EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000015989 (Gene tree)
Gene ID: 102349612
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 20520 bases
Position: chrJH126623.1:1420002-1440521
Accession: 102349612
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000018151	RRM_1	PF00076.22	8.2e-15	1	2
ENSLACP00000018151	RRM_1	PF00076.22	8.2e-15	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000018283	HTATSF1-201	2173	XM_005990341	ENSLACP00000018151	444 (aa)	XP_005990403	H3B8D0

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	65.746	ENSG00000102241	HTATSF1	100	62.948	Homo_sapiens
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.111	ENSAPOG00000009823	htatsf1	99	61.111	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.062	ENSACIG00000020459	htatsf1	99	61.726	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	58.696	ENSAOCG00000020994	htatsf1	99	59.783	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.956	ENSAPEG00000016432	htatsf1	99	59.913	Amphiprion_percula
ENSLACG00000015989	HTATSF1	85	66.150	ENSATEG00000008903	htatsf1	86	66.150	Anabas_testudineus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	90	67.233	ENSAPLG00000012401	HTATSF1	99	67.718	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	65.274	ENSACAG00000009346	HTATSF1	98	65.482	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.572	ENSACLG00000008096	htatsf1	99	61.978	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	60.085	ENSAMXG00000008387	htatsf1	99	60.860	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	85	63.351	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	50	63.684	Bos_taurus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	76	38.728	WBGene00022025	Y65B4A.1	76	39.031	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	66.316	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	50	66.316	Canis_familiaris
ENSLACG00000015989	HTATSF1	79	64.463	ENSCCAG00000025329	-	54	64.829	Cebus_capucinus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	66.374	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	100	66.740	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000015989	HTATSF1	78	47.500	ENSCING00000005914	-	86	47.354	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	44.722	ENSCSAVG00000000371	-	95	44.722	Ciona_savignyi
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.333	ENSCVAG00000014070	htatsf1	98	61.641	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.062	ENSDARG00000056649	htatsf1	99	61.062	Danio_rerio
ENSLACG00000015989	HTATSF1	83	44.737	FBgn0037081	barc	67	43.490	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000015989	HTATSF1	94	50.113	ENSEBUG00000001534	htatsf1	88	50.113	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	57.391	ENSELUG00000005486	htatsf1	90	59.259	Esox_lucius
ENSLACG00000015989	HTATSF1	85	64.660	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	50	65.000	Felis_catus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	63.956	ENSFALG00000003728	HTATSF1	100	63.956	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	62.168	ENSFHEG00000020286	htatsf1	99	62.168	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	65.205	ENSGMOG00000016444	htatsf1	100	65.205	Gadus_morhua
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	65.487	ENSGALG00000006410	HTATSF1	100	65.929	Gallus_gallus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.863	ENSGAFG00000003041	htatsf1	98	61.556	Gambusia_affinis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	58.520	ENSGACG00000020459	htatsf1	99	58.520	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.790	ENSHBUG00000004392	htatsf1	99	61.978	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	57.522	ENSHCOG00000009056	htatsf1	99	58.520	Hippocampus_comes
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	58.155	ENSIPUG00000017828	htatsf1	99	59.529	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	65.746	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	51	66.053	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.947	ENSKMAG00000007622	htatsf1	99	62.168	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.735	ENSLBEG00000001154	htatsf1	99	60.398	Labrus_bergylta
ENSLACG00000015989	HTATSF1	98	42.424	ENSLOCG00000015118	htatsf1	99	41.826	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	66.142	ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	66.142	Loxodonta_africana
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	65.193	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	55	65.526	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.560	ENSMAMG00000021225	htatsf1	100	59.170	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.572	ENSMZEG00005000485	htatsf1	99	61.758	Maylandia_zebra
ENSLACG00000015989	HTATSF1	92	67.221	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	98	67.221	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	66.851	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	50	67.368	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	64.384	ENSMICG00000009348	HTATSF1	51	64.675	Microcebus_murinus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	66.298	ENSMOCG00000023007	-	50	66.579	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000015989	HTATSF1	98	60.619	ENSMMOG00000011013	htatsf1	99	60.619	Mola_mola
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	63.883	ENSMODG00000014087	-	97	63.883	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000015989	HTATSF1	54	64.372	ENSMODG00000000199	-	97	64.372	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.050	ENSMALG00000019977	htatsf1	99	61.050	Monopterus_albus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	66.484	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	50	66.754	Mus_caroli
ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	64.286	ENSMLUG00000009234	-	51	64.286	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	65.746	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	51	65.969	Nannospalax_galili
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	60.475	ENSNBRG00000003818	htatsf1	99	61.555	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000015989	HTATSF1	91	65.770	ENSMEUG00000004133	-	97	65.770	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	60.259	ENSONIG00000008638	htatsf1	99	61.339	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	90	66.667	ENSOANG00000011674	-	99	66.667	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.780	ENSORLG00000002356	htatsf1	99	59.780	Oryzias_latipes
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.737	ENSORLG00020017818	htatsf1	96	59.870	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	60.132	ENSORLG00015002268	htatsf1	99	60.132	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	60.526	ENSOMEG00000007564	htatsf1	99	60.526	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	65.263	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	50	65.263	Panthera_pardus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	60.403	ENSPKIG00000024852	htatsf1	99	60.403	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000015989	HTATSF1	78	69.405	ENSPSIG00000010192	HTATSF1	99	69.405	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.477	ENSPMGG00000006172	htatsf1	99	59.477	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	97	61.609	ENSPCIG00000018896	-	97	61.609	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	93	65.083	ENSPCIG00000030173	-	95	65.311	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.333	ENSPFOG00000007871	htatsf1	96	61.333	Poecilia_formosa
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.419	ENSPLAG00000007532	htatsf1	99	61.419	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.556	ENSPMEG00000000352	htatsf1	99	61.556	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	62.084	ENSPREG00000007811	htatsf1	99	62.084	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000015989	HTATSF1	83	60.477	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	51	60.743	Procavia_capensis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	65.470	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	50	65.789	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000015989	HTATSF1	85	64.042	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	54	64.380	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.572	ENSPNYG00000016693	htatsf1	99	61.758	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.459	ENSPNAG00000006166	htatsf1	99	59.775	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000015989	HTATSF1	89	63.750	ENSSBOG00000027186	-	53	63.750	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	79	65.242	ENSSBOG00000017914	-	51	63.010	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	85	68.848	ENSSHAG00000006440	-	97	69.841	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000015989	HTATSF1	97	63.205	ENSSHAG00000018908	-	97	63.205	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000015989	HTATSF1	85	66.844	ENSSFOG00015012002	htatsf1	99	58.458	Scleropages_formosus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	60.394	ENSSMAG00000002970	htatsf1	99	60.659	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	58.352	ENSSDUG00000020002	htatsf1	99	58.797	Seriola_dumerili
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.283	ENSSLDG00000016880	htatsf1	99	61.283	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	88	61.832	ENSSARG00000005193	HTATSF1	53	61.832	Sorex_araneus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	66.225	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	99	66.372	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.649	ENSSPAG00000000732	htatsf1	99	60.175	Stegastes_partitus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	80	66.851	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	56	65.633	Sus_scrofa
ENSLACG00000015989	HTATSF1	98	64.206	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	99	64.653	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	59.688	ENSTRUG00000013383	htatsf1	99	60.356	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	61.778	ENSTNIG00000016140	htatsf1	99	61.778	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	77	65.607	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	58	65.607	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	66.053	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	50	66.053	Ursus_americanus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	62.389	ENSXETG00000019749	htatsf1	85	62.389	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	57.563	ENSXCOG00000006912	htatsf1	97	62.381	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000015989	HTATSF1	99	62.585	ENSXMAG00000000490	htatsf1	99	62.585	Xiphophorus_maculatus