EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000010835 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: AGO1
Alias: EIF2C1|hAGO1
Full Name: argonaute 1%2C RISC catalytic component
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 28468 bases
Position: chrscaffold_34:14959280-14987747
Accession: 3262
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000009067	PAZ	PF02170.22	8.3e-29	1	1
ENSLAFP00000009067	Piwi	PF02171.17	1.1e-110	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000010835	AGO1-201	2553	-	ENSLAFP00000009067	850 (aa)	-	G3T6C8

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000010835	AGO1	93	84.191	ENSLAFG00000010394	AGO4	100	84.191
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	84.923	ENSLAFG00000002744	AGO3	99	84.923
ENSLAFG00000010835	AGO1	98	83.890	ENSLAFG00000012905	AGO2	99	83.452

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSG00000092847	AGO1	100	100.000	Homo_sapiens
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSAPOG00000024299	ago1	99	96.235	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSAMEG00000000504	AGO1	99	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000010835	AGO1	83	92.023	ENSACIG00000005298	ago1	98	92.023	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSAOCG00000017727	ago1	99	96.235	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSAPEG00000004458	ago1	99	96.576	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSATEG00000008523	ago1	99	96.235	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	93.787	ENSAPLG00000010440	AGO1	98	93.787	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000010835	AGO1	92	99.872	ENSACAG00000029174	AGO1	100	99.872	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSANAG00000037711	AGO1	99	100.000	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.000	ENSACLG00000000890	ago1	99	96.000	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000010835	AGO1	81	98.542	ENSAMXG00000001917	ago1	98	98.542	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	ENSBTAG00000012253	AGO1	99	99.882	Bos_taurus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	99.765	ENSCJAG00000032023	AGO1	99	100.000	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSCAFG00000003443	AGO1	99	100.000	Canis_familiaris
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.762	ENSCAFG00020009251	AGO1	99	99.683	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.529	ENSCHIG00000011848	-	99	99.063	Capra_hircus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSTSYG00000009767	-	99	100.000	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	79.499	ENSTSYG00000032426	-	99	79.499	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000010835	AGO1	90	93.983	ENSCAPG00000010228	AGO1	99	93.111	Cavia_aperea
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSCPOG00000011568	AGO1	99	100.000	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSCCAG00000011823	AGO1	99	100.000	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	99.765	ENSCATG00000031521	AGO1	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSCLAG00000011507	AGO1	99	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSCSAG00000001091	AGO1	99	100.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000010835	AGO1	86	94.574	ENSCHOG00000011591	AGO1	86	94.574	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.764	ENSCPBG00000018594	AGO1	99	99.764	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSCANG00000039798	AGO1	99	100.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	100.000	ENSCGRG00001022708	Ago1	99	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	100.000	ENSCGRG00000010386	Ago1	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	94.780	ENSCSEG00000001051	ago1	99	94.780	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSCVAG00000018173	ago1	99	96.235	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.471	ENSDARG00000092644	ago1	99	96.471	Danio_rerio
ENSLAFG00000010835	AGO1	92	100.000	ENSDNOG00000008077	AGO1	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000010835	AGO1	93	99.255	ENSDORG00000008494	Ago1	99	100.000	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000010835	AGO1	84	93.128	ENSETEG00000007626	AGO1	99	93.128	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSEASG00005012086	AGO1	99	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSECAG00000024353	AGO1	99	100.000	Equus_caballus
ENSLAFG00000010835	AGO1	93	91.614	ENSEEUG00000005349	AGO1	92	91.614	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000010835	AGO1	92	97.059	ENSELUG00000016803	ago1	100	97.059	Esox_lucius
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSFCAG00000000746	AGO1	99	100.000	Felis_catus
ENSLAFG00000010835	AGO1	92	92.219	ENSFALG00000000790	AGO1	100	92.219	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	99.765	ENSFDAG00000017210	AGO1	99	99.882	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	92.680	ENSFHEG00000017927	ago1	99	92.680	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000010835	AGO1	88	84.646	ENSGMOG00000019413	ago1	100	84.646	Gadus_morhua
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	ENSGALG00000002249	AGO1	99	99.882	Gallus_gallus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.353	ENSGAFG00000009775	ago1	99	96.353	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000010835	AGO1	88	97.204	ENSGACG00000012443	ago1	100	97.204	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000010835	AGO1	92	99.872	ENSGAGG00000012893	-	100	99.872	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSGGOG00000003316	AGO1	99	100.000	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.000	ENSHBUG00000010459	ago1	99	96.000	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSHGLG00000011540	AGO1	99	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSHGLG00100005568	AGO1	99	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	96.576	ENSHCOG00000005708	ago1	99	96.576	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSIPUG00000023216	ago1	99	96.235	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	100.000	ENSSTOG00000010857	AGO1	99	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	ENSJJAG00000019449	Ago1	99	99.882	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSKMAG00000019464	ago1	99	96.235	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.353	ENSLBEG00000007694	ago1	99	96.353	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	93.522	ENSLACG00000017009	AGO1	99	93.522	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	94.118	ENSLOCG00000000504	AGO1	99	94.118	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSMFAG00000002846	AGO1	99	100.000	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	95.176	ENSMMUG00000006251	AGO1	100	95.255	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	96.466	ENSMNEG00000028881	AGO1	100	100.000	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSMLEG00000038388	AGO1	99	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSMAMG00000008381	ago1	99	96.235	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.000	ENSMZEG00005007996	ago1	99	96.000	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	94.509	ENSMGAG00000003822	AGO1	99	94.509	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSMAUG00000015189	Ago1	99	100.000	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSMICG00000016147	AGO1	99	100.000	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	ENSMOCG00000000537	Ago1	99	99.882	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000010835	AGO1	79	98.657	ENSMMOG00000018459	ago1	93	98.657	Mola_mola
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.647	ENSMODG00000023335	AGO1	99	99.647	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	96.539	ENSMALG00000011057	ago1	99	96.539	Monopterus_albus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0026478	Ago1	100	99.458	Mus_caroli
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSMUSG00000041530	Ago1	100	99.458	Mus_musculus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	MGP_PahariEiJ_G0028809	Ago1	100	99.458	Mus_pahari
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0027457	Ago1	100	99.458	Mus_spretus
ENSLAFG00000010835	AGO1	84	100.000	ENSMPUG00000014872	AGO1	100	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000010835	AGO1	62	99.426	ENSMLUG00000009628	AGO1	99	99.426	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	ENSNGAG00000017448	Ago1	99	99.882	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000010835	AGO1	92	97.059	ENSNBRG00000010867	ago1	100	97.059	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	ENSNLEG00000011181	AGO1	99	99.882	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000010835	AGO1	85	100.000	ENSMEUG00000013429	AGO1	91	100.000	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000010835	AGO1	92	100.000	ENSOPRG00000012325	AGO1	92	100.000	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	99.882	ENSODEG00000005321	AGO1	99	100.000	Octodon_degus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.000	ENSONIG00000016345	ago1	100	96.000	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	90.920	ENSOANG00000002080	AGO1	99	91.901	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	ENSOCUG00000023116	AGO1	99	99.882	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSORLG00000014965	ago1	99	96.235	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSORLG00020018253	ago1	99	96.235	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSORLG00015003287	ago1	99	96.235	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.235	ENSOMEG00000020528	ago1	99	96.235	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	99.882	ENSOGAG00000010279	AGO1	99	99.882	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.882	ENSOARG00000019591	AGO1	99	99.882	Ovis_aries
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSPPAG00000034838	AGO1	99	100.000	Pan_paniscus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSPPRG00000006475	AGO1	99	100.000	Panthera_pardus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.764	ENSPTIG00000020991	AGO1	99	99.764	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	99.529	ENSPTRG00000000528	AGO1	99	100.000	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSPANG00000009060	AGO1	99	100.000	Papio_anubis
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.050	ENSPSIG00000017482	AGO1	100	99.050	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000010835	AGO1	81	97.384	ENSPMGG00000024099	ago1	98	97.384	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSPEMG00000023313	Ago1	99	100.000	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	99.647	ENSPCIG00000000172	AGO1	99	99.647	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.353	ENSPFOG00000005867	ago1	99	96.353	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.353	ENSPLAG00000002824	ago1	99	98.119	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.353	ENSPMEG00000001787	ago1	99	98.119	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000010835	AGO1	100	96.353	ENSPREG00000006534	ago1	99	96.353	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSPPYG00000001551	AGO1	99	100.000	Pongo_abelii
ENSLAFG00000010835	AGO1	58	100.000	ENSPCAG00000005604	AGO1	65	100.000	Procavia_capensis
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSPCOG00000022061	AGO1	100	100.000	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000010835	AGO1	99	100.000	ENSPVAG00000005082	AGO1	99	100.000	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000010835	AGO1	92	92.219	ENSPNYG00000012586	ago1	100	92.219	Pundamilia_nyererei
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