EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000016888 (Gene tree)
Gene ID: 102352992
Gene Symbol: AGO4
Alias: EIF2C4|FLJ20033|KIAA1567|hAGO4
Full Name: argonaute 4%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 37641 bases
Position: chrJH126588.1:1794271-1831911
Accession: 102352992
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000019198	PAZ	PF02170.22	1.6e-28	1	1
ENSLACP00000019198	Piwi	PF02171.17	1.5e-105	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000019331	AGO4-201	2843	XM_005988507	ENSLACP00000019198	861 (aa)	XP_005988569	H3BBC7

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000016888	AGO4	100	73.103	ENSLACG00000001277	-	99	73.103
ENSLACG00000016888	AGO4	99	78.388	ENSLACG00000017009	AGO1	99	78.388

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSG00000134698	AGO4	100	98.490	Homo_sapiens
ENSLACG00000016888	AGO4	96	96.420	ENSAPOG00000023867	ago4	99	96.420	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.021	ENSAMEG00000000573	AGO4	100	98.021	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.111	ENSACIG00000014548	ago4	100	98.111	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000016888	AGO4	92	93.577	ENSAPEG00000022426	ago4	100	93.577	Amphiprion_percula
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.453	ENSATEG00000006717	ago4	100	96.770	Anabas_testudineus
ENSLACG00000016888	AGO4	98	98.819	ENSAPLG00000010882	AGO4	100	98.819	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.544	ENSACAG00000017275	AGO4	99	97.544	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.374	ENSANAG00000031428	AGO4	100	98.374	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	ENSACLG00000005181	ago4	100	96.339	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	ENSAMXG00000010318	ago4	100	96.599	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.552	ENSBTAG00000015220	AGO4	99	97.552	Bos_taurus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSCJAG00000001610	AGO4	100	98.490	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.615	ENSCAFG00000024306	AGO4	100	98.615	Canis_familiaris
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.606	ENSCHIG00000026564	AGO4	100	98.606	Capra_hircus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.480	ENSTSYG00000014007	AGO4	100	98.480	Carlito_syrichta
ENSLACG00000016888	AGO4	94	93.960	ENSCAPG00000009369	AGO4	100	93.960	Cavia_aperea
ENSLACG00000016888	AGO4	99	96.051	ENSCPOG00000011557	AGO4	99	96.051	Cavia_porcellus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSCCAG00000001397	AGO4	100	98.490	Cebus_capucinus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSCATG00000043421	AGO4	100	99.483	Cercocebus_atys
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.244	ENSCLAG00000012097	AGO4	100	98.244	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSCSAG00000001090	AGO4	100	98.490	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000016888	AGO4	80	99.410	ENSCHOG00000006867	AGO4	81	99.410	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.713	ENSCPBG00000018602	AGO4	98	98.713	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.480	ENSCANG00000016914	AGO4	100	98.480	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.142	ENSCGRG00001002701	Ago4	100	98.142	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.126	ENSCGRG00000013335	Ago4	100	98.126	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000016888	AGO4	92	91.960	ENSCSEG00000010696	ago4	100	91.960	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.567	ENSDARG00000100854	ago4	100	97.567	Danio_rerio
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.374	ENSDNOG00000015674	AGO4	100	98.374	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSDORG00000008933	Ago4	100	98.490	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000016888	AGO4	60	99.015	ENSETEG00000018390	AGO4	83	99.015	Echinops_telfairi
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSEASG00005012079	AGO4	100	98.490	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSECAG00000024686	AGO4	100	98.490	Equus_caballus
ENSLACG00000016888	AGO4	79	95.053	ENSEEUG00000000745	AGO4	79	95.053	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	95.558	ENSELUG00000023873	ago4	100	95.558	Esox_lucius
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.606	ENSFCAG00000006218	AGO4	100	98.606	Felis_catus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.478	ENSFDAG00000021483	AGO4	100	98.478	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000016888	AGO4	97	88.876	ENSFHEG00000019658	ago4	100	88.876	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.206	ENSGMOG00000009544	ago4	99	97.206	Gadus_morhua
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.722	ENSGALG00000039713	AGO4	100	98.866	Gallus_gallus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.110	ENSGAFG00000017239	ago4	100	96.110	Gambusia_affinis
ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.558	ENSGACG00000002683	ago4	99	97.558	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.866	ENSGAGG00000012897	AGO4	100	98.866	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000016888	AGO4	99	95.182	ENSGGOG00000036532	AGO4	100	95.182	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	ENSHBUG00000001525	ago4	100	96.339	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSHGLG00000010241	AGO4	100	98.490	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.588	ENSHGLG00100005233	AGO4	99	98.588	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	ENSHCOG00000003725	ago4	100	96.224	Hippocampus_comes
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	ENSIPUG00000015600	ago4	100	96.224	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.488	ENSSTOG00000004725	AGO4	100	98.488	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	ENSKMAG00000018602	ago4	100	96.224	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	95.909	ENSLBEG00000010670	ago4	100	95.909	Labrus_bergylta
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.678	ENSLOCG00000000584	ago4	100	96.678	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000016888	AGO4	93	98.127	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	98.127	Loxodonta_africana
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSMFAG00000035543	AGO4	100	98.490	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.252	ENSMMUG00000003343	AGO4	100	99.206	Macaca_mulatta
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSMNEG00000037723	AGO4	100	99.206	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.478	ENSMLEG00000039490	AGO4	100	98.478	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	ENSMAMG00000003874	ago4	100	96.491	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	ENSMZEG00005026346	ago4	100	96.339	Maylandia_zebra
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.363	ENSMGAG00000003851	AGO4	99	98.363	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000016888	AGO4	82	100.000	ENSMAUG00000021743	Ago4	99	95.707	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.246	ENSMICG00000033507	AGO4	100	98.246	Microcebus_murinus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.142	ENSMOCG00000005772	Ago4	100	98.142	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000016888	AGO4	92	97.229	ENSMMOG00000013473	ago4	100	97.229	Mola_mola
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.839	ENSMODG00000017888	AGO4	100	98.839	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000016888	AGO4	99	96.037	ENSMALG00000011797	ago4	100	96.037	Monopterus_albus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.677	MGP_CAROLIEiJ_G0026479	Ago4	100	97.677	Mus_caroli
ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.561	ENSMUSG00000042500	Ago4	100	97.561	Mus_musculus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.329	MGP_PahariEiJ_G0028810	Ago4	100	97.329	Mus_pahari
ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.445	MGP_SPRETEiJ_G0027458	Ago4	100	97.445	Mus_spretus
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.615	ENSMPUG00000014876	AGO4	100	98.615	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.664	ENSMLUG00000017102	AGO4	98	97.664	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.478	ENSNGAG00000020544	Ago4	100	98.478	Nannospalax_galili
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	ENSNBRG00000013492	ago4	100	96.339	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.478	ENSNLEG00000011125	AGO4	100	98.478	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000016888	AGO4	90	97.231	ENSMEUG00000001023	AGO4	90	97.231	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000016888	AGO4	99	91.335	ENSOPRG00000012309	AGO4	100	91.335	Ochotona_princeps
ENSLACG00000016888	AGO4	93	98.496	ENSODEG00000006355	AGO4	97	98.496	Octodon_degus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	ENSONIG00000013603	ago4	100	96.339	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.992	ENSOANG00000002082	AGO4	100	98.992	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.374	ENSOCUG00000004076	AGO4	100	98.374	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.453	ENSORLG00000009865	ago4	92	96.453	Oryzias_latipes
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.453	ENSORLG00020016978	ago4	92	96.453	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.453	ENSORLG00015008800	ago4	92	96.453	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.453	ENSOMEG00000006399	ago4	100	96.453	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000016888	AGO4	93	97.372	ENSOGAG00000004233	-	100	97.372	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000016888	AGO4	100	90.244	ENSOGAG00000027107	-	100	90.244	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.788	ENSOARG00000019568	AGO4	98	97.788	Ovis_aries
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.478	ENSPPAG00000031752	AGO4	100	98.478	Pan_paniscus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.606	ENSPPRG00000006520	AGO4	100	98.606	Panthera_pardus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.595	ENSPTIG00000020262	AGO4	100	98.595	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSPTRG00000000527	AGO4	100	98.490	Pan_troglodytes
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.615	ENSPANG00000007232	AGO4	100	98.615	Papio_anubis
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	ENSPKIG00000022598	ago4	100	96.224	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.713	ENSPSIG00000013832	AGO4	99	98.713	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000016888	AGO4	92	97.985	ENSPMGG00000023325	ago4	100	97.985	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000016888	AGO4	88	100.000	ENSPEMG00000022651	-	97	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.839	ENSPCIG00000000092	AGO4	100	98.839	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	ENSPFOG00000001935	ago4	100	96.224	Poecilia_formosa
ENSLACG00000016888	AGO4	100	97.451	ENSPLAG00000011534	ago4	100	97.451	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	ENSPMEG00000005049	ago4	100	96.224	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	ENSPREG00000010315	ago4	100	96.224	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.478	ENSPPYG00000001552	AGO4	100	98.478	Pongo_abelii
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.246	ENSPCOG00000015935	AGO4	100	98.246	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000016888	AGO4	87	100.000	ENSPVAG00000005079	AGO4	88	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	ENSPNYG00000002089	ago4	100	96.339	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.987	ENSPNAG00000005191	ago4	100	96.987	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000016888	AGO4	69	97.822	ENSRNOG00000025596	Ago4	100	97.822	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.415	ENSRBIG00000040185	AGO4	100	99.206	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.615	ENSRROG00000035783	AGO4	100	98.615	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000016888	AGO4	99	94.529	ENSSBOG00000026529	AGO4	100	98.415	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000016888	AGO4	99	98.142	ENSSHAG00000017320	AGO4	100	98.142	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	ENSSFOG00015022028	ago4	100	96.522	Scleropages_formosus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	93.966	ENSSMAG00000000808	ago4	93	95.730	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	95.470	ENSSDUG00000020781	ago4	100	97.607	Seriola_dumerili
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.111	ENSSLDG00000021841	ago4	100	98.111	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000016888	AGO4	79	99.000	ENSSARG00000011504	AGO4	79	99.000	Sorex_araneus
ENSLACG00000016888	AGO4	100	98.490	ENSSPUG00000000889	AGO4	100	98.490	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	93.176	ENSTGUG00000001631	AGO4	99	92.442	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.339	ENSTRUG00000008052	ago4	100	96.339	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000016888	AGO4	99	97.666	ENSTNIG00000006331	ago4	99	97.666	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000016888	AGO4	77	100.000	ENSTBEG00000016478	AGO4	77	100.000	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000016888	AGO4	99	94.731	ENSTTRG00000015086	AGO4	100	94.731	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.615	ENSUAMG00000027156	-	100	98.615	Ursus_americanus
ENSLACG00000016888	AGO4	99	96.391	ENSUMAG00000006297	AGO4	99	95.333	Ursus_maritimus
ENSLACG00000016888	AGO4	88	97.892	ENSVPAG00000006662	AGO4	100	97.892	Vicugna_pacos
ENSLACG00000016888	AGO4	92	98.615	ENSVVUG00000000465	-	100	98.615	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000016888	AGO4	100	85.383	ENSXETG00000009664	ago4	100	85.383	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000016888	AGO4	100	96.224	ENSXMAG00000016657	ago4	100	96.224	Xiphophorus_maculatus