EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000016741 (Gene tree)
Gene ID: 102351393
Gene Symbol: PTRH1
Alias: C9orf115|PTH1
Full Name: peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6971 bases
Position: chrJH126677.1:1710206-1717176
Accession: 102351393
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000019026	Pept_tRNA_hydro	PF01195.19	3.1e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000019159	PTRH1-201	1222	XM_005992107	ENSLACP00000019026	242 (aa)	XP_005992169	H3BAV5

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000016741's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000016741's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSG00000187024	PTRH1	90	58.031	Homo_sapiens
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	59.375	ENSAPOG00000000947	PTRH1	68	59.375	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	59.375	ENSAPOG00000010719	ptrh1	68	59.375	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	59.375	ENSAPOG00000003014	-	68	59.375	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	53.968	ENSAMEG00000016791	PTRH1	90	53.968	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000016741	PTRH1	69	62.500	ENSACIG00000006734	ptrh1	72	62.500	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	59.375	ENSAOCG00000009725	ptrh1	68	59.375	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	59.375	ENSAPEG00000020993	ptrh1	68	59.375	Amphiprion_percula
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.947	ENSATEG00000010003	ptrh1	68	58.947	Anabas_testudineus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	59.162	ENSANAG00000025547	PTRH1	89	59.162	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	62.209	ENSACLG00000025462	ptrh1	74	59.574	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000016741	PTRH1	77	59.596	ENSAMXG00000034117	ptrh1	74	59.596	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000016741	PTRH1	64	56.250	ENSBTAG00000012736	PTRH1	57	56.250	Bos_taurus
ENSLACG00000016741	PTRH1	76	59.459	ENSCJAG00000019841	PTRH1	69	58.730	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000016741	PTRH1	87	53.774	ENSCAFG00000020123	PTRH1	96	53.774	Canis_familiaris
ENSLACG00000016741	PTRH1	87	54.028	ENSCAFG00020015776	PTRH1	92	54.028	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	57.732	ENSCHIG00000008188	PTRH1	91	57.732	Capra_hircus
ENSLACG00000016741	PTRH1	55	59.091	ENSCAPG00000015926	PTRH1	95	59.091	Cavia_aperea
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	57.143	ENSCPOG00000023968	PTRH1	88	57.143	Cavia_porcellus
ENSLACG00000016741	PTRH1	84	56.863	ENSCCAG00000023134	PTRH1	95	56.863	Cebus_capucinus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSCATG00000042852	PTRH1	90	58.031	Cercocebus_atys
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	57.672	ENSCLAG00000011155	PTRH1	88	57.672	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSCSAG00000013748	PTRH1	85	58.031	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000016741	PTRH1	72	58.857	ENSCPBG00000025207	PTRH1	99	58.857	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSCANG00000039856	PTRH1	90	58.031	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000016741	PTRH1	84	56.311	ENSCGRG00001013108	Ptrh1	99	56.311	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000016741	PTRH1	76	58.919	ENSCGRG00000016553	Ptrh1	99	58.919	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	55.556	ENSCSEG00000010332	ptrh1	69	55.556	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	59.884	ENSCVAG00000010701	ptrh1	71	56.477	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	55.556	ENSDARG00000098206	ptrh1	80	55.556	Danio_rerio
ENSLACG00000016741	PTRH1	73	59.091	ENSDNOG00000024194	PTRH1	82	59.091	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	57.436	ENSDORG00000013321	Ptrh1	91	57.436	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	59.794	ENSEASG00005020466	PTRH1	91	59.794	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000016741	PTRH1	75	61.878	ENSECAG00000007615	PTRH1	67	61.878	Equus_caballus
ENSLACG00000016741	PTRH1	75	59.116	ENSELUG00000015467	ptrh1	68	59.116	Esox_lucius
ENSLACG00000016741	PTRH1	77	57.219	ENSFCAG00000001483	PTRH1	88	57.219	Felis_catus
ENSLACG00000016741	PTRH1	72	57.714	ENSFALG00000001352	PTRH1	83	57.714	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	56.614	ENSFDAG00000020077	PTRH1	93	56.614	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	58.549	ENSFHEG00000010590	ptrh1	75	57.000	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000016741	PTRH1	85	56.585	ENSGAFG00000016215	ptrh1	86	56.585	Gambusia_affinis
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	61.628	ENSGACG00000014682	ptrh1	96	60.000	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000016741	PTRH1	74	60.556	ENSGAGG00000022860	PTRH1	80	60.556	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSGGOG00000011033	PTRH1	90	58.031	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	62.209	ENSHBUG00000020824	ptrh1	67	59.574	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	57.143	ENSHGLG00000019147	PTRH1	93	57.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	53.684	ENSHGLG00100003681	PTRH1	95	53.684	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000016741	PTRH1	82	55.779	ENSHCOG00000014772	ptrh1	76	55.779	Hippocampus_comes
ENSLACG00000016741	PTRH1	73	63.277	ENSIPUG00000015364	ptrh1	69	63.277	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000016741	PTRH1	70	60.588	ENSSTOG00000008942	PTRH1	88	57.143	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000016741	PTRH1	83	54.950	ENSJJAG00000014338	Ptrh1	92	57.143	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000016741	PTRH1	73	61.932	ENSKMAG00000003253	ptrh1	64	61.932	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000016741	PTRH1	55	64.925	ENSLBEG00000028842	ptrh1	79	64.925	Labrus_bergylta
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	53.927	ENSLAFG00000021934	PTRH1	94	53.927	Loxodonta_africana
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSMFAG00000001700	PTRH1	90	58.031	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSMMUG00000016424	PTRH1	90	58.031	Macaca_mulatta
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSMNEG00000033061	PTRH1	85	58.031	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000016741	PTRH1	74	61.111	ENSMAMG00000017386	ptrh1	73	57.711	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	61.628	ENSMZEG00005020001	ptrh1	74	59.043	Maylandia_zebra
ENSLACG00000016741	PTRH1	84	56.311	ENSMAUG00000006266	Ptrh1	99	56.311	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000016741	PTRH1	87	55.450	ENSMICG00000005611	PTRH1	98	55.450	Microcebus_murinus
ENSLACG00000016741	PTRH1	82	57.214	ENSMOCG00000013992	Ptrh1	99	57.214	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000016741	PTRH1	72	62.644	ENSMMOG00000014747	ptrh1	66	59.375	Mola_mola
ENSLACG00000016741	PTRH1	82	56.500	ENSMODG00000005503	PTRH1	92	56.500	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000016741	PTRH1	51	65.041	ENSMALG00000005392	ptrh1	72	65.041	Monopterus_albus
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	57.216	MGP_CAROLIEiJ_G0023450	Ptrh1	95	57.216	Mus_caroli
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	57.216	ENSMUSG00000053746	Ptrh1	95	57.216	Mus_musculus
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	57.216	MGP_PahariEiJ_G0024907	Ptrh1	95	57.216	Mus_pahari
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	57.732	MGP_SPRETEiJ_G0024367	Ptrh1	95	57.732	Mus_spretus
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	55.497	ENSMPUG00000013790	PTRH1	88	55.497	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	53.922	ENSMLUG00000013454	PTRH1	92	53.922	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000016741	PTRH1	75	57.459	ENSNGAG00000014008	Ptrh1	89	57.459	Nannospalax_galili
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	62.209	ENSNBRG00000015590	ptrh1	67	59.574	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	57.513	ENSNLEG00000017468	PTRH1	90	57.513	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	56.085	ENSODEG00000004012	PTRH1	90	56.085	Octodon_degus
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	62.209	ENSONIG00000013912	ptrh1	72	59.574	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000016741	PTRH1	65	62.420	ENSOANG00000011891	PTRH1	78	59.091	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	57.292	ENSOCUG00000006894	PTRH1	83	57.292	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000016741	PTRH1	77	59.358	ENSOGAG00000008094	PTRH1	89	59.358	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	49.756	ENSOARG00000011808	PTRH1	92	49.756	Ovis_aries
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSPPAG00000041782	PTRH1	90	58.031	Pan_paniscus
ENSLACG00000016741	PTRH1	77	57.219	ENSPPRG00000007889	PTRH1	88	57.219	Panthera_pardus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSPTRG00000021394	PTRH1	90	58.031	Pan_troglodytes
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	50.000	ENSPANG00000031755	PTRH1	90	50.000	Papio_anubis
ENSLACG00000016741	PTRH1	84	56.158	ENSPKIG00000005449	ptrh1	66	56.158	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000016741	PTRH1	77	56.989	ENSPSIG00000013828	PTRH1	67	56.989	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	53.448	ENSPMGG00000002148	ptrh1	68	50.785	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000016741	PTRH1	65	63.057	ENSPEMG00000014360	Ptrh1	86	59.659	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	58.031	ENSPFOG00000003715	ptrh1	72	58.031	Poecilia_formosa
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	59.585	ENSPLAG00000023354	ptrh1	76	59.585	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	58.031	ENSPMEG00000000447	ptrh1	72	58.031	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	59.585	ENSPREG00000012612	ptrh1	72	59.585	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000016741	PTRH1	91	52.252	ENSPPYG00000019628	PTRH1	97	52.252	Pongo_abelii
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	58.421	ENSPCAG00000007016	PTRH1	88	58.421	Procavia_capensis
ENSLACG00000016741	PTRH1	81	57.071	ENSPCOG00000014541	PTRH1	92	57.071	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	59.278	ENSPVAG00000000954	PTRH1	91	59.278	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	61.628	ENSPNYG00000007789	ptrh1	67	59.043	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000016741	PTRH1	73	63.636	ENSPNAG00000029930	ptrh1	66	63.636	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	57.216	ENSRNOG00000049034	Ptrh1	95	57.216	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSRBIG00000027290	PTRH1	90	58.031	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSRROG00000028799	PTRH1	85	58.031	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000016741	PTRH1	67	31.765	YHR189W	PTH1	87	31.765	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.031	ENSSBOG00000026699	PTRH1	84	58.639	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000016741	PTRH1	73	59.669	ENSSHAG00000018238	PTRH1	88	59.669	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000016741	PTRH1	73	63.842	ENSSFOG00015007053	ptrh1	83	66.071	Scleropages_formosus
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	56.701	ENSSMAG00000016747	ptrh1	83	56.345	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000016741	PTRH1	71	59.884	ENSSDUG00000013471	ptrh1	94	57.627	Seriola_dumerili
ENSLACG00000016741	PTRH1	69	61.310	ENSSLDG00000024662	ptrh1	83	57.672	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000016741	PTRH1	74	58.659	ENSSPUG00000000040	PTRH1	79	58.659	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000016741	PTRH1	77	57.754	ENSSPAG00000003298	ptrh1	87	60.345	Stegastes_partitus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	58.115	ENSSSCG00000005615	PTRH1	89	58.115	Sus_scrofa
ENSLACG00000016741	PTRH1	55	65.672	ENSTGUG00000003648	PTRH1	100	65.672	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	60.638	ENSTRUG00000019801	PTRH1	69	60.638	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	58.031	ENSTNIG00000016735	ptrh1	86	58.031	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000016741	PTRH1	78	53.968	ENSTTRG00000016458	PTRH1	88	53.968	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	57.292	ENSUAMG00000023948	-	86	57.292	Ursus_americanus
ENSLACG00000016741	PTRH1	74	47.191	ENSVPAG00000001805	PTRH1	98	47.191	Vicugna_pacos
ENSLACG00000016741	PTRH1	79	55.440	ENSVVUG00000013198	PTRH1	87	55.440	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000016741	PTRH1	77	56.989	ENSXETG00000009980	ptrh1	99	56.989	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000016741	PTRH1	76	58.919	ENSXCOG00000011498	ptrh1	78	58.919	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000016741	PTRH1	80	57.513	ENSXMAG00000009256	ptrh1	72	57.513	Xiphophorus_maculatus