EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000012893 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: CAPRIN2
Alias: C1QDC1|EEG1|FLJ11391|FLJ22569|RNG140|caprin-2
Full Name: caprin family member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 35606 bases
Position: chrscaffold_2:20568280-20603885
Accession: 21259
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000010783	Caprin-1_C	PF12287.8	3.6e-130	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000012895	CAPRIN2-201	3138	-	ENSLAFP00000010783	1045 (aa)	-	G3TAA9

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	43.820	ENSLAFG00000012387	CAPRIN1	89	42.642

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	60	41.887	ENSG00000135387	CAPRIN1	96	41.004	Homo_sapiens
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	84.967	ENSG00000110888	CAPRIN2	100	98.810	Homo_sapiens
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	43.333	ENSAPOG00000004726	caprin1a	88	43.333	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	87	45.016	ENSAPOG00000019808	caprin2	95	44.695	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	50	47.475	ENSAPOG00000010508	caprin1b	93	40.909	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	43.071	ENSAMEG00000008137	CAPRIN1	89	43.130	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	92.447	ENSAMEG00000009118	CAPRIN2	93	92.447	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	50	48.485	ENSACIG00000017913	caprin1b	81	48.485	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	56	43.774	ENSACIG00000005383	caprin1a	89	43.774	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	80	54.187	ENSACIG00000005589	caprin2	88	54.187	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	42.963	ENSAOCG00000003017	caprin1a	88	42.963	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	40.152	ENSAOCG00000004574	caprin1b	87	40.909	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	87	44.551	ENSAOCG00000013014	caprin2	94	44.231	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	40.152	ENSAPEG00000001227	caprin1b	87	40.909	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	42.963	ENSAPEG00000008548	caprin1a	88	42.963	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	41.353	ENSATEG00000015675	caprin1b	87	40.659	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	39.925	ENSATEG00000007707	caprin1a	89	39.925	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	55	40.873	ENSAPLG00000006975	CAPRIN1	93	41.600	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	70.028	ENSAPLG00000006703	CAPRIN2	97	69.787	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	41.603	ENSACAG00000013621	CAPRIN1	87	41.221	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	60.570	ENSACAG00000012953	CAPRIN2	98	61.234	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	91.205	ENSANAG00000035460	CAPRIN2	100	91.205	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	42.697	ENSANAG00000032811	-	96	41.597	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	31.102	ENSANAG00000034464	-	89	31.873	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	42.164	ENSACLG00000007463	caprin1b	87	40.809	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	42.697	ENSACLG00000026749	caprin1a	89	42.697	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	83	42.246	ENSACLG00000015175	-	92	42.246	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	84	45.664	ENSAMXG00000007266	caprin2	93	45.664	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	56	40.441	ENSAMXG00000006601	caprin1a	83	46.341	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	54	44.545	ENSAMXG00000005142	caprin1b	95	38.435	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	43.071	ENSBTAG00000016744	CAPRIN1	94	39.731	Bos_taurus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	91.778	ENSBTAG00000019373	CAPRIN2	98	91.778	Bos_taurus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	42.697	ENSCJAG00000010542	CAPRIN1	89	42.748	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	90.727	ENSCJAG00000001080	CAPRIN2	99	88.784	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	43.071	ENSCAFG00000007104	CAPRIN1	88	43.130	Canis_familiaris
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	92.639	ENSCAFG00000010713	CAPRIN2	98	92.639	Canis_familiaris
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	43.071	ENSCAFG00020004525	CAPRIN1	96	43.130	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	91.271	ENSCAFG00020018961	-	100	91.271	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	91.874	ENSCHIG00000026352	CAPRIN2	100	91.683	Capra_hircus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	43.071	ENSCHIG00000017561	CAPRIN1	94	39.731	Capra_hircus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	55	39.474	ENSTSYG00000028754	-	90	39.033	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	41.870	ENSTSYG00000033857	-	97	41.736	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	86.711	ENSTSYG00000008590	CAPRIN2	94	86.711	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	37.849	ENSCAPG00000000035	CAPRIN1	91	37.849	Cavia_aperea
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	86.424	ENSCPOG00000006625	CAPRIN2	100	90.672	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	41.887	ENSCPOG00000015734	CAPRIN1	95	39.527	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	42.697	ENSCCAG00000020172	-	96	41.597	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	61	39.179	ENSCCAG00000022482	-	91	39.544	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	99	90.682	ENSCCAG00000027709	CAPRIN2	100	92.460	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	41.887	ENSCATG00000038427	CAPRIN1	89	42.205	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	90.144	ENSCATG00000031463	CAPRIN2	100	92.857	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	85.551	ENSCLAG00000001513	CAPRIN2	100	91.638	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	60	35.043	ENSCLAG00000007513	-	85	38.071	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	60	41.636	ENSCLAG00000015468	-	93	40.067	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	90.631	ENSCSAG00000007446	CAPRIN2	98	91.109	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	89.484	ENSCHOG00000008931	CAPRIN2	93	89.388	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	40.672	ENSCPBG00000012511	CAPRIN1	93	39.189	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	64.267	ENSCPBG00000027227	CAPRIN2	98	64.273	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	86.520	ENSCANG00000035343	CAPRIN2	93	87.189	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	41.887	ENSCANG00000032583	CAPRIN1	96	41.004	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	77.937	ENSCGRG00001002901	Caprin2	100	86.760	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	43.130	ENSCGRG00001006383	Caprin1	89	43.130	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	43.130	ENSCGRG00000012551	Caprin1	95	43.130	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	79	87.805	ENSCGRG00000001249	Caprin2	100	86.760	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	43.446	ENSCSEG00000001898	caprin1a	89	43.446	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	60	41.985	ENSCSEG00000013073	caprin1b	93	41.353	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	40.493	ENSCVAG00000021994	caprin1b	89	41.071	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	41.176	ENSCVAG00000005129	caprin1a	91	41.091	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	64	42.105	ENSDARG00000009346	caprin1a	95	41.221	Danio_rerio
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	91	46.057	ENSDARG00000020749	caprin2	96	45.625	Danio_rerio
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	39.855	ENSDARG00000054272	caprin1b	90	39.855	Danio_rerio
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	42.697	ENSDNOG00000031223	-	89	43.130	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	41.564	ENSDNOG00000037711	-	96	42.017	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	94	81.864	ENSDNOG00000009793	CAPRIN2	100	81.966	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	55	43.071	ENSDORG00000006566	Caprin1	84	42.264	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	73	90.351	ENSDORG00000012639	Caprin2	100	90.351	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	77	77.174	ENSETEG00000011498	-	82	77.174	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	41.057	ENSETEG00000009308	CAPRIN1	97	42.510	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	38.328	ENSEBUG00000005422	CAPRIN1	91	37.586	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	92.065	ENSEASG00005005997	CAPRIN2	100	91.100	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	60	42.222	ENSEASG00005020196	CAPRIN1	97	41.502	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	92.352	ENSECAG00000000608	CAPRIN2	98	92.352	Equus_caballus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	60	42.222	ENSECAG00000007147	CAPRIN1	97	40.945	Equus_caballus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	54	41.569	ENSEEUG00000006638	CAPRIN1	91	42.000	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	61	41.667	ENSELUG00000006003	caprin1b	93	41.667	Esox_lucius
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	56	40.299	ENSELUG00000009443	caprin1a	87	41.199	Esox_lucius
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	80	47.335	ENSELUG00000019776	caprin2	90	47.022	Esox_lucius
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	86.204	ENSFCAG00000007004	CAPRIN2	95	91.026	Felis_catus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	41.975	ENSFCAG00000030411	CAPRIN1	96	41.079	Felis_catus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	41.065	ENSFALG00000001291	CAPRIN1	86	41.065	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	65.845	ENSFALG00000009038	CAPRIN2	98	65.843	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	81.220	ENSFDAG00000020134	CAPRIN2	100	81.220	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	43.071	ENSFDAG00000015466	CAPRIN1	91	43.346	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	87	42.857	ENSFHEG00000004435	caprin2	97	41.975	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	38.014	ENSFHEG00000009076	caprin1b	89	39.362	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	40.149	ENSFHEG00000020227	caprin1a	89	39.130	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	39.925	ENSGMOG00000008955	caprin1a	89	38.686	Gadus_morhua
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	40.221	ENSGMOG00000002853	caprin1b	88	40.221	Gadus_morhua
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	41.825	ENSGALG00000013532	CAPRIN1	87	41.065	Gallus_gallus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	64.965	ENSGALG00000012947	CAPRIN2	98	64.812	Gallus_gallus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	84	42.177	ENSGAFG00000020084	caprin2	94	42.177	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	40.293	ENSGAFG00000013909	caprin1a	92	38.768	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	79	43.066	ENSGACG00000019233	caprin2	88	43.066	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	37.828	ENSGACG00000009867	caprin1b	87	39.033	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	37.500	ENSGACG00000015620	caprin1a	90	37.276	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	62.086	ENSGAGG00000015057	CAPRIN2	98	62.086	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	40.672	ENSGAGG00000002048	CAPRIN1	93	38.851	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	86.711	ENSGGOG00000006182	CAPRIN2	92	86.711	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	51	52.907	ENSGGOG00000010997	CAPRIN1	86	52.907	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	50	49.495	ENSHBUG00000003821	caprin1b	81	49.495	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	83	42.959	ENSHBUG00000012107	-	92	42.959	Haplochromis_burtoni
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	79	90.941	ENSHGLG00000007117	CAPRIN2	100	90.941	Heterocephalus_glaber_female
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	42.164	ENSMZEG00005005204	caprin1b	87	40.809	Maylandia_zebra
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	54	39.648	ENSMGAG00000010122	CAPRIN1	93	38.767	Meleagris_gallopavo
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	42.322	ENSMPUG00000011533	-	89	41.509	Mustela_putorius_furo
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	63	37.386	ENSSFOG00015015517	CAPRIN1	93	37.386	Scleropages_formosus
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	70.260	ENSTGUG00000011456	-	97	70.270	Taeniopygia_guttata
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	42.066	ENSTRUG00000017061	caprin1b	89	41.392	Takifugu_rubripes
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	81	95.410	ENSTBEG00000001706	CAPRIN2	77	95.410	Tupaia_belangeri
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	84.608	ENSVPAG00000007238	CAPRIN2	93	84.608	Vicugna_pacos
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	59	42.629	ENSVVUG00000010396	CAPRIN1	98	42.017	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	100	92.734	ENSVVUG00000007217	CAPRIN2	83	92.734	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	43.511	ENSXETG00000003985	caprin1	93	43.726	Xenopus_tropicalis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	71	70.588	ENSXETG00000007516	caprin2	85	65.537	Xenopus_tropicalis
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	38.095	ENSXCOG00000011070	caprin1a	89	36.786	Xiphophorus_couchianus
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ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	57	40.520	ENSXMAG00000007148	caprin1a	89	39.568	Xiphophorus_maculatus
ENSLAFG00000012893	CAPRIN2	58	41.135	ENSXMAG00000007287	caprin1b	89	42.199	Xiphophorus_maculatus