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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSLACG00000016657 (Gene tree)
Gene ID: 102352484
Gene Symbol: IPO13
Alias: IMP13|KIAA0724|RANBP13
Full Name: importin 13
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 80080 bases
Position: chrJH126762.1:1668206-1748285
Accession: 16853
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000018934	Xpo1	PF08389.12	1.6e-28	1	1
ENSLACP00000018934	IBN_N	PF03810.19	1.9e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000019067	IPO13-201	3079	-	ENSLACP00000018934	965 (aa)	-	H3BAL3

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000016657	IPO13	83	32.778	ENSLACG00000002351	TNPO3	98	32.778

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSG00000117408	IPO13	97	79.852	Homo_sapiens
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.331	ENSAPOG00000003308	ipo13	98	77.331	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	61.870	ENSAPOG00000022358	si:ch73-182a11.2	98	61.780	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSAMEG00000001123	IPO13	97	79.427	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000016657	IPO13	96	75.676	ENSACIG00000008146	ipo13	100	75.784	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	61.801	ENSACIG00000011776	si:ch73-182a11.2	98	61.801	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	60.625	ENSAOCG00000024622	si:ch73-182a11.2	97	60.540	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.225	ENSAOCG00000004943	ipo13	98	77.225	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.225	ENSAPEG00000011282	ipo13	98	77.225	Amphiprion_percula
ENSLACG00000016657	IPO13	98	60.625	ENSAPEG00000001137	si:ch73-182a11.2	97	60.540	Amphiprion_percula
ENSLACG00000016657	IPO13	98	60.606	ENSATEG00000001251	si:ch73-182a11.2	99	60.774	Anabas_testudineus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	76.695	ENSATEG00000018367	ipo13	98	76.695	Anabas_testudineus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	82.471	ENSAPLG00000001349	IPO13	98	82.471	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000016657	IPO13	99	81.432	ENSACAG00000014300	IPO13	98	82.609	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSANAG00000034183	IPO13	97	79.852	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000016657	IPO13	98	62.227	ENSACLG00000013726	si:ch73-182a11.2	98	62.033	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000016657	IPO13	96	76.699	ENSACLG00000011458	ipo13	100	76.699	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000016657	IPO13	99	56.740	ENSAMXG00000006313	si:ch73-182a11.2	99	56.740	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	78.473	ENSAMXG00000005200	ipo13	98	78.473	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSBTAG00000018887	IPO13	97	79.427	Bos_taurus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSCJAG00000007453	IPO13	97	79.852	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSCAFG00000004875	IPO13	97	79.427	Canis_familiaris
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSCAFG00020017359	IPO13	97	79.427	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSCHIG00000008341	IPO13	97	79.427	Capra_hircus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.745	ENSTSYG00000035980	IPO13	97	79.745	Carlito_syrichta
ENSLACG00000016657	IPO13	86	84.394	ENSCAPG00000001972	IPO13	97	83.000	Cavia_aperea
ENSLACG00000016657	IPO13	97	79.421	ENSCPOG00000012445	IPO13	96	79.421	Cavia_porcellus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.745	ENSCCAG00000022035	IPO13	97	79.745	Cebus_capucinus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSCATG00000041276	IPO13	97	79.852	Cercocebus_atys
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.533	ENSCLAG00000002914	IPO13	97	79.533	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSCSAG00000001190	IPO13	97	79.852	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000016657	IPO13	95	81.650	ENSCPBG00000003471	IPO13	100	81.650	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000016657	IPO13	98	35.460	ENSCING00000001863	-	99	35.356	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000016657	IPO13	97	35.863	ENSCSAVG00000001368	-	99	35.804	Ciona_savignyi
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSCANG00000009091	IPO13	97	79.852	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.321	ENSCGRG00001021177	Ipo13	97	79.321	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.321	ENSCGRG00000012411	Ipo13	97	79.321	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000016657	IPO13	98	75.422	ENSCSEG00000007713	ipo13	98	75.448	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000016657	IPO13	98	56.625	ENSCSEG00000016612	si:ch73-182a11.2	97	56.684	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.542	ENSCVAG00000013039	ipo13	98	77.542	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000016657	IPO13	94	59.287	ENSCVAG00000007910	si:ch73-182a11.2	98	59.027	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	78.791	ENSDARG00000060618	ipo13	98	78.791	Danio_rerio
ENSLACG00000016657	IPO13	98	59.514	ENSDARG00000076996	si:ch73-182a11.2	99	59.514	Danio_rerio
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.639	ENSDNOG00000016583	IPO13	97	79.639	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.639	ENSDORG00000005471	Ipo13	97	79.639	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000016657	IPO13	98	63.674	ENSEBUG00000006281	ipo13	100	63.209	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSEASG00005001738	IPO13	97	79.427	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSECAG00000015508	IPO13	97	79.427	Equus_caballus
ENSLACG00000016657	IPO13	67	79.389	ENSEEUG00000011681	IPO13	80	79.389	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	58.793	ENSELUG00000003341	si:ch73-182a11.2	97	58.075	Esox_lucius
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.013	ENSELUG00000001498	ipo13	98	77.013	Esox_lucius
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.639	ENSFCAG00000006488	IPO13	97	79.639	Felis_catus
ENSLACG00000016657	IPO13	95	81.759	ENSFALG00000005368	IPO13	100	81.759	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSFDAG00000015599	IPO13	97	79.427	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000016657	IPO13	97	61.644	ENSFHEG00000015719	si:ch73-182a11.2	97	61.385	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.436	ENSFHEG00000023271	ipo13	98	77.436	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000016657	IPO13	97	53.700	ENSGMOG00000016863	si:ch73-182a11.2	97	53.605	Gadus_morhua
ENSLACG00000016657	IPO13	98	76.825	ENSGMOG00000015856	ipo13	97	76.825	Gadus_morhua
ENSLACG00000016657	IPO13	98	82.291	ENSGALG00000010087	IPO13	98	82.291	Gallus_gallus
ENSLACG00000016657	IPO13	97	60.651	ENSGAFG00000011643	si:ch73-182a11.2	97	60.546	Gambusia_affinis
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.542	ENSGAFG00000006361	ipo13	98	77.542	Gambusia_affinis
ENSLACG00000016657	IPO13	97	61.246	ENSGACG00000016242	si:ch73-182a11.2	97	61.158	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	75.767	ENSGACG00000014562	ipo13	97	75.767	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	81.560	ENSGAGG00000008331	IPO13	99	81.560	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSGGOG00000016375	IPO13	97	79.852	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.200	ENSHBUG00000018605	ipo13	100	75.620	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000016657	IPO13	98	61.290	ENSHBUG00000015271	si:ch73-182a11.2	97	61.100	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSHGLG00000001822	IPO13	97	79.427	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSHGLG00100015830	IPO13	97	79.427	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000016657	IPO13	98	73.403	ENSHCOG00000018408	ipo13	98	73.789	Hippocampus_comes
ENSLACG00000016657	IPO13	97	58.324	ENSHCOG00000005273	si:ch73-182a11.2	100	58.324	Hippocampus_comes
ENSLACG00000016657	IPO13	98	76.988	ENSIPUG00000011283	IPO13	97	76.988	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	54.228	ENSIPUG00000010787	si:ch73-182a11.2	98	54.171	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSSTOG00000003611	IPO13	97	79.852	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.639	ENSJJAG00000018591	Ipo13	97	79.639	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000016657	IPO13	97	76.603	ENSKMAG00000007869	ipo13	97	76.603	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000016657	IPO13	97	62.185	ENSKMAG00000006041	si:ch73-182a11.2	97	62.185	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000016657	IPO13	99	74.923	ENSLBEG00000007442	ipo13	97	76.266	Labrus_bergylta
ENSLACG00000016657	IPO13	97	60.106	ENSLBEG00000011390	si:ch73-182a11.2	98	59.831	Labrus_bergylta
ENSLACG00000016657	IPO13	98	74.737	ENSLOCG00000010620	ipo13	98	74.737	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.907	ENSLAFG00000017144	IPO13	97	77.907	Loxodonta_africana
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSMFAG00000032846	IPO13	97	79.852	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSMMUG00000015142	IPO13	97	79.852	Macaca_mulatta
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSMNEG00000041971	IPO13	97	79.852	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.852	ENSMLEG00000044330	IPO13	97	79.852	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.094	ENSMAMG00000017290	ipo13	98	77.119	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	62.080	ENSMAMG00000000328	si:ch73-182a11.2	98	62.029	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	62.227	ENSMZEG00005009283	si:ch73-182a11.2	98	62.033	Maylandia_zebra
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.094	ENSMZEG00005019335	ipo13	98	77.094	Maylandia_zebra
ENSLACG00000016657	IPO13	98	80.912	ENSMGAG00000009898	IPO13	100	80.700	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000016657	IPO13	81	80.616	ENSMAUG00000013018	Ipo13	97	80.616	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	68.538	ENSMICG00000011003	IPO13	97	71.716	Microcebus_murinus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.745	ENSMOCG00000008881	Ipo13	97	79.745	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000016657	IPO13	98	74.628	ENSMMOG00000001954	ipo13	99	74.628	Mola_mola
ENSLACG00000016657	IPO13	98	59.563	ENSMMOG00000018046	si:ch73-182a11.2	99	59.440	Mola_mola
ENSLACG00000016657	IPO13	95	79.587	ENSMODG00000003017	IPO13	100	79.587	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000016657	IPO13	96	74.838	ENSMALG00000010805	ipo13	100	74.838	Monopterus_albus
ENSLACG00000016657	IPO13	81	60.327	ENSMALG00000006451	si:ch73-182a11.2	92	62.618	Monopterus_albus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.533	MGP_CAROLIEiJ_G0026367	Ipo13	97	79.533	Mus_caroli
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	ENSMUSG00000033365	Ipo13	97	79.427	Mus_musculus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	80.237	MGP_PahariEiJ_G0028698	Ipo13	96	81.744	Mus_pahari
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.427	MGP_SPRETEiJ_G0027339	Ipo13	97	79.427	Mus_spretus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	73.878	ENSMPUG00000013635	IPO13	97	73.878	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.745	ENSMLUG00000006360	IPO13	97	79.745	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000016657	IPO13	98	79.533	ENSNGAG00000013019	Ipo13	97	79.533	Nannospalax_galili
ENSLACG00000016657	IPO13	98	52.862	ENSNBRG00000006781	si:ch73-182a11.2	97	52.862	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000016657	IPO13	98	77.200	ENSNBRG00000023538	ipo13	98	77.200	Neolamprologus_brichardi
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