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Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000002458 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: GZF1
Alias: ZBTB23|ZNF336|dJ322G13.2
Full Name: GDNF inducible zinc finger protein 1
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 6415 bases
Position: chrscaffold_19:2964142-2970556
Accession: 15808
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000002055	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-34	1	7
ENSLAFP00000002055	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-34	2	7
ENSLAFP00000002055	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-34	3	7
ENSLAFP00000002055	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-34	4	7
ENSLAFP00000002055	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-34	5	7
ENSLAFP00000002055	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-34	6	7
ENSLAFP00000002055	zf-C2H2	PF00096.26	1.7e-34	7	7
ENSLAFP00000026797	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-30	1	6
ENSLAFP00000026797	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-30	2	6
ENSLAFP00000026797	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-30	3	6
ENSLAFP00000026797	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-30	4	6
ENSLAFP00000026797	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-30	5	6
ENSLAFP00000026797	zf-C2H2	PF00096.26	3.5e-30	6	6
ENSLAFP00000022891	zf-C2H2	PF00096.26	3.2e-24	1	5
ENSLAFP00000022891	zf-C2H2	PF00096.26	3.2e-24	2	5
ENSLAFP00000022891	zf-C2H2	PF00096.26	3.2e-24	3	5
ENSLAFP00000022891	zf-C2H2	PF00096.26	3.2e-24	4	5
ENSLAFP00000022891	zf-C2H2	PF00096.26	3.2e-24	5	5
ENSLAFP00000026797	zf-met	PF12874.7	1e-07	1	1
ENSLAFP00000022891	zf-met	PF12874.7	3.3e-07	1	1
ENSLAFP00000002055	zf-met	PF12874.7	1.3e-06	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000031775	GZF1-202	2109	-	ENSLAFP00000026797	702 (aa)	-	G3UG39
ENSLAFT00000026087	GZF1-203	1560	-	ENSLAFP00000022891	520 (aa)	-	G3U4Y3
ENSLAFT00000002458	GZF1-201	2127	-	ENSLAFP00000002055	708 (aa)	-	G3SQH4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000002458	GZF1	51	41.379	ENSLAFG00000010205	ZFAT	99	41.379
ENSLAFG00000002458	GZF1	72	40.102	ENSLAFG00000016590	ZBTB49	53	45.455
ENSLAFG00000002458	GZF1	57	36.994	ENSLAFG00000003570	ZBTB47	60	36.994
ENSLAFG00000002458	GZF1	51	40.541	ENSLAFG00000013445	ZNF521	99	40.000
ENSLAFG00000002458	GZF1	51	44.326	ENSLAFG00000011186	ZNF235	74	44.326
ENSLAFG00000002458	GZF1	96	32.174	ENSLAFG00000002317	PATZ1	87	34.783
ENSLAFG00000002458	GZF1	97	43.243	ENSLAFG00000006642	BCL6B	91	39.877
ENSLAFG00000002458	GZF1	52	41.441	ENSLAFG00000018386	ZNF423	90	41.441
ENSLAFG00000002458	GZF1	66	32.984	ENSLAFG00000012902	ZBTB41	61	30.548
ENSLAFG00000002458	GZF1	81	33.333	ENSLAFG00000004927	ZNF131	67	33.333
ENSLAFG00000002458	GZF1	62	36.318	ENSLAFG00000032716	-	100	35.821
ENSLAFG00000002458	GZF1	53	43.602	ENSLAFG00000031653	-	100	47.518
ENSLAFG00000002458	GZF1	96	39.080	ENSLAFG00000001696	MYNN	72	36.842
ENSLAFG00000002458	GZF1	53	36.816	ENSLAFG00000006532	PRDM5	99	38.095
ENSLAFG00000002458	GZF1	99	40.741	ENSLAFG00000026719	ZBTB24	51	42.453
ENSLAFG00000002458	GZF1	67	36.181	ENSLAFG00000014626	ZBTB16	58	36.000
ENSLAFG00000002458	GZF1	95	35.238	ENSLAFG00000004952	ZBTB14	87	35.294

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.342	ENSG00000125812	GZF1	100	91.667	Homo_sapiens
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	46.269	ENSAPOG00000012930	GZF1	94	49.000	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	84.358	ENSAMEG00000009853	GZF1	100	84.218	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000002458	GZF1	99	40.805	ENSAOCG00000024275	GZF1	93	49.832	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	39.513	ENSATEG00000018374	GZF1	88	78.142	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	84.810	ENSANAG00000028240	GZF1	100	85.091	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000002458	GZF1	99	45.729	ENSAMXG00000017178	GZF1	84	46.479	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	84.810	ENSCJAG00000000733	GZF1	100	84.810	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	86.883	ENSCAFG00000005142	GZF1	100	86.582	Canis_familiaris
ENSLAFG00000002458	GZF1	56	90.000	ENSCAFG00020027463	-	100	90.000	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	78.852	ENSTSYG00000028054	GZF1	100	79.272	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	77.235	ENSCAPG00000002173	GZF1	100	77.095	Cavia_aperea
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	77.095	ENSCPOG00000010790	GZF1	100	76.955	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	85.091	ENSCCAG00000035601	GZF1	100	85.091	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.518	ENSCATG00000039279	GZF1	100	87.377	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	76.913	ENSCLAG00000014714	GZF1	100	76.639	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.360	ENSCSAG00000011054	GZF1	100	87.219	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000002458	GZF1	95	53.145	ENSCPBG00000023418	-	88	47.353	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	76.816	ENSCPBG00000023415	GZF1	100	76.676	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.201	ENSCANG00000041260	GZF1	100	87.201	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	79.831	ENSCGRG00001003944	Gzf1	100	79.690	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	79.831	ENSCGRG00000012721	Gzf1	100	79.690	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000002458	GZF1	99	45.134	ENSCSEG00000002270	GZF1	63	58.462	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000002458	GZF1	72	58.481	ENSCVAG00000013068	-	75	47.475	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000002458	GZF1	80	84.669	ENSDNOG00000014290	GZF1	100	85.017	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	84.777	ENSDORG00000011855	Gzf1	100	84.777	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000002458	GZF1	70	61.932	ENSEBUG00000004858	GZF1	65	61.932	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000002458	GZF1	56	90.909	ENSECAG00000040045	-	100	90.909	Equus_caballus
ENSLAFG00000002458	GZF1	82	44.872	ENSELUG00000013581	GZF1	86	46.739	Esox_lucius
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.972	ENSFCAG00000006484	GZF1	100	87.972	Felis_catus
ENSLAFG00000002458	GZF1	92	77.059	ENSFDAG00000019468	GZF1	96	76.765	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000002458	GZF1	87	43.721	ENSFHEG00000020498	GZF1	54	67.516	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	46.154	ENSGMOG00000011017	GZF1	100	47.528	Gadus_morhua
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	75.872	ENSGALG00000053640	GZF1	100	75.732	Gallus_gallus
ENSLAFG00000002458	GZF1	88	41.123	ENSGAFG00000008725	GZF1	74	46.190	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000002458	GZF1	99	44.221	ENSGACG00000012415	GZF1	99	71.429	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.219	ENSGGOG00000023248	GZF1	100	87.079	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	76.567	ENSHGLG00000008891	GZF1	100	76.294	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	76.567	ENSHGLG00100015117	GZF1	100	76.294	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	45.128	ENSHCOG00000004326	GZF1	63	63.863	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	84.993	ENSSTOG00000009820	GZF1	100	85.273	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	83.636	ENSJJAG00000008172	Gzf1	100	83.636	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000002458	GZF1	55	72.632	ENSKMAG00000001453	-	98	71.134	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000002458	GZF1	99	44.878	ENSLBEG00000025803	-	73	48.433	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.518	ENSMFAG00000042408	GZF1	100	87.377	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.518	ENSMMUG00000022387	GZF1	100	87.377	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.640	ENSMNEG00000033117	GZF1	100	87.500	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.640	ENSMLEG00000036831	GZF1	100	87.500	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	46.193	ENSMAMG00000011931	-	80	47.713	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	74.038	ENSMAUG00000019656	Gzf1	100	82.462	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	86.217	ENSMICG00000046070	GZF1	100	85.654	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	79.606	ENSMOCG00000017816	Gzf1	100	78.873	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	40.883	ENSMMOG00000004395	-	75	45.854	Mola_mola
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	78.771	ENSMODG00000006238	GZF1	100	85.385	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	81.997	MGP_CAROLIEiJ_G0024409	Gzf1	100	82.138	Mus_caroli
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	81.523	ENSMUSG00000027439	Gzf1	100	81.523	Mus_musculus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	81.549	MGP_PahariEiJ_G0025852	Gzf1	100	80.282	Mus_pahari
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	81.382	MGP_SPRETEiJ_G0025327	Gzf1	100	81.382	Mus_spretus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	86.434	ENSMPUG00000001160	GZF1	89	86.294	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000002458	GZF1	98	83.571	ENSMLUG00000002194	GZF1	100	83.429	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	85.049	ENSNGAG00000024012	Gzf1	100	84.908	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	36.868	ENSNBRG00000019987	GZF1	79	45.600	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	86.779	ENSNLEG00000011565	GZF1	100	86.639	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	76.243	ENSOPRG00000004697	GZF1	100	76.657	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	73.907	ENSODEG00000013020	GZF1	100	74.048	Octodon_degus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	45.226	ENSONIG00000000989	GZF1	100	48.485	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	80.986	ENSOCUG00000025214	GZF1	100	80.986	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	83.380	ENSOGAG00000028389	GZF1	100	82.817	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	86.620	ENSPPAG00000028487	GZF1	100	86.620	Pan_paniscus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.972	ENSPPRG00000010040	GZF1	100	87.972	Panthera_pardus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	88.252	ENSPTIG00000019328	GZF1	100	88.252	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	86.357	ENSPTRG00000013320	GZF1	100	86.217	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	87.500	ENSPANG00000017419	GZF1	100	87.360	Papio_anubis
ENSLAFG00000002458	GZF1	97	44.123	ENSPKIG00000003781	GZF1	77	50.940	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000002458	GZF1	91	53.459	ENSPSIG00000014208	-	73	51.890	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	76.620	ENSPSIG00000014455	GZF1	100	76.620	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000002458	GZF1	63	52.558	ENSPMGG00000003778	-	73	53.101	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	80.536	ENSPEMG00000011285	Gzf1	100	80.536	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	79.888	ENSPCIG00000013803	GZF1	100	79.469	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	45.685	ENSPFOG00000002393	GZF1	99	48.026	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000002458	GZF1	100	45.685	ENSPLAG00000005232	GZF1	93	46.935	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000002458	GZF1	94	37.452	ENSPMEG00000020017	-	74	38.416	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000002458	GZF1	88	43.317	ENSPREG00000016398	GZF1	76	42.137	Poecilia_reticulata
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