EuRBPDB

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RBDs

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000013685 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: PUSL1
Alias: FLJ90811
Full Name: pseudouridine synthase like 1
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 2228 bases
Position: chrscaffold_26:22127662-22129889
Accession: 26914
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000011452	PseudoU_synth_1	PF01416.20	4.4e-35	1	2
ENSLAFP00000011452	PseudoU_synth_1	PF01416.20	4.4e-35	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000013685	PUSL1-201	798	-	ENSLAFP00000011452	266 (aa)	-	G3TBS4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	82.510	ENSG00000169972	PUSL1	98	82.927	Homo_sapiens
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.613	ENSAPOG00000016290	pusl1	83	51.613	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	83.650	ENSAMEG00000013752	PUSL1	87	83.650	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	50.403	ENSACIG00000015240	pusl1	95	48.193	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	52.016	ENSAOCG00000019419	pusl1	76	51.899	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	52.016	ENSAPEG00000005452	pusl1	82	52.016	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.613	ENSATEG00000024154	pusl1	82	51.613	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	53.435	ENSAPLG00000004946	PUSL1	87	53.435	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000013685	PUSL1	96	52.713	ENSACAG00000014111	PUSL1	97	52.713	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	83.588	ENSANAG00000037456	PUSL1	86	83.588	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	50.403	ENSACLG00000008675	pusl1	93	48.790	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	48.263	ENSAMXG00000044007	pusl1	90	49.187	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	82.955	ENSBTAG00000007619	PUSL1	91	82.955	Bos_taurus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	83.588	ENSCJAG00000010972	PUSL1	86	83.588	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	83.270	ENSCAFG00000019291	PUSL1	86	83.270	Canis_familiaris
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	82.890	ENSCAFG00020011568	PUSL1	86	82.890	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	82.576	ENSCHIG00000012615	PUSL1	92	82.576	Capra_hircus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	78.571	ENSCPOG00000005149	PUSL1	87	78.571	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	84.351	ENSCCAG00000027475	PUSL1	86	84.351	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	82.129	ENSCATG00000018260	PUSL1	87	82.129	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	81.579	ENSCLAG00000005232	PUSL1	86	81.579	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	81.369	ENSCSAG00000000680	PUSL1	87	81.369	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	54.198	ENSCPBG00000022621	PUSL1	89	54.198	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	81.369	ENSCANG00000034373	PUSL1	87	81.369	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	76.046	ENSCGRG00001012429	Pusl1	90	76.046	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	76.046	ENSCGRG00000006466	Pusl1	90	76.046	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000013685	PUSL1	95	50.588	ENSCSEG00000005159	pusl1	83	51.200	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	94	44.400	ENSCVAG00000012923	pusl1	95	44.400	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	50.000	ENSDARG00000074565	pusl1	93	50.000	Danio_rerio
ENSLAFG00000013685	PUSL1	95	31.834	FBgn0083976	CG34140	93	31.834	Drosophila_melanogaster
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	84.962	ENSECAG00000006248	PUSL1	88	84.962	Equus_caballus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	75.940	ENSEEUG00000000837	PUSL1	90	75.940	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	49.621	ENSELUG00000015945	pusl1	89	49.621	Esox_lucius
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	85.115	ENSFCAG00000007617	PUSL1	87	85.115	Felis_catus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	94	53.571	ENSFHEG00000006370	pusl1	84	53.571	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	94	53.360	ENSGMOG00000019388	pusl1	89	53.360	Gadus_morhua
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	52.672	ENSGALG00000001714	PUSL1	93	53.360	Gallus_gallus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	94	51.587	ENSGAFG00000007546	pusl1	85	51.587	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	52.610	ENSGACG00000007848	pusl1	82	52.610	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	55.344	ENSGAGG00000004730	PUSL1	89	55.344	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000013685	PUSL1	91	83.128	ENSGGOG00000005364	PUSL1	94	83.128	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	50.403	ENSHBUG00000001264	pusl1	85	50.403	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	80.899	ENSHGLG00000017570	PUSL1	87	81.203	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	81.273	ENSHGLG00100007641	PUSL1	88	81.273	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	54.839	ENSHCOG00000010077	pusl1	89	54.839	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	47.126	ENSIPUG00000023921	pusl1	89	47.126	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	83.459	ENSSTOG00000001783	PUSL1	83	83.459	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	80.827	ENSJJAG00000020471	Pusl1	90	80.827	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.613	ENSKMAG00000005154	pusl1	84	51.613	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	52.107	ENSLBEG00000013469	pusl1	89	52.107	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000013685	PUSL1	72	54.639	ENSLACG00000018795	PUSL1	95	54.639	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	49.042	ENSLOCG00000002210	pusl1	88	49.042	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	80.989	ENSMFAG00000046288	PUSL1	87	80.989	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	71.103	ENSMMUG00000016279	PUSL1	85	71.103	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	81.749	ENSMNEG00000037989	PUSL1	87	81.749	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.210	ENSMAMG00000016538	pusl1	81	51.210	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	50.403	ENSMZEG00005026990	pusl1	94	47.791	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	52.416	ENSMGAG00000003037	PUSL1	91	52.416	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	76.806	ENSMAUG00000019924	Pusl1	90	76.806	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	80.827	ENSMICG00000014171	PUSL1	90	80.827	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	76.426	ENSMOCG00000005602	Pusl1	90	76.426	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.394	ENSMMOG00000003269	pusl1	89	51.394	Mola_mola
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	50.570	ENSMALG00000021686	pusl1	86	50.570	Monopterus_albus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	77.947	MGP_CAROLIEiJ_G0026911	Pusl1	90	77.947	Mus_caroli
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	77.947	ENSMUSG00000051557	Pusl1	90	77.947	Mus_musculus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	78.707	MGP_PahariEiJ_G0029260	Pusl1	90	78.707	Mus_pahari
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	77.947	MGP_SPRETEiJ_G0027906	Pusl1	90	77.947	Mus_spretus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	82.197	ENSMPUG00000014313	PUSL1	87	82.197	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	77.273	ENSNGAG00000004647	Pusl1	79	77.273	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	46.923	ENSNBRG00000014762	pusl1	95	46.923	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	81.679	ENSNLEG00000000051	PUSL1	95	81.679	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	64.639	ENSMEUG00000011649	-	92	64.639	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000013685	PUSL1	91	54.321	ENSMEUG00000005176	-	94	54.321	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	78.571	ENSODEG00000008247	PUSL1	85	78.571	Octodon_degus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	94	51.181	ENSONIG00000019361	pusl1	85	51.181	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	50.806	ENSORLG00000016228	pusl1	83	50.806	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	50.763	ENSORLG00020013710	pusl1	88	50.763	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	50.806	ENSORLG00015008715	pusl1	87	50.806	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	49.618	ENSOMEG00000018897	pusl1	90	49.618	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	80.534	ENSOGAG00000031692	PUSL1	91	80.534	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	82.890	ENSOARG00000004905	PUSL1	99	82.890	Ovis_aries
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	82.129	ENSPPAG00000029283	PUSL1	87	82.129	Pan_paniscus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	85.551	ENSPPRG00000023329	PUSL1	87	85.551	Panthera_pardus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	85.932	ENSPTIG00000018532	PUSL1	97	85.932	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	82.129	ENSPTRG00000000021	PUSL1	87	82.129	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	80.989	ENSPANG00000000591	PUSL1	87	80.989	Papio_anubis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	48.134	ENSPKIG00000002447	pusl1	92	48.134	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000013685	PUSL1	94	56.126	ENSPSIG00000002781	PUSL1	93	56.126	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	49.042	ENSPMGG00000011051	pusl1	94	49.042	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	79.087	ENSPEMG00000013541	Pusl1	90	79.087	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	65.169	ENSPCIG00000007816	-	61	65.169	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	54.435	ENSPFOG00000015448	pusl1	86	54.435	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	54.435	ENSPLAG00000004348	pusl1	83	54.435	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	54.435	ENSPMEG00000000931	pusl1	89	48.594	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	53.252	ENSPREG00000002324	pusl1	83	53.252	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000013685	PUSL1	93	80.162	ENSPPYG00000002014	PUSL1	89	80.162	Pongo_abelii
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	77.143	ENSPCAG00000002272	PUSL1	100	77.143	Procavia_capensis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	70	84.211	ENSPVAG00000001016	PUSL1	61	84.211	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	78	49.282	ENSPNYG00000006588	pusl1	86	49.282	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	49.621	ENSPNAG00000024441	pusl1	91	49.621	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	79.848	ENSRNOG00000022354	Pusl1	98	79.839	Rattus_norvegicus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	80.989	ENSRBIG00000036842	PUSL1	87	80.989	Rhinopithecus_bieti
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	80.608	ENSRROG00000030704	PUSL1	87	80.608	Rhinopithecus_roxellana
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	82.375	ENSSBOG00000032249	PUSL1	94	82.375	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	56	69.333	ENSSHAG00000004840	-	78	69.333	Sarcophilus_harrisii
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	49.242	ENSSFOG00015008281	pusl1	87	49.242	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	50.602	ENSSMAG00000007187	pusl1	81	50.602	Scophthalmus_maximus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.613	ENSSDUG00000000287	pusl1	92	49.206	Seriola_dumerili
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.613	ENSSLDG00000009605	pusl1	79	51.613	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	71	79.787	ENSSARG00000005323	-	100	79.787	Sorex_araneus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	47.177	ENSSPAG00000002528	pusl1	89	47.177	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	100	81.955	ENSSSCG00000003338	PUSL1	86	81.955	Sus_scrofa
ENSLAFG00000013685	PUSL1	97	54.580	ENSTGUG00000003214	PUSL1	92	54.580	Taeniopygia_guttata
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	51.613	ENSTRUG00000010102	pusl1	83	51.613	Takifugu_rubripes
ENSLAFG00000013685	PUSL1	68	46.703	ENSTNIG00000005789	pusl1	81	46.703	Tetraodon_nigroviridis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	66	78.409	ENSTBEG00000005001	PUSL1	74	78.409	Tupaia_belangeri
ENSLAFG00000013685	PUSL1	98	75.285	ENSTTRG00000017030	PUSL1	87	75.285	Tursiops_truncatus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	84.016	ENSUAMG00000012801	PUSL1	81	84.016	Ursus_americanus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	83.607	ENSUMAG00000002084	PUSL1	81	83.607	Ursus_maritimus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	99	83.270	ENSVVUG00000004320	PUSL1	88	72.517	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000013685	PUSL1	79	51.659	ENSXETG00000011145	pusl1	92	51.659	Xenopus_tropicalis
ENSLAFG00000013685	PUSL1	93	51.600	ENSXCOG00000017748	pusl1	90	51.600	Xiphophorus_couchianus
ENSLAFG00000013685	PUSL1	92	53.629	ENSXMAG00000018846	pusl1	83	53.629	Xiphophorus_maculatus