EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000022282 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 1607 bases
Position: chrJH126949.1:8930-10536
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000022167	RVT_1	PF00078.27	3.6e-45	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000025805	-	1607	-	ENSLACP00000022167	528 (aa)	-	M3XHG1

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000022282's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000022282's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000022282	-	100	98.106	ENSLACG00000022113	-	96	98.106
ENSLACG00000022282	-	54	30.945	ENSLACG00000022114	-	65	30.945
ENSLACG00000022282	-	100	98.674	ENSLACG00000017681	-	100	98.674
ENSLACG00000022282	-	95	98.413	ENSLACG00000022410	-	100	98.413
ENSLACG00000022282	-	92	96.311	ENSLACG00000022681	-	100	96.311
ENSLACG00000022282	-	93	81.136	ENSLACG00000005314	-	95	81.136
ENSLACG00000022282	-	100	89.391	ENSLACG00000015198	-	100	89.391

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000022282	-	76	31.188	ENSAPEG00000014494	-	88	31.188	Amphiprion_percula
ENSLACG00000022282	-	54	35.254	ENSACLG00000015445	-	77	35.254	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	56	31.250	ENSACLG00000020009	-	52	31.250	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	72	30.334	ENSACLG00000001773	-	51	30.334	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	81	30.269	ENSACLG00000010366	-	96	30.269	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	77	30.787	ENSACLG00000008558	-	90	30.787	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	50	34.559	ENSACLG00000005509	-	60	34.559	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	72	30.749	ENSACLG00000009848	-	87	30.749	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	71	31.362	ENSACLG00000021942	-	55	31.362	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	70	34.383	ENSACLG00000025576	-	51	34.383	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	55	32.542	ENSACLG00000016290	-	95	32.542	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	69	30.688	ENSACLG00000019219	-	80	30.688	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	66	32.394	ENSACLG00000027577	-	57	32.394	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	68	31.044	ENSACLG00000026307	-	99	31.044	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	63	32.641	ENSACLG00000004613	-	82	32.641	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	55	32.248	ENSACLG00000000505	-	86	32.248	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	88	30.208	ENSACLG00000023590	-	95	30.208	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	72	30.890	ENSACLG00000026433	-	86	30.890	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	57	33.226	ENSACLG00000021422	-	78	33.226	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022282	-	72	54.354	ENSCPBG00000002764	-	69	54.354	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	70	55.376	ENSCPBG00000022940	-	59	55.376	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	96	52.174	ENSCPBG00000025030	-	98	52.174	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	58	55.921	ENSCPBG00000013338	-	81	55.921	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	51	55.762	ENSCPBG00000001920	-	97	55.762	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	55	55.973	ENSCPBG00000001455	-	80	55.973	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	51	55.224	ENSCPBG00000015885	-	79	55.224	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	55	55.290	ENSCPBG00000004450	-	80	55.290	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	93	53.469	ENSCPBG00000001489	-	89	53.469	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	75	55.190	ENSCPBG00000001408	-	92	55.190	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	88	52.677	ENSCPBG00000024353	-	93	52.677	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	55	56.401	ENSCPBG00000002205	-	81	56.401	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	53	56.429	ENSCPBG00000003199	-	83	56.429	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	60	52.050	ENSCPBG00000011561	-	83	52.050	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	79	55.904	ENSCPBG00000022715	-	92	55.904	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	88	51.620	ENSCPBG00000010408	-	93	51.620	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	55	53.472	ENSCPBG00000010221	-	97	53.472	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	53	57.500	ENSCPBG00000003209	-	89	57.500	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	54	57.244	ENSCPBG00000013207	-	65	57.244	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	53	54.255	ENSCPBG00000022391	-	98	54.255	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	61	51.553	ENSCPBG00000006651	-	84	51.553	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	64	54.006	ENSCPBG00000019838	-	95	54.006	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	70	55.163	ENSCPBG00000004252	-	90	55.163	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	65	53.079	ENSCPBG00000005177	-	91	53.079	Chrysemys_picta_bellii
ENSLACG00000022282	-	51	35.379	ENSEBUG00000013969	-	63	35.379	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000022282	-	62	33.432	ENSEBUG00000000391	-	93	33.432	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000022282	-	55	36.770	ENSEBUG00000006081	-	76	36.770	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000022282	-	52	33.445	ENSEBUG00000006721	-	99	33.445	Eptatretus_burgeri
ENSLACG00000022282	-	65	31.006	ENSFHEG00000011635	-	85	31.006	Fundulus_heteroclitus
ENSLACG00000022282	-	58	41.558	ENSGALG00000055012	-	77	41.558	Gallus_gallus
ENSLACG00000022282	-	66	52.874	ENSGAGG00000022076	-	91	52.874	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	58	53.420	ENSGAGG00000025522	-	90	53.420	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	53	54.643	ENSGAGG00000008672	-	87	54.643	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	53	50.890	ENSGAGG00000008670	-	97	50.890	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	61	51.070	ENSGAGG00000000719	-	95	51.070	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	58	53.896	ENSGAGG00000021053	-	97	53.896	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	57	51.803	ENSGAGG00000007999	-	94	51.803	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	83	52.164	ENSGAGG00000002004	-	97	52.164	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	75	54.937	ENSGAGG00000017850	-	92	54.937	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	51	50.000	ENSGAGG00000008305	-	96	50.000	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	62	50.000	ENSGAGG00000012597	-	91	50.000	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	81	52.074	ENSGAGG00000005937	-	62	52.074	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	58	54.221	ENSGAGG00000003617	-	90	54.221	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	87	52.278	ENSGAGG00000021953	-	85	52.278	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	57	53.465	ENSGAGG00000015930	-	90	53.465	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	95	49.606	ENSGAGG00000019034	-	62	49.606	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	86	51.209	ENSGAGG00000006259	-	98	51.209	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	79	53.494	ENSGAGG00000021454	-	98	53.494	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	93	51.927	ENSGAGG00000014895	-	99	51.927	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	98	49.427	ENSGAGG00000009371	-	72	49.427	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	83	51.701	ENSGAGG00000020043	-	68	51.701	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	54	55.124	ENSGAGG00000024468	-	87	55.124	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	62	51.506	ENSGAGG00000009965	-	54	51.506	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	73	51.671	ENSGAGG00000022089	-	96	51.671	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	59	53.674	ENSGAGG00000006922	-	90	53.674	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	62	51.057	ENSGAGG00000009263	-	62	51.057	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	98	49.237	ENSGAGG00000018246	-	96	49.237	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	98	49.809	ENSGAGG00000025872	-	82	49.809	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	61	51.070	ENSGAGG00000001427	-	51	51.070	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	98	49.237	ENSGAGG00000011204	-	94	49.237	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	79	51.544	ENSGAGG00000013858	-	52	51.544	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	79	53.828	ENSGAGG00000010190	-	98	53.828	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	58	51.316	ENSGAGG00000011675	-	99	51.316	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	63	54.819	ENSGAGG00000011049	-	99	54.819	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	84	51.225	ENSGAGG00000017706	-	96	51.225	Gopherus_agassizii
ENSLACG00000022282	-	59	34.472	ENSKMAG00000020993	-	76	34.472	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000022282	-	53	32.500	ENSLBEG00000007826	-	71	32.500	Labrus_bergylta
ENSLACG00000022282	-	57	30.492	ENSLBEG00000007558	-	79	30.492	Labrus_bergylta
ENSLACG00000022282	-	62	31.953	ENSMZEG00005018243	-	92	31.953	Maylandia_zebra
ENSLACG00000022282	-	56	35.390	ENSMZEG00005019949	-	82	35.390	Maylandia_zebra
ENSLACG00000022282	-	62	31.940	ENSMZEG00005006492	-	79	31.940	Maylandia_zebra
ENSLACG00000022282	-	69	31.635	ENSMALG00000009771	-	96	31.635	Monopterus_albus
ENSLACG00000022282	-	71	31.865	ENSMALG00000009608	-	84	31.865	Monopterus_albus
ENSLACG00000022282	-	60	32.827	ENSMALG00000000456	-	87	32.827	Monopterus_albus
ENSLACG00000022282	-	69	32.447	ENSMALG00000009397	-	95	32.447	Monopterus_albus
ENSLACG00000022282	-	50	35.294	ENSMALG00000003604	-	91	34.495	Monopterus_albus
ENSLACG00000022282	-	76	30.467	ENSONIG00000021263	-	54	30.562	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000022282	-	92	30.040	ENSORLG00000022703	-	78	30.040	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022282	-	61	31.212	ENSORLG00000024294	-	60	31.124	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022282	-	92	30.040	ENSORLG00000030445	-	72	30.040	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022282	-	92	30.040	ENSORLG00000026969	-	92	30.040	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022282	-	73	31.313	ENSORLG00000030053	-	55	31.313	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022282	-	71	31.783	ENSORLG00000023191	-	85	31.783	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022282	-	92	30.242	ENSORLG00000026858	-	58	30.242	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022282	-	65	32.486	ENSORLG00000030573	-	83	32.486	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022282	-	64	31.339	ENSORLG00020011701	-	84	31.339	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022282	-	59	31.875	ENSORLG00020001304	-	81	31.875	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022282	-	65	32.203	ENSORLG00020002243	-	85	32.203	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022282	-	59	33.651	ENSORLG00020016658	-	96	33.651	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022282	-	69	33.155	ENSORLG00015005738	-	90	33.155	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022282	-	65	32.277	ENSORLG00015021158	-	99	32.277	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022282	-	61	31.212	ENSORLG00015020629	-	53	31.124	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022282	-	54	30.263	ENSORLG00015014737	-	91	30.263	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022282	-	88	30.126	ENSOMEG00000008180	-	84	30.126	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000022282	-	70	31.662	ENSOMEG00000001970	-	75	31.662	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000022282	-	50	34.701	ENSOMEG00000000479	-	78	34.701	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000022282	-	52	38.043	ENSOMEG00000022374	-	78	38.043	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000022282	-	63	51.818	ENSPKIG00000017464	-	97	51.818	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022282	-	62	54.711	ENSPKIG00000019910	-	75	54.711	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022282	-	82	51.732	ENSPKIG00000006601	-	99	51.732	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022282	-	73	51.042	ENSPKIG00000025410	-	99	51.042	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022282	-	59	54.633	ENSPKIG00000020548	-	82	54.633	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022282	-	74	52.430	ENSPKIG00000018399	-	98	52.430	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022282	-	64	53.824	ENSPKIG00000005006	-	98	53.824	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022282	-	94	54.251	ENSPSIG00000001439	-	87	54.251	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	55	55.631	ENSPSIG00000001849	-	90	55.631	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	95	53.106	ENSPSIG00000017129	-	97	53.106	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	61	55.763	ENSPSIG00000001144	-	98	55.763	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	59	54.313	ENSPSIG00000001649	-	90	54.313	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	61	57.188	ENSPSIG00000000492	-	96	57.188	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	65	55.718	ENSPSIG00000000025	-	63	55.718	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	75	55.668	ENSPSIG00000001720	-	99	55.668	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	51	54.815	ENSPSIG00000000689	-	100	54.815	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	59	54.516	ENSPSIG00000000636	-	100	54.516	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	62	53.988	ENSPSIG00000000638	-	92	53.988	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	64	50.794	ENSPSIG00000001699	-	97	50.794	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	67	56.941	ENSPSIG00000000449	-	99	56.941	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	61	56.563	ENSPSIG00000001970	-	98	56.563	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	59	52.244	ENSPSIG00000001071	-	99	52.244	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	52	57.664	ENSPSIG00000000628	-	80	57.664	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	63	54.790	ENSPSIG00000001058	-	99	54.790	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	74	50.636	ENSPSIG00000001586	-	83	50.636	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	58	55.556	ENSPSIG00000000402	-	67	55.556	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	53	53.571	ENSPSIG00000002038	-	100	53.571	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	67	54.085	ENSPSIG00000001804	-	97	54.085	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	50	56.604	ENSPSIG00000001926	-	79	56.604	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	53	56.738	ENSPSIG00000000711	-	98	56.738	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	59	53.205	ENSPSIG00000000719	-	99	53.205	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	96	54.348	ENSPSIG00000001343	-	96	54.348	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	64	56.471	ENSPSIG00000001186	-	82	56.471	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	95	54.473	ENSPSIG00000000799	-	86	54.473	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	72	56.021	ENSPSIG00000001440	-	84	56.021	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	71	55.733	ENSPSIG00000001446	-	96	55.733	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	62	53.659	ENSPSIG00000000465	-	84	53.659	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	60	55.873	ENSPSIG00000000817	-	92	55.873	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	60	56.151	ENSPSIG00000000884	-	77	56.151	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	62	54.103	ENSPSIG00000000039	-	93	54.103	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	73	56.736	ENSPSIG00000000480	-	91	56.736	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	69	55.890	ENSPSIG00000001169	-	98	55.890	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	55	57.639	ENSPSIG00000000970	-	80	57.639	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	70	56.183	ENSPSIG00000001873	-	82	56.183	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	80	56.235	ENSPSIG00000000982	-	84	56.235	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	70	56.098	ENSPSIG00000001250	-	86	56.098	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	51	57.090	ENSPSIG00000001253	-	97	57.090	Pelodiscus_sinensis
ENSLACG00000022282	-	61	33.030	ENSPMEG00000016465	-	79	33.030	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000022282	-	56	32.131	ENSPMEG00000007569	-	76	32.131	Poecilia_mexicana
ENSLACG00000022282	-	81	30.090	ENSPREG00000003521	-	96	30.090	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000022282	-	59	31.498	ENSPREG00000014046	-	63	31.498	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000022282	-	67	31.129	ENSXMAG00000029300	-	50	31.129	Xiphophorus_maculatus