EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000017433 (Gene tree)
Gene ID: 102353772
Gene Symbol: si:dkey-98f17.5
Alias: -
Full Name: uncharacterized LOC102353772
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 52779 bases
Position: chrJH126621.1:2096625-2149403
Accession: 102353772
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000019826	MMR_HSR1	PF01926.23	4.5e-07	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000019964	-	4896	XM_005990265	ENSLACP00000019826	455 (aa)	XP_005990327	H3BD55

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000017433's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000017433's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	62.000	ENSLACG00000004899	-	99	62.138
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	63.535	ENSLACG00000006280	si:ch211-11k18.4	99	63.535

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	60.045	ENSAPOG00000018833	si:ch211-11k18.4	98	60.045	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.820	ENSAPOG00000010378	si:dkey-98f17.5	99	69.820	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.144	ENSACIG00000017719	si:dkey-98f17.5	99	69.144	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	57.883	ENSACIG00000006696	si:ch211-11k18.4	98	57.883	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	60.045	ENSAOCG00000014284	si:ch211-11k18.4	98	60.045	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.595	ENSAOCG00000008661	si:dkey-98f17.5	99	69.595	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.819	ENSAPEG00000014910	si:ch211-11k18.4	98	59.819	Amphiprion_percula
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.369	ENSAPEG00000022447	si:dkey-98f17.5	99	69.369	Amphiprion_percula
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.144	ENSATEG00000007188	si:dkey-98f17.5	99	69.144	Anabas_testudineus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.368	ENSATEG00000004775	si:ch211-11k18.4	98	59.368	Anabas_testudineus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	59.161	ENSACAG00000028632	-	100	59.161	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	58.916	ENSACLG00000007907	si:ch211-11k18.4	98	58.916	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.270	ENSACLG00000001308	si:dkey-98f17.5	99	70.270	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	68.071	ENSAMXG00000001190	si:dkey-98f17.5	99	68.071	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	60.360	ENSAMXG00000017817	si:ch211-11k18.4	99	60.360	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	75	59.475	ENSCING00000020807	-	91	59.475	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	52.928	ENSCSAVG00000009987	-	99	53.795	Ciona_savignyi
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.142	ENSCSEG00000017661	si:ch211-11k18.4	98	58.691	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.468	ENSCSEG00000017512	si:dkey-98f17.5	98	67.376	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.270	ENSCVAG00000011351	si:dkey-98f17.5	99	70.270	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	60.045	ENSCVAG00000015346	si:ch211-11k18.4	98	59.910	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	96	68.950	ENSDARG00000068863	si:dkey-98f17.5	99	68.950	Danio_rerio
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	60.948	ENSDARG00000087869	si:ch211-11k18.4	97	73.298	Danio_rerio
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	79	56.983	ENSEBUG00000007620	si:dkey-98f17.5	96	56.983	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	67.184	ENSELUG00000003365	si:dkey-98f17.5	99	67.184	Esox_lucius
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.946	ENSFHEG00000012744	si:dkey-98f17.5	99	70.946	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	58.444	ENSFHEG00000019820	si:ch211-11k18.4	99	58.444	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	88	54.887	ENSGMOG00000003492	si:ch211-11k18.4	99	54.887	Gadus_morhua
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	58.108	ENSGAFG00000005677	si:ch211-11k18.4	98	58.108	Gambusia_affinis
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.820	ENSGAFG00000012362	si:dkey-98f17.5	88	69.820	Gambusia_affinis
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	83	62.434	ENSGACG00000013134	si:ch211-11k18.4	99	60.401	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	56	81.961	ENSGACG00000009399	si:dkey-98f17.5	98	81.961	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.495	ENSHBUG00000008331	si:dkey-98f17.5	99	70.495	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.142	ENSHBUG00000020638	si:ch211-11k18.4	98	59.142	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	65.914	ENSHCOG00000016505	si:dkey-98f17.5	97	65.914	Hippocampus_comes
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	59.234	ENSHCOG00000014773	si:ch211-11k18.4	99	59.234	Hippocampus_comes
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	94	58.548	ENSIPUG00000016678	si:ch211-11k18.4	98	58.548	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	65.843	ENSIPUG00000019981	si:dkey-98f17.5	99	65.843	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	83	57.031	ENSIPUG00000016694	si:ch211-11k18.4	84	56.771	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.369	ENSKMAG00000014997	si:dkey-98f17.5	99	69.369	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	58.916	ENSKMAG00000009327	si:ch211-11k18.4	98	58.784	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.243	ENSLBEG00000012756	si:dkey-98f17.5	99	68.243	Labrus_bergylta
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	67.114	ENSLOCG00000003824	si:dkey-98f17.5	99	67.114	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	94	60.656	ENSMAMG00000002536	si:ch211-11k18.4	98	60.656	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.919	ENSMAMG00000014528	si:dkey-98f17.5	99	68.919	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.495	ENSMZEG00005016572	si:dkey-98f17.5	99	70.495	Maylandia_zebra
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.142	ENSMZEG00005008941	si:ch211-11k18.4	98	59.142	Maylandia_zebra
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	58.014	ENSMMOG00000012485	si:ch211-11k18.4	98	58.014	Mola_mola
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	96	69.655	ENSMALG00000012761	si:dkey-98f17.5	99	69.655	Monopterus_albus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	58.691	ENSMALG00000019735	si:ch211-11k18.4	98	58.691	Monopterus_albus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	94	59.016	ENSNBRG00000002220	si:ch211-11k18.4	97	59.016	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.429	ENSNBRG00000006068	si:dkey-98f17.5	99	70.429	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.142	ENSONIG00000019412	si:ch211-11k18.4	98	59.142	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.270	ENSONIG00000013568	si:dkey-98f17.5	99	70.270	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	65.991	ENSORLG00000007958	si:dkey-98f17.5	99	65.991	Oryzias_latipes
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.775	ENSORLG00000012015	si:ch211-11k18.4	98	59.775	Oryzias_latipes
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.775	ENSORLG00020012386	si:ch211-11k18.4	98	59.775	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.694	ENSORLG00020013350	si:dkey-98f17.5	99	68.694	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.775	ENSORLG00015022862	si:ch211-11k18.4	98	59.775	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.694	ENSORLG00015002000	si:dkey-98f17.5	99	68.694	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.368	ENSOMEG00000018686	si:ch211-11k18.4	98	59.368	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.468	ENSOMEG00000003154	si:dkey-98f17.5	99	68.468	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	65.410	ENSPKIG00000024621	si:dkey-98f17.5	99	65.410	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.382	ENSPKIG00000018807	si:ch211-11k18.4	98	60.722	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	56.982	ENSPKIG00000023918	-	98	57.461	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.243	ENSPMGG00000019065	si:dkey-98f17.5	99	68.243	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	60.045	ENSPMGG00000016507	si:ch211-11k18.4	98	60.045	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	59.459	ENSPFOG00000007976	si:ch211-11k18.4	98	59.459	Poecilia_formosa
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.128	ENSPFOG00000015142	si:dkey-98f17.5	99	69.128	Poecilia_formosa
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.369	ENSPLAG00000003709	si:dkey-98f17.5	99	69.369	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	59.459	ENSPLAG00000019794	si:ch211-11k18.4	98	59.459	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.820	ENSPMEG00000018709	si:dkey-98f17.5	93	69.820	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	59.459	ENSPMEG00000024198	si:ch211-11k18.4	99	59.579	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	88	59.553	ENSPREG00000015319	si:ch211-11k18.4	91	59.500	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	96	69.195	ENSPREG00000000708	si:dkey-98f17.5	99	69.195	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.142	ENSPNYG00000017099	si:ch211-11k18.4	98	59.142	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	70.495	ENSPNYG00000017266	si:dkey-98f17.5	99	70.495	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	68.071	ENSPNAG00000021352	si:dkey-98f17.5	99	68.071	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	60.225	ENSPNAG00000022138	si:ch211-11k18.4	99	60.090	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	59.101	ENSSFOG00015000985	si:ch211-11k18.4	93	59.101	Scleropages_formosus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	99	63.858	ENSSFOG00015017965	si:dkey-98f17.5	99	63.858	Scleropages_formosus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	67.793	ENSSMAG00000011905	si:dkey-98f17.5	99	67.793	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	60.497	ENSSMAG00000009651	si:ch211-11k18.4	98	60.497	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.144	ENSSDUG00000013457	si:dkey-98f17.5	99	69.144	Seriola_dumerili
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	60.045	ENSSDUG00000016411	si:ch211-11k18.4	98	60.045	Seriola_dumerili
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.819	ENSSLDG00000019145	si:ch211-11k18.4	98	59.819	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.919	ENSSLDG00000025395	si:dkey-98f17.5	99	68.919	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	86	60.305	ENSSPUG00000010096	-	99	60.305	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.144	ENSSPAG00000018800	si:dkey-98f17.5	99	69.144	Stegastes_partitus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	59.594	ENSSPAG00000010697	si:ch211-11k18.4	98	59.594	Stegastes_partitus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	68.919	ENSTRUG00000021287	si:dkey-98f17.5	99	68.919	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	59.508	ENSTRUG00000020291	si:ch211-11k18.4	99	59.911	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	60.714	ENSXETG00000031783	-	99	60.714	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	60.090	ENSXCOG00000018094	si:ch211-11k18.4	98	59.556	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.977	ENSXCOG00000017002	si:dkey-98f17.5	99	69.977	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	98	60.090	ENSXMAG00000021235	si:ch211-11k18.4	98	59.685	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000017433	si:dkey-98f17.5	97	69.820	ENSXMAG00000007688	si:dkey-98f17.5	93	69.820	Xiphophorus_maculatus