EuRBPDB

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PPI

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Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000010823 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ZMAT5
Alias: SNRNP20|ZC3H19
Full Name: zinc finger matrin-type 5
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 14510 bases
Position: chrscaffold_68:4947900-4962409
Accession: 100660138
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000009056	zf-U1	PF06220.12	5.9e-08	1	1
ENSLAFP00000009056	zf-CCCH	PF00642.24	2.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000010822	ZMAT5-201	513	-	ENSLAFP00000009056	170 (aa)	XP_010597053	G3T6C0

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSG00000100319	ZMAT5	100	88.235	Homo_sapiens
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	55.618	ENSAPOG00000000944	zmat5	100	53.977	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	80.000	ENSAMEG00000008059	ZMAT5	100	80.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.955	ENSACIG00000015828	zmat5	100	51.955	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	56.111	ENSAOCG00000003009	zmat5	100	56.111	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	56.111	ENSAPEG00000011779	zmat5	100	56.111	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	50.282	ENSATEG00000020071	zmat5	100	49.721	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	50.857	ENSAPLG00000007232	ZMAT5	100	50.857	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	75	64.885	ENSACAG00000000796	ZMAT5	100	64.885	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.647	ENSANAG00000032394	ZMAT5	100	87.647	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	49.425	ENSAMXG00000006979	zmat5	100	49.425	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSBTAG00000017890	ZMAT5	100	88.235	Bos_taurus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSCJAG00000021763	ZMAT5	100	87.059	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.824	ENSCAFG00000012343	ZMAT5	100	88.824	Canis_familiaris
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.824	ENSCAFG00020000699	ZMAT5	100	88.824	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	75.000	ENSCHIG00000014766	ZMAT5	100	75.000	Capra_hircus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSTSYG00000032219	ZMAT5	100	87.059	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	75.294	ENSCAPG00000017916	ZMAT5	100	75.294	Cavia_aperea
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSCPOG00000035759	ZMAT5	100	87.059	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.824	ENSCCAG00000027039	ZMAT5	100	88.824	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSCATG00000041346	ZMAT5	100	88.235	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSCLAG00000011728	ZMAT5	100	87.059	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSCSAG00000009611	ZMAT5	100	88.235	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	67.647	ENSCPBG00000007737	ZMAT5	100	67.647	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	54	46.739	ENSCING00000024695	-	92	36.306	Ciona_intestinalis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	54	45.652	ENSCSAVG00000011080	-	90	38.608	Ciona_savignyi
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.647	ENSCANG00000027205	ZMAT5	100	87.647	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSCGRG00001006990	Zmat5	100	87.059	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSCGRG00000013989	Zmat5	100	87.059	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	48.333	ENSCSEG00000015698	zmat5	100	49.721	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.397	ENSCVAG00000021521	zmat5	100	51.397	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	49.425	ENSDARG00000035434	zmat5	100	50.000	Danio_rerio
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.647	ENSDNOG00000000899	ZMAT5	100	87.647	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	86.471	ENSDORG00000005655	Zmat5	100	86.471	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	59	32.727	FBgn0051922	CG31922	78	32.727	Drosophila_melanogaster
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	92.941	ENSETEG00000003789	ZMAT5	100	92.941	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	89	41.060	ENSEBUG00000015692	zmat5	69	41.060	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.647	ENSEASG00005010189	ZMAT5	100	87.647	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSECAG00000017576	ZMAT5	100	88.235	Equus_caballus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	81.176	ENSEEUG00000000936	ZMAT5	100	81.176	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.977	ENSELUG00000000943	zmat5	100	51.977	Esox_lucius
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.824	ENSFCAG00000004251	ZMAT5	100	88.824	Felis_catus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	67.059	ENSFALG00000007011	ZMAT5	100	67.059	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	86.471	ENSFDAG00000019792	ZMAT5	100	86.471	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	50.279	ENSFHEG00000020879	zmat5	100	50.279	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	96	49.080	ENSGMOG00000012163	zmat5	95	49.080	Gadus_morhua
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	70.000	ENSGALG00000008070	ZMAT5	100	70.000	Gallus_gallus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	50.838	ENSGAFG00000009069	zmat5	100	50.838	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	84	53.147	ENSGACG00000016940	zmat5	94	53.704	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	67.059	ENSGAGG00000012370	ZMAT5	100	67.059	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSGGOG00000003792	ZMAT5	100	88.235	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	50.838	ENSHBUG00000019402	zmat5	100	50.838	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSHGLG00000018180	ZMAT5	100	87.059	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	85.294	ENSHGLG00100014927	ZMAT5	100	85.294	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	50.867	ENSHCOG00000001727	zmat5	100	50.867	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	75	60.156	ENSIPUG00000006633	zmat5	100	50.568	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSSTOG00000005457	ZMAT5	100	88.235	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	50.847	ENSKMAG00000007209	zmat5	100	50.568	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.765	ENSLBEG00000017297	zmat5	100	51.765	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	54.023	ENSLACG00000001597	ZMAT5	100	54.023	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	53.448	ENSLOCG00000003675	zmat5	100	53.448	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSMFAG00000040309	ZMAT5	100	88.235	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSMMUG00000040034	ZMAT5	100	88.235	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSMNEG00000033419	ZMAT5	100	88.235	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSMLEG00000043289	ZMAT5	100	88.235	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.412	ENSMAMG00000011505	zmat5	100	51.724	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.397	ENSMZEG00005018406	zmat5	100	51.397	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	76	68.992	ENSMGAG00000009818	ZMAT5	100	68.992	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.647	ENSMAUG00000021576	Zmat5	100	87.647	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSMICG00000027135	ZMAT5	100	88.235	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSMOCG00000014203	Zmat5	100	87.059	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	53.977	ENSMMOG00000009336	zmat5	100	53.977	Mola_mola
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	74.706	ENSMODG00000009007	ZMAT5	100	74.706	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	52.542	ENSMALG00000011581	zmat5	100	52.542	Monopterus_albus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSMUSG00000009076	Zmat5	100	87.059	Mus_musculus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	81.714	ENSMPUG00000013253	ZMAT5	100	81.714	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	77.647	ENSMLUG00000017398	ZMAT5	100	77.647	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSNGAG00000019083	Zmat5	100	88.235	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.824	ENSNLEG00000003391	ZMAT5	100	88.824	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	52.941	ENSMEUG00000002484	ZMAT5	100	52.941	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	84.706	ENSODEG00000017389	ZMAT5	100	84.706	Octodon_degus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	50.556	ENSONIG00000013964	zmat5	100	50.556	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSOCUG00000005282	ZMAT5	100	87.059	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	99	50.286	ENSORLG00000008131	zmat5	99	50.286	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	99	50.286	ENSORLG00020017564	zmat5	99	50.286	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	99	50.286	ENSORLG00015004714	zmat5	99	50.286	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.136	ENSOMEG00000002536	zmat5	100	51.136	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	85.882	ENSOGAG00000016378	ZMAT5	100	85.882	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	84.393	ENSOARG00000005488	ZMAT5	100	84.393	Ovis_aries
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSPPAG00000029148	ZMAT5	100	88.235	Pan_paniscus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.824	ENSPPRG00000016453	ZMAT5	100	88.824	Panthera_pardus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.824	ENSPTIG00000021188	ZMAT5	100	88.824	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSPTRG00000014229	ZMAT5	100	88.235	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSPANG00000020624	ZMAT5	100	88.235	Papio_anubis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	52.299	ENSPKIG00000023667	zmat5	100	52.299	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	46.154	ENSPSIG00000005043	ZMAT5	100	46.154	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	50.000	ENSPMGG00000016190	zmat5	100	50.282	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.059	ENSPEMG00000007232	Zmat5	100	87.059	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	72.353	ENSPCIG00000026919	ZMAT5	100	72.353	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.397	ENSPFOG00000019788	zmat5	100	51.397	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	99	52.000	ENSPLAG00000022833	zmat5	99	51.124	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	99	52.000	ENSPMEG00000008885	zmat5	99	51.124	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.955	ENSPREG00000012981	zmat5	100	51.955	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSPPYG00000011696	ZMAT5	100	88.235	Pongo_abelii
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	85.882	ENSPCAG00000009438	ZMAT5	100	85.882	Procavia_capensis
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.824	ENSPCOG00000020052	ZMAT5	100	88.824	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	76.471	ENSPVAG00000017880	ZMAT5	100	76.471	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	51.397	ENSPNYG00000008778	zmat5	100	51.397	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	69	57.265	ENSPNAG00000008209	zmat5	100	47.126	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	87.647	ENSRNOG00000007849	Zmat5	100	87.647	Rattus_norvegicus
ENSLAFG00000010823	ZMAT5	100	88.235	ENSRBIG00000018881	ZMAT5	100	88.235	Rhinopithecus_bieti
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