACG00000013072	-	77	42.246
ENSLACG00000014189	-	84	38.525	ENSLACG00000014952	-	78	38.843
ENSLACG00000014189	-	75	33.488	ENSLACG00000010092	-	99	32.068
ENSLACG00000014189	-	88	34.351	ENSLACG00000001077	-	99	35.659
ENSLACG00000014189	-	61	31.461	ENSLACG00000002891	-	82	31.461
ENSLACG00000014189	-	72	40.758	ENSLACG00000009393	-	91	40.758
ENSLACG00000014189	-	69	37.089	ENSLACG00000010569	-	94	37.089
ENSLACG00000014189	-	69	34.673	ENSLACG00000002135	-	87	34.673
ENSLACG00000014189	-	95	30.292	ENSLACG00000010346	-	83	31.301
ENSLACG00000014189	-	82	35.865	ENSLACG00000011390	-	87	35.865
ENSLACG00000014189	-	72	39.524	ENSLACG00000003145	-	92	39.524

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000014189	-	87	31.418	ENSACIG00000013512	-	63	34.146	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000014189	-	67	37.629	ENSAPEG00000022657	-	54	37.629	Amphiprion_percula
ENSLACG00000014189	-	67	31.088	ENSAPEG00000002130	-	58	31.088	Amphiprion_percula
ENSLACG00000014189	-	67	32.474	ENSAPEG00000013155	-	60	32.474	Amphiprion_percula
ENSLACG00000014189	-	57	31.977	ENSCVAG00000022290	-	50	31.977	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000014189	-	65	41.026	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	70	41.026	Danio_rerio
ENSLACG00000014189	-	72	31.132	ENSFHEG00000006296	-	59	31.132	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000014189	-	62	37.853	ENSKMAG00000012954	-	55	38.286	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000014189	-	84	33.610	ENSLBEG00000017145	-	71	33.617	Labrus_bergylta
ENSLACG00000014189	-	78	30.973	ENSMZEG00005020773	-	75	30.973	Maylandia_zebra
ENSLACG00000014189	-	57	33.918	ENSMZEG00005024824	-	54	33.918	Maylandia_zebra
ENSLACG00000014189	-	82	31.513	ENSONIG00000020618	-	94	31.092	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000014189	-	55	31.677	ENSONIG00000021329	-	70	31.677	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000014189	-	66	41.327	ENSORLG00000020512	-	64	41.538	Oryzias_latipes
ENSLACG00000014189	-	84	30.290	ENSOMEG00000019152	-	87	30.290	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000014189	-	76	35.160	ENSPKIG00000001458	-	77	36.364	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000014189	-	81	33.755	ENSPKIG00000009100	-	69	33.755	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000014189	-	51	34.000	ENSPMGG00000001874	-	55	33.544	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000014189	-	76	35.160	ENSPFOG00000020584	-	79	35.160	Poecilia_formosa
ENSLACG00000014189	-	82	31.405	ENSPFOG00000020560	-	84	32.589	Poecilia_formosa
ENSLACG00000014189	-	82	33.333	ENSPFOG00000020665	-	81	33.333	Poecilia_formosa
ENSLACG00000014189	-	83	30.802	ENSPFOG00000020071	-	88	30.802	Poecilia_formosa
ENSLACG00000014189	-	57	30.909	ENSPLAG00000016026	-	61	30.909	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000014189	-	82	32.906	ENSPMEG00000014224	-	69	34.804	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000014189	-	84	31.076	ENSPMEG00000022872	-	78	31.076	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000014189	-	82	37.021	ENSPNYG00000003325	-	69	38.222	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000014189	-	84	34.000	ENSPNAG00000017685	-	71	34.440	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000014189	-	80	38.095	ENSSLDG00000008663	-	85	38.095	Seriola_lalandi_dorsalis