EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000017727 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1174 bases
Position: chrJH126607.1:2330486-2331659
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000020169	Transposase_22	PF02994.14	2.5e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000020308	-	684	-	ENSLACP00000020169	228 (aa)	-	H3BE48

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000017727's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000017727's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000017727	-	96	41.810	ENSLACG00000004508	-	86	41.810
ENSLACG00000017727	-	74	70.833	ENSLACG00000018384	-	87	70.833
ENSLACG00000017727	-	95	36.797	ENSLACG00000010859	-	85	36.797
ENSLACG00000017727	-	95	41.364	ENSLACG00000000668	-	72	41.364
ENSLACG00000017727	-	82	39.691	ENSLACG00000000465	-	77	39.691
ENSLACG00000017727	-	96	77.982	ENSLACG00000009393	-	95	77.982
ENSLACG00000017727	-	98	44.156	ENSLACG00000006473	-	90	44.156
ENSLACG00000017727	-	92	41.589	ENSLACG00000006865	-	90	41.589
ENSLACG00000017727	-	85	32.000	ENSLACG00000013538	-	93	32.000
ENSLACG00000017727	-	96	44.298	ENSLACG00000010346	-	77	44.298
ENSLACG00000017727	-	98	38.174	ENSLACG00000013472	-	93	38.174
ENSLACG00000017727	-	95	44.889	ENSLACG00000002471	-	76	44.889
ENSLACG00000017727	-	95	41.364	ENSLACG00000003217	-	78	41.364
ENSLACG00000017727	-	93	33.184	ENSLACG00000000369	-	78	33.184
ENSLACG00000017727	-	85	42.211	ENSLACG00000004272	-	93	42.211
ENSLACG00000017727	-	82	31.771	ENSLACG00000022180	-	78	31.771
ENSLACG00000017727	-	95	42.273	ENSLACG00000014952	-	72	42.273
ENSLACG00000017727	-	97	77.027	ENSLACG00000011265	-	91	77.027
ENSLACG00000017727	-	96	43.668	ENSLACG00000010900	-	86	43.668
ENSLACG00000017727	-	93	35.780	ENSLACG00000014474	-	82	35.780
ENSLACG00000017727	-	86	41.206	ENSLACG00000016517	-	94	41.206
ENSLACG00000017727	-	96	46.222	ENSLACG00000011150	-	82	46.222
ENSLACG00000017727	-	99	37.281	ENSLACG00000011390	-	87	37.281
ENSLACG00000017727	-	95	83.333	ENSLACG00000000077	-	83	83.333
ENSLACG00000017727	-	86	43.500	ENSLACG00000008859	-	79	43.500
ENSLACG00000017727	-	95	39.224	ENSLACG00000013987	-	85	39.130
ENSLACG00000017727	-	88	37.255	ENSLACG00000001384	-	100	36.585
ENSLACG00000017727	-	89	42.718	ENSLACG00000002651	-	84	42.718
ENSLACG00000017727	-	99	88.889	ENSLACG00000011580	-	95	88.889
ENSLACG00000017727	-	96	38.428	ENSLACG00000014189	-	79	38.428
ENSLACG00000017727	-	88	41.262	ENSLACG00000003451	-	91	41.262
ENSLACG00000017727	-	69	37.870	ENSLACG00000002891	-	77	37.870
ENSLACG00000017727	-	79	37.569	ENSLACG00000010165	-	69	37.569
ENSLACG00000017727	-	83	36.318	ENSLACG00000014732	-	89	36.816
ENSLACG00000017727	-	93	32.110	ENSLACG00000017411	-	98	32.110
ENSLACG00000017727	-	92	41.743	ENSLACG00000010092	-	96	40.789
ENSLACG00000017727	-	100	64.912	ENSLACG00000010019	-	95	64.912
ENSLACG00000017727	-	95	68.981	ENSLACG00000010569	-	88	68.981
ENSLACG00000017727	-	95	36.937	ENSLACG00000000534	-	82	36.937
ENSLACG00000017727	-	93	35.945	ENSLACG00000000673	-	84	35.945
ENSLACG00000017727	-	94	37.118	ENSLACG00000001077	-	93	37.118
ENSLACG00000017727	-	70	35.185	ENSLACG00000008643	-	93	35.185
ENSLACG00000017727	-	96	39.749	ENSLACG00000003957	-	83	39.749
ENSLACG00000017727	-	97	36.564	ENSLACG00000009806	-	83	36.564
ENSLACG00000017727	-	94	71.963	ENSLACG00000000848	-	89	71.963
ENSLACG00000017727	-	93	40.553	ENSLACG00000014493	-	72	40.553
ENSLACG00000017727	-	95	37.131	ENSLACG00000016396	-	83	37.131
ENSLACG00000017727	-	95	41.364	ENSLACG00000011552	-	81	41.364
ENSLACG00000017727	-	95	43.182	ENSLACG00000001559	-	73	43.182
ENSLACG00000017727	-	85	36.869	ENSLACG00000009013	-	60	36.869
ENSLACG00000017727	-	86	30.348	ENSLACG00000012896	-	74	30.348
ENSLACG00000017727	-	93	39.810	ENSLACG00000000876	-	91	39.810
ENSLACG00000017727	-	92	77.619	ENSLACG00000002189	-	91	77.619
ENSLACG00000017727	-	76	43.353	ENSLACG00000007535	-	96	43.976
ENSLACG00000017727	-	77	30.890	ENSLACG00000000425	-	97	30.890
ENSLACG00000017727	-	66	38.462	ENSLACG00000001295	-	64	38.462
ENSLACG00000017727	-	87	40.796	ENSLACG00000001298	-	85	40.796
ENSLACG00000017727	-	91	42.081	ENSLACG00000006820	-	82	42.081
ENSLACG00000017727	-	72	37.805	ENSLACG00000000907	-	78	37.805
ENSLACG00000017727	-	97	38.865	ENSLACG00000010144	-	84	38.865
ENSLACG00000017727	-	71	35.593	ENSLACG00000000903	-	77	35.593
ENSLACG00000017727	-	89	40.580	ENSLACG00000007340	-	86	40.580
ENSLACG00000017727	-	73	40.237	ENSLACG00000002051	-	86	34.454
ENSLACG00000017727	-	85	33.503	ENSLACG00000013090	-	93	33.503
ENSLACG00000017727	-	82	39.175	ENSLACG00000001055	-	85	39.175
ENSLACG00000017727	-	95	33.047	ENSLACG00000006813	-	90	33.047
ENSLACG00000017727	-	86	36.683	ENSLACG00000005368	-	92	36.683
ENSLACG00000017727	-	82	37.186	ENSLACG00000012357	-	84	37.688
ENSLACG00000017727	-	72	44.311	ENSLACG00000010080	-	71	44.311
ENSLACG00000017727	-	73	45.562	ENSLACG00000007342	-	82	45.562
ENSLACG00000017727	-	97	72.072	ENSLACG00000005009	-	90	72.072
ENSLACG00000017727	-	93	40.553	ENSLACG00000000643	-	88	40.553
ENSLACG00000017727	-	86	41.709	ENSLACG00000010705	-	82	41.709
ENSLACG00000017727	-	93	42.396	ENSLACG00000007821	-	73	42.396
ENSLACG00000017727	-	92	43.396	ENSLACG00000012198	-	89	43.396
ENSLACG00000017727	-	95	41.364	ENSLACG00000012229	-	87	41.364
ENSLACG00000017727	-	94	34.247	ENSLACG00000002451	-	79	34.247
ENSLACG00000017727	-	86	45.192	ENSLACG00000016955	-	81	45.192
ENSLACG00000017727	-	68	40.000	ENSLACG00000010633	-	97	39.181
ENSLACG00000017727	-	90	41.706	ENSLACG00000013072	-	83	41.706
ENSLACG00000017727	-	95	41.364	ENSLACG00000006210	-	84	41.364
ENSLACG00000017727	-	95	42.273	ENSLACG00000006110	-	97	42.273
ENSLACG00000017727	-	95	36.199	ENSLACG00000005266	-	77	36.199
ENSLACG00000017727	-	94	79.907	ENSLACG00000003145	-	96	79.907
ENSLACG00000017727	-	83	45.596	ENSLACG00000002135	-	86	45.596
ENSLACG00000017727	-	86	34.951	ENSLACG00000014769	-	97	36.318
ENSLACG00000017727	-	89	31.280	ENSLACG00000013182	-	93	31.280
ENSLACG00000017727	-	95	40.351	ENSLACG00000005344	-	82	40.351

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000017727	-	87	31.034	ENSACIG00000013512	-	62	31.034	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000017727	-	86	34.000	ENSAPEG00000022657	-	55	34.000	Amphiprion_percula
ENSLACG00000017727	-	92	35.349	ENSAPEG00000013155	-	66	35.349	Amphiprion_percula
ENSLACG00000017727	-	92	33.023	ENSAPEG00000002130	-	64	33.023	Amphiprion_percula
ENSLACG00000017727	-	98	36.564	ENSDARG00000109729	CABZ01073197.1	81	36.564	Danio_rerio
ENSLACG00000017727	-	82	35.052	ENSFHEG00000006296	-	58	35.052	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000017727	-	93	32.407	ENSLBEG00000017145	-	65	32.407	Labrus_bergylta
ENSLACG00000017727	-	96	34.071	ENSMZEG00005020773	-	73	34.071	Maylandia_zebra
ENSLACG00000017727	-	71	40.244	ENSONIG00000021329	-	71	40.244	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000017727	-	91	34.579	ENSONIG00000020618	-	86	34.579	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000017727	-	79	36.842	ENSORLG00000020512	-	63	36.842	Oryzias_latipes
ENSLACG00000017727	-	94	30.317	ENSOMEG00000019152	-	82	30.317	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000017727	-	85	40.415	ENSPKIG00000001458	-	75	40.415	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000017727	-	96	35.193	ENSPKIG00000009100	-	69	35.193	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000017727	-	68	41.615	ENSPMGG00000001874	-	56	41.615	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000017727	-	90	37.156	ENSPFOG00000020560	-	81	37.156	Poecilia_formosa
ENSLACG00000017727	-	91	33.019	ENSPFOG00000020584	-	76	33.019	Poecilia_formosa
ENSLACG00000017727	-	87	31.527	ENSPFOG00000020665	-	72	31.527	Poecilia_formosa
ENSLACG00000017727	-	87	30.049	ENSPMEG00000014224	-	68	30.049	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000017727	-	72	33.537	ENSPMEG00000021431	-	54	33.537	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000017727	-	87	30.049	ENSPMEG00000022872	-	63	30.049	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000017727	-	88	39.024	ENSPNYG00000003325	-	67	39.024	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000017727	-	99	37.778	ENSPNAG00000017685	-	65	37.778	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000017727	-	94	40.000	ENSSLDG00000008663	-	86	40.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000017727	-	77	31.217	ENSXMAG00000026781	-	52	31.217	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000017727	-	92	36.620	ENSXMAG00000029285	-	71	36.620	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000017727	-	77	31.217	ENSXMAG00000024802	-	58	31.217	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000017727	-	93	31.050	ENSXMAG00000023095	-	58	31.050	Xiphophorus_maculatus
ENSLACG00000017727	-	77	31.217	ENSXMAG00000021250	-	56	31.217	Xiphophorus_maculatus