EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000017227 (Gene tree)
Gene ID: 102349139
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 54753 bases
Position: chrJH126594.1:1974645-2029397
Accession: 102349139
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000019590	ResIII	PF04851.15	8.8e-08	1	1
ENSLACP00000019589	ResIII	PF04851.15	2e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000019728	SBNO1-202	4188	-	ENSLACP00000019590	1396 (aa)	-	H3BCG9
ENSLACT00000019727	SBNO1-201	4374	XM_005989014	ENSLACP00000019589	1239 (aa)	-	H3BCG8

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.387	ENSG00000139697	SBNO1	99	80.915	Homo_sapiens
ENSLACG00000017227	SBNO1	80	81.087	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	76.577	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.279	ENSAMEG00000015151	SBNO1	99	81.183	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000017227	SBNO1	98	74.233	ENSACIG00000008088	sbno1	99	71.358	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.561	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	71.529	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.561	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	71.529	Amphiprion_percula
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.099	ENSATEG00000006667	sbno1	100	71.710	Anabas_testudineus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	85.008	ENSAPLG00000015674	SBNO1	99	82.618	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	81.651	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	79.858	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	91.557	ENSANAG00000029958	-	98	83.687	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	72.977	ENSACLG00000024913	sbno1	100	70.735	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	79.291	ENSAMXG00000019473	sbno1	100	77.147	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.968	ENSBTAG00000020505	SBNO1	100	81.312	Bos_taurus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.482	ENSCJAG00000016599	SBNO1	99	81.000	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.482	ENSCAFG00000007503	SBNO1	92	93.978	Canis_familiaris
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	82.591	ENSCAFG00020015363	SBNO1	99	80.500	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.885	ENSCHIG00000008382	SBNO1	100	81.442	Capra_hircus
ENSLACG00000017227	SBNO1	98	92.246	ENSTSYG00000012749	SBNO1	99	81.214	Carlito_syrichta
ENSLACG00000017227	SBNO1	95	84.484	ENSCAPG00000000384	SBNO1	95	87.122	Cavia_aperea
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	90.885	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	81.916	Cavia_porcellus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	78.479	ENSCCAG00000035316	SBNO1	96	82.143	Cebus_capucinus
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	90.625	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	81.647	Cercocebus_atys
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	91.406	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	81.857	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000017227	SBNO1	81	87.387	ENSCSAG00000002064	SBNO1	99	83.993	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000017227	SBNO1	95	82.645	ENSCHOG00000008814	SBNO1	95	81.679	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	85.425	ENSCPBG00000025968	SBNO1	98	82.916	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	78.560	ENSCANG00000042688	-	96	79.345	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	89.323	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	80.599	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	89.323	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	80.599	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.940	ENSCSEG00000011919	sbno1	100	72.045	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.722	ENSCVAG00000007038	sbno1	100	72.433	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	77.456	ENSDARG00000099080	sbno1	99	76.835	Danio_rerio
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	81.870	ENSDNOG00000017147	SBNO1	99	83.114	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	72.823	ENSDORG00000015261	Sbno1	99	71.766	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	76.751	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	76.041	Echinops_telfairi
ENSLACG00000017227	SBNO1	85	63.114	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	62.932	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000017227	SBNO1	57	82.603	ENSEASG00005012595	-	91	83.143	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	84.130	ENSECAG00000006127	SBNO1	99	81.872	Equus_caballus
ENSLACG00000017227	SBNO1	81	81.696	ENSEEUG00000003793	SBNO1	81	81.585	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000017227	SBNO1	100	75.789	ENSELUG00000002886	sbno1	100	74.160	Esox_lucius
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.563	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	81.500	Felis_catus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	85.251	ENSFALG00000009273	SBNO1	99	82.761	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	82.334	ENSFDAG00000014232	SBNO1	100	79.943	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.060	ENSFHEG00000007360	sbno1	100	72.727	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	77.163	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	75.303	Gadus_morhua
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	84.846	ENSGALG00000003392	SBNO1	98	85.179	Gallus_gallus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.239	ENSGAFG00000003960	sbno1	100	72.836	Gambusia_affinis
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	77.444	ENSGACG00000015633	sbno1	100	74.359	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	91.710	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	84.019	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.885	ENSGGOG00000015000	SBNO1	99	80.843	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	66.962	ENSHBUG00000011910	sbno1	100	65.149	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	91.821	ENSHGLG00000014165	-	99	81.714	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000017227	SBNO1	91	86.216	ENSHCOG00000003246	sbno1	80	86.216	Hippocampus_comes
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	78.198	ENSIPUG00000015830	Sbno1	99	77.518	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.625	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	81.201	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	84.115	ENSJJAG00000001741	Sbno1	99	81.429	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.159	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	73.221	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.782	ENSLBEG00000007623	sbno1	100	71.840	Labrus_bergylta
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	80.949	ENSLOCG00000005725	sbno1	98	78.738	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	82.915	ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	80.786	Loxodonta_africana
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.625	ENSMFAG00000031429	SBNO1	99	83.537	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.625	ENSMMUG00000011496	SBNO1	99	80.986	Macaca_mulatta
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.625	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	82.358	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.081	ENSMAMG00000005473	sbno1	100	72.986	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	84.765	ENSMGAG00000003274	SBNO1	98	85.179	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000017227	SBNO1	56	82.066	ENSMAUG00000004834	-	100	82.783	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	82.429	ENSMICG00000006573	-	99	80.143	Microcebus_murinus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.365	ENSMOCG00000009390	Sbno1	96	82.286	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	70.353	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	67.966	Mola_mola
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	84.291	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	81.916	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.206	ENSMALG00000001056	sbno1	100	71.047	Monopterus_albus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.306	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	94	95.595	Mus_caroli
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.468	ENSMUSG00000038095	Sbno1	94	95.595	Mus_musculus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.644	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	94	95.595	Mus_pahari
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.468	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	94	95.595	Mus_spretus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.644	ENSMPUG00000001658	SBNO1	99	81.571	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.806	ENSMLUG00000017159	SBNO1	99	81.447	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.625	ENSNGAG00000012620	Sbno1	99	81.357	Nannospalax_galili
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	72.816	ENSNBRG00000019189	sbno1	100	70.450	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.854	ENSNLEG00000001502	SBNO1	99	78.777	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000017227	SBNO1	70	75.989	ENSMEUG00000008768	-	92	79.375	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	81.553	ENSOPRG00000011054	SBNO1	99	79.528	Ochotona_princeps
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	91.146	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	81.773	Octodon_degus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.127	ENSONIG00000015348	sbno1	100	71.378	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.793	ENSOCUG00000002441	SBNO1	94	80.408	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.245	ENSORLG00000001593	sbno1	100	71.569	Oryzias_latipes
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.383	ENSORLG00020015216	sbno1	100	71.741	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.224	ENSORLG00015002726	sbno1	100	71.670	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.661	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	72.187	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000017227	SBNO1	56	80.631	ENSOGAG00000010781	-	100	81.205	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.900	ENSOARG00000004404	SBNO1	100	81.254	Ovis_aries
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.885	ENSPPAG00000024635	SBNO1	99	80.929	Pan_paniscus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.563	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	81.500	Panthera_pardus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.172	ENSPTIG00000017803	SBNO1	99	81.357	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.885	ENSPTRG00000005597	SBNO1	99	80.857	Pan_troglodytes
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.625	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	83.483	Papio_anubis
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	80.161	ENSPKIG00000001441	sbno1	100	77.825	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	84.342	ENSPSIG00000009572	-	99	82.407	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	82.324	ENSPSIG00000009256	-	98	80.377	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	89.844	ENSPEMG00000016087	Sbno1	100	80.670	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.981	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	81.714	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.781	ENSPFOG00000005069	sbno1	100	72.714	Poecilia_formosa
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.622	ENSPLAG00000015015	sbno1	100	72.574	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.801	ENSPMEG00000021212	sbno1	100	72.734	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.324	ENSPREG00000017746	sbno1	100	72.312	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.144	ENSPPYG00000005084	SBNO1	99	80.701	Pongo_abelii
ENSLACG00000017227	SBNO1	84	79.781	ENSPCAG00000008634	SBNO1	88	79.806	Procavia_capensis
ENSLACG00000017227	SBNO1	93	91.512	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	81.571	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000017227	SBNO1	84	91.843	ENSPVAG00000015304	SBNO1	86	82.072	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.145	ENSPNYG00000004291	sbno1	100	71.620	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	78.474	ENSPNAG00000015622	sbno1	100	76.416	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	91.146	ENSRNOG00000001064	Sbno1	98	83.687	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	90.625	ENSRROG00000034230	SBNO1	99	80.929	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000017227	SBNO1	95	79.680	ENSSBOG00000015422	SBNO1	99	77.646	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	79.742	ENSSFOG00015019025	sbno1	100	77.312	Scleropages_formosus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.801	ENSSMAG00000013640	sbno1	100	72.265	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.437	ENSSDUG00000023480	sbno1	100	72.426	Seriola_dumerili
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.358	ENSSLDG00000007928	sbno1	100	72.285	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000017227	SBNO1	89	84.211	ENSSARG00000002594	SBNO1	89	84.211	Sorex_araneus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	82.711	ENSSPUG00000012640	SBNO1	99	80.601	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.821	ENSSPAG00000016244	sbno1	100	71.469	Stegastes_partitus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.874	ENSSSCG00000009776	SBNO1	99	81.415	Sus_scrofa
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	85.008	ENSTGUG00000005380	SBNO1	99	82.546	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	73.927	ENSTRUG00000018490	sbno1	99	72.375	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000017227	SBNO1	63	70.370	ENSTNIG00000013506	sbno1	99	69.926	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.563	ENSUAMG00000019671	SBNO1	99	81.429	Ursus_americanus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.563	ENSUMAG00000004002	SBNO1	99	81.429	Ursus_maritimus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	78.930	ENSVPAG00000007024	SBNO1	92	76.187	Vicugna_pacos
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	83.482	ENSVVUG00000027807	SBNO1	99	81.357	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	78.722	ENSXETG00000031930	SBNO1	99	75.960	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	74.478	ENSXCOG00000011607	sbno1	95	74.595	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000017227	SBNO1	99	75.219	ENSXMAG00000002140	sbno1	100	72.676	Xiphophorus_maculatus