EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000017009 (Gene tree)
Gene ID: 102353432
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35429 bases
Position: chrJH126588.1:1859662-1895090
Accession: 102353432
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000019337	PAZ	PF02170.22	7.7e-29	1	1
ENSLACP00000019337	Piwi	PF02171.17	1.5e-92	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000019471	AGO1-201	2559	XM_005988509	ENSLACP00000019337	852 (aa)	-	H3BBR6

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000017009's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000017009's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000017009	AGO1	99	78.388	ENSLACG00000016888	AGO4	99	78.388
ENSLACG00000017009	AGO1	99	72.118	ENSLACG00000001277	-	98	72.118

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSG00000092847	AGO1	100	93.240	Homo_sapiens
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSAPOG00000024299	ago1	99	90.824	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSAMEG00000000504	AGO1	99	93.522	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000017009	AGO1	82	85.227	ENSACIG00000005298	ago1	98	85.227	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSAOCG00000017727	ago1	99	90.824	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSAPEG00000004458	ago1	100	90.824	Amphiprion_percula
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSATEG00000008523	ago1	99	90.824	Anabas_testudineus
ENSLACG00000017009	AGO1	100	87.209	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	87.209	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000017009	AGO1	92	93.367	ENSACAG00000029174	AGO1	100	93.367	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSANAG00000037711	AGO1	99	93.522	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.588	ENSACLG00000000890	ago1	99	90.588	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000017009	AGO1	80	91.570	ENSAMXG00000001917	ago1	98	91.570	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.506	ENSBTAG00000012253	AGO1	99	93.404	Bos_taurus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSCJAG00000032023	AGO1	99	93.522	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSCAFG00000003443	AGO1	99	93.522	Canis_familiaris
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.238	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	93.238	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000017009	AGO1	100	92.515	ENSCHIG00000011848	-	99	92.623	Capra_hircus
ENSLACG00000017009	AGO1	98	76.134	ENSTSYG00000032426	-	99	76.134	Carlito_syrichta
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSTSYG00000009767	-	99	93.522	Carlito_syrichta
ENSLACG00000017009	AGO1	90	84.298	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	83.368	Cavia_aperea
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSCPOG00000011568	AGO1	99	93.522	Cavia_porcellus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSCCAG00000011823	AGO1	99	93.522	Cebus_capucinus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.522	ENSCATG00000031521	AGO1	100	93.240	Cercocebus_atys
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSCLAG00000011507	AGO1	99	93.522	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSCSAG00000001091	AGO1	99	93.522	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000017009	AGO1	86	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.757	ENSCPBG00000018594	AGO1	99	93.757	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSCANG00000039798	AGO1	99	93.522	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000017009	AGO1	100	92.982	ENSCGRG00001022708	Ago1	99	93.522	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000017009	AGO1	100	92.982	ENSCGRG00000010386	Ago1	99	93.522	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000017009	AGO1	99	89.492	ENSCSEG00000001051	ago1	100	89.492	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSCVAG00000018173	ago1	99	90.824	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	91.176	ENSDARG00000092644	ago1	99	91.176	Danio_rerio
ENSLACG00000017009	AGO1	92	93.240	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	93.240	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000017009	AGO1	91	100.000	ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000017009	AGO1	83	85.414	ENSETEG00000007626	AGO1	99	85.414	Echinops_telfairi
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSEASG00005012086	AGO1	99	93.522	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSECAG00000024353	AGO1	99	93.522	Equus_caballus
ENSLACG00000017009	AGO1	92	85.044	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	85.044	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000017009	AGO1	92	90.944	ENSELUG00000016803	ago1	100	90.944	Esox_lucius
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSFCAG00000000746	AGO1	99	93.522	Felis_catus
ENSLACG00000017009	AGO1	92	86.005	ENSFALG00000000790	AGO1	100	86.005	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.522	ENSFDAG00000017210	AGO1	99	93.522	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000017009	AGO1	99	87.059	ENSFHEG00000017927	ago1	100	87.059	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000017009	AGO1	88	79.067	ENSGMOG00000019413	ago1	100	79.067	Gadus_morhua
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.743	ENSGALG00000002249	AGO1	99	93.640	Gallus_gallus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSGAFG00000009775	ago1	99	90.824	Gambusia_affinis
ENSLACG00000017009	AGO1	88	91.345	ENSGACG00000012443	ago1	100	91.345	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000017009	AGO1	92	93.367	ENSGAGG00000012893	-	100	93.367	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSGGOG00000003316	AGO1	99	93.522	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.588	ENSHBUG00000010459	ago1	99	90.588	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSHGLG00000011540	AGO1	99	93.522	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSHGLG00100005568	AGO1	99	93.522	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSHCOG00000005708	ago1	100	90.824	Hippocampus_comes
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSIPUG00000023216	ago1	99	90.824	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000017009	AGO1	100	93.099	ENSSTOG00000010857	AGO1	99	93.522	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.640	ENSJJAG00000019449	Ago1	99	93.640	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSKMAG00000019464	ago1	99	90.824	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSLBEG00000007694	ago1	99	90.824	Labrus_bergylta
ENSLACG00000017009	AGO1	99	88.575	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	88.575	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.522	ENSLAFG00000010835	AGO1	99	93.522	Loxodonta_africana
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSMFAG00000002846	AGO1	99	93.522	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000017009	AGO1	99	89.046	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	88.876	Macaca_mulatta
ENSLACG00000017009	AGO1	99	89.683	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	93.240	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSMLEG00000038388	AGO1	99	93.522	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSMAMG00000008381	ago1	99	90.824	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.588	ENSMZEG00005007996	ago1	99	90.588	Maylandia_zebra
ENSLACG00000017009	AGO1	99	88.837	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	88.837	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSMAUG00000015189	Ago1	99	93.522	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSMICG00000016147	AGO1	99	93.522	Microcebus_murinus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.506	ENSMOCG00000000537	Ago1	99	93.404	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000017009	AGO1	79	91.518	ENSMMOG00000018459	ago1	93	91.518	Mola_mola
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.640	ENSMODG00000023335	AGO1	99	93.640	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.706	ENSMALG00000011057	ago1	100	90.706	Monopterus_albus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	99	93.522	Mus_caroli
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSMUSG00000041530	Ago1	99	93.522	Mus_musculus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	99	93.522	Mus_pahari
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	99	93.522	Mus_spretus
ENSLACG00000017009	AGO1	84	93.056	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	93.056	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000017009	AGO1	61	98.453	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	98.453	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.640	ENSNGAG00000017448	Ago1	99	93.640	Nannospalax_galili
ENSLACG00000017009	AGO1	92	90.944	ENSNBRG00000010867	ago1	100	90.944	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.522	ENSNLEG00000011181	AGO1	99	93.522	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000017009	AGO1	84	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000017009	AGO1	90	89.841	ENSOPRG00000012325	AGO1	90	89.841	Ochotona_princeps
ENSLACG00000017009	AGO1	100	93.099	ENSODEG00000005321	AGO1	99	93.522	Octodon_degus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.588	ENSONIG00000016345	ago1	99	90.588	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	84.884	ENSOANG00000002080	AGO1	99	85.815	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.506	ENSOCUG00000023116	AGO1	99	93.404	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSORLG00000014965	ago1	99	90.824	Oryzias_latipes
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSORLG00020018253	ago1	99	90.824	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSORLG00015003287	ago1	99	90.824	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSOMEG00000020528	ago1	99	90.824	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000017009	AGO1	100	92.982	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	92.982	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.506	ENSOARG00000019591	AGO1	99	93.404	Ovis_aries
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSPPAG00000034838	AGO1	99	93.522	Pan_paniscus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSPPRG00000006475	AGO1	99	93.522	Panthera_pardus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.388	ENSPTIG00000020991	AGO1	99	93.286	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000017009	AGO1	100	92.632	ENSPTRG00000000528	AGO1	99	93.522	Pan_troglodytes
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSPANG00000009060	AGO1	99	93.522	Papio_anubis
ENSLACG00000017009	AGO1	98	93.128	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	93.128	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000017009	AGO1	81	90.435	ENSPMGG00000024099	ago1	98	90.435	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSPEMG00000023313	Ago1	99	93.522	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.640	ENSPCIG00000000172	AGO1	99	93.640	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSPFOG00000005867	ago1	99	90.824	Poecilia_formosa
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSPLAG00000002824	ago1	99	91.198	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSPMEG00000001787	ago1	99	91.198	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSPREG00000006534	ago1	99	90.824	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSPPYG00000001551	AGO1	99	93.522	Pongo_abelii
ENSLACG00000017009	AGO1	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	Procavia_capensis
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	93.240	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSPVAG00000005082	AGO1	99	93.522	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000017009	AGO1	92	86.132	ENSPNYG00000012586	ago1	100	86.132	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000017009	AGO1	93	86.375	ENSPNAG00000000597	ago1	99	86.375	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.506	ENSRNOG00000055915	Ago1	99	93.404	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSRBIG00000032611	AGO1	99	93.522	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSRROG00000044469	AGO1	99	93.522	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSSBOG00000020867	AGO1	99	93.522	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000017009	AGO1	99	92.840	ENSSHAG00000017468	AGO1	99	92.840	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.706	ENSSFOG00015020982	ago1	99	90.706	Scleropages_formosus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.706	ENSSMAG00000002841	ago1	99	90.706	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSSDUG00000010864	ago1	99	90.824	Seriola_dumerili
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSSLDG00000000386	ago1	99	90.824	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000017009	AGO1	73	100.000	ENSSARG00000011520	AGO1	73	100.000	Sorex_araneus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.655	ENSSPUG00000000836	AGO1	99	93.655	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSSPAG00000019154	ago1	99	90.824	Stegastes_partitus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	89.977	ENSTRUG00000024431	ago1	100	90.368	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.599	ENSTNIG00000012102	ago1	99	90.599	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000017009	AGO1	85	92.116	ENSTBEG00000016514	AGO1	100	92.116	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000017009	AGO1	99	91.991	ENSTTRG00000015088	AGO1	99	91.991	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSUAMG00000027154	AGO1	99	93.522	Ursus_americanus
ENSLACG00000017009	AGO1	100	89.252	ENSUMAG00000002480	AGO1	99	89.753	Ursus_maritimus
ENSLACG00000017009	AGO1	95	85.819	ENSVPAG00000006663	AGO1	99	85.819	Vicugna_pacos
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.625	ENSVVUG00000000405	AGO1	99	95.082	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.051	ENSXETG00000004364	ago1	99	93.051	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000017009	AGO1	92	90.306	ENSXCOG00000007669	ago1	100	90.306	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000017009	AGO1	99	90.824	ENSXMAG00000021899	ago1	99	90.824	Xiphophorus_maculatus