EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

Pathways

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000018148 (Gene tree)
Gene ID: 102360452
Gene Symbol: EHD1
Alias: FLJ42622|FLJ44618|H-PAST|HPAST1|PAST1
Full Name: EH domain containing 1
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 32588 bases
Position: chrJH126593.1:2813179-2845766
Accession: 102360452
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000020654	MMR_HSR1	PF01926.23	1.9e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000020794	EHD1-201	2012	XM_005988880	ENSLACP00000020654	536 (aa)	XP_005988942	H3BFI3

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000018148's gene model file

Pathways

Pathway ID	Pathway Name	Source
lcm04144	Endocytosis	KEGG

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000018148's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000018148	EHD1	54	37.113	ENSLACG00000002825	SRL	64	37.113
ENSLACG00000018148	EHD1	99	77.799	ENSLACG00000017804	EHD4	90	77.799
ENSLACG00000018148	EHD1	100	64.804	ENSLACG00000018332	ehd2a	99	64.804

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSG00000110047	EHD1	100	93.293	Homo_sapiens
ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.973	ENSAPOG00000013440	ehd1a	98	86.973	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.366	ENSAMEG00000017785	EHD1	96	89.366	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.165	ENSACIG00000022182	ehd1a	98	87.165	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.356	ENSAOCG00000016322	ehd1a	98	87.356	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.356	ENSAPEG00000010363	ehd1a	98	87.356	Amphiprion_percula
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.739	ENSATEG00000013980	ehd1a	98	87.739	Anabas_testudineus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSANAG00000034810	EHD1	100	89.925	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.548	ENSACLG00000016016	ehd1a	98	87.548	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000018148	EHD1	99	84.803	ENSAMXG00000039344	ehd1a	99	84.803	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000018148	EHD1	99	84.428	ENSAMXG00000031892	-	99	84.428	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSBTAG00000050712	EHD1	100	89.925	Bos_taurus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	66.789	WBGene00004373	rme-1	98	66.789	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSCJAG00000002660	EHD1	100	89.925	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000018148	EHD1	79	89.671	ENSCAFG00000014128	EHD1	92	89.450	Canis_familiaris
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.739	ENSCAFG00020014846	EHD1	100	89.739	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSCHIG00000020707	-	100	89.925	Capra_hircus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSCPOG00000008157	EHD1	100	89.925	Cavia_porcellus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSCCAG00000004590	EHD1	100	89.925	Cebus_capucinus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.299	ENSCATG00000010658	EHD1	97	90.299	Cercocebus_atys
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSCLAG00000016412	EHD1	100	89.925	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSCSAG00000007397	EHD1	100	90.112	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000018148	EHD1	99	88.889	ENSCPBG00000023692	EHD1	98	88.889	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSCANG00000042123	EHD1	100	90.112	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	ENSCGRG00001019701	Ehd1	100	89.552	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000018148	EHD1	94	89.109	ENSCGRG00000000662	Ehd1	99	89.109	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000018148	EHD1	97	85.441	ENSCSEG00000006078	ehd1a	98	85.441	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.739	ENSCVAG00000012152	ehd1a	98	87.739	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	84.328	ENSDARG00000098853	ehd1a	99	84.328	Danio_rerio
ENSLACG00000018148	EHD1	99	86.492	ENSDARG00000014793	ehd1b	99	86.492	Danio_rerio
ENSLACG00000018148	EHD1	68	90.608	ENSDNOG00000017834	EHD1	96	90.608	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	ENSDORG00000030186	Ehd1	100	89.552	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000018148	EHD1	99	68.715	FBgn0016693	Past1	99	68.715	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000018148	EHD1	59	79.299	ENSEBUG00000010829	EHD1	90	79.299	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000018148	EHD1	100	78.253	ENSEBUG00000009968	EHD1	99	78.253	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	ENSEASG00005018250	EHD1	100	89.552	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	ENSECAG00000011638	EHD1	100	89.552	Equus_caballus
ENSLACG00000018148	EHD1	99	85.849	ENSELUG00000016093	ehd1b	99	85.958	Esox_lucius
ENSLACG00000018148	EHD1	98	86.667	ENSELUG00000007973	-	98	86.667	Esox_lucius
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSFCAG00000027734	EHD1	97	90.112	Felis_catus
ENSLACG00000018148	EHD1	99	90.449	ENSFDAG00000007697	EHD1	99	90.449	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.931	ENSFHEG00000002690	ehd1a	98	87.931	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.973	ENSGMOG00000012192	ehd1a	99	86.973	Gadus_morhua
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.356	ENSGAFG00000000730	ehd1a	98	87.356	Gambusia_affinis
ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.590	ENSGACG00000017605	ehd1a	98	86.590	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	88.993	ENSGAGG00000001677	-	92	88.993	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.548	ENSHBUG00000012087	ehd1a	98	87.548	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSHGLG00000010254	EHD1	100	89.925	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSHGLG00100014206	EHD1	100	89.925	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.398	ENSHCOG00000006825	ehd1a	98	86.398	Hippocampus_comes
ENSLACG00000018148	EHD1	99	85.741	ENSIPUG00000002819	ehd1a	99	85.741	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	84.515	ENSIPUG00000017390	EHD1	99	84.644	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSSTOG00000009829	EHD1	100	89.925	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.366	ENSJJAG00000022299	Ehd1	100	89.366	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.165	ENSKMAG00000004764	ehd1a	98	87.165	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.207	ENSLBEG00000004390	ehd1a	98	86.207	Labrus_bergylta
ENSLACG00000018148	EHD1	99	81.426	ENSLOCG00000000924	ehd1b	96	81.426	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	87.127	ENSLAFG00000011643	EHD1	100	87.127	Loxodonta_africana
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSMFAG00000032608	EHD1	100	90.112	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSMMUG00000003972	EHD1	97	90.112	Macaca_mulatta
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSMNEG00000031673	EHD1	100	90.112	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSMLEG00000031992	EHD1	100	90.112	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.973	ENSMAMG00000021737	ehd1a	98	86.973	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.548	ENSMZEG00005004305	ehd1a	98	87.548	Maylandia_zebra
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	ENSMAUG00000013823	Ehd1	100	89.552	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSMICG00000001239	EHD1	99	89.888	Microcebus_murinus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.739	ENSMOCG00000015517	Ehd1	100	89.739	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000018148	EHD1	98	87.786	ENSMMOG00000003005	ehd1a	98	87.786	Mola_mola
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.356	ENSMALG00000012679	ehd1a	98	87.356	Monopterus_albus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	MGP_CAROLIEiJ_G0022603	Ehd1	100	89.552	Mus_caroli
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	ENSMUSG00000024772	Ehd1	100	89.552	Mus_musculus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.366	MGP_PahariEiJ_G0014097	Ehd1	100	89.366	Mus_pahari
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	MGP_SPRETEiJ_G0023514	Ehd1	100	89.552	Mus_spretus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSMPUG00000012497	EHD1	100	89.925	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.739	ENSNGAG00000020358	Ehd1	100	89.739	Nannospalax_galili
ENSLACG00000018148	EHD1	98	87.786	ENSNBRG00000002933	ehd1a	98	87.786	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSNLEG00000005375	EHD1	100	90.112	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.366	ENSOPRG00000011350	EHD1	100	89.366	Ochotona_princeps
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSODEG00000014527	EHD1	100	89.925	Octodon_degus
ENSLACG00000018148	EHD1	61	91.104	ENSOCUG00000029532	EHD1	96	91.104	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.165	ENSORLG00000022561	ehd1a	98	87.165	Oryzias_latipes
ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.973	ENSORLG00020018451	ehd1a	98	86.973	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.973	ENSORLG00015017672	ehd1a	98	86.973	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.739	ENSOMEG00000019329	ehd1a	98	87.739	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.739	ENSOGAG00000009351	EHD1	100	89.739	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000018148	EHD1	91	90.408	ENSOARG00000010447	EHD1	99	90.408	Ovis_aries
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSPPAG00000037178	EHD1	100	90.112	Pan_paniscus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	87.873	ENSPPRG00000006031	EHD1	97	87.873	Panthera_pardus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSPTRG00000003851	EHD1	97	90.112	Pan_troglodytes
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSPANG00000023358	EHD1	97	90.112	Papio_anubis
ENSLACG00000018148	EHD1	68	88.950	ENSPKIG00000020297	-	88	88.950	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000018148	EHD1	99	84.717	ENSPKIG00000023165	-	99	84.717	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	ENSPSIG00000005727	EHD1	100	89.552	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000018148	EHD1	99	85.122	ENSPMGG00000017810	ehd1a	97	86.015	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.739	ENSPEMG00000010917	Ehd1	100	89.739	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.739	ENSPCIG00000014850	EHD1	100	89.739	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000018148	EHD1	73	69.133	ENSPCIG00000017053	-	96	69.133	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.931	ENSPFOG00000010613	ehd1a	97	87.931	Poecilia_formosa
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.931	ENSPLAG00000023296	ehd1a	98	87.931	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.931	ENSPMEG00000003397	ehd1a	98	87.931	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000018148	EHD1	97	88.123	ENSPREG00000015893	ehd1a	98	88.123	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSPPYG00000003093	EHD1	100	90.112	Pongo_abelii
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.739	ENSPCOG00000010309	EHD1	99	89.739	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000018148	EHD1	99	90.075	ENSPVAG00000007890	EHD1	99	90.075	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.548	ENSPNYG00000015448	ehd1a	98	87.548	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000018148	EHD1	99	86.679	ENSPNAG00000007408	EHD1	99	86.679	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000018148	EHD1	99	85.366	ENSPNAG00000023091	ehd1a	99	85.366	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.552	ENSRNOG00000043503	Ehd1	100	89.552	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSRBIG00000039111	EHD1	100	90.112	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000018148	EHD1	100	90.112	ENSRROG00000026366	EHD1	100	90.112	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSSBOG00000023399	EHD1	100	89.925	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000018148	EHD1	75	68.983	ENSSHAG00000007430	-	96	66.587	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000018148	EHD1	100	86.567	ENSSFOG00015006481	-	99	86.567	Scleropages_formosus
ENSLACG00000018148	EHD1	92	86.762	ENSSFOG00015019587	EHD1	100	86.762	Scleropages_formosus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	85.824	ENSSMAG00000018210	ehd1a	98	85.824	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.356	ENSSDUG00000016436	ehd1a	98	87.356	Seriola_dumerili
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.356	ENSSLDG00000015328	ehd1a	98	87.356	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.165	ENSSPAG00000008682	ehd1a	98	87.165	Stegastes_partitus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.925	ENSSSCG00000013017	EHD1	100	89.925	Sus_scrofa
ENSLACG00000018148	EHD1	97	88.314	ENSTRUG00000025890	ehd1a	98	88.314	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000018148	EHD1	97	86.973	ENSTNIG00000016792	ehd1a	97	86.973	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000018148	EHD1	78	81.146	ENSTBEG00000007057	EHD1	100	81.146	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.366	ENSTTRG00000008887	EHD1	100	89.366	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.739	ENSUAMG00000012071	EHD1	100	89.739	Ursus_americanus
ENSLACG00000018148	EHD1	98	88.381	ENSUMAG00000007890	EHD1	99	88.381	Ursus_maritimus
ENSLACG00000018148	EHD1	100	89.739	ENSVVUG00000027552	EHD1	84	89.739	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000018148	EHD1	100	88.993	ENSXETG00000001638	ehd1	100	88.993	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000018148	EHD1	99	86.654	ENSXCOG00000001781	ehd1a	98	86.654	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000018148	EHD1	97	87.739	ENSXMAG00000005301	ehd1a	98	87.739	Xiphophorus_maculatus