EuRBPDB

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RBDs

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Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000017059 (Gene tree)
Gene ID: 102346620
Gene Symbol: URB1
Alias: C21orf108|KIAA0539|NPA1
Full Name: URB1 ribosome biogenesis homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 98283 bases
Position: chrJH126734.1:1888783-1987065
Accession: 102346620
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000019395	Npa1	PF11707.8	1.3e-60	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000019530	URB1-201	6849	XM_005993622	ENSLACP00000019395	2283 (aa)	-	H3BBX4
ENSLACT00000019531	URB1-202	2610	-	ENSLACP00000019396	870 (aa)	-	H3BBX5

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.312	ENSG00000142207	URB1	99	48.312	Homo_sapiens
ENSLACG00000017059	URB1	94	58.824	ENSAPOG00000020308	urb1	97	58.824	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.012	ENSAMEG00000011998	URB1	99	48.055	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000017059	URB1	94	43.882	ENSACIG00000003248	urb1	96	43.882	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000017059	URB1	100	40.987	ENSAOCG00000010364	urb1	99	40.927	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000017059	URB1	100	42.943	ENSAPEG00000010758	urb1	99	42.882	Amphiprion_percula
ENSLACG00000017059	URB1	99	43.854	ENSATEG00000011790	urb1	99	43.811	Anabas_testudineus
ENSLACG00000017059	URB1	96	54.790	ENSAPLG00000012791	URB1	99	54.655	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000017059	URB1	99	51.096	ENSACAG00000002817	URB1	99	51.418	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.832	ENSANAG00000024617	URB1	99	48.832	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000017059	URB1	99	45.284	ENSACLG00000024865	urb1	99	44.933	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000017059	URB1	99	40.949	ENSAMXG00000012306	urb1	99	40.927	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.520	ENSBTAG00000012412	URB1	99	47.693	Bos_taurus
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.531	ENSCJAG00000009118	URB1	99	48.531	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.749	ENSCAFG00000008892	URB1	99	48.749	Canis_familiaris
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.662	ENSCAFG00020025994	-	99	47.662	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.550	ENSCAFG00020025987	-	99	48.550	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.607	ENSCHIG00000015645	URB1	99	47.607	Capra_hircus
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.919	ENSTSYG00000013286	URB1	99	48.919	Carlito_syrichta
ENSLACG00000017059	URB1	98	48.120	ENSCAPG00000015589	URB1	99	48.120	Cavia_aperea
ENSLACG00000017059	URB1	99	47.794	ENSCPOG00000006748	URB1	99	47.794	Cavia_porcellus
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.853	ENSCCAG00000021299	URB1	99	48.853	Cebus_capucinus
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.746	ENSCATG00000042630	URB1	99	48.789	Cercocebus_atys
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.127	ENSCLAG00000005262	URB1	99	48.127	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.447	ENSCSAG00000009584	URB1	99	48.490	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000017059	URB1	99	55.431	ENSCPBG00000006454	URB1	99	55.387	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.811	ENSCANG00000031088	URB1	99	48.854	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.168	ENSCGRG00001010616	Urb1	99	47.910	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000017059	URB1	98	48.238	ENSCGRG00000015840	Urb1	99	48.238	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000017059	URB1	95	50.549	ENSCSEG00000012616	urb1	98	50.549	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000017059	URB1	99	50.100	ENSCVAG00000009076	urb1	99	50.616	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000017059	URB1	92	55.556	ENSDARG00000060308	urb1	96	55.556	Danio_rerio
ENSLACG00000017059	URB1	83	52.621	ENSDNOG00000015586	URB1	98	52.621	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000017059	URB1	99	47.792	ENSDORG00000006735	Urb1	99	47.879	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000017059	URB1	90	53.501	ENSETEG00000009080	URB1	91	53.501	Echinops_telfairi
ENSLACG00000017059	URB1	93	55.595	ENSEASG00005007711	URB1	99	48.006	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000017059	URB1	95	56.081	ENSECAG00000013206	URB1	99	56.081	Equus_caballus
ENSLACG00000017059	URB1	55	63.485	ENSEEUG00000003626	-	55	63.485	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000017059	URB1	100	44.329	ENSELUG00000020516	urb1	99	44.243	Esox_lucius
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.773	ENSFCAG00000002177	URB1	99	47.730	Felis_catus
ENSLACG00000017059	URB1	98	46.900	ENSFALG00000004636	URB1	99	46.900	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000017059	URB1	99	47.758	ENSFDAG00000007288	URB1	95	47.758	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000017059	URB1	93	58.261	ENSFHEG00000000202	urb1	96	58.261	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000017059	URB1	93	44.190	ENSGMOG00000001838	urb1	94	44.275	Gadus_morhua
ENSLACG00000017059	URB1	99	53.415	ENSGALG00000015887	URB1	99	53.415	Gallus_gallus
ENSLACG00000017059	URB1	94	50.000	ENSGAFG00000020694	urb1	98	50.000	Gambusia_affinis
ENSLACG00000017059	URB1	99	44.769	ENSGACG00000011703	urb1	99	44.701	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000017059	URB1	99	55.517	ENSGAGG00000022544	URB1	99	55.198	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.594	ENSGGOG00000000285	URB1	99	48.507	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000017059	URB1	99	45.240	ENSHBUG00000001904	urb1	99	44.890	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000017059	URB1	99	47.593	ENSHGLG00000004907	URB1	99	47.548	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000017059	URB1	99	47.907	ENSHGLG00100010749	URB1	99	47.907	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000017059	URB1	75	49.165	ENSHCOG00000018683	urb1	99	49.907	Hippocampus_comes
ENSLACG00000017059	URB1	100	40.317	ENSIPUG00000014721	urb1	99	40.557	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.166	ENSSTOG00000004539	URB1	99	47.757	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000017059	URB1	97	46.031	ENSKMAG00000006001	urb1	99	45.930	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000017059	URB1	94	49.535	ENSLBEG00000027208	urb1	99	49.535	Labrus_bergylta
ENSLACG00000017059	URB1	99	47.382	ENSLOCG00000009190	urb1	99	47.273	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000017059	URB1	99	49.675	ENSLAFG00000010407	URB1	99	49.632	Loxodonta_africana
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.616	ENSMFAG00000034391	URB1	96	48.659	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.616	ENSMMUG00000010295	URB1	99	48.659	Macaca_mulatta
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.578	ENSMNEG00000032981	URB1	99	47.664	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.702	ENSMLEG00000041435	URB1	99	48.702	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000017059	URB1	100	43.313	ENSMAMG00000011238	urb1	99	43.184	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000017059	URB1	93	60.690	ENSMZEG00005011862	urb1	97	60.690	Maylandia_zebra
ENSLACG00000017059	URB1	98	53.366	ENSMGAG00000014512	URB1	99	53.542	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000017059	URB1	93	55.344	ENSMAUG00000010516	Urb1	99	53.955	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.489	ENSMICG00000016424	URB1	99	48.446	Microcebus_murinus
ENSLACG00000017059	URB1	99	46.769	ENSMOCG00000012613	Urb1	98	46.769	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000017059	URB1	100	49.459	ENSMODG00000021076	URB1	99	49.502	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000017059	URB1	97	50.780	ENSMALG00000017411	urb1	99	50.625	Monopterus_albus
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.110	MGP_CAROLIEiJ_G0020948	Urb1	99	47.064	Mus_caroli
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.239	ENSMUSG00000039929	Urb1	99	47.193	Mus_musculus
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.500	MGP_PahariEiJ_G0016653	Urb1	99	47.455	Mus_pahari
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.282	MGP_SPRETEiJ_G0021854	Urb1	99	47.237	Mus_spretus
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.421	ENSMPUG00000001123	URB1	99	48.464	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000017059	URB1	99	46.652	ENSNGAG00000001905	Urb1	99	46.695	Nannospalax_galili
ENSLACG00000017059	URB1	79	44.966	ENSNBRG00000001049	urb1	95	44.724	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000017059	URB1	99	47.464	ENSNLEG00000026872	URB1	99	47.464	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000017059	URB1	88	66.857	ENSMEUG00000010828	URB1	92	52.549	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000017059	URB1	99	45.573	ENSOPRG00000013482	URB1	99	45.573	Ochotona_princeps
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.527	ENSODEG00000002587	URB1	99	47.613	Octodon_degus
ENSLACG00000017059	URB1	99	45.000	ENSONIG00000005599	urb1	99	44.938	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.119	ENSOCUG00000009381	URB1	99	48.076	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000017059	URB1	100	42.741	ENSORLG00000003429	urb1	99	42.741	Oryzias_latipes
ENSLACG00000017059	URB1	100	42.514	ENSORLG00020013785	urb1	99	42.514	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000017059	URB1	94	58.042	ENSORLG00015019421	urb1	97	58.042	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000017059	URB1	72	53.892	ENSOMEG00000002094	urb1	97	54.092	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.554	ENSOGAG00000017140	URB1	99	48.466	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000017059	URB1	96	50.084	ENSOARG00000013679	URB1	99	49.216	Ovis_aries
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.485	ENSPPAG00000003423	URB1	99	48.485	Pan_paniscus
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.249	ENSPPRG00000023131	URB1	99	48.206	Panthera_pardus
ENSLACG00000017059	URB1	91	48.318	ENSPTIG00000016125	URB1	97	48.269	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.398	ENSPTRG00000013852	URB1	99	48.398	Pan_troglodytes
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.746	ENSPANG00000021964	URB1	99	48.789	Papio_anubis
ENSLACG00000017059	URB1	99	44.348	ENSPKIG00000003683	urb1	99	44.237	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.841	ENSPEMG00000021205	Urb1	99	47.841	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000017059	URB1	74	33.844	ENSPMAG00000009733	URB1	96	34.050	Petromyzon_marinus
ENSLACG00000017059	URB1	100	50.129	ENSPCIG00000016350	URB1	99	50.333	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000017059	URB1	97	43.403	ENSPLAG00000004371	urb1	99	43.206	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000017059	URB1	100	44.181	ENSPMEG00000006634	urb1	99	43.990	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000017059	URB1	100	44.148	ENSPREG00000013453	urb1	99	44.086	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.377	ENSPPYG00000011359	URB1	99	48.377	Pongo_abelii
ENSLACG00000017059	URB1	99	43.401	ENSPCAG00000007430	URB1	99	43.358	Procavia_capensis
ENSLACG00000017059	URB1	99	48.997	ENSPCOG00000022695	URB1	99	48.976	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000017059	URB1	99	47.769	ENSPVAG00000000889	URB1	99	47.792	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000017059	URB1	99	44.216	ENSPNYG00000010589	urb1	99	43.747	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000017059	URB1	99	42.147	ENSPNAG00000019324	urb1	99	42.022	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000017059	URB1	100	47.221	ENSRNOG00000002080	Urb1	99	47.264	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.704	ENSRBIG00000033122	URB1	99	48.747	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.812	ENSRROG00000040237	URB1	99	48.855	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000017059	URB1	99	49.039	ENSSBOG00000027672	URB1	99	48.702	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000017059	URB1	100	49.957	ENSSHAG00000005140	URB1	100	50.043	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000017059	URB1	93	46.064	ENSSFOG00015000339	urb1	99	46.097	Scleropages_formosus
ENSLACG00000017059	URB1	99	44.803	ENSSMAG00000003782	urb1	99	44.883	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000017059	URB1	100	45.207	ENSSDUG00000012313	urb1	99	45.207	Seriola_dumerili
ENSLACG00000017059	URB1	100	45.164	ENSSLDG00000023179	urb1	99	45.164	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000017059	URB1	100	52.833	ENSSPUG00000012447	URB1	99	52.876	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000017059	URB1	94	58.621	ENSSPAG00000006325	urb1	97	58.621	Stegastes_partitus
ENSLACG00000017059	URB1	99	47.125	ENSSSCG00000032024	URB1	99	47.125	Sus_scrofa
ENSLACG00000017059	URB1	73	53.630	ENSTGUG00000013442	URB1	100	53.477	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000017059	URB1	99	43.788	ENSTRUG00000009372	urb1	99	43.745	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000017059	URB1	99	43.582	ENSTNIG00000016277	urb1	99	43.539	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000017059	URB1	74	61.290	ENSTBEG00000010044	URB1	75	61.290	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000017059	URB1	91	52.308	ENSTTRG00000007712	URB1	92	52.513	Tursiops_truncatus
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ENSLACG00000017059	URB1	87	50.075	ENSUMAG00000017419	URB1	97	49.559	Ursus_maritimus
ENSLACG00000017059	URB1	65	65.873	ENSVPAG00000001164	URB1	68	65.873	Vicugna_pacos
ENSLACG00000017059	URB1	100	48.418	ENSVVUG00000000551	URB1	99	48.418	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000017059	URB1	99	51.386	ENSXETG00000009895	urb1	99	51.130	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000017059	URB1	95	55.556	ENSXCOG00000005500	urb1	97	55.556	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000017059	URB1	95	56.209	ENSXMAG00000007253	urb1	97	56.209	Xiphophorus_maculatus