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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSLACG00000018623 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: REXO2
Alias: CGI-114|DKFZP566E144|SFN
Full Name: RNA exonuclease 2
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 9134 bases
Position: chrJH126582.1:3817854-3826987
Accession: 17851
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000021199	RNase_T	PF00929.24	4.3e-24	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000021339	REXO2-201	1272	-	ENSLACP00000021199	243 (aa)	-	H3BH28

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000018623	REXO2	97	67.227	ENSG00000076043	REXO2	97	75.135	Homo_sapiens
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSAMEG00000013263	REXO2	94	71.239	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLACG00000018623	REXO2	74	71.978	ENSACIG00000023553	smfn	97	71.978	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000018623	REXO2	52	78.295	ENSAOCG00000011565	smfn	79	78.295	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000018623	REXO2	86	67.773	ENSAPEG00000012435	smfn	76	67.773	Amphiprion_percula
ENSLACG00000018623	REXO2	82	70.647	ENSATEG00000015385	smfn	71	70.647	Anabas_testudineus
ENSLACG00000018623	REXO2	78	75.916	ENSAPLG00000005045	REXO2	92	75.916	Anas_platyrhynchos
ENSLACG00000018623	REXO2	84	60.870	ENSACAG00000011631	REXO2	100	59.361	Anolis_carolinensis
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.239	ENSANAG00000020834	REXO2	94	71.681	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000018623	REXO2	91	64.414	ENSACLG00000024566	smfn	95	70.330	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSBTAG00000005843	REXO2	94	71.239	Bos_taurus
ENSLACG00000018623	REXO2	77	43.011	WBGene00007429	C08B6.8	92	56.944	Caenorhabditis_elegans
ENSLACG00000018623	REXO2	97	66.807	ENSCJAG00000012434	REXO2	97	67.227	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000018623	REXO2	97	66.387	ENSCAFG00000013511	REXO2	97	66.807	Canis_familiaris
ENSLACG00000018623	REXO2	97	67.227	ENSCAFG00020002513	REXO2	97	67.647	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSCHIG00000009264	REXO2	94	71.239	Capra_hircus
ENSLACG00000018623	REXO2	77	66.842	ENSTSYG00000027948	-	96	67.368	Carlito_syrichta
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSTSYG00000002237	REXO2	94	71.239	Carlito_syrichta
ENSLACG00000018623	REXO2	75	75.135	ENSCAPG00000006093	REXO2	97	75.676	Cavia_aperea
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.239	ENSCPOG00000010548	REXO2	94	71.681	Cavia_porcellus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.681	ENSCCAG00000034979	REXO2	94	72.124	Cebus_capucinus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSCATG00000015278	REXO2	94	71.239	Cercocebus_atys
ENSLACG00000018623	REXO2	90	70.909	ENSCLAG00000011195	REXO2	92	71.364	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.354	ENSCSAG00000002754	REXO2	94	70.796	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	68.304	ENSCHOG00000000642	-	94	68.750	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000018623	REXO2	60	56.849	ENSCHOG00000013497	REXO2	99	56.849	Choloepus_hoffmanni
ENSLACG00000018623	REXO2	57	83.571	ENSCPBG00000009359	REXO2	97	83.571	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000018623	REXO2	75	53.552	ENSCING00000009858	-	87	53.552	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSCANG00000034756	REXO2	94	71.239	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000018623	REXO2	82	72.139	ENSCGRG00001010922	-	97	72.637	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000018623	REXO2	82	73.134	ENSCGRG00001013673	-	97	73.632	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000018623	REXO2	93	70.175	ENSCGRG00001019814	-	94	70.614	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000018623	REXO2	93	70.175	ENSCGRG00000006235	Rexo2	94	70.614	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLACG00000018623	REXO2	93	62.500	ENSCSEG00000007214	smfn	83	62.500	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000018623	REXO2	76	66.845	ENSCVAG00000012008	smfn	100	66.845	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000018623	REXO2	90	68.807	ENSDARG00000009806	smfn	81	68.807	Danio_rerio
ENSLACG00000018623	REXO2	81	72.081	ENSDNOG00000046533	REXO2	98	70.531	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.239	ENSDORG00000011255	Rexo2	94	71.681	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000018623	REXO2	78	62.500	ENSDORG00000025142	-	88	62.069	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000018623	REXO2	79	43.523	FBgn0039115	CG10214	89	43.523	Drosophila_melanogaster
ENSLACG00000018623	REXO2	74	72.778	ENSEBUG00000013964	REXO2	61	72.778	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.089	ENSEASG00005006674	REXO2	94	70.536	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.089	ENSECAG00000005988	REXO2	94	70.536	Equus_caballus
ENSLACG00000018623	REXO2	83	69.608	ENSELUG00000020072	smfn	70	69.608	Esox_lucius
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSFCAG00000018632	REXO2	94	71.239	Felis_catus
ENSLACG00000018623	REXO2	76	75.806	ENSFALG00000010044	REXO2	91	75.806	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.239	ENSFDAG00000011764	REXO2	94	71.681	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000018623	REXO2	77	71.809	ENSGMOG00000006370	smfn	96	71.809	Gadus_morhua
ENSLACG00000018623	REXO2	79	77.720	ENSGALG00000035980	REXO2	91	73.148	Gallus_gallus
ENSLACG00000018623	REXO2	82	68.317	ENSGAFG00000015349	smfn	71	68.317	Gambusia_affinis
ENSLACG00000018623	REXO2	77	68.617	ENSGACG00000020096	smfn	92	68.617	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000018623	REXO2	88	70.968	ENSGAGG00000021126	REXO2	93	70.968	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSGGOG00000023267	REXO2	97	67.647	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000018623	REXO2	51	79.200	ENSHBUG00000020097	REXO2	62	79.200	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.354	ENSHGLG00000013556	REXO2	94	70.796	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSHGLG00100005257	REXO2	94	71.239	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000018623	REXO2	74	67.778	ENSHCOG00000007122	smfn	98	67.778	Hippocampus_comes
ENSLACG00000018623	REXO2	81	71.859	ENSIPUG00000020440	rexo2	76	69.378	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000018623	REXO2	97	67.227	ENSSTOG00000012465	REXO2	97	67.647	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000018623	REXO2	97	47.479	ENSJJAG00000022605	-	96	47.479	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.239	ENSJJAG00000013710	-	94	71.681	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000018623	REXO2	79	68.718	ENSKMAG00000016795	smfn	72	66.829	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000018623	REXO2	74	70.492	ENSLBEG00000006021	smfn	96	70.492	Labrus_bergylta
ENSLACG00000018623	REXO2	83	74.020	ENSLOCG00000002389	smfn	96	74.020	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000018623	REXO2	81	74.747	ENSLAFG00000012451	REXO2	92	71.818	Loxodonta_africana
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSMFAG00000041155	REXO2	94	71.239	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSMMUG00000012269	REXO2	94	71.239	Macaca_mulatta
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSMNEG00000033379	REXO2	94	71.239	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSMLEG00000036571	REXO2	94	71.239	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000018623	REXO2	86	66.667	ENSMAMG00000021209	smfn	76	66.667	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	64.414	ENSMZEG00005020730	REXO2	84	64.414	Maylandia_zebra
ENSLACG00000018623	REXO2	91	64.414	ENSMZEG00005023224	-	84	64.414	Maylandia_zebra
ENSLACG00000018623	REXO2	63	84.177	ENSMGAG00000003026	REXO2	97	84.177	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000018623	REXO2	93	70.175	ENSMAUG00000014576	Rexo2	94	70.614	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.239	ENSMICG00000010094	REXO2	94	71.681	Microcebus_murinus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.556	ENSMOCG00000009016	Rexo2	94	71.556	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000018623	REXO2	80	67.005	ENSMMOG00000006430	smfn	72	67.005	Mola_mola
ENSLACG00000018623	REXO2	92	72.124	ENSMODG00000013913	REXO2	92	72.124	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000018623	REXO2	94	58.120	ENSMALG00000018130	smfn	65	58.120	Monopterus_albus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	69.778	MGP_CAROLIEiJ_G0032166	Rexo2	94	70.222	Mus_caroli
ENSLACG00000018623	REXO2	91	69.778	ENSMUSG00000032026	Rexo2	94	70.222	Mus_musculus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	69.778	MGP_PahariEiJ_G0015034	Rexo2	94	70.222	Mus_pahari
ENSLACG00000018623	REXO2	91	69.778	MGP_SPRETEiJ_G0033305	Rexo2	94	70.222	Mus_spretus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSMPUG00000003947	REXO2	94	71.239	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.354	ENSMLUG00000009030	REXO2	94	70.796	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000018623	REXO2	82	74.627	ENSNGAG00000008819	Rexo2	97	75.124	Nannospalax_galili
ENSLACG00000018623	REXO2	77	70.430	ENSNBRG00000006529	smfn	98	70.430	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSNLEG00000029745	REXO2	97	67.647	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000018623	REXO2	90	72.851	ENSMEUG00000011558	REXO2	97	72.851	Notamacropus_eugenii
ENSLACG00000018623	REXO2	52	82.946	ENSOPRG00000011076	REXO2	54	83.721	Ochotona_princeps
ENSLACG00000018623	REXO2	81	59.091	ENSODEG00000016046	-	98	59.091	Octodon_degus
ENSLACG00000018623	REXO2	75	75.135	ENSODEG00000009750	-	97	75.676	Octodon_degus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	65.315	ENSONIG00000001954	smfn	94	65.315	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000018623	REXO2	83	73.399	ENSOANG00000001754	REXO2	97	67.373	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLACG00000018623	REXO2	83	74.877	ENSOCUG00000004274	REXO2	89	70.742	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	67.257	ENSORLG00000005119	smfn	72	67.257	Oryzias_latipes
ENSLACG00000018623	REXO2	81	72.500	ENSORLG00020010121	smfn	64	72.500	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000018623	REXO2	81	72.000	ENSORLG00015015699	smfn	67	69.856	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000018623	REXO2	57	80.714	ENSOMEG00000008940	-	98	80.714	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000018623	REXO2	85	68.421	ENSOMEG00000016878	REXO2	75	68.421	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.239	ENSOGAG00000016860	REXO2	94	71.681	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000018623	REXO2	81	74.747	ENSOARG00000001040	REXO2	97	72.596	Ovis_aries
ENSLACG00000018623	REXO2	97	67.227	ENSPPAG00000039849	REXO2	97	67.647	Pan_paniscus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSPPRG00000007255	REXO2	94	71.239	Panthera_pardus
ENSLACG00000018623	REXO2	75	74.595	ENSPTIG00000015578	REXO2	97	75.135	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000018623	REXO2	97	67.227	ENSPTRG00000004306	REXO2	97	67.647	Pan_troglodytes
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSPANG00000010675	REXO2	94	71.239	Papio_anubis
ENSLACG00000018623	REXO2	94	64.957	ENSPKIG00000000911	smfn	77	76.000	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000018623	REXO2	80	76.142	ENSPSIG00000005151	REXO2	78	72.350	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000018623	REXO2	77	67.895	ENSPMGG00000007442	smfn	100	67.895	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000018623	REXO2	83	66.995	ENSPEMG00000001421	Rexo2	84	67.488	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000018623	REXO2	92	72.124	ENSPCIG00000011227	REXO2	58	72.124	Phascolarctos_cinereus
ENSLACG00000018623	REXO2	83	68.473	ENSPFOG00000017861	smfn	98	69.154	Poecilia_formosa
ENSLACG00000018623	REXO2	74	65.556	ENSPLAG00000007327	REXO2	68	65.556	Poecilia_latipinna
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ENSLACG00000018623	REXO2	82	68.317	ENSPREG00000016438	smfn	71	68.317	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSPPYG00000003895	REXO2	97	67.647	Pongo_abelii
ENSLACG00000018623	REXO2	91	69.643	ENSPCAG00000005237	REXO2	94	71.239	Procavia_capensis
ENSLACG00000018623	REXO2	77	70.899	ENSPCOG00000027639	REXO2	95	70.899	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000018623	REXO2	91	68.142	ENSPVAG00000005295	REXO2	94	68.584	Pteropus_vampyrus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	63.964	ENSPNYG00000018401	smfn	84	63.964	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000018623	REXO2	79	74.611	ENSPNAG00000005290	smfn	79	68.182	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.222	ENSRNOG00000018939	Rexo2	94	70.667	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSRBIG00000037809	REXO2	94	71.239	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000018623	REXO2	91	70.796	ENSRROG00000038928	REXO2	94	71.239	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000018623	REXO2	72	39.560	YLR059C	REX2	68	39.560	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLACG00000018623	REXO2	91	71.239	ENSSBOG00000028651	REXO2	94	71.681	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000018623	REXO2	92	72.124	ENSSHAG00000008008	REXO2	93	72.124	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000018623	REXO2	75	71.892	ENSSFOG00015022414	smfn	97	71.892	Scleropages_formosus
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ENSLACG00000018623	REXO2	90	64.732	ENSSDUG00000015624	smfn	78	64.732	Seriola_dumerili
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ENSLACG00000018623	REXO2	74	71.585	ENSSPAG00000001530	smfn	97	71.585	Stegastes_partitus
ENSLACG00000018623	REXO2	93	69.163	ENSSSCG00000015056	REXO2	92	69.604	Sus_scrofa
ENSLACG00000018623	REXO2	80	74.619	ENSTGUG00000000121	REXO2	90	71.296	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000018623	REXO2	78	71.429	ENSTRUG00000021529	smfn	73	69.192	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000018623	REXO2	92	65.778	ENSTNIG00000008588	smfn	96	66.667	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000018623	REXO2	97	67.227	ENSTBEG00000017040	REXO2	97	67.647	Tupaia_belangeri
ENSLACG00000018623	REXO2	91	68.750	ENSTTRG00000014928	REXO2	94	69.196	Tursiops_truncatus
ENSLACG00000018623	REXO2	91	63.274	ENSUAMG00000019096	REXO2	95	69.841	Ursus_americanus
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ENSLACG00000018623	REXO2	75	55.978	ENSVPAG00000006301	REXO2	97	57.297	Vicugna_pacos
ENSLACG00000018623	REXO2	99	66.116	ENSVVUG00000025223	REXO2	97	67.227	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000018623	REXO2	83	74.634	ENSXETG00000012648	rexo2	83	74.634	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000018623	REXO2	84	64.251	ENSXCOG00000018838	smfn	96	67.179	Xiphophorus_couchianus
ENSLACG00000018623	REXO2	81	68.000	ENSXMAG00000021125	smfn	63	68.000	Xiphophorus_maculatus