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Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000002135 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SBNO1
Alias: FLJ10701|FLJ10833|MOP3|Sno
Full Name: strawberry notch homolog 1
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 35861 bases
Position: chrscaffold_84:3101856-3137716
Accession: 100673818
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000001786	ResIII	PF04851.15	6.6e-08	1	1
ENSLAFP00000022445	ResIII	PF04851.15	7e-08	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000002135	SBNO1-201	4179	-	ENSLAFP00000001786	1392 (aa)	-	G3SPW6
ENSLAFT00000028854	SBNO1-202	4176	-	ENSLAFP00000022445	1392 (aa)	XP_003420333	G3U3N7

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000002135	SBNO1	81	51.316	ENSLAFG00000008824	SBNO2	75	67.865

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.985	ENSG00000139697	SBNO1	100	96.985	Homo_sapiens
ENSLAFG00000002135	SBNO1	83	80.842	ENSAPOG00000003196	sbno1	98	80.482	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.920	ENSAMEG00000015151	SBNO1	100	96.920	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.243	ENSACIG00000008088	sbno1	99	73.892	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.877	ENSAOCG00000014859	sbno1	99	74.579	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.877	ENSAPEG00000006069	sbno1	99	74.579	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.560	ENSATEG00000006667	sbno1	99	75.630	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	91.170	ENSAPLG00000015674	SBNO1	100	91.248	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	86.506	ENSACAG00000015441	SBNO1	88	86.293	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.913	ENSANAG00000029958	-	99	98.373	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.122	ENSACLG00000024913	sbno1	99	74.019	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	78.734	ENSAMXG00000019473	sbno1	99	78.876	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	97.486	ENSBTAG00000020505	SBNO1	99	97.486	Bos_taurus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.841	ENSCJAG00000016599	SBNO1	100	96.841	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.276	ENSCAFG00000007503	SBNO1	100	97.276	Canis_familiaris
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.554	ENSCAFG00020015363	SBNO1	100	96.554	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	97.270	ENSCHIG00000008382	SBNO1	99	97.326	Capra_hircus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.344	ENSTSYG00000012749	SBNO1	100	97.344	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000002135	SBNO1	96	97.220	ENSCAPG00000000384	SBNO1	100	97.220	Cavia_aperea
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.554	ENSCPOG00000008109	SBNO1	99	98.373	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	92.468	ENSCCAG00000035316	SBNO1	100	92.468	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	97	97.185	ENSCATG00000008239	SBNO1	98	98.734	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.770	ENSCLAG00000008995	SBNO1	99	98.373	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000002135	SBNO1	83	98.014	ENSCSAG00000002064	SBNO1	100	98.014	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	96	94.038	ENSCHOG00000008814	SBNO1	96	94.038	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	91.320	ENSCPBG00000025968	SBNO1	99	91.320	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	91.613	ENSCANG00000042688	-	100	91.541	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.482	ENSCGRG00001017470	Sbno1	100	96.482	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.482	ENSCGRG00000004756	Sbno1	100	96.482	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.175	ENSCSEG00000011919	sbno1	99	74.895	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.264	ENSCVAG00000007038	sbno1	99	75.524	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	78.801	ENSDARG00000099080	sbno1	99	79.372	Danio_rerio
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.521	ENSDNOG00000017147	SBNO1	98	97.225	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	90.524	ENSDORG00000015261	Sbno1	100	90.524	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000002135	SBNO1	93	90.909	ENSETEG00000005620	SBNO1	93	90.909	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000002135	SBNO1	75	62.873	ENSEBUG00000013823	sbno1	93	61.808	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000002135	SBNO1	51	93.653	ENSEASG00005012595	-	92	93.653	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.559	ENSECAG00000006127	SBNO1	100	97.559	Equus_caballus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	83	96.703	ENSEEUG00000003793	SBNO1	83	96.703	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	77.356	ENSELUG00000002886	sbno1	99	77.426	Esox_lucius
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	97.557	ENSFCAG00000015331	SBNO1	99	97.557	Felis_catus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	91.170	ENSFALG00000009273	SBNO1	100	91.248	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	94.899	ENSFDAG00000014232	SBNO1	99	94.899	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.317	ENSFHEG00000007360	sbno1	99	75.316	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	94	77.702	ENSGMOG00000018229	sbno1	99	77.508	Gadus_morhua
ENSLAFG00000002135	SBNO1	88	91.558	ENSGALG00000003392	SBNO1	99	91.477	Gallus_gallus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.476	ENSGAFG00000003960	sbno1	99	75.332	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	94	78.871	ENSGACG00000015633	sbno1	99	78.642	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	90.459	ENSGAGG00000001065	SBNO1	99	94.575	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.841	ENSGGOG00000015000	SBNO1	100	97.865	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	68.451	ENSHBUG00000011910	sbno1	99	68.372	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.770	ENSHGLG00000014165	-	99	98.553	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000002135	SBNO1	93	84.387	ENSHCOG00000003246	sbno1	95	84.387	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	78.196	ENSIPUG00000015830	Sbno1	98	78.165	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.272	ENSSTOG00000023221	SBNO1	99	98.553	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.698	ENSJJAG00000001741	Sbno1	100	96.698	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.300	ENSKMAG00000009696	sbno1	99	75.351	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.821	ENSLBEG00000007623	sbno1	99	75.961	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	80.786	ENSLACG00000017227	SBNO1	99	82.915	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	81.321	ENSLOCG00000005725	sbno1	97	81.166	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.913	ENSMFAG00000031429	SBNO1	100	96.913	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.913	ENSMMUG00000011496	SBNO1	100	96.913	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	95.474	ENSMLEG00000033260	SBNO1	99	98.734	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.405	ENSMAMG00000005473	sbno1	99	75.035	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	91.242	ENSMGAG00000003274	SBNO1	100	91.320	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000002135	SBNO1	50	92.418	ENSMAUG00000004834	-	100	92.418	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.339	ENSMICG00000006573	-	100	96.339	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	96	96.803	ENSMOCG00000009390	Sbno1	100	92.545	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	71.600	ENSMMOG00000008691	sbno1	99	71.298	Mola_mola
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	93.835	ENSMODG00000012470	SBNO1	98	93.894	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.332	ENSMALG00000001056	sbno1	99	75.262	Monopterus_albus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	96.408	MGP_CAROLIEiJ_G0027749	Sbno1	99	96.264	Mus_caroli
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	96.911	ENSMUSG00000038095	Sbno1	100	96.061	Mus_musculus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	96.911	MGP_PahariEiJ_G0024329	Sbno1	99	96.911	Mus_pahari
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	96.695	MGP_SPRETEiJ_G0028747	Sbno1	99	96.695	Mus_spretus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.344	ENSMPUG00000001658	SBNO1	100	97.344	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.770	ENSMLUG00000017159	SBNO1	100	96.770	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.272	ENSNGAG00000012620	Sbno1	100	97.272	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	73.944	ENSNBRG00000019189	sbno1	99	73.628	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	93.252	ENSNLEG00000001502	SBNO1	100	93.252	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000002135	SBNO1	62	86.076	ENSMEUG00000008768	-	93	84.810	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	93.262	ENSOPRG00000011054	SBNO1	100	93.190	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.267	ENSODEG00000009997	SBNO1	99	98.373	Octodon_degus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.282	ENSONIG00000015348	sbno1	99	75.245	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	98	95.259	ENSOCUG00000002441	SBNO1	95	95.259	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.736	ENSORLG00000001593	sbno1	99	74.782	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.789	ENSORLG00020015216	sbno1	99	74.666	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.789	ENSORLG00015002726	sbno1	99	74.736	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	74.684	ENSOMEG00000019313	sbno1	99	74.719	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000002135	SBNO1	50	89.557	ENSOGAG00000010781	-	100	90.272	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	97.059	ENSOARG00000004404	SBNO1	99	97.059	Ovis_aries
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.985	ENSPPAG00000024635	SBNO1	100	97.687	Pan_paniscus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	97.557	ENSPPRG00000022092	SBNO1	99	97.557	Panthera_pardus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.272	ENSPTIG00000017803	SBNO1	100	97.272	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.057	ENSPTRG00000005597	SBNO1	100	97.865	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.841	ENSPANG00000011640	SBNO1	99	98.734	Papio_anubis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	79.986	ENSPKIG00000001441	sbno1	99	79.914	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000002135	SBNO1	92	87.024	ENSPSIG00000009256	-	100	87.024	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	90.650	ENSPSIG00000009572	-	100	90.636	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.267	ENSPEMG00000016087	Sbno1	99	97.468	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	93.410	ENSPCIG00000010985	SBNO1	99	93.683	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.775	ENSPFOG00000005069	sbno1	99	75.787	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.634	ENSPLAG00000015015	sbno1	99	75.823	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.721	ENSPMEG00000021212	sbno1	99	75.734	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.299	ENSPREG00000017746	sbno1	99	75.315	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	96.554	ENSPPYG00000005084	SBNO1	100	96.554	Pongo_abelii
ENSLAFG00000002135	SBNO1	84	97.748	ENSPCAG00000008634	SBNO1	84	97.748	Procavia_capensis
ENSLAFG00000002135	SBNO1	100	97.416	ENSPCOG00000024277	SBNO1	99	98.545	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000002135	SBNO1	87	98.016	ENSPVAG00000015304	SBNO1	87	98.016	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	75.458	ENSPNYG00000004291	sbno1	99	75.211	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000002135	SBNO1	99	78.637	ENSPNAG00000015622	sbno1	99	78.440	Pygocentrus_nattereri
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