EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000016857 (Gene tree)
Gene ID: 102363089
Gene Symbol: -
Alias: zgc:92772
Full Name: ras-related protein Rab-11B
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11744 bases
Position: chrJH126613.1:1776000-1787743
Accession: 102363089
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000019161	MMR_HSR1	PF01926.23	2.2e-07	1	1
ENSLACP00000019162	MMR_HSR1	PF01926.23	1.1e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000019295	-	684	-	ENSLACP00000019162	228 (aa)	-	H3BB91
ENSLACT00000019294	-	1703	XM_005989853	ENSLACP00000019161	218 (aa)	XP_005989915	H3BB90

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000016857's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm04144	Endocytosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000016857's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000016857	-	100	88.532	ENSLACG00000012184	RAB11A	100	88.532
ENSLACG00000016857	-	64	34.286	ENSLACG00000018793	RAN	93	34.286
ENSLACG00000016857	-	83	36.066	ENSLACG00000011557	zgc:101559	79	36.066
ENSLACG00000016857	-	80	52.299	ENSLACG00000011181	RAB14	81	52.299
ENSLACG00000016857	-	83	37.705	ENSLACG00000012674	si:dkey-34d22.5	87	37.705
ENSLACG00000016857	-	74	54.321	ENSLACG00000014446	RAB2B	98	54.321
ENSLACG00000016857	-	72	43.312	ENSLACG00000007092	RAB22A	81	43.312
ENSLACG00000016857	-	80	44.134	ENSLACG00000008103	-	98	44.134
ENSLACG00000016857	-	74	36.420	ENSLACG00000004025	RAB23	76	35.912
ENSLACG00000016857	-	73	32.099	ENSLACG00000003581	rasd3	77	32.919
ENSLACG00000016857	-	70	39.103	ENSLACG00000017799	RAB36	58	39.103
ENSLACG00000016857	-	57	37.600	ENSLACG00000010885	-	82	37.600
ENSLACG00000016857	-	68	32.468	ENSLACG00000014985	RAP2B	88	34.337
ENSLACG00000016857	-	72	35.669	ENSLACG00000013980	rab41	74	35.669
ENSLACG00000016857	-	79	47.126	ENSLACG00000016074	RAB39B	82	47.126
ENSLACG00000016857	-	74	47.531	ENSLACG00000009310	rab18a	78	47.531
ENSLACG00000016857	-	96	46.411	ENSLACG00000012717	RAB1B	99	46.411
ENSLACG00000016857	-	75	34.146	ENSLACG00000012088	rheb	91	33.136
ENSLACG00000016857	-	72	36.943	ENSLACG00000016518	-	50	36.943
ENSLACG00000016857	-	96	40.000	ENSLACG00000006407	RAB30	97	40.000
ENSLACG00000016857	-	80	46.893	ENSLACG00000002332	-	83	46.893
ENSLACG00000016857	-	78	32.941	ENSLACG00000017464	KRAS	93	34.066
ENSLACG00000016857	-	95	38.679	ENSLACG00000010461	RAB12	82	38.679
ENSLACG00000016857	-	74	39.506	ENSLACG00000022111	-	81	39.752
ENSLACG00000016857	-	95	48.585	ENSLACG00000012521	RAB2A	99	48.585
ENSLACG00000016857	-	68	35.333	ENSLACG00000018427	HRAS	85	36.420
ENSLACG00000016857	-	70	34.839	ENSLACG00000018428	NRAS	87	35.928
ENSLACG00000016857	-	77	44.379	ENSLACG00000011256	rab18b	82	44.379
ENSLACG00000016857	-	78	38.636	ENSLACG00000013571	RAB33B	81	37.368
ENSLACG00000016857	-	94	43.204	ENSLACG00000004663	RAB5A	90	43.204
ENSLACG00000016857	-	99	78.341	ENSLACG00000011380	rab11al	99	78.341
ENSLACG00000016857	-	88	34.197	ENSLACG00000005168	RAB6A	88	34.197
ENSLACG00000016857	-	57	30.827	ENSLACG00000015350	ARL4C	64	30.827
ENSLACG00000016857	-	81	40.331	ENSLACG00000018444	RAB35	99	37.850
ENSLACG00000016857	-	85	34.737	ENSLACG00000016958	-	88	34.737
ENSLACG00000016857	-	72	30.573	ENSLACG00000013122	RRAS2	88	30.726
ENSLACG00000016857	-	76	37.427	ENSLACG00000002523	RAB29	83	37.427
ENSLACG00000016857	-	70	33.974	ENSLACG00000001081	RAB34	60	33.974
ENSLACG00000016857	-	72	39.877	ENSLACG00000008809	zgc:100918	79	39.877
ENSLACG00000016857	-	77	41.040	ENSLACG00000017891	RAB9B	81	41.040
ENSLACG00000016857	-	95	37.915	ENSLACG00000012755	-	98	37.915
ENSLACG00000016857	-	79	32.948	ENSLACG00000017138	RRAS	99	32.948
ENSLACG00000016857	-	79	34.615	ENSLACG00000003722	rabl2	76	34.615
ENSLACG00000016857	-	99	46.512	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	46.512
ENSLACG00000016857	-	72	39.877	ENSLACG00000015770	RAB7A	78	39.877
ENSLACG00000016857	-	80	35.795	ENSLACG00000010042	-	85	36.264
ENSLACG00000016857	-	57	31.783	ENSLACG00000003905	ARL4D	65	31.579
ENSLACG00000016857	-	78	100.000	ENSLACG00000016974	RAB11B	99	100.000
ENSLACG00000016857	-	100	67.431	ENSLACG00000011157	RAB25	100	67.431

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSAPOG00000023455	rab11bb	100	97.248	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSACIG00000024376	-	100	97.706	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000016857	-	100	84.862	ENSACIG00000019631	rab11bb	100	84.862	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSAOCG00000018239	rab11bb	100	97.248	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSAOCG00000018849	-	100	97.706	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSAPEG00000016590	rab11bb	100	97.248	Amphiprion_percula
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSATEG00000023725	-	100	97.248	Anabas_testudineus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSATEG00000017696	rab11bb	100	97.248	Anabas_testudineus
ENSLACG00000016857	-	96	99.043	ENSAPLG00000011046	-	96	99.043	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSACLG00000005446	-	100	97.706	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSACLG00000007076	rab11bb	100	97.248	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSAMXG00000037623	-	100	97.706	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSAMXG00000042655	rab11bb	100	98.624	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSBTAG00000002475	RAB11B	100	98.624	Bos_taurus
ENSLACG00000016857	-	96	96.651	ENSCHIG00000022426	-	98	92.793	Capra_hircus
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSCATG00000029188	-	100	98.624	Cercocebus_atys
ENSLACG00000016857	-	100	100.000	ENSCPBG00000017056	-	100	100.000	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSCSEG00000012149	rab11bb	100	97.248	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSCSEG00000007239	-	100	97.248	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSCVAG00000017021	-	100	97.248	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSCVAG00000019718	-	100	96.789	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000016857	-	100	95.413	ENSCVAG00000019751	-	100	95.413	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000016857	-	100	98.165	ENSDARG00000090086	rab11bb	100	98.165	Danio_rerio
ENSLACG00000016857	-	99	96.313	ENSETEG00000000905	-	99	96.313	Echinops_telfairi
ENSLACG00000016857	-	99	94.884	ENSEASG00005003708	-	99	94.884	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000016857	-	99	94.884	ENSECAG00000000716	RAB11B	99	94.884	Equus_caballus
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSELUG00000020948	-	98	98.438	Esox_lucius
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSELUG00000021148	rab11bb	100	97.248	Esox_lucius
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSELUG00000000916	-	100	96.789	Esox_lucius
ENSLACG00000016857	-	100	100.000	ENSFALG00000011828	-	100	100.000	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSFHEG00000022676	-	100	97.248	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSFHEG00000018353	rab11bb	100	97.248	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000016857	-	99	93.519	ENSGMOG00000009668	-	99	93.519	Gadus_morhua
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSGMOG00000009211	rab11bb	100	97.248	Gadus_morhua
ENSLACG00000016857	-	100	100.000	ENSGALG00000000613	RAB11B	100	100.000	Gallus_gallus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSGAFG00000007102	rab11bb	100	97.248	Gambusia_affinis
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSGACG00000015479	rab11bb	100	96.789	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000016857	-	100	95.413	ENSGACG00000013297	-	99	95.413	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSGGOG00000014516	RAB11B	100	98.624	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSHBUG00000009947	-	100	97.706	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSHBUG00000014777	rab11bb	100	97.248	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000016857	-	100	95.413	ENSHCOG00000000954	-	100	95.413	Hippocampus_comes
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSHCOG00000002423	rab11bb	100	97.706	Hippocampus_comes
ENSLACG00000016857	-	100	92.202	ENSHCOG00000000985	-	100	92.202	Hippocampus_comes
ENSLACG00000016857	-	100	98.165	ENSIPUG00000019927	rab11bb	100	98.165	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000016857	-	100	98.165	ENSIPUG00000025100	rab11b	100	98.165	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSKMAG00000006170	-	100	97.706	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSKMAG00000009033	rab11bb	100	97.248	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSLBEG00000004172	-	100	97.248	Labrus_bergylta
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSLBEG00000015248	rab11bb	100	96.789	Labrus_bergylta
ENSLACG00000016857	-	100	89.908	ENSLBEG00000005981	-	100	89.908	Labrus_bergylta
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSMFAG00000003654	RAB11B	100	98.624	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSMLEG00000030601	-	100	98.624	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSMAMG00000006378	rab11bb	100	96.789	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000016857	-	100	96.330	ENSMAMG00000018533	-	100	96.330	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSMZEG00005003352	rab11bb	100	97.248	Maylandia_zebra
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSMZEG00005010975	-	100	97.706	Maylandia_zebra
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSMICG00000034065	-	100	98.624	Microcebus_murinus
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSMMOG00000001250	-	100	97.706	Mola_mola
ENSLACG00000016857	-	99	96.313	ENSMMOG00000001238	-	99	96.313	Mola_mola
ENSLACG00000016857	-	94	98.049	ENSMMOG00000007917	rab11bb	100	98.049	Mola_mola
ENSLACG00000016857	-	100	100.000	ENSMODG00000003841	-	100	100.000	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSMALG00000022187	rab11bb	100	97.248	Monopterus_albus
ENSLACG00000016857	-	94	89.372	ENSMLUG00000006677	-	100	89.372	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSNBRG00000000372	rab11bb	100	97.248	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSNBRG00000023885	-	100	97.706	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000016857	-	100	100.000	ENSMEUG00000003686	-	100	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSONIG00000010435	rab11bb	100	97.248	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSONIG00000002544	-	100	97.706	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000016857	-	50	98.165	ENSOANG00000031567	-	81	95.575	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSORLG00000013938	rab11bb	100	96.789	Oryzias_latipes
ENSLACG00000016857	-	99	95.853	ENSORLG00000015284	-	72	95.853	Oryzias_latipes
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSORLG00020019393	rab11bb	100	96.789	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000016857	-	99	95.853	ENSORLG00020020844	RAB11B	99	95.853	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSORLG00015020173	rab11bb	100	96.789	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000016857	-	99	95.853	ENSORLG00015016999	RAB11B	99	95.853	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSOMEG00000017806	-	100	97.248	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSOMEG00000002562	-	100	96.789	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSPPAG00000028589	-	100	98.624	Pan_paniscus
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSPTRG00000010422	RAB11B	100	98.624	Pan_troglodytes
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSPANG00000007765	-	100	98.624	Papio_anubis
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSPKIG00000011703	-	100	98.624	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000016857	-	98	98.131	ENSPKIG00000001389	-	69	98.131	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSPKIG00000011640	rab11bb	100	97.248	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000016857	-	98	94.521	ENSPSIG00000010242	-	85	94.521	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000016857	-	99	93.548	ENSPMGG00000014336	-	99	93.548	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000016857	-	100	95.872	ENSPMGG00000014333	-	100	95.872	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSPMGG00000009435	rab11bb	100	97.248	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000016857	-	97	97.642	ENSPCIG00000020371	-	99	97.642	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSPFOG00000024114	-	100	97.248	Poecilia_formosa
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSPFOG00000006224	-	100	97.706	Poecilia_formosa
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSPLAG00000001598	rab11bb	100	97.248	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSPLAG00000014207	-	100	97.706	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSPMEG00000007842	-	100	97.706	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSPMEG00000012389	rab11bb	100	97.248	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSPREG00000014269	rab11bb	100	97.248	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSPREG00000006336	-	100	97.248	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSPNYG00000019611	-	100	97.706	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSPNYG00000004098	rab11bb	100	97.248	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSRROG00000037812	-	100	98.624	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000016857	-	97	98.113	ENSSHAG00000006816	-	97	98.113	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000016857	-	100	98.624	ENSSFOG00015009042	rab11bb	100	98.624	Scleropages_formosus
ENSLACG00000016857	-	100	73.394	ENSSFOG00015006245	-	100	73.394	Scleropages_formosus
ENSLACG00000016857	-	100	94.037	ENSSMAG00000018613	-	100	94.037	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000016857	-	100	96.789	ENSSMAG00000004922	rab11bb	100	96.789	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSSDUG00000002934	-	100	97.706	Seriola_dumerili
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSSDUG00000013558	rab11bb	100	97.248	Seriola_dumerili
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSSLDG00000020676	rab11bb	100	97.248	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSSLDG00000005275	-	100	97.706	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000016857	-	100	99.541	ENSSPUG00000002243	-	100	99.541	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSSPAG00000014559	-	100	97.706	Stegastes_partitus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSSPAG00000011419	rab11bb	100	97.248	Stegastes_partitus
ENSLACG00000016857	-	100	100.000	ENSTGUG00000000084	-	100	100.000	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000016857	-	99	95.392	ENSTRUG00000021614	-	99	95.392	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000016857	-	99	97.685	ENSTRUG00000021619	-	100	97.685	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSTRUG00000022029	rab11bb	100	97.248	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000016857	-	100	96.330	ENSTNIG00000011081	rab11bb	100	96.330	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000016857	-	99	94.931	ENSTNIG00000013184	-	99	94.931	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000016857	-	99	97.685	ENSTNIG00000013182	-	100	97.685	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000016857	-	93	96.059	ENSTNIG00000002003	-	100	96.059	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000016857	-	94	98.537	ENSUAMG00000006639	-	99	98.537	Ursus_americanus
ENSLACG00000016857	-	100	98.630	ENSXETG00000025484	rab11b.1	99	98.630	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSXCOG00000008042	-	100	97.248	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000016857	-	100	97.706	ENSXCOG00000009190	-	100	97.706	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSXMAG00000024840	-	100	97.248	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000016857	-	100	97.248	ENSXMAG00000011926	rab11bb	100	97.248	Xiphophorus_maculatus