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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000011796 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: TNPO1
Alias: IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Full Name: transportin 1
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 131814 bases
Position: chrscaffold_7:75172436-75304249
Accession: 6401
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000009859	IBN_N	PF03810.19	1.2e-15	1	1
ENSLAFP00000019455	IBN_N	PF03810.19	7e-15	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000011798	TNPO1-201	2598	-	ENSLAFP00000009859	866 (aa)	-	G3T870
ENSLAFT00000033206	TNPO1-202	2538	-	ENSLAFP00000019455	845 (aa)	-	G3TV47

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	84.589	ENSLAFG00000003661	TNPO2	98	84.589

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSG00000083312	TNPO1	100	99.482	Homo_sapiens
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	93.187	ENSAPOG00000003453	tnpo1	97	93.187	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.284	ENSAMEG00000007147	TNPO1	96	98.284	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000011796	TNPO1	87	92.267	ENSACIG00000003711	tnpo1	97	92.267	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	93.303	ENSAOCG00000008154	tnpo1	97	93.303	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	93.303	ENSAPEG00000001112	tnpo1	97	93.303	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.956	ENSATEG00000010408	tnpo1	97	92.956	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	93.743	ENSAPLG00000009619	-	97	93.563	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	96.305	ENSACAG00000009599	TNPO1	97	96.305	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.716	ENSANAG00000025351	-	95	91.716	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.730	ENSANAG00000022453	-	96	98.730	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	64.277	ENSANAG00000027118	-	97	64.692	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	90.878	ENSACLG00000027223	tnpo1	97	90.878	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.166	ENSAMXG00000009842	tnpo1	97	91.820	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.961	ENSBTAG00000007979	TNPO1	96	98.961	Bos_taurus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	ENSCJAG00000016409	TNPO1	96	98.845	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	99.533	ENSCAFG00000008081	TNPO1	100	99.533	Canis_familiaris
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	95.958	ENSCAFG00020017397	TNPO1	97	95.958	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	ENSCHIG00000023462	TNPO1	96	98.845	Capra_hircus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	98.012	ENSTSYG00000001871	TNPO1	97	98.012	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.730	ENSCCAG00000026472	TNPO1	97	98.730	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSCATG00000043792	TNPO1	97	99.192	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.730	ENSCLAG00000016191	TNPO1	97	98.730	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	ENSCSAG00000015616	TNPO1	96	99.076	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	94	85.890	ENSCHOG00000001746	TNPO1	96	85.890	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	97.344	ENSCPBG00000000260	TNPO1	92	97.344	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	74.856	ENSCSAVG00000010981	-	97	74.856	Ciona_savignyi
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSCANG00000004353	TNPO1	96	99.192	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	ENSCGRG00001016580	Tnpo1	96	98.845	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	99.415	ENSCGRG00000010366	Tnpo1	100	99.415	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.801	ENSCSEG00000012674	tnpo1	97	91.801	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.725	ENSCVAG00000001010	tnpo1	97	92.725	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.042	ENSDARG00000035390	tnpo1	97	91.696	Danio_rerio
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.635	ENSDNOG00000006647	TNPO1	97	92.635	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	96	99.518	ENSDORG00000006476	Tnpo1	100	99.517	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000011796	TNPO1	97	59.201	FBgn0035693	CG8219	96	59.201	Drosophila_melanogaster
ENSLAFG00000011796	TNPO1	86	100.000	ENSETEG00000017805	TNPO1	86	100.000	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000011796	TNPO1	98	84.643	ENSEBUG00000001895	tnpo1	100	85.119	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSEASG00005018055	TNPO1	97	99.192	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	ENSECAG00000024424	TNPO1	96	99.076	Equus_caballus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	85.906	ENSELUG00000002821	tnpo1	97	85.459	Esox_lucius
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSFCAG00000013181	TNPO1	97	99.192	Felis_catus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	96.998	ENSFALG00000010292	TNPO1	97	96.998	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	ENSFDAG00000013345	TNPO1	96	98.845	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.964	ENSFHEG00000019234	tnpo1	97	92.964	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	89.413	ENSGMOG00000000347	tnpo1	97	89.413	Gadus_morhua
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	96.305	ENSGALG00000015014	TNPO1	97	96.305	Gallus_gallus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.705	ENSGAFG00000000943	tnpo1	97	91.705	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.494	ENSGACG00000015841	tnpo1	97	92.494	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	97.113	ENSGAGG00000013419	TNPO1	97	97.113	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	82.488	ENSGGOG00000022535	-	95	82.488	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSGGOG00000026800	TNPO1	97	99.192	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.494	ENSHBUG00000008068	tnpo1	97	92.494	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.499	ENSHGLG00000000970	-	97	98.499	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	99.064	ENSHGLG00100017090	-	99	99.064	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	78.673	ENSHGLG00100000963	-	98	78.673	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.961	ENSJJAG00000010244	Tnpo1	94	98.961	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.956	ENSKMAG00000018195	tnpo1	97	92.956	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	90	89.454	ENSLBEG00000009521	tnpo1	94	89.454	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	89.057	ENSLACG00000012199	TNPO1	99	89.057	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	94.919	ENSLOCG00000011092	tnpo1	95	94.919	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSMFAG00000003636	TNPO1	96	99.192	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	ENSMMUG00000020923	TNPO1	97	99.076	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSMNEG00000044581	TNPO1	96	99.192	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSMLEG00000030740	TNPO1	96	99.192	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.956	ENSMAMG00000001357	tnpo1	97	92.956	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.263	ENSMZEG00005004913	tnpo1	97	92.263	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	ENSMAUG00000020550	Tnpo1	96	98.845	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	94.919	ENSMICG00000008468	TNPO1	97	94.919	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	ENSMOCG00000009301	Tnpo1	96	98.845	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000011796	TNPO1	87	92.021	ENSMMOG00000005551	tnpo1	96	92.021	Mola_mola
ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	98.085	ENSMODG00000001721	TNPO1	78	98.085	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.801	ENSMALG00000009782	tnpo1	97	91.801	Monopterus_albus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.614	MGP_CAROLIEiJ_G0018826	Tnpo1	97	98.614	Mus_caroli
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	ENSMUSG00000009470	Tnpo1	97	98.851	Mus_musculus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.730	MGP_PahariEiJ_G0015901	Tnpo1	97	98.723	Mus_pahari
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.614	MGP_SPRETEiJ_G0019708	Tnpo1	97	98.595	Mus_spretus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	ENSMPUG00000014387	TNPO1	96	99.076	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	99.069	ENSMLUG00000016317	TNPO1	100	99.069	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	ENSNGAG00000021263	Tnpo1	97	98.845	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000011796	TNPO1	87	92.133	ENSNBRG00000009998	tnpo1	97	92.133	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSNLEG00000004572	TNPO1	97	99.192	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000011796	TNPO1	91	93.662	ENSOPRG00000012390	TNPO1	86	93.662	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.730	ENSODEG00000001771	TNPO1	96	98.730	Octodon_degus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	91.743	ENSONIG00000011151	tnpo1	96	91.743	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	95	97.927	ENSOANG00000015785	TNPO1	100	97.927	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	94.090	ENSOCUG00000013318	TNPO1	100	94.090	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	87	92.000	ENSORLG00000003182	tnpo1	97	92.000	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.263	ENSORLG00020011559	tnpo1	98	92.263	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.379	ENSORLG00015019113	tnpo1	98	92.379	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.263	ENSOMEG00000014567	tnpo1	98	92.263	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	ENSOGAG00000000808	TNPO1	96	99.076	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.961	ENSOARG00000005038	TNPO1	81	98.961	Ovis_aries
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSPPAG00000042518	TNPO1	96	99.192	Pan_paniscus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSPPRG00000022336	TNPO1	97	99.192	Panthera_pardus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSPTIG00000018839	TNPO1	97	99.192	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000011796	TNPO1	94	86.163	ENSPTRG00000047731	-	97	86.163	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSPTRG00000016972	TNPO1	96	99.192	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.192	ENSPANG00000006074	TNPO1	96	99.192	Papio_anubis
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	89.954	ENSPKIG00000019795	tnpo1	97	89.954	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	96.998	ENSPSIG00000014366	TNPO1	97	96.998	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	90.081	ENSPMGG00000017014	tnpo1	97	90.081	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	99	99.415	ENSPEMG00000007444	Tnpo1	100	99.415	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	97.806	ENSPCIG00000026080	TNPO1	97	97.806	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.520	ENSPFOG00000011447	tnpo1	97	92.520	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.520	ENSPLAG00000018696	tnpo1	97	92.520	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.725	ENSPMEG00000024121	tnpo1	97	92.725	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.627	ENSPREG00000020705	tnpo1	97	92.627	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	ENSPPYG00000015545	TNPO1	96	99.076	Pongo_abelii
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	99.076	ENSPCOG00000004254	TNPO1	96	99.076	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.845	ENSPVAG00000013051	TNPO1	96	98.845	Pteropus_vampyrus
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ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	98.614	ENSRNOG00000014999	Tnpo1	97	98.614	Rattus_norvegicus
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ENSLAFG00000011796	TNPO1	100	92.388	ENSXMAG00000005440	tnpo1	97	92.388	Xiphophorus_maculatus