EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000016319 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 773 bases
Position: chrJH126573.1:1530542-1531314
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000018536	Transposase_22	PF02994.14	3.4e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000018669	-	753	-	ENSLACP00000018536	251 (aa)	-	H3B9G5

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000016319's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000016319's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000016319	-	74	36.500	ENSLACG00000002451	-	72	36.500
ENSLACG00000016319	-	73	32.124	ENSLACG00000010144	-	70	32.124
ENSLACG00000016319	-	73	30.319	ENSLACG00000006110	-	84	30.319
ENSLACG00000016319	-	95	31.325	ENSLACG00000014474	-	89	31.325
ENSLACG00000016319	-	67	35.393	ENSLACG00000017411	-	84	35.393
ENSLACG00000016319	-	75	30.366	ENSLACG00000001055	-	80	30.366
ENSLACG00000016319	-	87	32.287	ENSLACG00000000369	-	77	32.287
ENSLACG00000016319	-	95	30.196	ENSLACG00000016396	-	87	30.196
ENSLACG00000016319	-	74	30.653	ENSLACG00000000673	-	75	30.653
ENSLACG00000016319	-	75	33.508	ENSLACG00000010080	-	79	33.508
ENSLACG00000016319	-	51	33.077	ENSLACG00000008643	-	73	33.077
ENSLACG00000016319	-	66	34.911	ENSLACG00000012198	-	72	34.911
ENSLACG00000016319	-	67	37.430	ENSLACG00000014189	-	62	37.430
ENSLACG00000016319	-	73	32.338	ENSLACG00000012357	-	84	33.333
ENSLACG00000016319	-	94	32.157	ENSLACG00000001559	-	83	32.157
ENSLACG00000016319	-	54	31.655	ENSLACG00000007342	-	68	31.655
ENSLACG00000016319	-	63	31.902	ENSLACG00000007340	-	69	31.902
ENSLACG00000016319	-	71	35.829	ENSLACG00000014732	-	82	35.829
ENSLACG00000016319	-	73	34.021	ENSLACG00000005368	-	91	34.021
ENSLACG00000016319	-	75	32.828	ENSLACG00000000425	-	98	32.828
ENSLACG00000016319	-	74	30.526	ENSLACG00000012229	-	76	30.526
ENSLACG00000016319	-	73	34.021	ENSLACG00000014769	-	93	34.021
ENSLACG00000016319	-	71	30.851	ENSLACG00000002051	-	68	31.383
ENSLACG00000016319	-	68	31.818	ENSLACG00000003145	-	79	31.818
ENSLACG00000016319	-	53	34.559	ENSLACG00000007535	-	78	34.559
ENSLACG00000016319	-	74	30.693	ENSLACG00000006210	-	79	30.693
ENSLACG00000016319	-	74	34.673	ENSLACG00000005266	-	67	34.673
ENSLACG00000016319	-	96	31.783	ENSLACG00000014952	-	83	31.783
ENSLACG00000016319	-	73	35.567	ENSLACG00000000643	-	79	35.567
ENSLACG00000016319	-	75	30.882	ENSLACG00000010859	-	76	30.882
ENSLACG00000016319	-	75	30.392	ENSLACG00000011552	-	76	30.392
ENSLACG00000016319	-	82	38.249	ENSLACG00000022180	-	89	38.249
ENSLACG00000016319	-	75	38.384	ENSLACG00000007888	-	81	38.384
ENSLACG00000016319	-	78	31.163	ENSLACG00000003217	-	78	31.163
ENSLACG00000016319	-	74	36.500	ENSLACG00000013090	-	94	36.500
ENSLACG00000016319	-	75	30.583	ENSLACG00000004508	-	76	30.583
ENSLACG00000016319	-	76	30.198	ENSLACG00000013987	-	75	30.198
ENSLACG00000016319	-	95	32.129	ENSLACG00000010165	-	85	32.129
ENSLACG00000016319	-	81	75.481	ENSLACG00000013538	-	98	75.481
ENSLACG00000016319	-	64	37.349	ENSLACG00000000465	-	66	37.349
ENSLACG00000016319	-	71	30.220	ENSLACG00000002891	-	82	30.220
ENSLACG00000016319	-	72	30.270	ENSLACG00000013072	-	75	30.270
ENSLACG00000016319	-	72	31.088	ENSLACG00000006473	-	74	31.088
ENSLACG00000016319	-	74	31.472	ENSLACG00000013472	-	77	31.472
ENSLACG00000016319	-	90	30.894	ENSLACG00000003957	-	84	30.894
ENSLACG00000016319	-	63	31.928	ENSLACG00000000848	-	69	31.928
ENSLACG00000016319	-	70	33.333	ENSLACG00000001295	-	76	33.333
ENSLACG00000016319	-	86	30.213	ENSLACG00000001298	-	95	30.213
ENSLACG00000016319	-	61	34.756	ENSLACG00000010633	-	96	35.088