EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000016955 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 790 bases
Position: chrJH126642.1:1828206-1828995
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000019274	Transposase_22	PF02994.14	4.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000019408	-	771	-	ENSLACP00000019274	257 (aa)	-	H3BBK3

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000016955's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000016955's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000016955	-	73	44.681	ENSLACG00000000077	-	71	44.681
ENSLACG00000016955	-	58	34.211	ENSLACG00000000534	-	57	34.641
ENSLACG00000016955	-	72	35.484	ENSLACG00000010705	-	76	35.484
ENSLACG00000016955	-	58	38.158	ENSLACG00000010859	-	56	38.158
ENSLACG00000016955	-	73	33.673	ENSLACG00000012229	-	79	33.673
ENSLACG00000016955	-	69	38.889	ENSLACG00000000673	-	69	38.889
ENSLACG00000016955	-	100	69.962	ENSLACG00000014493	-	88	69.962
ENSLACG00000016955	-	62	37.107	ENSLACG00000002051	-	66	35.556
ENSLACG00000016955	-	57	39.456	ENSLACG00000007535	-	85	39.456
ENSLACG00000016955	-	72	35.484	ENSLACG00000009013	-	56	35.484
ENSLACG00000016955	-	70	38.889	ENSLACG00000000876	-	75	38.889
ENSLACG00000016955	-	100	59.091	ENSLACG00000007821	-	88	59.091
ENSLACG00000016955	-	97	31.325	ENSLACG00000010165	-	90	31.325
ENSLACG00000016955	-	72	31.980	ENSLACG00000000425	-	100	31.980
ENSLACG00000016955	-	69	35.028	ENSLACG00000013182	-	86	32.642
ENSLACG00000016955	-	93	31.301	ENSLACG00000002451	-	89	31.301
ENSLACG00000016955	-	58	39.474	ENSLACG00000010080	-	65	39.474
ENSLACG00000016955	-	70	36.264	ENSLACG00000009806	-	65	36.264
ENSLACG00000016955	-	73	33.673	ENSLACG00000006110	-	88	33.673
ENSLACG00000016955	-	79	34.975	ENSLACG00000001055	-	89	34.975
ENSLACG00000016955	-	80	83.962	ENSLACG00000010900	-	80	83.962
ENSLACG00000016955	-	83	42.523	ENSLACG00000011265	-	82	42.523
ENSLACG00000016955	-	73	34.694	ENSLACG00000004508	-	73	34.694
ENSLACG00000016955	-	73	42.781	ENSLACG00000003145	-	82	42.781
ENSLACG00000016955	-	84	82.028	ENSLACG00000006473	-	82	82.028
ENSLACG00000016955	-	95	31.325	ENSLACG00000005344	-	85	31.325
ENSLACG00000016955	-	72	35.870	ENSLACG00000014732	-	81	35.870
ENSLACG00000016955	-	68	32.787	ENSLACG00000007340	-	77	32.787
ENSLACG00000016955	-	57	37.162	ENSLACG00000007342	-	72	37.162
ENSLACG00000016955	-	89	32.479	ENSLACG00000001298	-	98	32.479
ENSLACG00000016955	-	79	33.824	ENSLACG00000001295	-	79	33.824
ENSLACG00000016955	-	71	37.158	ENSLACG00000000369	-	64	37.158
ENSLACG00000016955	-	95	33.068	ENSLACG00000014474	-	90	33.068
ENSLACG00000016955	-	83	36.916	ENSLACG00000010569	-	82	36.916
ENSLACG00000016955	-	81	45.192	ENSLACG00000017727	-	86	45.192
ENSLACG00000016955	-	74	42.408	ENSLACG00000000848	-	78	42.932
ENSLACG00000016955	-	66	31.111	ENSLACG00000017411	-	84	31.111
ENSLACG00000016955	-	86	32.579	ENSLACG00000006813	-	83	32.579
ENSLACG00000016955	-	80	43.204	ENSLACG00000011580	-	82	43.204
ENSLACG00000016955	-	70	33.516	ENSLACG00000013987	-	67	33.516
ENSLACG00000016955	-	83	34.722	ENSLACG00000014952	-	70	34.722
ENSLACG00000016955	-	100	84.791	ENSLACG00000010346	-	89	84.791
ENSLACG00000016955	-	92	33.740	ENSLACG00000001559	-	81	33.740
ENSLACG00000016955	-	82	33.175	ENSLACG00000014769	-	86	37.222
ENSLACG00000016955	-	83	35.514	ENSLACG00000012357	-	86	35.514
ENSLACG00000016955	-	70	35.714	ENSLACG00000012198	-	75	35.714
ENSLACG00000016955	-	73	31.980	ENSLACG00000001077	-	80	31.980
ENSLACG00000016955	-	67	43.931	ENSLACG00000005009	-	74	43.931
ENSLACG00000016955	-	84	69.907	ENSLACG00000003451	-	93	69.907
ENSLACG00000016955	-	73	39.153	ENSLACG00000018384	-	96	39.153
ENSLACG00000016955	-	83	33.796	ENSLACG00000013472	-	78	33.796
ENSLACG00000016955	-	71	39.011	ENSLACG00000005368	-	86	39.011
ENSLACG00000016955	-	74	33.854	ENSLACG00000013072	-	78	33.854
ENSLACG00000016955	-	64	35.366	ENSLACG00000010633	-	94	35.542
ENSLACG00000016955	-	86	33.628	ENSLACG00000011552	-	81	33.628
ENSLACG00000016955	-	86	32.444	ENSLACG00000003217	-	79	32.444
ENSLACG00000016955	-	79	62.019	ENSLACG00000004272	-	99	62.019
ENSLACG00000016955	-	62	35.503	ENSLACG00000000465	-	68	35.503
ENSLACG00000016955	-	96	69.919	ENSLACG00000011150	-	88	69.919
ENSLACG00000016955	-	95	32.800	ENSLACG00000000668	-	81	32.800
ENSLACG00000016955	-	56	34.965	ENSLACG00000008643	-	82	34.965
ENSLACG00000016955	-	74	42.932	ENSLACG00000009393	-	82	42.932
ENSLACG00000016955	-	84	34.862	ENSLACG00000006210	-	82	34.862
ENSLACG00000016955	-	70	36.667	ENSLACG00000005266	-	62	36.667
ENSLACG00000016955	-	70	34.184	ENSLACG00000011390	-	76	34.184
ENSLACG00000016955	-	89	61.017	ENSLACG00000002651	-	97	61.017
ENSLACG00000016955	-	95	32.932	ENSLACG00000006820	-	88	32.932
ENSLACG00000016955	-	74	78.307	ENSLACG00000002135	-	84	78.307
ENSLACG00000016955	-	78	84.951	ENSLACG00000010092	-	87	84.951
ENSLACG00000016955	-	71	33.333	ENSLACG00000000907	-	89	33.333
ENSLACG00000016955	-	72	31.443	ENSLACG00000000903	-	82	31.443
ENSLACG00000016955	-	91	66.383	ENSLACG00000008859	-	91	66.383
ENSLACG00000016955	-	83	38.318	ENSLACG00000010019	-	85	38.318
ENSLACG00000016955	-	81	33.333	ENSLACG00000013090	-	99	33.333
ENSLACG00000016955	-	72	37.500	ENSLACG00000014189	-	88	33.206
ENSLACG00000016955	-	83	41.121	ENSLACG00000002189	-	87	41.121
ENSLACG00000016955	-	70	41.758	ENSLACG00000010144	-	66	41.758
ENSLACG00000016955	-	85	60.000	ENSLACG00000006865	-	88	61.905
ENSLACG00000016955	-	100	84.791	ENSLACG00000002471	-	88	84.791
ENSLACG00000016955	-	70	40.331	ENSLACG00000000643	-	74	40.331
ENSLACG00000016955	-	77	34.518	ENSLACG00000001384	-	88	36.364
ENSLACG00000016955	-	90	32.083	ENSLACG00000003957	-	82	32.083
ENSLACG00000016955	-	79	60.096	ENSLACG00000016517	-	99	60.096