EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000018917 (Gene tree)
Gene ID: 102355797
Gene Symbol: tyw1
Alias: im:6898509|wu:fb74d01|zgc:153368
Full Name: tRNA-yW synthesizing protein 1 homolog
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 116139 bases
Position: chrJH126574.1:5297827-5413965
Accession: 102355797
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000021528	Wyosine_form	PF08608.12	1.9e-27	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000021669	-	2280	XM_005987563	ENSLACP00000021528	759 (aa)	-	H3BI07

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.849	ENSG00000198874	TYW1	99	66.849	Homo_sapiens
ENSLACG00000018917	tyw1	96	58.654	ENSG00000277149	TYW1B	98	56.946	Homo_sapiens
ENSLACG00000018917	tyw1	99	63.696	ENSAPOG00000014391	tyw1	99	63.565	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLACG00000018917	tyw1	95	64.560	ENSACIG00000007325	tyw1	99	64.099	Amphilophus_citrinellus
ENSLACG00000018917	tyw1	99	63.386	ENSAOCG00000016792	tyw1	99	64.436	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000018917	tyw1	97	64.698	ENSAPEG00000015939	tyw1	99	67.204	Amphiprion_percula
ENSLACG00000018917	tyw1	90	64.338	ENSATEG00000006856	tyw1	93	62.518	Anabas_testudineus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.392	ENSANAG00000037051	-	98	65.385	Aotus_nancymaae
ENSLACG00000018917	tyw1	99	65.212	ENSACLG00000018688	tyw1	99	64.032	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000018917	tyw1	98	65.421	ENSAMXG00000004157	tyw1	100	65.995	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	67.121	ENSBTAG00000008446	TYW1	99	66.530	Bos_taurus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	67.353	ENSCJAG00000004295	-	98	64.973	Callithrix_jacchus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.282	ENSCAFG00000010867	-	99	64.793	Canis_familiaris
ENSLACG00000018917	tyw1	93	60.644	ENSCAFG00020005367	-	99	59.720	Canis_lupus_dingo
ENSLACG00000018917	tyw1	96	68.622	ENSCHIG00000019510	-	99	68.622	Capra_hircus
ENSLACG00000018917	tyw1	86	67.073	ENSTSYG00000008236	-	98	66.311	Carlito_syrichta
ENSLACG00000018917	tyw1	85	62.946	ENSCAPG00000013569	-	100	63.411	Cavia_aperea
ENSLACG00000018917	tyw1	95	65.021	ENSCPOG00000011182	-	98	64.714	Cavia_porcellus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	67.353	ENSCCAG00000026643	-	98	66.209	Cebus_capucinus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.804	ENSCATG00000043677	-	98	66.804	Cercocebus_atys
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.633	ENSCLAG00000006321	-	98	64.960	Chinchilla_lanigera
ENSLACG00000018917	tyw1	96	64.377	ENSCSAG00000018274	-	98	64.377	Chlorocebus_sabaeus
ENSLACG00000018917	tyw1	99	70.317	ENSCPBG00000014896	-	99	75.547	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000018917	tyw1	65	66.667	ENSCING00000004125	-	97	55.853	Ciona_intestinalis
ENSLACG00000018917	tyw1	73	65.649	ENSCSAVG00000005712	-	100	52.879	Ciona_savignyi
ENSLACG00000018917	tyw1	96	67.078	ENSCANG00000033209	-	98	67.078	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLACG00000018917	tyw1	69	74.083	ENSCGRG00001003679	Tyw1	86	75.410	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLACG00000018917	tyw1	100	64.258	ENSCSEG00000005810	tyw1	98	63.553	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000018917	tyw1	87	65.964	ENSCVAG00000001054	tyw1	92	65.361	Cyprinodon_variegatus
ENSLACG00000018917	tyw1	99	66.711	ENSDARG00000062987	tyw1	99	66.711	Danio_rerio
ENSLACG00000018917	tyw1	96	68.213	ENSDNOG00000024165	-	99	67.258	Dasypus_novemcinctus
ENSLACG00000018917	tyw1	83	61.844	ENSDORG00000014772	Tyw1	88	63.279	Dipodomys_ordii
ENSLACG00000018917	tyw1	60	71.296	ENSEBUG00000004494	tyw1	91	71.296	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000018917	tyw1	96	67.486	ENSEASG00005008818	-	99	66.033	Equus_asinus_asinus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	60.792	ENSECAG00000023164	-	99	58.560	Equus_caballus
ENSLACG00000018917	tyw1	60	81.443	ENSEEUG00000005950	-	54	81.443	Erinaceus_europaeus
ENSLACG00000018917	tyw1	100	60.807	ENSELUG00000008449	tyw1	82	76.230	Esox_lucius
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.359	ENSFCAG00000014262	-	99	63.784	Felis_catus
ENSLACG00000018917	tyw1	97	63.833	ENSFALG00000013810	-	99	62.618	Ficedula_albicollis
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.062	ENSFDAG00000013270	-	98	62.687	Fukomys_damarensis
ENSLACG00000018917	tyw1	81	69.305	ENSFHEG00000020824	tyw1	81	68.932	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000018917	tyw1	97	66.531	ENSGALG00000001110	-	99	66.086	Gallus_gallus
ENSLACG00000018917	tyw1	95	63.824	ENSGACG00000012692	tyw1	98	63.686	Gasterosteus_aculeatus
ENSLACG00000018917	tyw1	97	71.565	ENSGAGG00000022393	-	99	71.565	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000018917	tyw1	86	58.537	ENSGGOG00000001473	TYW1	98	56.031	Gorilla_gorilla
ENSLACG00000018917	tyw1	99	65.079	ENSHBUG00000002640	tyw1	99	63.900	Haplochromis_burtoni
ENSLACG00000018917	tyw1	85	66.151	ENSHGLG00000012093	-	96	74.936	Heterocephalus_glaber_female
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.844	ENSHGLG00100011743	TYW1	98	65.844	Heterocephalus_glaber_male
ENSLACG00000018917	tyw1	96	60.383	ENSHCOG00000019949	tyw1	55	75.844	Hippocampus_comes
ENSLACG00000018917	tyw1	100	65.924	ENSIPUG00000016330	tyw1	98	65.912	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	64.481	ENSSTOG00000004067	-	90	64.754	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLACG00000018917	tyw1	95	63.762	ENSJJAG00000022959	Tyw1	98	63.649	Jaculus_jaculus
ENSLACG00000018917	tyw1	100	64.567	ENSKMAG00000018599	tyw1	99	63.852	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000018917	tyw1	100	68.283	ENSLOCG00000004035	tyw1	99	68.289	Lepisosteus_oculatus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	67.078	ENSMFAG00000035457	-	98	67.078	Macaca_fascicularis
ENSLACG00000018917	tyw1	96	67.078	ENSMMUG00000030374	-	98	67.078	Macaca_mulatta
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.804	ENSMNEG00000041992	-	98	70.310	Macaca_nemestrina
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.941	ENSMLEG00000039741	-	98	66.941	Mandrillus_leucophaeus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.164	ENSMAMG00000016089	tyw1	94	65.844	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000018917	tyw1	88	70.387	ENSMZEG00005024386	tyw1	97	69.104	Maylandia_zebra
ENSLACG00000018917	tyw1	97	67.751	ENSMGAG00000002176	-	99	66.220	Meleagris_gallopavo
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.800	ENSMAUG00000002959	Tyw1	99	66.074	Mesocricetus_auratus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	68.681	ENSMICG00000014374	-	99	68.681	Microcebus_murinus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.800	ENSMOCG00000017720	Tyw1	99	65.800	Microtus_ochrogaster
ENSLACG00000018917	tyw1	98	59.597	ENSMMOG00000005064	tyw1	99	58.737	Mola_mola
ENSLACG00000018917	tyw1	97	65.559	ENSMODG00000025697	-	99	64.887	Monodelphis_domestica
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.575	ENSMALG00000010238	tyw1	96	66.255	Monopterus_albus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	64.247	MGP_CAROLIEiJ_G0027801	Tyw1	99	64.247	Mus_caroli
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.199	ENSMUSG00000056310	Tyw1	98	65.199	Mus_musculus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.027	MGP_PahariEiJ_G0024383	Tyw1	99	63.896	Mus_pahari
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.199	MGP_SPRETEiJ_G0028799	Tyw1	98	65.199	Mus_spretus
ENSLACG00000018917	tyw1	92	66.809	ENSMPUG00000016191	-	99	65.149	Mustela_putorius_furo
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.536	ENSMLUG00000013582	-	99	65.536	Myotis_lucifugus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.750	ENSNGAG00000002742	Tyw1	98	64.787	Nannospalax_galili
ENSLACG00000018917	tyw1	88	68.012	ENSNBRG00000016996	tyw1	95	67.066	Neolamprologus_brichardi
ENSLACG00000018917	tyw1	96	67.078	ENSNLEG00000013210	-	97	65.981	Nomascus_leucogenys
ENSLACG00000018917	tyw1	81	73.333	ENSOPRG00000008734	-	69	73.333	Ochotona_princeps
ENSLACG00000018917	tyw1	96	59.178	ENSODEG00000014729	-	98	58.470	Octodon_degus
ENSLACG00000018917	tyw1	99	65.073	ENSONIG00000005872	tyw1	99	63.830	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000018917	tyw1	95	67.310	ENSOCUG00000003173	-	98	66.392	Oryctolagus_cuniculus
ENSLACG00000018917	tyw1	97	65.000	ENSORLG00000001393	tyw1	96	64.547	Oryzias_latipes
ENSLACG00000018917	tyw1	97	65.047	ENSORLG00020019361	tyw1	99	62.433	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.395	ENSORLG00015008095	tyw1	99	62.618	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000018917	tyw1	97	67.344	ENSOGAG00000016555	-	99	67.344	Otolemur_garnettii
ENSLACG00000018917	tyw1	96	68.157	ENSOARG00000010673	-	99	68.157	Ovis_aries
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.757	ENSPPRG00000004945	-	99	64.169	Panthera_pardus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.894	ENSPTIG00000019545	-	99	64.305	Panthera_tigris_altaica
ENSLACG00000018917	tyw1	96	61.580	ENSPTRG00000023076	TYW1B	97	59.891	Pan_troglodytes
ENSLACG00000018917	tyw1	96	67.078	ENSPANG00000019053	-	98	67.078	Papio_anubis
ENSLACG00000018917	tyw1	99	61.119	ENSPKIG00000006545	tyw1	99	61.457	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000018917	tyw1	93	66.294	ENSPMGG00000004240	tyw1	99	65.686	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.847	ENSPEMG00000008274	Tyw1	99	65.847	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.484	ENSPFOG00000015855	tyw1	98	64.666	Poecilia_formosa
ENSLACG00000018917	tyw1	99	63.241	ENSPLAG00000000838	tyw1	89	75.325	Poecilia_latipinna
ENSLACG00000018917	tyw1	96	64.754	ENSPMEG00000019437	tyw1	100	61.188	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000018917	tyw1	97	61.164	ENSPREG00000018773	tyw1	98	60.569	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000018917	tyw1	96	68.176	ENSPPYG00000017514	TYW1	98	67.490	Pongo_abelii
ENSLACG00000018917	tyw1	96	53.151	ENSPCOG00000015294	-	86	60.291	Propithecus_coquereli
ENSLACG00000018917	tyw1	99	65.212	ENSPNYG00000022381	tyw1	99	64.032	Pundamilia_nyererei
ENSLACG00000018917	tyw1	98	67.385	ENSPNAG00000009001	tyw1	100	66.846	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.800	ENSRNOG00000024352	Tyw1	99	65.527	Rattus_norvegicus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.941	ENSRBIG00000039619	-	98	66.941	Rhinopithecus_bieti
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.804	ENSRROG00000039780	-	98	66.804	Rhinopithecus_roxellana
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.667	ENSSBOG00000025873	-	98	64.698	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLACG00000018917	tyw1	97	66.125	ENSSHAG00000010346	-	99	65.978	Sarcophilus_harrisii
ENSLACG00000018917	tyw1	100	63.827	ENSSFOG00015001054	tyw1	100	62.779	Scleropages_formosus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.075	ENSSMAG00000020514	tyw1	100	63.399	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.213	ENSSDUG00000001552	tyw1	95	69.016	Seriola_dumerili
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.076	ENSSLDG00000003554	tyw1	96	65.937	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLACG00000018917	tyw1	97	66.756	ENSSPUG00000002715	-	99	66.756	Sphenodon_punctatus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.393	ENSSSCG00000007733	-	99	65.574	Sus_scrofa
ENSLACG00000018917	tyw1	88	65.172	ENSTGUG00000003428	-	99	64.275	Taeniopygia_guttata
ENSLACG00000018917	tyw1	96	65.710	ENSTRUG00000016107	tyw1	94	64.714	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000018917	tyw1	87	70.149	ENSTNIG00000018999	tyw1	100	68.966	Tetraodon_nigroviridis
ENSLACG00000018917	tyw1	96	66.667	ENSUMAG00000015343	-	99	65.353	Ursus_maritimus
ENSLACG00000018917	tyw1	96	64.953	ENSVVUG00000016457	-	99	64.266	Vulpes_vulpes
ENSLACG00000018917	tyw1	97	71.313	ENSXETG00000010094	tyw1	99	70.501	Xenopus_tropicalis
ENSLACG00000018917	tyw1	100	62.516	ENSXMAG00000013125	tyw1	100	62.385	Xiphophorus_maculatus