EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000008755 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TWISTNB
Alias: -
Full Name: TWIST neighbor
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 15529 bases
Position: chrscaffold_5:38994578-39010106
Accession: 18027
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000007354	SHS2_Rpb7-N	PF03876.17	7.7e-10	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000008756	TWISTNB-201	996	-	ENSLAFP00000007354	332 (aa)	-	G3T2G1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.934	ENSG00000105849	TWISTNB	98	83.234	Homo_sapiens
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	74.413	ENSAMEG00000008558	TWISTNB	98	74.413	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	56	55.851	ENSACIG00000020400	twistnb	50	55.851	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	55	60.870	ENSACAG00000011817	TWISTNB	93	60.870	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	81.325	ENSANAG00000026418	TWISTNB	99	81.250	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	66	52.511	ENSAMXG00000035868	twistnb	57	56.122	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	80.597	ENSBTAG00000006721	TWISTNB	99	79.403	Bos_taurus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.282	ENSCJAG00000001148	TWISTNB	99	82.196	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	77.971	ENSCAFG00000002511	TWISTNB	99	79.420	Canis_familiaris
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	79.765	ENSCAFG00020002140	TWISTNB	92	80.938	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	81.306	ENSCHIG00000024078	TWISTNB	99	81.306	Capra_hircus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	83.086	ENSTSYG00000001471	TWISTNB	99	83.086	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	83.036	ENSCPOG00000031651	TWISTNB	99	82.738	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	82.687	ENSCCAG00000026416	TWISTNB	99	82.687	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.635	ENSCATG00000035621	TWISTNB	98	82.934	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	82.196	ENSCLAG00000012696	TWISTNB	99	81.899	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.934	ENSCSAG00000013544	TWISTNB	98	83.234	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	79	89.394	ENSCHOG00000006034	TWISTNB	77	89.394	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	92	59.425	ENSCPBG00000000367	TWISTNB	95	58.786	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.934	ENSCANG00000038759	TWISTNB	98	83.234	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	76.488	ENSCGRG00001000499	Twistnb	100	76.786	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	61	56.158	ENSCVAG00000014324	twistnb	52	56.158	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	87.463	ENSDNOG00000006438	-	99	87.463	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	92	78.641	ENSDORG00000007795	Twistnb	95	78.641	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	86.866	ENSEASG00005021702	TWISTNB	95	86.866	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	86.866	ENSECAG00000014563	TWISTNB	95	86.866	Equus_caballus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	91	44.268	ENSELUG00000000098	TWISTNB	52	59.574	Esox_lucius
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	85.373	ENSFCAG00000025987	TWISTNB	99	85.075	Felis_catus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	84	52.862	ENSFALG00000009761	TWISTNB	97	52.862	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	81.627	ENSFDAG00000017368	TWISTNB	99	81.548	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	95	55.140	ENSGALG00000010863	TWISTNB	78	53.172	Gallus_gallus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	84	42.282	ENSGAFG00000018309	twistnb	79	43.599	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	62	51.174	ENSGACG00000006425	twistnb	66	56.897	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	83.234	ENSGGOG00000026888	TWISTNB	98	83.533	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	82.985	ENSHGLG00000010976	TWISTNB	99	82.985	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	83.082	ENSHGLG00100005410	TWISTNB	99	82.985	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	93	42.515	ENSIPUG00000004117	twistnb	91	42.216	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	81.493	ENSSTOG00000022702	TWISTNB	92	81.493	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	76.435	ENSJJAG00000015887	Twistnb	99	76.133	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	52	58.621	ENSKMAG00000001591	twistnb	54	56.931	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	97	46.628	ENSLBEG00000024225	twistnb	51	56.436	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	92	53.797	ENSLACG00000010508	TWISTNB	90	48.182	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	57	63.158	ENSLOCG00000011399	twistnb	58	62.564	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.934	ENSMFAG00000045328	TWISTNB	98	83.234	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.934	ENSMMUG00000009609	TWISTNB	97	83.234	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.335	ENSMNEG00000041159	TWISTNB	98	82.635	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.934	ENSMLEG00000042783	TWISTNB	98	83.234	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	83.036	ENSMICG00000036489	TWISTNB	99	83.036	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	96	75.542	ENSMOCG00000003458	Twistnb	98	76.324	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	88	59.934	ENSMODG00000001402	-	71	59.215	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	55	55.738	ENSMALG00000016407	twistnb	81	42.812	Monopterus_albus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	74.260	MGP_CAROLIEiJ_G0017692	Twistnb	100	74.556	Mus_caroli
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	73.591	ENSMUSG00000020561	Twistnb	100	74.777	Mus_musculus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	75.000	MGP_PahariEiJ_G0029450	Twistnb	98	76.852	Mus_pahari
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	73.887	MGP_SPRETEiJ_G0018534	Twistnb	100	75.074	Mus_spretus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	85.672	ENSMPUG00000013948	TWISTNB	93	85.373	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	92	79.221	ENSMLUG00000008848	TWISTNB	99	79.677	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	60	87.500	ENSNGAG00000022455	Twistnb	99	87.500	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	65	53.881	ENSNBRG00000008652	twistnb	52	56.701	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	95	83.699	ENSNLEG00000035755	TWISTNB	94	84.013	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	75.811	ENSOPRG00000016109	TWISTNB	98	76.106	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	82.143	ENSODEG00000007222	TWISTNB	99	82.143	Octodon_degus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	81.602	ENSOGAG00000009189	TWISTNB	98	82.388	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	80.952	ENSOARG00000009803	TWISTNB	98	80.952	Ovis_aries
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.635	ENSPPAG00000034623	TWISTNB	98	83.234	Pan_paniscus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	84.776	ENSPPRG00000005877	TWISTNB	99	82.687	Panthera_pardus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	89	85.522	ENSPTIG00000021539	TWISTNB	99	84.848	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	83.234	ENSPTRG00000018962	TWISTNB	98	83.533	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.635	ENSPANG00000015736	TWISTNB	98	82.934	Papio_anubis
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	66	54.585	ENSPKIG00000025635	twistnb	55	58.706	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	95	45.481	ENSPMGG00000019023	twistnb	52	55.941	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	92	58.252	ENSPCIG00000017456	TWISTNB	97	57.015	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	81.791	ENSPPYG00000017752	TWISTNB	98	82.090	Pongo_abelii
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	80.952	ENSPCOG00000017601	TWISTNB	98	81.845	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	80.952	ENSPVAG00000015574	TWISTNB	98	81.250	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	65	53.881	ENSPNYG00000002674	twistnb	51	56.701	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	93	46.746	ENSPNAG00000011956	twistnb	56	56.158	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	96	77.019	ENSRNOG00000010750	Twistnb	99	77.329	Rattus_norvegicus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.635	ENSRBIG00000043007	TWISTNB	97	82.934	Rhinopithecus_bieti
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	82.635	ENSRROG00000040155	TWISTNB	98	82.934	Rhinopithecus_roxellana
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	81.325	ENSSBOG00000023188	TWISTNB	99	81.548	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	88	45.277	ENSSFOG00015012788	twistnb	52	60.000	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	91	45.679	ENSSMAG00000012792	twistnb	78	47.079	Scophthalmus_maximus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	91	50.645	ENSSPUG00000007595	TWISTNB	95	50.165	Sphenodon_punctatus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	95	42.508	ENSSPAG00000005871	twistnb	55	53.431	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	84.866	ENSSSCG00000025298	TWISTNB	99	82.143	Sus_scrofa
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	92	47.452	ENSTNIG00000017778	twistnb	89	46.689	Tetraodon_nigroviridis
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	99	83.832	ENSTBEG00000003554	TWISTNB	98	83.234	Tupaia_belangeri
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	86.269	ENSUAMG00000017593	TWISTNB	99	85.970	Ursus_americanus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	85.970	ENSUMAG00000022203	TWISTNB	99	85.672	Ursus_maritimus
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	100	80.938	ENSVVUG00000008386	TWISTNB	99	81.818	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000008755	TWISTNB	61	56.158	ENSXCOG00000020199	twistnb	55	56.158	Xiphophorus_couchianus