EuRBPDB

Description

RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000015328 (Gene tree)
Gene ID: 102364470
Gene Symbol: RYBP
Alias: AAP1|DEDAF|YEAF1
Full Name: RING1 and YY1 binding protein
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 105152 bases
Position: chrJH127051.1:1146835-1251986
Accession: 102364470
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000017401	zf-RanBP	PF00641.18	9.6e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000017529	RYBP-201	4675	XM_005998962	ENSLACP00000017401	237 (aa)	XP_005999024	H3B680

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000015328	RYBP	95	83.772	ENSG00000163602	RYBP	99	80.702	Homo_sapiens
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.064	ENSG00000015153	YAF2	98	80.000	Homo_sapiens
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSAMEG00000015131	RYBP	69	80.786	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000015328	RYBP	100	69.328	ENSACIG00000021280	rybpb	100	67.227	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	49.787	ENSACIG00000002635	YAF2	50	48.936	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	76.419	ENSAPEG00000021704	rybpb	83	73.684	Amphiprion_percula
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.913	ENSAPLG00000013882	RYBP	97	81.304	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000015328	RYBP	100	81.172	ENSACAG00000014789	RYBP	100	81.172	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSANAG00000027832	RYBP	100	81.590	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000015328	RYBP	99	76.695	ENSAMXG00000034604	rybpb	99	78.814	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.100	ENSBTAG00000022689	RYBP	100	81.172	Bos_taurus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSCJAG00000045849	RYBP	100	81.590	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.064	ENSCJAG00000017762	YAF2	85	78.947	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSCAFG00000006441	RYBP	90	80.786	Canis_familiaris
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSCAFG00020016734	RYBP	100	81.590	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.100	ENSCHIG00000026041	RYBP	100	81.172	Capra_hircus
ENSLACG00000015328	RYBP	95	83.700	ENSCPOG00000032177	RYBP	95	80.617	Cavia_porcellus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.064	ENSCCAG00000018849	YAF2	85	78.947	Cebus_capucinus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSCCAG00000025583	RYBP	100	81.590	Cebus_capucinus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.271	ENSCATG00000034263	YAF2	85	78.947	Cercocebus_atys
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSCATG00000034872	RYBP	100	81.590	Cercocebus_atys
ENSLACG00000015328	RYBP	95	83.772	ENSCLAG00000006008	RYBP	100	80.702	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSCSAG00000011518	RYBP	100	81.590	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000015328	RYBP	61	76.389	ENSCHOG00000011528	RYBP	99	71.528	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.477	ENSCPBG00000015509	YAF2	95	84.615	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.913	ENSCPBG00000006439	RYBP	88	81.304	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000015328	RYBP	99	80.498	ENSCANG00000013251	RYBP	100	77.593	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.271	ENSCANG00000042756	YAF2	85	78.947	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSCGRG00001020152	Rybp	100	81.590	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSCGRG00000009553	Rybp	90	80.786	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000015328	RYBP	99	47.660	ENSCSEG00000004331	YAF2	81	87.037	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000015328	RYBP	100	74.895	ENSCSEG00000007805	rybpb	100	69.874	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000015328	RYBP	99	71.705	ENSDARG00000053459	rybpb	100	74.319	Danio_rerio
ENSLACG00000015328	RYBP	95	78.070	ENSDORG00000015021	Rybp	96	75.000	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000015328	RYBP	96	80.786	ENSETEG00000015145	RYBP	100	80.786	Echinops_telfairi
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSEASG00005002228	RYBP	100	81.590	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSECAG00000000266	RYBP	100	81.590	Equus_caballus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	75.546	ENSEEUG00000011620	-	100	71.616	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000015328	RYBP	98	50.000	ENSELUG00000020855	yaf2	78	77.778	Esox_lucius
ENSLACG00000015328	RYBP	100	76.569	ENSELUG00000003503	rybpb	100	74.895	Esox_lucius
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSFCAG00000043691	RYBP	100	81.590	Felis_catus
ENSLACG00000015328	RYBP	95	84.141	ENSFALG00000013425	RYBP	84	81.304	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000015328	RYBP	97	81.897	ENSFDAG00000012183	RYBP	100	80.702	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000015328	RYBP	99	43.830	ENSFHEG00000005397	YAF2	100	47.881	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000015328	RYBP	68	92.000	ENSGMOG00000007374	rybpb	50	92.000	Gadus_morhua
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSGALG00000033025	RYBP	100	82.008	Gallus_gallus
ENSLACG00000015328	RYBP	92	66.667	ENSGACG00000011809	rybpb	56	94.118	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.478	ENSGAGG00000004755	RYBP	91	80.870	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000015328	RYBP	97	72.845	ENSHGLG00000009354	-	99	67.672	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSHGLG00000003273	RYBP	100	81.590	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSHGLG00100010608	-	96	80.702	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000015328	RYBP	97	72.845	ENSHGLG00100001264	-	99	67.672	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000015328	RYBP	99	46.186	ENSHCOG00000006027	YAF2	69	87.273	Hippocampus_comes
ENSLACG00000015328	RYBP	99	73.725	ENSIPUG00000001221	rybpb	99	75.745	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	57.692	ENSIPUG00000007091	rybpa	88	91.429	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000015328	RYBP	95	80.263	ENSSTOG00000000185	RYBP	100	80.263	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000015328	RYBP	95	83.772	ENSJJAG00000017045	Rybp	100	80.702	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	50.427	ENSKMAG00000005787	YAF2	80	88.889	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	79.151	ENSLOCG00000009980	rybpa	100	80.934	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	80.498	ENSMFAG00000001693	RYBP	100	77.593	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.271	ENSMFAG00000035590	YAF2	85	78.947	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSMMUG00000042444	RYBP	99	80.435	Macaca_mulatta
ENSLACG00000015328	RYBP	100	82.008	ENSMNEG00000010262	RYBP	100	79.079	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.271	ENSMNEG00000029487	YAF2	85	78.947	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000015328	RYBP	99	80.498	ENSMLEG00000038150	RYBP	100	77.593	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000015328	RYBP	98	82.553	ENSMAUG00000010834	Rybp	100	80.702	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.064	ENSMICG00000006755	YAF2	91	86.275	Microcebus_murinus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	74.895	ENSMOCG00000006750	-	100	74.477	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000015328	RYBP	95	83.333	ENSMOCG00000006102	-	100	80.263	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000015328	RYBP	90	52.093	ENSMMOG00000014622	YAF2	60	87.037	Mola_mola
ENSLACG00000015328	RYBP	100	73.750	ENSMMOG00000010572	rybpb	100	69.167	Mola_mola
ENSLACG00000015328	RYBP	96	82.174	ENSMODG00000003921	RYBP	88	82.174	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000015328	RYBP	100	73.529	ENSMALG00000008839	rybpb	100	68.908	Monopterus_albus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	MGP_CAROLIEiJ_G0028688	Rybp	100	81.590	Mus_caroli
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.489	ENSMUSG00000022634	Yaf2	75	88.235	Mus_musculus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSMUSG00000072872	Rybp	100	81.590	Mus_musculus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	MGP_PahariEiJ_G0022439	Rybp	100	81.590	Mus_pahari
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	MGP_SPRETEiJ_G0029716	Rybp	100	81.590	Mus_spretus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSMPUG00000017004	RYBP	99	80.786	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.100	ENSNGAG00000006529	Rybp	100	81.172	Nannospalax_galili
ENSLACG00000015328	RYBP	99	49.573	ENSNBRG00000020680	YAF2	77	85.185	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.406	ENSNLEG00000031222	RYBP	97	80.349	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000015328	RYBP	96	42.105	ENSMEUG00000012378	YAF2	84	84.211	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSODEG00000008699	RYBP	100	81.590	Octodon_degus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	82.008	ENSOANG00000011702	RYBP	100	82.008	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	84.279	ENSOCUG00000011730	RYBP	78	81.223	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	48.101	ENSORLG00000023863	yaf2	75	75.000	Oryzias_latipes
ENSLACG00000015328	RYBP	99	48.305	ENSORLG00020019706	yaf2	75	75.000	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000015328	RYBP	99	80.498	ENSPPAG00000039197	RYBP	100	77.593	Pan_paniscus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.064	ENSPPAG00000033805	YAF2	91	86.275	Pan_paniscus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSPPRG00000004794	RYBP	100	80.786	Panthera_pardus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSPTIG00000012035	RYBP	84	80.786	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.064	ENSPTRG00000004837	YAF2	91	86.275	Pan_troglodytes
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSPTRG00000051886	RYBP	100	81.590	Pan_troglodytes
ENSLACG00000015328	RYBP	99	51.271	ENSPANG00000012257	YAF2	85	78.947	Papio_anubis
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSPANG00000007988	RYBP	100	81.590	Papio_anubis
ENSLACG00000015328	RYBP	99	73.016	ENSPKIG00000021549	rybpb	100	72.908	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000015328	RYBP	98	48.069	ENSPKIG00000022643	YAF2	72	87.037	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000015328	RYBP	95	83.772	ENSPSIG00000011534	RYBP	94	81.140	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000015328	RYBP	97	47.639	ENSPMGG00000010767	YAF2	96	85.185	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	77.824	ENSPEMG00000017621	-	100	80.263	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSPPYG00000013718	-	75	80.786	Pongo_abelii
ENSLACG00000015328	RYBP	99	50.847	ENSPCOG00000021954	YAF2	85	78.947	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSPCOG00000025214	RYBP	100	81.590	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.406	ENSPVAG00000012905	RYBP	100	80.786	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	75.847	ENSPNAG00000026904	rybpb	99	77.966	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSRNOG00000005353	Rybp	85	80.786	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.913	ENSRBIG00000037631	RYBP	91	80.349	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000015328	RYBP	99	50.847	ENSRBIG00000028301	YAF2	84	70.175	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSRROG00000043276	RYBP	92	80.702	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000015328	RYBP	97	81.818	ENSSBOG00000024112	RYBP	97	79.736	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000015328	RYBP	98	48.148	ENSSFOG00015005147	YAF2	79	73.438	Scleropages_formosus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	50.638	ENSSLDG00000022945	YAF2	98	86.538	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000015328	RYBP	95	81.858	ENSSARG00000011312	RYBP	100	79.204	Sorex_araneus
ENSLACG00000015328	RYBP	99	81.435	ENSSPUG00000011547	RYBP	100	81.435	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000015328	RYBP	100	84.519	ENSSSCG00000025053	RYBP	100	81.590	Sus_scrofa
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.913	ENSTGUG00000009932	-	99	81.304	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000015328	RYBP	85	82.759	ENSTRUG00000009347	rybpb	53	89.474	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000015328	RYBP	89	50.711	ENSTRUG00000016786	YAF2	58	88.889	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSTBEG00000003789	RYBP	100	80.786	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSTTRG00000005375	RYBP	100	80.786	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000015328	RYBP	94	83.036	ENSUAMG00000008323	RYBP	99	79.911	Ursus_americanus
ENSLACG00000015328	RYBP	98	50.000	ENSUAMG00000016872	YAF2	90	80.769	Ursus_americanus
ENSLACG00000015328	RYBP	96	83.843	ENSUMAG00000024028	RYBP	76	80.786	Ursus_maritimus
ENSLACG00000015328	RYBP	59	74.820	ENSVPAG00000007715	RYBP	99	69.784	Vicugna_pacos
ENSLACG00000015328	RYBP	95	48.673	ENSVPAG00000012039	YAF2	79	84.444	Vicugna_pacos
ENSLACG00000015328	RYBP	95	83.772	ENSVVUG00000013920	RYBP	92	80.702	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000015328	RYBP	91	91.667	ENSXETG00000015914	rybp	54	91.667	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000015328	RYBP	80	64.000	ENSXCOG00000020837	YAF2	88	87.037	Xiphophorus_couchianus