EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLACG00000022383 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: -
Alias: -
Full Name: -
Gene Type: protein_coding
Species: Latimeria_chalumnae
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 1356 bases
Position: chrJH129061.1:109487-110842
Accession: -
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLACP00000022528	RVT_1	PF00078.27	4.6e-19	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLACT00000024937	-	1356	-	ENSLACP00000022528	443 (aa)	-	M3XIH2

Gene Model

Click here to download ENSLACG00000022383's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLACG00000022383's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLACG00000022383	-	85	64.362	ENSLACG00000022513	-	53	64.362
ENSLACG00000022383	-	73	96.273	ENSLACG00000022370	-	76	96.273
ENSLACG00000022383	-	54	75.519	ENSLACG00000022527	-	71	75.519
ENSLACG00000022383	-	72	66.352	ENSLACG00000022504	-	87	66.352
ENSLACG00000022383	-	69	79.153	ENSLACG00000017993	-	74	79.153
ENSLACG00000022383	-	65	86.713	ENSLACG00000022484	-	64	86.713
ENSLACG00000022383	-	85	64.894	ENSLACG00000011269	-	53	64.894
ENSLACG00000022383	-	74	95.427	ENSLACG00000022114	-	71	95.427

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLACG00000022383	-	100	37.333	ENSAOCG00000011105	-	56	37.333	Amphiprion_ocellaris
ENSLACG00000022383	-	85	39.844	ENSAPEG00000006041	-	53	39.844	Amphiprion_percula
ENSLACG00000022383	-	53	46.473	ENSAPEG00000007939	-	57	46.473	Amphiprion_percula
ENSLACG00000022383	-	68	42.715	ENSAPEG00000024080	-	94	42.715	Amphiprion_percula
ENSLACG00000022383	-	99	36.703	ENSATEG00000009980	-	71	36.703	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	99	36.264	ENSATEG00000019513	-	57	36.264	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	54	42.857	ENSATEG00000002707	-	60	42.857	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	99	36.364	ENSATEG00000013493	-	54	36.364	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	99	36.484	ENSATEG00000015818	-	57	36.484	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	99	35.730	ENSATEG00000007199	-	57	35.730	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	98	35.177	ENSATEG00000007276	-	81	35.177	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	74	40.060	ENSATEG00000014522	-	71	40.060	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	99	36.484	ENSATEG00000016515	-	71	36.484	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	53	47.034	ENSATEG00000004853	-	73	47.034	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	99	36.484	ENSATEG00000007647	-	83	36.484	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	53	46.186	ENSATEG00000015488	-	75	46.186	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	53	47.034	ENSATEG00000021051	-	68	47.034	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	99	36.484	ENSATEG00000010400	-	57	36.484	Anabas_testudineus
ENSLACG00000022383	-	72	42.724	ENSACLG00000005547	-	50	42.724	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	83	40.811	ENSACLG00000015704	-	61	40.811	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	37.310	ENSACLG00000021287	-	53	37.310	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	72	42.415	ENSACLG00000017297	-	59	42.415	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	72	42.724	ENSACLG00000025851	-	83	42.724	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	72	41.796	ENSACLG00000014746	-	50	41.796	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	84	40.107	ENSACLG00000011058	-	78	40.107	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	35.792	ENSACLG00000004144	-	60	35.792	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	37.069	ENSACLG00000005642	-	78	37.069	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	37.744	ENSACLG00000008391	-	53	37.744	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	83	40.541	ENSACLG00000000736	-	52	40.541	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	56	45.968	ENSACLG00000027256	-	61	45.968	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	72	42.724	ENSACLG00000003670	-	50	42.724	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	37.310	ENSACLG00000020864	-	57	37.310	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	37.093	ENSACLG00000002614	-	64	37.093	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	54	45.041	ENSACLG00000021583	-	57	45.041	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	37.527	ENSACLG00000027996	-	57	37.527	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	72	41.796	ENSACLG00000012094	-	66	41.796	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	37.310	ENSACLG00000002468	-	53	37.310	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	37.527	ENSACLG00000023885	-	53	37.527	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	99	37.527	ENSACLG00000004826	-	53	37.527	Astatotilapia_calliptera
ENSLACG00000022383	-	55	40.741	ENSAMXG00000035521	-	67	40.741	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000022383	-	53	44.398	ENSAMXG00000031937	-	61	44.398	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000022383	-	85	37.931	ENSAMXG00000033627	-	53	37.931	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000022383	-	85	38.642	ENSAMXG00000030235	-	59	38.642	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000022383	-	98	36.865	ENSAMXG00000036981	-	52	36.865	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000022383	-	53	44.813	ENSAMXG00000040990	-	70	44.813	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000022383	-	98	35.177	ENSAMXG00000034383	-	60	35.177	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000022383	-	53	43.983	ENSAMXG00000030100	-	65	43.983	Astyanax_mexicanus
ENSLACG00000022383	-	99	36.069	ENSCSEG00000014137	-	54	36.069	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000022383	-	75	40.413	ENSCSEG00000013241	-	51	40.413	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000022383	-	95	36.446	ENSCSEG00000013023	-	57	36.446	Cynoglossus_semilaevis
ENSLACG00000022383	-	66	43.390	ENSIPUG00000005213	-	90	43.390	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000022383	-	74	40.541	ENSIPUG00000013666	-	51	40.541	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000022383	-	54	45.902	ENSIPUG00000013052	-	78	45.902	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000022383	-	53	44.215	ENSIPUG00000009893	-	67	44.215	Ictalurus_punctatus
ENSLACG00000022383	-	91	40.099	ENSKMAG00000000948	-	55	40.099	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000022383	-	91	40.099	ENSKMAG00000001967	-	55	40.099	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000022383	-	91	40.099	ENSKMAG00000010396	-	55	40.099	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000022383	-	74	42.638	ENSKMAG00000012984	-	50	42.638	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000022383	-	83	40.650	ENSKMAG00000014228	-	51	40.720	Kryptolebias_marmoratus
ENSLACG00000022383	-	65	43.434	ENSLBEG00000018498	-	67	43.289	Labrus_bergylta
ENSLACG00000022383	-	65	44.631	ENSLBEG00000019648	-	94	44.631	Labrus_bergylta
ENSLACG00000022383	-	74	39.939	ENSLBEG00000019587	-	50	39.939	Labrus_bergylta
ENSLACG00000022383	-	53	44.444	ENSMAMG00000002309	-	57	44.444	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	81	38.420	ENSMAMG00000002569	-	72	38.420	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	82	40.800	ENSMAMG00000002966	-	71	40.800	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	82	39.785	ENSMAMG00000018938	-	61	39.785	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	98	37.768	ENSMAMG00000020611	-	53	37.768	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	79	38.873	ENSMAMG00000010110	-	67	39.377	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	53	44.856	ENSMAMG00000008505	-	68	44.856	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	53	44.856	ENSMAMG00000017188	-	54	44.856	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	82	40.800	ENSMAMG00000010869	-	71	40.800	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	85	37.922	ENSMAMG00000020823	-	92	37.922	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	53	44.444	ENSMAMG00000020669	-	53	44.444	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	82	41.067	ENSMAMG00000004067	-	81	41.067	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	81	40.379	ENSMAMG00000008097	-	70	40.379	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	82	40.800	ENSMAMG00000008830	-	51	40.800	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	82	40.800	ENSMAMG00000007919	-	58	40.800	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	82	40.800	ENSMAMG00000006859	-	68	40.800	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	83	38.338	ENSMAMG00000000902	-	54	38.338	Mastacembelus_armatus
ENSLACG00000022383	-	85	40.526	ENSMZEG00005024820	-	75	40.526	Maylandia_zebra
ENSLACG00000022383	-	83	38.947	ENSMALG00000015180	-	50	38.947	Monopterus_albus
ENSLACG00000022383	-	72	39.577	ENSMALG00000022075	-	64	39.577	Monopterus_albus
ENSLACG00000022383	-	66	39.322	ENSONIG00000020838	-	82	39.322	Oreochromis_niloticus
ENSLACG00000022383	-	95	36.916	ENSORLG00000023890	-	72	36.916	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	99	36.937	ENSORLG00000022274	-	54	37.246	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	99	37.246	ENSORLG00000021915	-	61	37.246	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	70	40.193	ENSORLG00000023272	-	58	40.193	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	98	38.074	ENSORLG00000024429	-	59	38.074	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	75	57.516	ENSORLG00000029533	-	58	57.516	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	98	38.074	ENSORLG00000024521	-	55	38.074	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	98	37.856	ENSORLG00000024832	-	54	37.856	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	86	40.000	ENSORLG00000027991	-	51	40.000	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	82	40.379	ENSORLG00000023398	-	61	39.231	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	98	38.462	ENSORLG00000023083	-	55	38.462	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00000022150	-	62	39.487	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	82	39.344	ENSORLG00000025465	-	85	39.344	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	99	35.909	ENSORLG00000021796	-	50	35.909	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	81	37.778	ENSORLG00000030154	-	88	37.778	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	98	37.225	ENSORLG00000025731	-	61	37.225	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	74	40.729	ENSORLG00000025567	-	50	40.729	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	98	37.637	ENSORLG00000025672	-	54	37.637	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	74	36.280	ENSORLG00000027283	-	50	36.585	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	98	38.074	ENSORLG00000029298	-	61	38.074	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	78	40.960	ENSORLG00000022789	-	94	40.960	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	98	37.856	ENSORLG00000028760	-	50	37.856	Oryzias_latipes
ENSLACG00000022383	-	100	34.910	ENSORLG00020016049	-	54	34.910	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020021237	-	60	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.231	ENSORLG00020009908	-	57	39.231	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	100	38.514	ENSORLG00020010019	-	54	38.514	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.231	ENSORLG00020012251	-	51	39.231	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	98	37.637	ENSORLG00020002120	-	69	37.637	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	81	40.761	ENSORLG00020017918	-	91	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020016342	-	51	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	99	34.989	ENSORLG00020003864	-	81	34.989	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020012664	-	75	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020008999	-	51	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	98	37.225	ENSORLG00020007092	-	56	37.225	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.744	ENSORLG00020019476	-	72	39.744	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.744	ENSORLG00020008289	-	58	39.744	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020011031	-	56	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020012063	-	51	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.744	ENSORLG00020000803	-	51	39.744	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	59	42.424	ENSORLG00020007940	-	65	42.424	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	82	39.837	ENSORLG00020014062	-	51	38.718	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.744	ENSORLG00020006111	-	60	39.744	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020019768	-	75	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020001010	-	58	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	54	43.333	ENSORLG00020002010	-	58	43.333	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	38.974	ENSORLG00020005777	-	71	38.974	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	82	40.650	ENSORLG00020015125	-	53	40.650	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020021860	-	51	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.487	ENSORLG00020003779	-	57	39.487	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	86	39.744	ENSORLG00020003775	-	56	39.744	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	98	37.637	ENSORLG00020005060	-	51	37.637	Oryzias_latipes_hni
ENSLACG00000022383	-	68	39.803	ENSORLG00015013890	-	91	40.264	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	99	35.909	ENSORLG00015012293	-	50	35.909	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	86	39.744	ENSORLG00015019396	-	86	39.744	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	86	39.231	ENSORLG00015017024	-	64	39.231	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	86	39.231	ENSORLG00015006495	-	59	39.231	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	74	38.415	ENSORLG00015011229	-	50	38.415	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	95	36.471	ENSORLG00015011143	-	81	36.471	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	96	38.498	ENSORLG00015022021	-	82	38.498	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	67	38.983	ENSORLG00015009440	-	60	38.983	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	74	38.415	ENSORLG00015018421	-	50	38.415	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	95	36.557	ENSORLG00015022603	-	56	36.471	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	55	45.817	ENSORLG00015010906	-	52	46.154	Oryzias_latipes_hsok
ENSLACG00000022383	-	84	40.909	ENSOMEG00000004029	-	53	40.909	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000022383	-	99	36.807	ENSOMEG00000021672	-	52	37.838	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000022383	-	81	40.997	ENSOMEG00000013776	-	72	40.997	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000022383	-	70	38.065	ENSOMEG00000006273	-	65	37.821	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000022383	-	84	40.584	ENSOMEG00000002430	-	53	40.584	Oryzias_melastigma
ENSLACG00000022383	-	99	36.748	ENSPKIG00000003654	-	92	36.748	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022383	-	67	38.462	ENSPKIG00000024981	-	52	38.462	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022383	-	73	37.764	ENSPKIG00000009876	-	88	37.838	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLACG00000022383	-	82	40.984	ENSPREG00000012441	-	83	40.984	Poecilia_reticulata
ENSLACG00000022383	-	65	42.034	ENSPNAG00000009566	-	55	42.034	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000022383	-	53	44.444	ENSPNAG00000013546	-	59	44.444	Pygocentrus_nattereri
ENSLACG00000022383	-	99	36.069	ENSSMAG00000017424	-	55	36.069	Scophthalmus_maximus
ENSLACG00000022383	-	77	39.884	ENSTRUG00000024195	-	76	39.884	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000022383	-	81	38.398	ENSTRUG00000022494	-	78	38.398	Takifugu_rubripes
ENSLACG00000022383	-	84	35.027	ENSXMAG00000028039	-	53	35.027	Xiphophorus_maculatus