EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000013470 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: ACO1
Alias: IREB1|IREBP|IRP1
Full Name: aconitase 1
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 34457 bases
Position: chrscaffold_6:67501686-67536142
Accession: 117
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000011276	Aconitase	PF00330.20	4e-177	1	1
ENSLAFP00000019136	Aconitase	PF00330.20	1e-170	1	1
ENSLAFP00000011276	Aconitase_C	PF00694.19	5.7e-46	1	1
ENSLAFP00000019136	Aconitase_C	PF00694.19	6.1e-46	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000033458	ACO1-201	2697	-	ENSLAFP00000019136	899 (aa)	-	G3TU78
ENSLAFT00000013474	ACO1-202	2667	-	ENSLAFP00000011276	889 (aa)	-	G3TBD3

Gene Model

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000013470	ACO1	97	61.104	ENSLAFG00000012839	IREB2	99	56.381

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.026	ENSG00000122729	ACO1	100	93.026	Homo_sapiens
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	79.640	ENSAPOG00000008670	aco1	99	79.640	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.584	ENSAMEG00000003746	ACO1	100	92.584	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	80.090	ENSACIG00000014377	aco1	99	80.090	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	79.640	ENSAOCG00000007699	aco1	99	79.640	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	79.753	ENSAPEG00000014370	aco1	99	79.753	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	80.856	ENSATEG00000000560	aco1	99	80.856	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	85.923	ENSAPLG00000015490	ACO1	99	85.923	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000013470	ACO1	97	85.465	ENSACAG00000001541	ACO1	99	85.465	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	91.667	ENSANAG00000003359	ACO1	99	91.667	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	79.528	ENSACLG00000007755	aco1	99	79.528	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	80.068	ENSAMXG00000002499	aco1	99	80.068	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.251	ENSBTAG00000000555	ACO1	100	93.251	Bos_taurus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	91.901	ENSCJAG00000007687	ACO1	100	91.901	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.360	ENSCAFG00000001786	ACO1	99	92.360	Canis_familiaris
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.463	ENSCAFG00020014553	ACO1	100	92.463	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.138	ENSCHIG00000007667	ACO1	100	93.138	Capra_hircus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.026	ENSTSYG00000004179	ACO1	99	93.026	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	73.543	ENSCAPG00000007254	ACO1	100	73.543	Cavia_aperea
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	91.339	ENSCPOG00000003768	ACO1	100	91.339	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	91.789	ENSCCAG00000022465	ACO1	100	91.789	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.463	ENSCATG00000045333	ACO1	100	92.463	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	91.001	ENSCLAG00000002487	ACO1	100	91.001	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.463	ENSCSAG00000009824	ACO1	99	92.463	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000013470	ACO1	90	75.934	ENSCHOG00000008996	ACO1	90	75.934	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	87.162	ENSCPBG00000008077	ACO1	99	87.162	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.351	ENSCANG00000014847	ACO1	100	92.351	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.138	ENSCGRG00001024337	Aco1	100	93.138	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.126	ENSCGRG00000004877	-	100	92.126	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	75.901	ENSCSEG00000018262	aco1	99	75.901	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	74.099	ENSCVAG00000020264	aco1	99	74.099	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	80.427	ENSDARG00000026376	aco1	99	80.427	Danio_rerio
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.588	ENSDNOG00000003951	ACO1	100	93.588	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.238	ENSDORG00000014246	Aco1	100	92.238	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000013470	ACO1	86	73.016	ENSETEG00000012415	-	85	73.016	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000013470	ACO1	98	64.655	ENSEBUG00000015441	aco1	89	64.655	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.926	ENSEASG00005004602	ACO1	100	93.926	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.813	ENSECAG00000014846	ACO1	100	93.813	Equus_caballus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	80.877	ENSEEUG00000015174	ACO1	100	80.877	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	79.415	ENSELUG00000016812	aco1	97	79.415	Esox_lucius
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.688	ENSFCAG00000001293	ACO1	100	92.688	Felis_catus
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	85.698	ENSFALG00000001167	ACO1	99	85.698	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.238	ENSFDAG00000016058	ACO1	100	92.238	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	79.820	ENSFHEG00000005619	aco1	99	79.820	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	76.550	ENSGMOG00000005514	aco1	99	76.550	Gadus_morhua
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	86.036	ENSGALG00000002162	ACO1	99	86.036	Gallus_gallus
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	79.256	ENSGACG00000001637	aco1	99	79.256	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	86.486	ENSGAGG00000023315	ACO1	99	86.486	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.801	ENSGGOG00000016306	ACO1	100	92.801	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	79.640	ENSHBUG00000008952	aco1	99	79.640	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.688	ENSHGLG00000018922	Aco1	100	92.688	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.688	ENSHGLG00100000149	Aco1	100	92.688	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	77.928	ENSHCOG00000015881	aco1	99	77.928	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	80.090	ENSIPUG00000020088	ACO1	99	80.090	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.026	ENSSTOG00000006942	ACO1	99	93.026	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.238	ENSJJAG00000013824	Aco1	100	92.238	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	79.030	ENSKMAG00000015759	aco1	99	79.030	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	75.618	ENSLBEG00000013866	aco1	99	75.618	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000013470	ACO1	75	72.700	ENSLACG00000000936	ACO1	99	72.849	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	82.187	ENSLOCG00000011082	aco1	99	82.187	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.688	ENSMFAG00000001702	ACO1	100	92.688	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.801	ENSMMUG00000008196	ACO1	100	92.801	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.576	ENSMNEG00000045040	ACO1	100	92.576	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.688	ENSMLEG00000005636	ACO1	100	92.688	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	80.990	ENSMAMG00000002915	aco1	99	80.990	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	76.260	ENSMZEG00005012733	aco1	99	76.260	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	70.871	ENSMGAG00000008851	ACO1	99	70.871	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.576	ENSMAUG00000021408	Aco1	100	92.576	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.588	ENSMICG00000006540	ACO1	100	93.588	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.238	ENSMOCG00000015393	Aco1	100	92.238	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	78.515	ENSMMOG00000020282	aco1	99	78.515	Mola_mola
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	88.751	ENSMODG00000004463	ACO1	100	88.751	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	79.978	ENSMALG00000019764	aco1	99	79.978	Monopterus_albus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.126	MGP_CAROLIEiJ_G0025892	Aco1	100	92.126	Mus_caroli
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	91.901	ENSMUSG00000028405	Aco1	100	91.901	Mus_musculus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.463	MGP_PahariEiJ_G0024015	Aco1	100	92.463	Mus_pahari
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.238	MGP_SPRETEiJ_G0026841	Aco1	100	92.238	Mus_spretus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.251	ENSMPUG00000004340	ACO1	100	93.251	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	91.226	ENSMLUG00000003029	ACO1	100	91.226	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.238	ENSNGAG00000005703	Aco1	100	92.238	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	61.685	ENSNBRG00000008973	aco1	99	61.685	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.688	ENSNLEG00000003409	ACO1	100	92.688	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000013470	ACO1	90	81.777	ENSMEUG00000014756	ACO1	90	81.777	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	88.639	ENSOPRG00000016791	ACO1	100	88.639	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	88.076	ENSODEG00000015432	-	100	88.076	Octodon_degus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	90.439	ENSODEG00000001240	-	100	90.439	Octodon_degus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	79.415	ENSONIG00000019869	aco1	99	79.415	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000013470	ACO1	81	90.318	ENSOANG00000012132	ACO1	100	90.318	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	90.990	ENSOCUG00000015960	ACO1	100	90.990	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	79.392	ENSORLG00000020656	aco1	99	79.392	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	79.167	ENSORLG00020010991	aco1	99	79.167	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	79.392	ENSORLG00015011785	aco1	99	79.392	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	78.079	ENSOMEG00000000660	aco1	99	78.079	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.363	ENSOGAG00000010522	ACO1	100	93.363	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.138	ENSOARG00000014707	ACO1	98	93.138	Ovis_aries
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.913	ENSPPAG00000033498	ACO1	100	92.913	Pan_paniscus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.576	ENSPPRG00000009875	ACO1	100	92.576	Panthera_pardus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.463	ENSPTIG00000016606	ACO1	98	92.463	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.913	ENSPTRG00000020843	ACO1	100	92.913	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.688	ENSPANG00000025270	ACO1	100	92.688	Papio_anubis
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	78.403	ENSPKIG00000023168	aco1	99	78.403	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	86.937	ENSPSIG00000008030	ACO1	99	86.937	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	80.405	ENSPMGG00000020708	aco1	99	80.405	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	92.463	ENSPEMG00000018464	Aco1	100	92.463	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	88.301	ENSPCIG00000029321	ACO1	100	88.429	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	78.781	ENSPFOG00000013405	aco1	98	78.877	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000013470	ACO1	90	79.574	ENSPLAG00000023422	aco1	97	79.574	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000013470	ACO1	90	79.500	ENSPMEG00000011800	aco1	98	79.500	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000013470	ACO1	99	78.716	ENSPREG00000021791	aco1	99	78.716	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000013470	ACO1	100	93.026	ENSPPYG00000019150	ACO1	95	93.026	Pongo_abelii
ENSLAFG00000013470	ACO1	78	94.340	ENSPCAG00000013222	ACO1	91	94.340	Procavia_capensis
ENSLAFG00000013470	ACO1	89	92.911	ENSPCOG00000021198	ACO1	100	92.911	Propithecus_coquereli
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