EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000004081 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SRP9
Alias: -
Full Name: signal recognition particle 9
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 8715 bases
Position: chrscaffold_16:48408279-48416993
Accession: 100674050
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000003406	SRP9-21	PF05486.12	4.2e-13	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000004080	SRP9-201	258	-	ENSLAFP00000003406	86 (aa)	XP_003410983	G3STL4

Gene Model

Click here to download ENSLAFG00000004081's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLAFG00000004081's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSG00000143742	SRP9	100	89.535	Homo_sapiens
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSAPOG00000006089	srp9	100	77.907	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSAMEG00000014744	SRP9	100	97.674	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	58.140	ENSACIG00000022298	srp9	100	58.140	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSAOCG00000014643	srp9	100	77.907	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSAPEG00000004398	srp9	100	77.907	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSATEG00000014339	srp9	100	79.070	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000004081	SRP9	81	88.571	ENSAPLG00000015368	SRP9	100	88.571	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	90.698	ENSACAG00000005788	SRP9	100	90.698	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	90.698	ENSANAG00000022626	SRP9	100	90.698	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSACLG00000018392	srp9	100	79.070	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSAMXG00000010366	srp9	100	79.070	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSBTAG00000033322	SRP9	100	97.674	Bos_taurus
ENSLAFG00000004081	SRP9	88	53.947	WBGene00013984	ZK512.4	100	53.947	Caenorhabditis_elegans
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	90.698	ENSCJAG00000040095	SRP9	100	90.698	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSCAFG00000016162	SRP9	100	97.674	Canis_familiaris
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSCAFG00020003285	SRP9	100	97.674	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSCHIG00000006407	SRP9	100	97.674	Capra_hircus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	86.047	ENSTSYG00000026832	SRP9	100	86.047	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	91.860	ENSCPOG00000033454	SRP9	100	91.860	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSCCAG00000034464	SRP9	100	89.535	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSCATG00000041813	SRP9	100	89.535	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000004081	SRP9	99	84.706	ENSCLAG00000017687	-	99	84.706	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	93.023	ENSCLAG00000001368	-	100	93.023	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSCHOG00000006096	-	100	97.674	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	63.953	ENSCHOG00000012912	-	100	63.953	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000004081	SRP9	58	100.000	ENSCHOG00000008435	-	100	100.000	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSCPBG00000011999	SRP9	100	89.535	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	88.372	ENSCANG00000012015	-	100	88.372	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSCANG00000030765	-	100	89.535	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	93.023	ENSCGRG00001008910	Srp9	100	93.023	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000004081	SRP9	74	87.500	ENSCGRG00000009651	Srp9	84	87.500	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSCSEG00000018438	srp9	100	77.907	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	80.233	ENSCVAG00000001083	srp9	100	80.233	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	76.744	ENSDARG00000042851	srp9	100	76.744	Danio_rerio
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSDNOG00000013412	-	100	97.674	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000004081	SRP9	85	38.356	FBgn0035827	Srp9	95	38.356	Drosophila_melanogaster
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	88.372	ENSETEG00000012291	SRP9	100	88.372	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000004081	SRP9	98	66.667	ENSEBUG00000009080	srp9	100	66.667	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSECAG00000033839	SRP9	100	97.674	Equus_caballus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	90.698	ENSEEUG00000001344	SRP9	100	90.698	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	80.233	ENSELUG00000001506	srp9	100	80.233	Esox_lucius
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSFCAG00000010275	SRP9	62	97.674	Felis_catus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	88.372	ENSFALG00000011689	SRP9	100	88.372	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	94.186	ENSFDAG00000020469	SRP9	100	94.186	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	80.233	ENSFHEG00000011666	srp9	100	80.233	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	80.233	ENSGMOG00000003565	srp9	100	80.233	Gadus_morhua
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	87.209	ENSGALG00000026009	SRP9	100	87.209	Gallus_gallus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSGAFG00000009506	srp9	100	79.070	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSGACG00000004110	srp9	100	77.907	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSGAGG00000017129	SRP9	100	89.535	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSGGOG00000011555	SRP9	100	89.535	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSHBUG00000021430	srp9	100	79.070	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSHGLG00000020168	-	100	89.535	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000004081	SRP9	81	88.571	ENSHGLG00000019830	-	100	88.571	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000004081	SRP9	98	82.143	ENSHGLG00000006535	-	99	82.143	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000004081	SRP9	93	96.250	ENSHGLG00000020925	-	100	96.250	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	95.349	ENSHGLG00000002329	SRP9	100	95.349	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000004081	SRP9	98	82.143	ENSHGLG00100009760	-	99	82.143	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	96.512	ENSHGLG00100019986	-	100	96.512	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSHGLG00100011806	-	100	77.907	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSHGLG00100020800	-	100	89.535	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000004081	SRP9	95	93.902	ENSHGLG00100016521	-	100	93.902	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	59.302	ENSHCOG00000006978	srp9	100	59.302	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSIPUG00000020674	srp9	100	77.907	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSSTOG00000026827	SRP9	100	97.674	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	83.721	ENSJJAG00000016583	Srp9	100	83.721	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	80.233	ENSKMAG00000014117	srp9	100	80.233	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSLBEG00000020620	srp9	100	79.070	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	83.721	ENSLACG00000007546	SRP9	100	83.721	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	81.395	ENSLOCG00000015903	srp9	100	81.395	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSMFAG00000002641	SRP9	100	89.535	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSMMUG00000000134	SRP9	100	89.535	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSMNEG00000043512	SRP9	100	89.535	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSMLEG00000037309	SRP9	100	89.535	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSMAMG00000004755	srp9	100	79.070	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSMZEG00005015517	srp9	100	79.070	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	87.209	ENSMGAG00000008061	SRP9	100	87.209	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	93.023	ENSMAUG00000017552	Srp9	100	93.023	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	96.512	ENSMICG00000030104	-	100	96.512	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	93.023	ENSMOCG00000012590	Srp9	100	93.023	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.011	ENSMMOG00000014838	srp9	100	77.011	Mola_mola
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	95.349	ENSMODG00000025664	SRP9	100	95.349	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	76.744	ENSMALG00000004262	srp9	100	76.744	Monopterus_albus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	93.023	MGP_CAROLIEiJ_G0014997	Srp9	100	93.023	Mus_caroli
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	93.023	ENSMUSG00000026511	Srp9	100	93.023	Mus_musculus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	90.698	MGP_PahariEiJ_G0028229	Srp9	100	90.698	Mus_pahari
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	93.023	MGP_SPRETEiJ_G0015797	Srp9	100	93.023	Mus_spretus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	98.837	ENSMLUG00000014914	SRP9	100	98.837	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	94.186	ENSNGAG00000019936	Srp9	100	94.186	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSNBRG00000010915	srp9	100	79.070	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSNLEG00000013740	SRP9	100	89.535	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSOPRG00000012133	SRP9	100	97.674	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	87.209	ENSODEG00000015075	-	100	87.209	Octodon_degus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	82.955	ENSODEG00000010125	-	76	82.955	Octodon_degus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSONIG00000011409	srp9	100	77.907	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	94.186	ENSOANG00000001472	SRP9	100	94.186	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSOCUG00000010791	SRP9	100	97.674	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSORLG00020003090	srp9	100	79.070	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	80.233	ENSORLG00015001636	srp9	89	80.233	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSOMEG00000020548	srp9	100	79.070	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	91.860	ENSOGAG00000031299	-	100	91.860	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	91.860	ENSOGAG00000001752	-	100	91.860	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSPPAG00000042680	SRP9	100	89.535	Pan_paniscus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSPPRG00000011732	SRP9	100	97.674	Panthera_pardus
ENSLAFG00000004081	SRP9	72	98.387	ENSPTIG00000014838	SRP9	72	98.387	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSPTRG00000002038	SRP9	100	89.535	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSPANG00000030164	SRP9	100	89.535	Papio_anubis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSPKIG00000015012	srp9	100	77.907	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSPSIG00000014842	SRP9	100	89.535	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	59.302	ENSPMGG00000002318	srp9	100	59.302	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	94.186	ENSPEMG00000022774	Srp9	100	94.186	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	95.349	ENSPCIG00000017399	SRP9	100	95.349	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSPREG00000020242	srp9	100	79.070	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000004081	SRP9	97	90.361	ENSPPYG00000000174	SRP9	100	90.361	Pongo_abelii
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	98.837	ENSPCAG00000014886	SRP9	100	98.837	Procavia_capensis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	76.404	ENSPCOG00000012531	-	100	76.404	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000004081	SRP9	72	95.161	ENSPCOG00000021743	-	100	95.161	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSPVAG00000008142	SRP9	100	97.674	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSPNYG00000010536	srp9	100	79.070	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSPNAG00000008264	srp9	100	77.907	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	95.349	ENSRNOG00000003211	Srp9	100	95.349	Rattus_norvegicus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSRBIG00000040480	SRP9	100	89.535	Rhinopithecus_bieti
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	89.535	ENSRROG00000028703	SRP9	100	89.535	Rhinopithecus_roxellana
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	90.698	ENSSBOG00000034573	SRP9	100	90.698	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	95.349	ENSSHAG00000013504	SRP9	100	95.349	Sarcophilus_harrisii
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	76.744	ENSSFOG00015000310	srp9	100	76.744	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSSMAG00000001318	srp9	100	77.907	Scophthalmus_maximus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSSDUG00000008772	srp9	100	77.907	Seriola_dumerili
ENSLAFG00000004081	SRP9	87	80.000	ENSSLDG00000019141	srp9	95	80.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLAFG00000004081	SRP9	99	68.235	ENSSPUG00000014436	SRP9	99	68.235	Sphenodon_punctatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSSPAG00000017244	srp9	100	79.070	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSSSCG00000031664	-	100	97.674	Sus_scrofa
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	88.372	ENSTGUG00000004123	SRP9	100	88.372	Taeniopygia_guttata
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSTRUG00000024107	srp9	100	77.907	Takifugu_rubripes
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	79.070	ENSTNIG00000007254	srp9	100	79.070	Tetraodon_nigroviridis
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	95.349	ENSTBEG00000005634	SRP9	100	95.349	Tupaia_belangeri
ENSLAFG00000004081	SRP9	72	98.387	ENSTTRG00000010081	SRP9	100	98.387	Tursiops_truncatus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSUAMG00000020489	SRP9	100	97.674	Ursus_americanus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSUMAG00000015908	SRP9	100	97.674	Ursus_maritimus
ENSLAFG00000004081	SRP9	72	98.387	ENSVPAG00000001698	SRP9	100	98.387	Vicugna_pacos
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	97.674	ENSVVUG00000002065	SRP9	100	97.674	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSXCOG00000000662	srp9	100	77.907	Xiphophorus_couchianus
ENSLAFG00000004081	SRP9	100	77.907	ENSXMAG00000029514	srp9	100	77.907	Xiphophorus_maculatus