EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000014769 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 950 bases
Position: chrJH126902.1:1097172-1098121
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000016764	Transposase_22	PF02994.14	3.2e-06	1	1
ENSLACP00000016763	Transposase_22	PF02994.14	1.6e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000016881	-	759	-	ENSLACP00000016763	253 (aa)	-	H3B4E2
ENSLACT00000016882	-	621	-	ENSLACP00000016764	207 (aa)	-	H3B4E3

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000014769's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000014769's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000014769	-	85	40.782	ENSLACG00000017411	-	69	42.857
ENSLACG00000014769	-	99	34.634	ENSLACG00000002471	-	70	34.615
ENSLACG00000014769	-	98	36.667	ENSLACG00000009806	-	74	34.951
ENSLACG00000014769	-	99	38.164	ENSLACG00000013987	-	56	45.033
ENSLACG00000014769	-	93	34.579	ENSLACG00000010900	-	57	41.447
ENSLACG00000014769	-	97	36.139	ENSLACG00000001077	-	62	41.447
ENSLACG00000014769	-	88	46.703	ENSLACG00000001384	-	89	44.505
ENSLACG00000014769	-	87	36.264	ENSLACG00000009013	-	55	36.264
ENSLACG00000014769	-	70	47.973	ENSLACG00000010080	-	65	46.711
ENSLACG00000014769	-	85	43.820	ENSLACG00000004508	-	56	45.695
ENSLACG00000014769	-	70	44.371	ENSLACG00000007342	-	72	44.371
ENSLACG00000014769	-	87	91.713	ENSLACG00000002051	-	69	92.021
ENSLACG00000014769	-	79	42.945	ENSLACG00000010633	-	94	42.771
ENSLACG00000014769	-	85	41.436	ENSLACG00000005344	-	55	45.455
ENSLACG00000014769	-	83	33.628	ENSLACG00000010859	-	70	39.683
ENSLACG00000014769	-	95	42.347	ENSLACG00000013090	-	97	41.379
ENSLACG00000014769	-	97	45.894	ENSLACG00000000643	-	85	45.894
ENSLACG00000014769	-	97	34.483	ENSLACG00000013538	-	93	34.466
ENSLACG00000014769	-	95	33.838	ENSLACG00000010705	-	83	33.168
ENSLACG00000014769	-	97	44.279	ENSLACG00000005266	-	72	43.269
ENSLACG00000014769	-	71	52.055	ENSLACG00000007535	-	85	52.055
ENSLACG00000014769	-	99	32.683	ENSLACG00000004272	-	98	32.683
ENSLACG00000014769	-	96	35.149	ENSLACG00000002189	-	87	36.364
ENSLACG00000014769	-	87	49.444	ENSLACG00000010144	-	66	49.444
ENSLACG00000014769	-	85	38.122	ENSLACG00000007340	-	64	40.909
ENSLACG00000014769	-	85	38.547	ENSLACG00000000425	-	94	37.368
ENSLACG00000014769	-	99	32.039	ENSLACG00000006865	-	74	32.039
ENSLACG00000014769	-	99	70.588	ENSLACG00000014189	-	73	70.335
ENSLACG00000014769	-	71	46.000	ENSLACG00000006210	-	59	46.000
ENSLACG00000014769	-	95	37.879	ENSLACG00000008859	-	79	37.198
ENSLACG00000014769	-	93	34.536	ENSLACG00000010569	-	75	37.059
ENSLACG00000014769	-	67	33.094	ENSLACG00000012896	-	51	33.094
ENSLACG00000014769	-	99	32.195	ENSLACG00000014493	-	68	32.195
ENSLACG00000014769	-	95	31.000	ENSLACG00000022180	-	83	30.542
ENSLACG00000014769	-	99	33.333	ENSLACG00000007821	-	69	33.333
ENSLACG00000014769	-	86	40.331	ENSLACG00000012229	-	61	45.333
ENSLACG00000014769	-	86	41.436	ENSLACG00000006110	-	69	45.455
ENSLACG00000014769	-	99	35.122	ENSLACG00000003451	-	90	35.122
ENSLACG00000014769	-	99	35.747	ENSLACG00000011390	-	57	44.595
ENSLACG00000014769	-	87	34.066	ENSLACG00000010092	-	86	32.683
ENSLACG00000014769	-	99	80.392	ENSLACG00000012357	-	87	80.193
ENSLACG00000014769	-	96	36.139	ENSLACG00000010019	-	85	36.139
ENSLACG00000014769	-	83	35.023	ENSLACG00000000534	-	56	42.282
ENSLACG00000014769	-	96	36.816	ENSLACG00000009393	-	85	36.058
ENSLACG00000014769	-	94	37.879	ENSLACG00000011265	-	82	36.585
ENSLACG00000014769	-	87	39.130	ENSLACG00000000077	-	57	43.624
ENSLACG00000014769	-	99	33.816	ENSLACG00000011150	-	75	33.816
ENSLACG00000014769	-	92	46.316	ENSLACG00000000673	-	74	46.316
ENSLACG00000014769	-	99	49.020	ENSLACG00000014474	-	77	50.239
ENSLACG00000014769	-	98	83.251	ENSLACG00000010165	-	78	83.333
ENSLACG00000014769	-	91	36.082	ENSLACG00000005009	-	65	41.722
ENSLACG00000014769	-	87	41.209	ENSLACG00000012198	-	64	46.667
ENSLACG00000014769	-	86	37.222	ENSLACG00000016955	-	82	33.175
ENSLACG00000014769	-	71	46.358	ENSLACG00000011552	-	70	40.212
ENSLACG00000014769	-	93	34.021	ENSLACG00000016319	-	73	34.021
ENSLACG00000014769	-	71	45.695	ENSLACG00000003217	-	68	40.107
ENSLACG00000014769	-	97	38.119	ENSLACG00000016396	-	69	37.441
ENSLACG00000014769	-	93	80.829	ENSLACG00000014732	-	86	80.829
ENSLACG00000014769	-	95	70.558	ENSLACG00000005368	-	93	70.558
ENSLACG00000014769	-	87	41.758	ENSLACG00000001559	-	51	47.333
ENSLACG00000014769	-	97	43.284	ENSLACG00000002451	-	77	42.453
ENSLACG00000014769	-	100	34.286	ENSLACG00000007888	-	84	34.286
ENSLACG00000014769	-	100	43.478	ENSLACG00000006813	-	80	44.444
ENSLACG00000014769	-	82	37.427	ENSLACG00000018384	-	67	46.721
ENSLACG00000014769	-	77	36.842	ENSLACG00000000903	-	51	46.087
ENSLACG00000014769	-	96	47.980	ENSLACG00000000907	-	94	46.341
ENSLACG00000014769	-	98	37.619	ENSLACG00000001298	-	65	45.033
ENSLACG00000014769	-	88	48.087	ENSLACG00000001295	-	79	47.872
ENSLACG00000014769	-	99	30.918	ENSLACG00000002651	-	85	30.918
ENSLACG00000014769	-	85	44.944	ENSLACG00000003957	-	52	47.020
ENSLACG00000014769	-	96	35.176	ENSLACG00000011580	-	79	34.673
ENSLACG00000014769	-	99	40.488	ENSLACG00000000876	-	66	51.701
ENSLACG00000014769	-	75	52.903	ENSLACG00000001055	-	71	51.235
ENSLACG00000014769	-	95	35.533	ENSLACG00000010346	-	71	34.135
ENSLACG00000014769	-	86	40.884	ENSLACG00000006820	-	56	46.358
ENSLACG00000014769	-	84	44.318	ENSLACG00000013472	-	78	40.000
ENSLACG00000014769	-	83	37.736	ENSLACG00000014952	-	51	46.358
ENSLACG00000014769	-	97	68.000	ENSLACG00000000369	-	73	68.116
ENSLACG00000014769	-	94	38.462	ENSLACG00000013182	-	69	45.513
ENSLACG00000014769	-	71	44.295	ENSLACG00000000465	-	60	44.295
ENSLACG00000014769	-	97	31.500	ENSLACG00000016517	-	95	31.500
ENSLACG00000014769	-	88	41.667	ENSLACG00000013072	-	61	47.333
ENSLACG00000014769	-	86	38.462	ENSLACG00000000848	-	78	34.615
ENSLACG00000014769	-	91	38.776	ENSLACG00000000668	-	50	44.000
ENSLACG00000014769	-	79	32.317	ENSLACG00000002891	-	75	30.994
ENSLACG00000014769	-	69	52.113	ENSLACG00000008643	-	82	52.113
ENSLACG00000014769	-	97	33.831	ENSLACG00000002135	-	91	31.651
ENSLACG00000014769	-	87	37.017	ENSLACG00000006473	-	79	33.659
ENSLACG00000014769	-	97	36.318	ENSLACG00000017727	-	86	34.951
ENSLACG00000014769	-	88	36.612	ENSLACG00000003145	-	80	36.957

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000014769	-	96	32.500	ENSAPEG00000013155	-	61	32.500	Amphiprion_percula
ENSLACG00000014769	-	96	31.500	ENSAPEG00000002130	-	60	31.500	Amphiprion_percula
ENSLACG00000014769	-	99	32.510	ENSAPEG00000023573	-	55	36.842	Amphiprion_percula
ENSLACG00000014769	-	99	32.510	ENSAPEG00000008945	-	55	36.842	Amphiprion_percula
ENSLACG00000014769	-	98	36.275	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	73	36.275	Danio_rerio
ENSLACG00000014769	-	93	33.333	ENSFHEG00000006296	-	58	33.010	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000014769	-	97	32.850	ENSLBEG00000017145	-	62	32.850	Labrus_bergylta
ENSLACG00000014769	-	97	31.579	ENSMZEG00005020773	-	65	31.401	Maylandia_zebra
ENSLACG00000014769	-	81	33.908	ENSMZEG00005024824	-	53	33.908	Maylandia_zebra
ENSLACG00000014769	-	70	32.877	ENSONIG00000021329	-	63	32.877	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000014769	-	91	30.366	ENSONIG00000020618	-	62	33.766	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000014769	-	99	39.024	ENSORLG00000020512	-	69	38.571	Oryzias_latipes
ENSLACG00000014769	-	89	30.435	ENSOMEG00000019152	-	61	34.568	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000014769	-	97	35.644	ENSPKIG00000009100	-	59	36.275	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000014769	-	99	37.198	ENSPKIG00000001458	-	77	36.190	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000014769	-	95	34.010	ENSPFOG00000020584	-	73	34.010	Poecilia_formosa
ENSLACG00000014769	-	96	33.000	ENSPFOG00000020560	-	75	33.000	Poecilia_formosa
ENSLACG00000014769	-	99	30.392	ENSPFOG00000020071	-	76	31.068	Poecilia_formosa
ENSLACG00000014769	-	99	32.212	ENSPFOG00000020665	-	73	33.178	Poecilia_formosa
ENSLACG00000014769	-	87	33.149	ENSPMEG00000014224	-	69	32.710	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000014769	-	97	40.796	ENSPNYG00000003325	-	64	39.904	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000014769	-	98	36.765	ENSPNAG00000017685	-	56	35.961	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000014769	-	82	39.904	ENSSLDG00000008663	-	75	39.423	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000014769	-	92	32.124	ENSXMAG00000029285	-	68	31.343	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000014769	-	65	36.957	ENSXMAG00000023095	-	51	32.143	Xiphophorus_maculatus