EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000010404 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PAPOLG
Alias: FLJ12972
Full Name: poly(A) polymerase gamma
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 29183 bases
Position: chrscaffold_52:1456728-1485910
Accession: 14982
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000008710	PAP_RNA-bind	PF04926.15	4.8e-28	1	2
ENSLAFP00000008710	PAP_RNA-bind	PF04926.15	4.8e-28	2	2
ENSLAFP00000011412	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5e-28	1	2
ENSLAFP00000011412	PAP_RNA-bind	PF04926.15	5e-28	2	2
ENSLAFP00000023041	PAP_RNA-bind	PF04926.15	2.7e-20	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000013634	PAPOLG-201	2229	-	ENSLAFP00000011412	742 (aa)	-	G3TBP3
ENSLAFT00000010404	PAPOLG-202	2214	-	ENSLAFP00000008710	738 (aa)	-	G3T5J5
ENSLAFT00000025737	PAPOLG-203	1290	-	ENSLAFP00000023041	429 (aa)	-	G3U5D3

Gene Model

Click here to download ENSLAFG00000010404's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLAFG00000010404's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	96	81.022	ENSLAFG00000000946	PAPOLA	98	59.651

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSG00000115421	PAPOLG	100	99.573	Homo_sapiens
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	ENSAPOG00000004798	papolg	99	69.987	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.592	ENSAMEG00000018227	PAPOLG	100	94.173	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.247	ENSACIG00000010546	papolg	99	70.027	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.548	ENSAOCG00000010254	papolg	89	72.155	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	ENSAPEG00000006944	papolg	89	72.289	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.014	ENSATEG00000009007	papolg	99	72.908	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	87.559	ENSAPLG00000006813	PAPOLG	99	72.557	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	81	64.039	ENSACAG00000015048	-	100	64.039	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSANAG00000024627	PAPOLG	100	93.943	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.014	ENSACLG00000015592	papolg	99	70.519	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	85.882	ENSAMXG00000004611	papolg	100	72.691	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.669	ENSBTAG00000007414	PAPOLG	100	94.078	Bos_taurus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSCJAG00000009102	PAPOLG	100	94.347	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSCAFG00000002975	PAPOLG	100	86.553	Canis_familiaris
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSCAFG00020026859	PAPOLG	100	93.458	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSCHIG00000015082	PAPOLG	100	93.809	Capra_hircus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSTSYG00000004947	PAPOLG	100	94.482	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	89	91.601	ENSCAPG00000014901	-	100	91.601	Cavia_aperea
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSCPOG00000010306	PAPOLG	100	94.205	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSCCAG00000026893	PAPOLG	100	94.347	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	91	97.425	ENSCATG00000044395	PAPOLG	100	97.425	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSCLAG00000008603	PAPOLG	100	93.809	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSCSAG00000014408	PAPOLG	100	94.213	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	89	93.020	ENSCHOG00000014028	PAPOLG	100	93.020	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	94	68.966	ENSCING00000024664	-	94	64.752	Ciona_intestinalis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	94	68.719	ENSCSAVG00000009085	-	97	65.083	Ciona_savignyi
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSCANG00000038120	PAPOLG	100	94.347	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	98	98.095	ENSCGRG00001014951	Papolg	100	92.224	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	98	98.095	ENSCGRG00000005552	-	100	92.224	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	ENSCSEG00000000771	papolg	99	70.856	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.848	ENSCVAG00000016602	papolg	89	85.030	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	86.761	ENSDARG00000012141	papolg	100	73.184	Danio_rerio
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	93.939	ENSDNOG00000011326	PAPOLG	100	93.127	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSDORG00000016228	Papolg	100	98.144	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	74.898	ENSETEG00000011815	PAPOLG	99	74.831	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	79	84.291	ENSEBUG00000004020	papolg	90	71.279	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	88	60.904	ENSEBUG00000005042	-	82	56.549	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSEASG00005002038	PAPOLG	100	94.751	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSECAG00000009859	PAPOLG	98	95.257	Equus_caballus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	82.075	ENSEEUG00000006196	PAPOLG	100	82.075	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.687	ENSELUG00000014497	papolg	99	64.713	Esox_lucius
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSFCAG00000026126	PAPOLG	100	93.809	Felis_catus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	79.196	ENSFALG00000011079	PAPOLG	97	65.067	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSFDAG00000010662	PAPOLG	97	93.540	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	67	61.923	ENSFHEG00000019080	papolg	90	64.047	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.082	ENSGMOG00000018772	papolg	93	82.374	Gadus_morhua
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.848	ENSGALG00000007853	PAPOLG	100	69.323	Gallus_gallus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.082	ENSGAFG00000003263	papolg	99	69.908	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	ENSGACG00000002718	papolg	100	71.673	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSGGOG00000006083	PAPOLG	100	94.078	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.014	ENSHBUG00000004882	papolg	99	70.519	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.592	ENSHGLG00000019610	PAPOLG	100	94.444	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSHGLG00100010429	PAPOLG	99	94.078	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.315	ENSHCOG00000006782	papolg	89	71.448	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.014	ENSIPUG00000021642	papolg	100	72.252	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSSTOG00000010861	PAPOLG	100	94.078	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSJJAG00000015601	Papolg	100	97.912	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.349	ENSKMAG00000016439	papolg	99	70.993	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.082	ENSLBEG00000023218	papolg	99	68.750	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	75.644	ENSLACG00000009543	PAPOLG	100	69.814	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.279	ENSLOCG00000016130	papolg	100	72.680	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSMFAG00000042450	PAPOLG	100	94.213	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSMMUG00000000498	PAPOLG	100	94.213	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.599	ENSMNEG00000035939	PAPOLG	100	85.695	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSMLEG00000039462	PAPOLG	100	94.078	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	ENSMAMG00000010667	papolg	99	70.525	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.014	ENSMZEG00005018140	papolg	99	71.233	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	83.879	ENSMGAG00000001741	PAPOLG	100	69.559	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	98	98.571	ENSMAUG00000009088	Papolg	99	92.497	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSMICG00000010042	PAPOLG	100	94.751	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	97.664	ENSMOCG00000006857	Papolg	100	92.857	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.082	ENSMMOG00000008020	papolg	99	71.963	Mola_mola
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	95.070	ENSMODG00000002160	PAPOLG	99	86.193	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.014	ENSMALG00000007012	papolg	89	71.751	Monopterus_albus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.131	MGP_CAROLIEiJ_G0016144	Papolg	99	98.372	Mus_caroli
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.131	ENSMUSG00000020273	Papolg	99	98.372	Mus_musculus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.131	MGP_PahariEiJ_G0016746	Papolg	100	93.315	Mus_pahari
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.131	MGP_SPRETEiJ_G0016987	Papolg	99	98.372	Mus_spretus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSMPUG00000005165	PAPOLG	90	93.809	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	97.418	ENSMLUG00000009853	PAPOLG	100	92.141	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSNGAG00000001120	Papolg	100	93.531	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	72.770	ENSNBRG00000011943	papolg	99	65.060	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSNLEG00000009507	-	100	98.144	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	66	97.826	ENSMEUG00000013605	-	87	78.082	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.669	ENSOPRG00000009630	PAPOLG	100	93.001	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	94.366	ENSODEG00000012424	PAPOLG	100	94.366	Octodon_degus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	74.884	ENSONIG00000002985	papolg	100	65.600	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	94.811	ENSOANG00000012403	PAPOLG	99	85.141	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSOCUG00000004962	PAPOLG	100	94.347	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	86.331	ENSORLG00000001577	papolg	99	70.106	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	86.571	ENSORLG00020002482	papolg	89	70.424	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	86.571	ENSORLG00015008836	papolg	99	70.106	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.848	ENSOMEG00000001406	papolg	89	69.881	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	58	87.442	ENSOGAG00000003145	PAPOLG	100	87.442	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSOARG00000001563	PAPOLG	91	93.809	Ovis_aries
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSPPAG00000019917	PAPOLG	100	93.943	Pan_paniscus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSPPRG00000023250	PAPOLG	100	93.809	Panthera_pardus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	97.902	ENSPTIG00000018126	PAPOLG	100	93.674	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSPTRG00000011948	PAPOLG	100	93.943	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	90.951	ENSPANG00000014543	PAPOLG	100	90.201	Papio_anubis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.687	ENSPKIG00000003313	papolg	100	72.679	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	83.765	ENSPKIG00000006027	PAPOLG	96	71.739	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	90.141	ENSPSIG00000013663	PAPOLG	99	78.209	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	98	98.571	ENSPEMG00000008960	-	100	92.224	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	95	67.488	ENSPMAG00000004864	-	96	63.599	Petromyzon_marinus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	65.403	ENSPMAG00000002961	papolg	99	53.928	Petromyzon_marinus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	94.872	ENSPCIG00000028094	PAPOLG	100	86.684	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.848	ENSPFOG00000012909	papolg	99	69.542	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.848	ENSPLAG00000018445	papolg	89	69.948	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.848	ENSPMEG00000003961	papolg	89	69.701	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.615	ENSPREG00000010358	papolg	89	68.872	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSPPYG00000012392	PAPOLG	100	93.943	Pongo_abelii
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	93.617	ENSPCAG00000012297	PAPOLG	100	83.537	Procavia_capensis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	90	98.196	ENSPCOG00000027306	PAPOLG	100	83.176	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	98.364	ENSPVAG00000013541	PAPOLG	89	92.580	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	86.014	ENSPNYG00000006729	papolg	99	70.519	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.548	ENSPNAG00000015521	papolg	100	72.630	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	97.897	ENSRNOG00000006261	Papolg	100	92.992	Rattus_norvegicus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	88.345	ENSRBIG00000040086	PAPOLG	100	88.291	Rhinopithecus_bieti
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSRROG00000035954	PAPOLG	100	94.078	Rhinopithecus_roxellana
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSSBOG00000026194	PAPOLG	100	94.078	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	90	97.143	ENSSHAG00000014942	PAPOLG	99	86.667	Sarcophilus_harrisii
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	77.283	ENSSFOG00015011874	papolg	100	63.503	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	82.984	ENSSFOG00015002383	papolg	100	69.401	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	96	87.409	ENSSMAG00000015598	papolg	95	67.915	Scophthalmus_maximus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	ENSSDUG00000000912	papolg	99	72.193	Seriola_dumerili
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	ENSSLDG00000001217	papolg	99	67.604	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	89.277	ENSSPUG00000007491	PAPOLG	100	77.147	Sphenodon_punctatus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.781	ENSSPAG00000009004	papolg	99	69.852	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSSSCG00000008389	PAPOLG	100	94.213	Sus_scrofa
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	80.435	ENSTGUG00000006762	PAPOLG	98	76.792	Taeniopygia_guttata
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	84.848	ENSTRUG00000006410	papolg	99	70.692	Takifugu_rubripes
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	76.606	ENSTNIG00000017106	papolg	100	65.879	Tetraodon_nigroviridis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	91.962	ENSTBEG00000002609	PAPOLG	100	86.531	Tupaia_belangeri
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	97.897	ENSTTRG00000006237	PAPOLG	100	89.367	Tursiops_truncatus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSUAMG00000011088	PAPOLG	100	93.861	Ursus_americanus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	98	98.812	ENSUMAG00000019081	PAPOLG	90	93.861	Ursus_maritimus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	99	92.671	ENSVPAG00000000492	PAPOLG	100	90.340	Vicugna_pacos
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	98.135	ENSVVUG00000010344	PAPOLG	99	94.347	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	100	85.082	ENSXETG00000002208	papolg	100	73.942	Xenopus_tropicalis
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	85.919	ENSXCOG00000006611	papolg	73	85.484	Xiphophorus_couchianus
ENSLAFG00000010404	PAPOLG	97	82.857	ENSXMAG00000007383	papolg	93	82.897	Xiphophorus_maculatus