EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000003661 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO2
Alias: FLJ12155|IPO3|KPNB2B|TRN2
Full Name: transportin 2
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 11960 bases
Position: chrscaffold_26:30352227-30364186
Accession: 100655839
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000003055	IBN_N	PF03810.19	5.3e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000003663	TNPO2-201	2691	-	ENSLAFP00000003055	897 (aa)	XP_003413119	G3SSU7

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000003661	TNPO2	98	84.589	ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	84.589

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSG00000105576	TNPO2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSAPOG00000009339	TNPO2	100	91.991	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	81	90.897	ENSAPOG00000013185	-	96	90.897	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	97.882	ENSAMEG00000012123	TNPO2	100	97.882	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000003661	TNPO2	86	92.348	ENSACIG00000009586	-	99	92.348	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	86	93.256	ENSACIG00000007518	tnpo2	98	93.256	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSAOCG00000010152	-	100	91.991	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSAOCG00000010374	tnpo2	100	91.880	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSAPEG00000013268	-	100	91.991	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSAPEG00000008429	tnpo2	100	91.880	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.769	ENSATEG00000019171	-	100	91.769	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.769	ENSATEG00000024761	TNPO2	100	91.769	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	95.546	ENSACAG00000003576	TNPO2	100	95.546	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.439	ENSANAG00000036645	TNPO2	100	98.439	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	85.762	ENSACLG00000020672	-	100	85.873	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSACLG00000001853	tnpo2	100	91.991	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.570	ENSAMXG00000010246	tnpo2	100	90.461	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.439	ENSBTAG00000011811	TNPO2	99	99.598	Bos_taurus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.443	ENSCJAG00000005096	TNPO2	100	99.443	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.662	ENSCAFG00000017226	TNPO2	85	98.662	Canis_familiaris
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.662	ENSCAFG00020005115	TNPO2	100	98.662	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	95.875	ENSCHIG00000011718	TNPO2	100	95.875	Capra_hircus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	ENSTSYG00000003828	TNPO2	100	98.551	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000003661	TNPO2	94	97.855	ENSCAPG00000015700	TNPO2	96	97.855	Cavia_aperea
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.216	ENSCPOG00000007033	TNPO2	100	98.216	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.443	ENSCCAG00000024574	TNPO2	100	99.443	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSCATG00000042599	TNPO2	100	99.554	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.220	ENSCLAG00000013442	TNPO2	100	99.220	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	ENSCSAG00000006597	TNPO2	100	98.551	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	95.880	ENSCPBG00000023892	TNPO2	100	95.880	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000003661	TNPO2	96	98.495	ENSCANG00000027834	TNPO2	98	98.495	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.666	ENSCGRG00001015917	Tnpo2	100	99.666	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.666	ENSCGRG00000012601	Tnpo2	100	99.666	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000003661	TNPO2	86	90.921	ENSCSEG00000011477	-	99	91.051	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	87.889	ENSCSEG00000012923	tnpo2	100	87.778	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.444	ENSCVAG00000002750	tnpo2	100	90.444	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSCVAG00000001908	TNPO2	100	91.880	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	88.765	ENSDARG00000038239	tnpo2	100	88.988	Danio_rerio
ENSLAFG00000003661	TNPO2	88	88.354	ENSDNOG00000043264	TNPO2	84	88.354	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	93.875	ENSDORG00000014993	Tnpo2	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	71.681	FBgn0024921	Tnpo	100	71.571	Drosophila_melanogaster
ENSLAFG00000003661	TNPO2	92	91.509	ENSETEG00000014785	TNPO2	92	91.509	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.439	ENSEASG00005004160	TNPO2	100	98.439	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	ENSECAG00000013673	TNPO2	100	98.551	Equus_caballus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.438	ENSELUG00000008680	tnpo2	100	91.438	Esox_lucius
ENSLAFG00000003661	TNPO2	79	90.385	ENSELUG00000016542	-	99	83.655	Esox_lucius
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSFCAG00000000467	TNPO2	100	99.554	Felis_catus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.331	ENSFDAG00000021543	TNPO2	100	99.331	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	97	91.264	ENSFHEG00000009734	TNPO2	99	91.264	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.667	ENSFHEG00000016501	tnpo2	100	90.667	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	84.838	ENSGMOG00000009021	tnpo2	100	84.838	Gadus_morhua
ENSLAFG00000003661	TNPO2	80	90.741	ENSGMOG00000014237	-	90	90.741	Gadus_morhua
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSGAFG00000010401	TNPO2	100	91.880	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.000	ENSGAFG00000018993	tnpo2	100	91.000	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	95.991	ENSGAGG00000010150	TNPO2	100	95.991	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSHBUG00000018317	-	100	91.880	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSHBUG00000014849	tnpo2	100	91.991	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.216	ENSHGLG00000016928	TNPO2	100	98.216	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.662	ENSHGLG00100009938	TNPO2	100	98.662	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.656	ENSHCOG00000005914	tnpo2	100	90.434	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSHCOG00000020440	-	100	91.880	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.212	ENSIPUG00000006884	TNPO2	99	91.212	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.657	ENSIPUG00000005768	tnpo2	100	91.657	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSSTOG00000006952	TNPO2	100	99.554	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSJJAG00000016820	Tnpo2	100	99.554	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	89.744	ENSKMAG00000021274	TNPO2	100	89.744	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.769	ENSKMAG00000018430	TNPO2	100	91.769	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSLBEG00000026241	tnpo2	100	91.991	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	92.214	ENSLBEG00000005301	-	100	92.214	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.190	ENSLACG00000012322	TNPO2	99	90.190	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	93.215	ENSLOCG00000006178	tnpo2	99	93.215	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSMFAG00000037531	TNPO2	100	99.554	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSMMUG00000005684	TNPO2	100	99.554	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSMNEG00000041024	TNPO2	100	99.554	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000003661	TNPO2	96	99.537	ENSMLEG00000018391	TNPO2	98	99.537	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSMAMG00000011862	-	100	91.991	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.231	ENSMAMG00000023658	tnpo2	100	90.231	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	87.778	ENSMZEG00005011298	TNPO2	100	88.111	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSMZEG00005023965	tnpo2	100	91.991	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSMZEG00005007408	-	100	91.880	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	ENSMICG00000016153	TNPO2	100	98.551	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.662	ENSMOCG00000016489	Tnpo2	100	98.662	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000003661	TNPO2	86	87.597	ENSMMOG00000005063	TNPO2	93	87.339	Mola_mola
ENSLAFG00000003661	TNPO2	86	92.348	ENSMMOG00000021390	TNPO2	99	92.348	Mola_mola
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	97.887	ENSMODG00000006888	TNPO2	100	97.887	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.434	ENSMALG00000004721	tnpo2	100	90.768	Monopterus_albus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSMALG00000006232	TNPO2	100	91.880	Monopterus_albus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.443	MGP_CAROLIEiJ_G0031326	Tnpo2	100	99.443	Mus_caroli
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.443	ENSMUSG00000031691	Tnpo2	100	100.000	Mus_musculus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.220	MGP_PahariEiJ_G0022931	Tnpo2	100	99.220	Mus_pahari
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.443	MGP_SPRETEiJ_G0032445	Tnpo2	100	99.443	Mus_spretus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.662	ENSMPUG00000004663	TNPO2	100	98.662	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000003661	TNPO2	96	98.495	ENSMLUG00000012669	TNPO2	99	98.495	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.666	ENSNGAG00000000650	Tnpo2	100	99.666	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	86.874	ENSNBRG00000006242	TNPO2	100	86.874	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSNBRG00000023849	TNPO2	100	91.880	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.190	ENSNLEG00000012758	TNPO2	100	90.190	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.657	ENSMEUG00000016658	TNPO2	100	91.657	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.331	ENSODEG00000009670	TNPO2	100	99.331	Octodon_degus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSONIG00000002147	tnpo2	100	91.880	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	92.325	ENSONIG00000017706	-	100	92.325	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	94.989	ENSOANG00000010051	TNPO2	100	94.878	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	80.178	ENSOCUG00000008251	TNPO2	90	80.178	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	56	91.000	ENSORLG00000011763	TNPO2	99	91.400	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.657	ENSORLG00000010363	tnpo2	100	91.657	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000003661	TNPO2	56	90.800	ENSORLG00020001020	TNPO2	99	91.200	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.657	ENSORLG00020015785	tnpo2	100	91.657	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000003661	TNPO2	56	91.000	ENSORLG00015003941	TNPO2	99	91.400	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.639	ENSORLG00015005489	tnpo2	100	91.639	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSOMEG00000013440	TNPO2	100	91.991	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.657	ENSOMEG00000014877	TNPO2	100	91.657	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	97.659	ENSOARG00000011717	TNPO2	92	98.241	Ovis_aries
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSPPAG00000019494	TNPO2	100	99.554	Pan_paniscus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSPPRG00000003075	TNPO2	100	99.554	Panthera_pardus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	84	93.351	ENSPTIG00000011213	TNPO2	97	93.351	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSPTRG00000010535	TNPO2	100	99.554	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.554	ENSPANG00000016857	TNPO2	100	99.554	Papio_anubis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.435	ENSPKIG00000004824	tnpo2	100	91.435	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000003661	TNPO2	97	90.000	ENSPKIG00000002899	-	99	91.082	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	93.126	ENSPSIG00000010215	TNPO2	100	92.794	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	56	91.182	ENSPMGG00000022850	tnpo2	99	91.383	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	86	91.892	ENSPMGG00000016459	TNPO2	99	91.892	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.666	ENSPEMG00000018702	Tnpo2	100	99.666	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000003661	TNPO2	99	95.270	ENSPCIG00000015327	TNPO2	97	95.270	Phascolarctos_cinereus
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ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.778	ENSPFOG00000012466	tnpo2	100	90.889	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000003661	TNPO2	93	91.776	ENSPLAG00000010687	TNPO2	97	91.776	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.889	ENSPLAG00000018842	tnpo2	100	91.000	Poecilia_latipinna
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ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSPMEG00000014011	-	100	91.991	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSPREG00000000415	TNPO2	99	91.991	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.000	ENSPREG00000001121	TNPO2	100	91.111	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	ENSPPYG00000009602	TNPO2	100	98.551	Pongo_abelii
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.889	ENSPCAG00000014916	TNPO2	100	90.889	Procavia_capensis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	ENSPCOG00000018386	TNPO2	100	98.551	Propithecus_coquereli
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ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSPNYG00000013748	tnpo2	100	91.880	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.769	ENSPNAG00000026208	-	100	91.769	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.657	ENSPNAG00000024491	tnpo2	100	91.657	Pygocentrus_nattereri
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ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	ENSRROG00000040402	TNPO2	100	98.551	Rhinopithecus_roxellana
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	98.551	ENSSBOG00000019551	TNPO2	100	98.551	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	97	96.552	ENSSHAG00000015858	TNPO2	100	96.552	Sarcophilus_harrisii
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	92.547	ENSSFOG00015018955	TNPO2	100	92.770	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.566	ENSSFOG00015010934	tnpo2	100	90.879	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	92.214	ENSSMAG00000012008	tnpo2	100	92.214	Scophthalmus_maximus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.769	ENSSMAG00000004050	-	100	91.769	Scophthalmus_maximus
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ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSSDUG00000002607	TNPO2	100	91.991	Seriola_dumerili
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	92.102	ENSSLDG00000013107	-	100	92.102	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSSLDG00000025629	tnpo2	100	91.991	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	82	99.500	ENSSARG00000003825	TNPO2	86	99.500	Sorex_araneus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	96.325	ENSSPUG00000000736	TNPO2	100	96.325	Sphenodon_punctatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	89.889	ENSSPAG00000008511	-	100	89.889	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.880	ENSSPAG00000008512	tnpo2	100	91.880	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.666	ENSSSCG00000013726	TNPO2	100	99.666	Sus_scrofa
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.991	ENSTRUG00000009453	TNPO2	100	91.991	Takifugu_rubripes
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.545	ENSTRUG00000012698	tnpo2	99	90.545	Takifugu_rubripes
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.635	ENSTNIG00000014071	TNPO2	100	90.190	Tetraodon_nigroviridis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	82.832	ENSTNIG00000003295	TNPO2	98	91.350	Tetraodon_nigroviridis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.666	ENSTTRG00000005443	TNPO2	100	99.666	Tursiops_truncatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	99.443	ENSUAMG00000019621	TNPO2	100	99.443	Ursus_americanus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	94.592	ENSUMAG00000006504	TNPO2	99	94.592	Ursus_maritimus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.081	ENSVVUG00000023860	TNPO2	92	100.000	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	92.308	ENSXETG00000004771	tnpo2	99	92.196	Xenopus_tropicalis
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	88.654	ENSXCOG00000014460	TNPO2	99	88.654	Xiphophorus_couchianus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	91.769	ENSXMAG00000012793	TNPO2	100	91.769	Xiphophorus_maculatus
ENSLAFG00000003661	TNPO2	100	90.889	ENSXMAG00000014217	TNPO2	100	91.000	Xiphophorus_maculatus