EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000022113 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1761 bases
Position: chrJH127748.1:122893-124653
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000023583	RVT_1	PF00078.27	1.2e-44	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000026556	-	1761	-	ENSLACP00000023583	552 (aa)	-	M3XLH7

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000022113's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000022113's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000022113	-	96	98.106	ENSLACG00000022282	-	100	98.106
ENSLACG00000022113	-	96	89.913	ENSLACG00000015198	-	100	89.913
ENSLACG00000022113	-	52	31.270	ENSLACG00000022114	-	65	31.270
ENSLACG00000022113	-	94	80.658	ENSLACG00000005314	-	100	80.658
ENSLACG00000022113	-	96	99.432	ENSLACG00000017681	-	100	99.432
ENSLACG00000022113	-	91	99.206	ENSLACG00000022410	-	100	99.206
ENSLACG00000022113	-	88	96.107	ENSLACG00000022681	-	100	96.107

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000022113	-	72	31.188	ENSAPEG00000014494	-	88	31.188	Amphiprion_percula
ENSLACG00000022113	-	53	33.333	ENSACLG00000016290	-	95	33.333	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	83	30.042	ENSACLG00000008988	-	50	30.042	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	77	30.112	ENSACLG00000008558	-	92	30.112	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	67	32.216	ENSACLG00000004613	-	92	32.216	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	66	30.295	ENSACLG00000019219	-	80	30.295	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	55	33.654	ENSACLG00000021422	-	78	33.654	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	68	31.510	ENSACLG00000026433	-	86	31.510	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	52	33.446	ENSACLG00000005509	-	65	33.673	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	58	30.655	ENSACLG00000000505	-	91	30.655	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	67	32.292	ENSACLG00000006988	-	56	32.292	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	63	32.865	ENSACLG00000027577	-	57	32.865	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	67	32.292	ENSACLG00000016231	-	65	32.292	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	84	30.353	ENSACLG00000023590	-	95	30.353	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	83	30.591	ENSACLG00000025576	-	63	30.591	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	65	31.044	ENSACLG00000026307	-	99	31.044	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	58	30.746	ENSACLG00000020009	-	56	30.746	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	52	34.576	ENSACLG00000015445	-	77	34.576	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	78	30.649	ENSACLG00000010366	-	96	30.649	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022113	-	91	50.992	ENSCPBG00000024353	-	99	50.992	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	54	53.642	ENSCPBG00000015885	-	89	53.642	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	52	53.819	ENSCPBG00000010221	-	97	53.819	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	61	51.744	ENSCPBG00000004450	-	93	51.744	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	69	50.394	ENSCPBG00000005177	-	99	50.394	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	60	53.754	ENSCPBG00000002205	-	92	53.754	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	78	52.644	ENSCPBG00000001408	-	99	52.644	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	59	54.103	ENSCPBG00000013207	-	74	54.103	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	76	52.745	ENSCPBG00000022940	-	66	52.745	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	51	52.837	ENSCPBG00000001898	-	91	52.837	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	95	51.607	ENSCPBG00000001489	-	95	51.607	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	51	54.965	ENSCPBG00000022391	-	98	54.965	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	61	53.079	ENSCPBG00000001455	-	93	53.079	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	57	52.681	ENSCPBG00000011561	-	83	52.681	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	61	53.333	ENSCPBG00000013338	-	90	53.333	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	92	52.372	ENSCPBG00000025030	-	98	52.372	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	58	55.486	ENSCPBG00000003209	-	99	55.486	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	59	52.424	ENSCPBG00000003199	-	96	52.424	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	72	52.346	ENSCPBG00000004252	-	98	52.346	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	66	48.913	ENSCPBG00000006651	-	96	48.913	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	82	53.744	ENSCPBG00000022715	-	99	53.744	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	61	54.303	ENSCPBG00000019838	-	95	54.303	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	77	51.878	ENSCPBG00000002764	-	77	51.878	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	90	50.200	ENSCPBG00000010408	-	99	50.200	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022113	-	58	35.671	ENSEBUG00000006081	-	85	35.671	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000022113	-	59	33.628	ENSEBUG00000000391	-	93	33.628	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000022113	-	63	31.092	ENSFHEG00000011635	-	85	31.092	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000022113	-	56	41.234	ENSGALG00000055012	-	77	41.234	Gallus_gallus
ENSLACG00000022113	-	70	51.157	ENSGAGG00000022076	-	99	51.157	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	50	52.708	ENSGAGG00000019616	-	91	52.708	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	82	51.648	ENSGAGG00000006259	-	98	51.648	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	62	52.149	ENSGAGG00000003617	-	99	52.149	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	83	51.509	ENSGAGG00000005937	-	65	51.509	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	78	53.349	ENSGAGG00000017850	-	99	53.349	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	79	52.860	ENSGAGG00000002004	-	96	52.860	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	98	48.905	ENSGAGG00000011204	-	97	48.905	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	60	54.518	ENSGAGG00000011049	-	99	54.518	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	55	51.316	ENSGAGG00000011675	-	99	51.316	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	62	51.014	ENSGAGG00000025522	-	99	51.014	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	95	49.248	ENSGAGG00000019034	-	64	49.248	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	89	52.333	ENSGAGG00000014895	-	99	52.333	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	85	50.740	ENSGAGG00000017706	-	99	50.740	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	75	53.976	ENSGAGG00000021454	-	98	53.976	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	80	51.011	ENSGAGG00000013858	-	54	51.011	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	98	49.453	ENSGAGG00000025872	-	84	49.453	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	59	51.524	ENSGAGG00000024468	-	99	51.524	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	64	50.416	ENSGAGG00000009263	-	66	50.416	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	98	49.270	ENSGAGG00000018246	-	99	49.270	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	56	54.545	ENSGAGG00000021053	-	97	54.545	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	64	50.843	ENSGAGG00000009965	-	57	50.843	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	76	54.306	ENSGAGG00000010190	-	98	54.306	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	50	50.534	ENSGAGG00000008670	-	97	50.534	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	59	51.692	ENSGAGG00000008672	-	99	51.692	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	63	50.427	ENSGAGG00000001427	-	53	50.427	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	84	51.168	ENSGAGG00000020043	-	72	51.168	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	66	48.352	ENSGAGG00000012597	-	99	48.352	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	59	51.064	ENSGAGG00000007999	-	99	51.064	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	74	51.090	ENSGAGG00000022089	-	99	51.090	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	63	50.427	ENSGAGG00000000719	-	99	50.427	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	98	49.453	ENSGAGG00000009371	-	74	49.453	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	61	51.613	ENSGAGG00000015930	-	99	51.613	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	63	51.852	ENSGAGG00000006922	-	99	51.852	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	94	48.790	ENSGAGG00000021953	-	99	48.790	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022113	-	66	31.842	ENSKMAG00000020993	-	90	31.842	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000022113	-	84	30.000	ENSKMAG00000011565	-	97	30.000	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000022113	-	60	30.422	ENSLBEG00000007826	-	85	30.422	Labrus_bergylta
ENSLACG00000022113	-	54	31.475	ENSLBEG00000007558	-	79	31.475	Labrus_bergylta
ENSLACG00000022113	-	59	32.440	ENSMZEG00005006492	-	79	32.440	Maylandia_zebra
ENSLACG00000022113	-	64	31.436	ENSMZEG00005018243	-	99	31.436	Maylandia_zebra
ENSLACG00000022113	-	54	33.770	ENSMZEG00005019949	-	82	33.770	Maylandia_zebra
ENSLACG00000022113	-	68	32.124	ENSMALG00000009608	-	84	32.124	Monopterus_albus
ENSLACG00000022113	-	66	32.713	ENSMALG00000009397	-	95	32.713	Monopterus_albus
ENSLACG00000022113	-	71	30.827	ENSMALG00000007417	-	51	30.827	Monopterus_albus
ENSLACG00000022113	-	66	31.903	ENSMALG00000009771	-	96	31.903	Monopterus_albus
ENSLACG00000022113	-	58	33.131	ENSMALG00000000456	-	87	33.131	Monopterus_albus
ENSLACG00000022113	-	88	30.739	ENSORLG00000026969	-	92	30.739	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022113	-	62	32.768	ENSORLG00000030573	-	83	32.768	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022113	-	88	30.739	ENSORLG00000025899	-	92	30.739	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022113	-	68	31.783	ENSORLG00000023191	-	85	31.783	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022113	-	56	31.875	ENSORLG00020001304	-	81	31.875	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022113	-	62	32.486	ENSORLG00020002243	-	85	32.486	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022113	-	63	30.769	ENSORLG00020013935	-	72	30.769	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022113	-	88	30.739	ENSORLG00020019661	-	92	30.739	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022113	-	56	33.651	ENSORLG00020016658	-	96	33.651	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022113	-	62	31.339	ENSORLG00020011701	-	84	31.339	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022113	-	62	32.565	ENSORLG00015021158	-	99	32.565	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022113	-	65	30.053	ENSORLG00015007535	-	94	30.053	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022113	-	56	30.030	ENSORLG00015017095	-	94	30.030	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022113	-	59	32.024	ENSORLG00015005330	-	52	32.024	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022113	-	67	30.130	ENSORLG00015003033	-	96	30.130	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022113	-	51	30.592	ENSORLG00015014737	-	91	30.592	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022113	-	66	34.225	ENSORLG00015005738	-	90	34.225	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022113	-	88	30.539	ENSORLG00015013285	-	97	30.539	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022113	-	62	55.394	ENSPKIG00000019910	-	78	55.394	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022113	-	59	55.352	ENSPKIG00000020548	-	86	55.352	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022113	-	60	51.515	ENSPKIG00000017464	-	97	51.515	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022113	-	70	51.302	ENSPKIG00000025410	-	99	51.302	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022113	-	78	51.963	ENSPKIG00000006601	-	99	51.963	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022113	-	71	52.685	ENSPKIG00000018399	-	98	52.685	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022113	-	62	54.118	ENSPKIG00000005006	-	98	54.118	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022113	-	75	53.461	ENSPSIG00000001873	-	92	53.461	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	60	54.925	ENSPSIG00000000970	-	92	54.925	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	61	50.794	ENSPSIG00000001699	-	97	50.794	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	65	53.297	ENSPSIG00000000884	-	88	53.297	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	64	51.841	ENSPSIG00000001649	-	99	51.841	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	58	57.188	ENSPSIG00000000492	-	96	57.188	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	51	53.763	ENSPSIG00000002038	-	99	53.763	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	57	51.923	ENSPSIG00000001071	-	99	51.923	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	50	55.357	ENSPSIG00000000148	-	95	55.357	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	63	52.722	ENSPSIG00000000465	-	88	52.722	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	56	53.846	ENSPSIG00000001926	-	92	53.846	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	60	55.015	ENSPSIG00000000039	-	93	55.015	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	54	54.000	ENSPSIG00000001709	-	68	54.000	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	58	56.698	ENSPSIG00000001144	-	98	56.698	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	58	53.870	ENSPSIG00000001849	-	99	53.870	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	58	56.250	ENSPSIG00000001970	-	98	56.250	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	88	52.761	ENSPSIG00000000982	-	96	52.761	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	75	53.477	ENSPSIG00000001250	-	97	53.477	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	59	53.681	ENSPSIG00000000638	-	92	53.681	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	56	54.516	ENSPSIG00000000636	-	100	54.516	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	63	52.857	ENSPSIG00000000402	-	77	52.857	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	70	57.254	ENSPSIG00000000480	-	91	57.254	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	72	55.919	ENSPSIG00000001720	-	99	55.919	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	70	53.351	ENSPSIG00000000025	-	71	53.351	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	66	55.616	ENSPSIG00000001169	-	98	55.616	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	90	53.507	ENSPSIG00000017129	-	97	53.507	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	58	56.075	ENSPSIG00000000817	-	94	56.075	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	68	56.000	ENSPSIG00000001446	-	96	56.000	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	77	53.613	ENSPSIG00000001440	-	93	53.613	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	98	53.039	ENSPSIG00000000799	-	92	53.039	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	92	54.545	ENSPSIG00000001343	-	96	54.545	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	51	57.801	ENSPSIG00000000711	-	98	57.801	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	56	52.885	ENSPSIG00000000719	-	99	52.885	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	69	54.005	ENSPSIG00000001186	-	92	54.005	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	57	54.829	ENSPSIG00000000628	-	93	54.829	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	64	53.803	ENSPSIG00000001804	-	97	53.803	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	97	52.495	ENSPSIG00000001439	-	95	52.495	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	79	48.409	ENSPSIG00000001586	-	93	48.409	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	61	55.689	ENSPSIG00000001058	-	99	55.689	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	64	56.657	ENSPSIG00000000449	-	99	56.657	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022113	-	58	33.131	ENSPMEG00000016465	-	79	33.131	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000022113	-	53	32.566	ENSPMEG00000007569	-	76	32.566	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000022113	-	66	30.570	ENSPREG00000014046	-	75	30.570	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000022113	-	78	30.543	ENSPREG00000003521	-	96	30.543	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000022113	-	77	30.474	ENSXMAG00000028454	-	99	30.474	Xiphophorus_maculatus