EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000015338 (Gene tree)
Gene ID: 102355195
Gene Symbol: IPO5
Alias: IMB3|KPNB3|MGC2068|Pse1|RANBP5
Full Name: importin 5
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 61794 bases
Position: chrJH126683.1:1233254-1295047
Accession: 102355195
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000017413	IBN_N	PF03810.19	1.4e-05	1	1
ENSLACP00000017412	IBN_N	PF03810.19	1.5e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000017541	IPO5-202	3324	-	ENSLACP00000017413	1107 (aa)	-	H3B692
ENSLACT00000017540	IPO5-201	4314	XM_005992290	ENSLACP00000017412	1094 (aa)	XP_005992352	H3B691

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000015338	IPO5	99	89.551	ENSG00000065150	IPO5	99	89.570	Homo_sapiens
ENSLACG00000015338	IPO5	99	88.960	ENSACAG00000016245	-	99	88.960	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000015338	IPO5	99	89.459	ENSCJAG00000004323	IPO5	99	89.478	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000015338	IPO5	98	87.697	ENSTSYG00000005940	IPO5	99	87.385	Carlito_syrichta
ENSLACG00000015338	IPO5	95	89.489	ENSCATG00000038175	IPO5	99	89.489	Cercocebus_atys
ENSLACG00000015338	IPO5	91	89.138	ENSETEG00000000152	IPO5	89	89.138	Echinops_telfairi
ENSLACG00000015338	IPO5	99	89.551	ENSMFAG00000002597	IPO5	99	89.489	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000015338	IPO5	93	89.545	ENSMMUG00000013531	IPO5	99	89.545	Macaca_mulatta
ENSLACG00000015338	IPO5	95	89.489	ENSMNEG00000034763	IPO5	99	89.489	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000015338	IPO5	93	89.458	ENSMLEG00000028889	IPO5	99	89.458	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000015338	IPO5	98	89.410	ENSMAUG00000016575	-	100	89.410	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000015338	IPO5	95	85.862	ENSMICG00000012711	IPO5	99	85.862	Microcebus_murinus
ENSLACG00000015338	IPO5	98	89.488	ENSMODG00000008520	IPO5	95	89.488	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000015338	IPO5	99	86.929	ENSNGAG00000014885	Ipo5	99	86.953	Nannospalax_galili
ENSLACG00000015338	IPO5	88	91.684	ENSMEUG00000002867	IPO5	89	91.684	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000015338	IPO5	91	83.148	ENSOPRG00000015494	-	95	83.148	Ochotona_princeps
ENSLACG00000015338	IPO5	99	83.349	ENSODEG00000016371	-	99	83.349	Octodon_degus
ENSLACG00000015338	IPO5	99	87.008	ENSODEG00000019128	-	99	87.008	Octodon_degus
ENSLACG00000015338	IPO5	98	82.430	ENSODEG00000010941	-	100	82.430	Octodon_degus
ENSLACG00000015338	IPO5	98	89.552	ENSOANG00000005460	-	100	89.552	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000015338	IPO5	98	89.232	ENSOCUG00000003898	IPO5	100	89.232	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000015338	IPO5	95	88.693	ENSPTRG00000005984	IPO5	99	88.693	Pan_troglodytes
ENSLACG00000015338	IPO5	95	89.489	ENSPANG00000009971	IPO5	99	89.489	Papio_anubis
ENSLACG00000015338	IPO5	99	90.101	ENSPCIG00000027635	IPO5	99	90.525	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000015338	IPO5	93	88.739	ENSPCOG00000016473	IPO5	99	88.739	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000015338	IPO5	94	90.376	ENSRNOG00000010989	Ipo5	99	90.376	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000015338	IPO5	84	87.116	ENSRBIG00000036317	IPO5	100	87.116	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000015338	IPO5	92	86.895	ENSSBOG00000028024	IPO5	100	86.895	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000015338	IPO5	99	86.472	ENSSHAG00000001752	IPO5	99	86.472	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000015338	IPO5	94	88.623	ENSSPUG00000003786	IPO5	99	88.623	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000015338	IPO5	99	87.100	ENSTGUG00000011084	IPO5	99	87.100	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000015338	IPO5	91	89.177	ENSUAMG00000028286	IPO5	99	89.177	Ursus_americanus
ENSLACG00000015338	IPO5	100	88.171	ENSXETG00000023496	ipo5	99	89.214	Xenopus_tropicalis