EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSLACG00000017930 (Gene tree)
Gene ID: 102345104
Gene Symbol: XPO6
Alias: FLJ22519|KIAA0370|RANBP20
Full Name: exportin 6
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 98429 bases
Position: chrJH126634.1:2517059-2615487
Accession: 102345104
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000020402	Xpo1	PF08389.12	2.4e-25	1	1
ENSLACP00000020402	IBN_N	PF03810.19	2.1e-09	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000020542	XPO6-201	4747	XM_005990678	ENSLACP00000020402	1123 (aa)	XP_005990740	H3BET1

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.133	ENSG00000169180	XPO6	100	100.000	Homo_sapiens
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.868	ENSAPOG00000012873	xpo6	100	75.868	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.676	ENSAMEG00000011014	XPO6	100	85.676	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000017930	XPO6	99	76.460	ENSACIG00000008055	xpo6	99	76.664	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	77.511	ENSAOCG00000001326	xpo6	99	77.511	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000017930	XPO6	99	77.422	ENSAPEG00000016304	xpo6	99	77.422	Amphiprion_percula
ENSLACG00000017930	XPO6	100	77.128	ENSATEG00000002273	xpo6	100	77.168	Anabas_testudineus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	88.256	ENSAPLG00000007480	XPO6	99	88.701	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.133	ENSACAG00000016883	XPO6	100	75.575	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.956	ENSANAG00000031761	XPO6	100	85.956	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000017930	XPO6	99	77.005	ENSACLG00000007048	xpo6	99	77.005	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000017930	XPO6	100	72.140	ENSAMXG00000032539	xpo6	100	72.140	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.333	ENSBTAG00000010309	XPO6	100	85.333	Bos_taurus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSCJAG00000006014	XPO6	100	86.044	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.943	ENSCAFG00000017356	XPO6	100	85.943	Canis_familiaris
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSCAFG00020011808	XPO6	100	86.044	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.511	ENSCHIG00000022341	XPO6	100	85.511	Capra_hircus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	82.605	ENSTSYG00000012249	XPO6	100	82.605	Carlito_syrichta
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.511	ENSCPOG00000012824	XPO6	100	85.511	Cavia_porcellus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSCCAG00000036360	XPO6	100	86.044	Cebus_capucinus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSCATG00000034030	XPO6	100	86.044	Cercocebus_atys
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.320	ENSCLAG00000012270	XPO6	100	85.320	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000017930	XPO6	91	85.663	ENSCHOG00000004369	XPO6	91	85.663	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000017930	XPO6	89	86.887	ENSCPBG00000024660	XPO6	99	91.176	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000017930	XPO6	100	47.686	ENSCING00000006884	-	100	47.686	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000017930	XPO6	99	45.790	ENSCSAVG00000000850	-	99	45.790	Ciona_savignyi
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.956	ENSCANG00000041578	XPO6	100	85.956	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.511	ENSCGRG00001013173	Xpo6	100	85.511	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000017930	XPO6	100	76.377	ENSCSEG00000013622	xpo6	100	76.377	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000017930	XPO6	99	76.349	ENSCVAG00000017399	xpo6	100	76.349	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000017930	XPO6	97	71.069	ENSDARG00000041217	xpo6	99	71.069	Danio_rerio
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.311	ENSDNOG00000012449	XPO6	100	86.311	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.778	ENSDORG00000000919	Xpo6	100	85.778	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000017930	XPO6	82	83.012	ENSETEG00000018768	XPO6	85	83.012	Echinops_telfairi
ENSLACG00000017930	XPO6	100	62.356	ENSEBUG00000015560	xpo6	99	62.411	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.133	ENSEASG00005017296	XPO6	100	86.133	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSECAG00000008601	XPO6	100	86.044	Equus_caballus
ENSLACG00000017930	XPO6	97	79.560	ENSEEUG00000014587	XPO6	100	79.560	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	79.464	ENSELUG00000009159	xpo6	99	79.464	Esox_lucius
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.600	ENSFCAG00000010309	XPO6	100	85.600	Felis_catus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	86.484	ENSFALG00000004441	XPO6	98	86.926	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.587	ENSFDAG00000012689	XPO6	100	85.587	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000017930	XPO6	99	76.304	ENSFHEG00000021190	xpo6	99	76.304	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	88.178	ENSGALG00000035360	XPO6	100	88.622	Gallus_gallus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	74.826	ENSGAFG00000004044	xpo6	100	74.826	Gambusia_affinis
ENSLACG00000017930	XPO6	95	87.992	ENSGAGG00000022738	XPO6	100	88.086	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSGGOG00000005609	XPO6	100	86.044	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.608	ENSHBUG00000019504	xpo6	100	75.608	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.778	ENSHGLG00000009679	-	100	85.778	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000017930	XPO6	94	67.615	ENSHGLG00000003865	-	99	67.773	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000017930	XPO6	94	70.189	ENSHGLG00100001081	-	99	70.189	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.689	ENSHGLG00100003673	-	99	85.689	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.000	ENSHCOG00000004987	xpo6	100	74.891	Hippocampus_comes
ENSLACG00000017930	XPO6	100	71.341	ENSIPUG00000006516	xpo6	100	71.429	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.778	ENSSTOG00000012161	XPO6	100	85.778	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.244	ENSJJAG00000019392	Xpo6	100	85.244	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	76.313	ENSKMAG00000010403	xpo6	99	76.313	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	76.999	ENSLBEG00000023039	xpo6	99	76.999	Labrus_bergylta
ENSLACG00000017930	XPO6	94	81.606	ENSLOCG00000003304	xpo6	100	81.606	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.587	ENSLAFG00000011960	XPO6	98	89.011	Loxodonta_africana
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSMFAG00000045067	XPO6	100	86.044	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSMMUG00000018623	XPO6	100	86.044	Macaca_mulatta
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSMNEG00000028587	XPO6	100	86.044	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSMLEG00000029685	XPO6	100	86.044	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.260	ENSMAMG00000001351	xpo6	100	76.025	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	77.094	ENSMZEG00005010620	xpo6	99	77.094	Maylandia_zebra
ENSLACG00000017930	XPO6	97	87.238	ENSMGAG00000009566	XPO6	100	87.694	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000017930	XPO6	99	75.758	ENSMAUG00000012539	Xpo6	100	75.490	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.133	ENSMICG00000001923	XPO6	100	86.133	Microcebus_murinus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.778	ENSMOCG00000008015	Xpo6	100	85.778	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000017930	XPO6	100	76.377	ENSMMOG00000011992	xpo6	100	76.377	Mola_mola
ENSLACG00000017930	XPO6	100	87.644	ENSMODG00000015516	XPO6	100	87.644	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000017930	XPO6	99	70.479	ENSMALG00000020612	xpo6	99	70.567	Monopterus_albus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.867	MGP_CAROLIEiJ_G0030439	Xpo6	99	88.493	Mus_caroli
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.867	ENSMUSG00000000131	Xpo6	100	85.867	Mus_musculus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.689	MGP_PahariEiJ_G0013649	Xpo6	100	85.689	Mus_pahari
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.689	MGP_SPRETEiJ_G0031553	Xpo6	100	85.689	Mus_spretus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.142	ENSMPUG00000012920	XPO6	98	85.142	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000017930	XPO6	99	84.964	ENSMLUG00000012970	XPO6	100	84.964	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	86.121	ENSNGAG00000012740	Xpo6	99	86.121	Nannospalax_galili
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.694	ENSNBRG00000007275	xpo6	100	75.694	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.133	ENSNLEG00000011518	XPO6	100	86.133	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000017930	XPO6	87	87.855	ENSOPRG00000009278	XPO6	87	87.855	Ochotona_princeps
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.333	ENSODEG00000012917	XPO6	100	85.333	Octodon_degus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.434	ENSONIG00000019366	xpo6	100	75.434	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.587	ENSOCUG00000002727	XPO6	100	85.587	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.510	ENSORLG00000011231	xpo6	100	75.510	Oryzias_latipes
ENSLACG00000017930	XPO6	99	77.163	ENSORLG00020000386	xpo6	99	77.163	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.333	ENSORLG00015003636	xpo6	100	75.333	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.304	ENSOMEG00000016505	xpo6	100	75.304	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000017930	XPO6	99	86.121	ENSOGAG00000012844	XPO6	100	86.121	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.498	ENSOARG00000000960	XPO6	100	85.498	Ovis_aries
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSPPAG00000033668	XPO6	100	86.044	Pan_paniscus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.329	ENSPPRG00000001454	XPO6	100	85.329	Panthera_pardus
ENSLACG00000017930	XPO6	97	84.715	ENSPTIG00000016663	XPO6	99	84.715	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSPTRG00000007919	XPO6	100	86.044	Pan_troglodytes
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSPANG00000017103	XPO6	100	86.044	Papio_anubis
ENSLACG00000017930	XPO6	100	79.822	ENSPKIG00000022550	xpo6	99	79.822	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000017930	XPO6	99	86.061	ENSPSIG00000018225	XPO6	100	86.061	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000017930	XPO6	99	76.148	ENSPMGG00000014436	xpo6	100	76.148	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.511	ENSPEMG00000012100	Xpo6	100	85.511	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000017930	XPO6	99	71.642	ENSPMAG00000003127	xpo6	99	71.642	Petromyzon_marinus
ENSLACG00000017930	XPO6	97	87.179	ENSPCIG00000003863	XPO6	100	87.136	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	74.848	ENSPFOG00000008763	xpo6	100	74.848	Poecilia_formosa
ENSLACG00000017930	XPO6	100	74.826	ENSPLAG00000014054	xpo6	100	74.826	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000017930	XPO6	100	74.739	ENSPMEG00000018994	xpo6	100	74.739	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000017930	XPO6	97	74.575	ENSPREG00000016421	xpo6	96	74.575	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSPPYG00000007218	XPO6	100	86.044	Pongo_abelii
ENSLACG00000017930	XPO6	90	86.047	ENSPCAG00000008918	XPO6	90	86.047	Procavia_capensis
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.133	ENSPCOG00000017886	XPO6	100	86.133	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000017930	XPO6	80	92.754	ENSPVAG00000012234	XPO6	80	92.754	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	77.176	ENSPNYG00000008375	xpo6	100	77.176	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000017930	XPO6	100	71.640	ENSPNAG00000008284	xpo6	100	71.640	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.244	ENSRNOG00000016722	Xpo6	98	88.219	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSRBIG00000031469	XPO6	100	86.044	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000017930	XPO6	100	85.956	ENSRROG00000044864	XPO6	100	85.956	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSSBOG00000027650	XPO6	100	86.044	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000017930	XPO6	100	87.289	ENSSHAG00000013864	XPO6	100	87.289	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000017930	XPO6	100	76.174	ENSSFOG00015009347	xpo6	100	76.439	Scleropages_formosus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	76.313	ENSSMAG00000010566	xpo6	99	76.313	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.955	ENSSDUG00000017294	xpo6	100	75.955	Seriola_dumerili
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ENSLACG00000017930	XPO6	99	77.448	ENSSPAG00000009469	xpo6	99	77.448	Stegastes_partitus
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.133	ENSSSCG00000007812	XPO6	100	86.133	Sus_scrofa
ENSLACG00000017930	XPO6	87	86.965	ENSTGUG00000003781	XPO6	100	87.475	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000017930	XPO6	100	74.978	ENSTRUG00000004696	xpo6	100	74.978	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000017930	XPO6	99	74.805	ENSTNIG00000018949	xpo6	99	74.891	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000017930	XPO6	93	94.815	ENSTBEG00000009945	XPO6	93	94.815	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000017930	XPO6	99	85.320	ENSTTRG00000009558	XPO6	100	85.320	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000017930	XPO6	99	83.961	ENSUMAG00000007086	XPO6	99	83.961	Ursus_maritimus
ENSLACG00000017930	XPO6	91	92.647	ENSVPAG00000008493	XPO6	94	92.647	Vicugna_pacos
ENSLACG00000017930	XPO6	100	86.044	ENSVVUG00000024150	XPO6	100	86.044	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000017930	XPO6	99	78.292	ENSXETG00000010326	xpo6	99	78.292	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000017930	XPO6	100	75.087	ENSXMAG00000011630	xpo6	100	75.087	Xiphophorus_maculatus