EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000014061 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SMARCA2
Alias: BAF190|BRM|SNF2|SNF2L2|SNF2LA|SWI2|Sth1p|hBRM|hSNF2a
Full Name: SWI/SNF related%2C matrix associated%2C actin dependent regulator of chromatin%2C subfamily a%2C member 2
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 195497 bases
Position: chrscaffold_88:3390642-3586138
Accession: 11098
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000011784	ResIII	PF04851.15	2.2e-08	1	1
ENSLAFP00000011784	BRK	PF07533.16	1.9e-17	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000014073	SMARCA2-201	4746	-	ENSLAFP00000011784	1581 (aa)	-	G3TCJ1

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	96	75.384	ENSLAFG00000001433	SMARCA4	98	75.422

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	98.018	ENSG00000080503	SMARCA2	100	99.329	Homo_sapiens
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.900	ENSAPOG00000002641	SMARCA2	97	79.706	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	90	88.829	ENSAMEG00000012325	SMARCA2	100	97.263	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	78.331	ENSACIG00000015607	SMARCA2	97	78.608	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.751	ENSAOCG00000009647	-	97	79.577	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.838	ENSAPEG00000007646	SMARCA2	97	79.577	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	80.682	ENSATEG00000006916	SMARCA2	96	80.475	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	89	89.704	ENSAPLG00000013873	SMARCA2	93	89.422	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	89.514	ENSACAG00000002423	SMARCA2	100	88.377	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	94.185	ENSANAG00000026498	SMARCA2	100	95.394	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	84.527	ENSACLG00000004248	SMARCA2	97	79.370	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	81.756	ENSAMXG00000012404	smarca2	97	81.701	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.449	ENSBTAG00000007494	SMARCA2	100	95.957	Bos_taurus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.322	ENSCJAG00000010710	SMARCA2	100	95.259	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	96.210	ENSCAFG00000002013	SMARCA2	100	96.210	Canis_familiaris
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	77	94.330	ENSCAFG00020026802	SMARCA2	98	94.330	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.449	ENSCHIG00000025863	SMARCA2	100	95.957	Capra_hircus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	94.011	ENSTSYG00000003858	SMARCA2	99	95.241	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	82	92.857	ENSCAPG00000002890	SMARCA2	100	90.032	Cavia_aperea
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.563	ENSCPOG00000005475	SMARCA2	99	93.397	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	94.311	ENSCCAG00000030636	SMARCA2	100	95.521	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	94.987	ENSCATG00000031470	SMARCA2	100	94.987	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.561	ENSCLAG00000014484	SMARCA2	100	93.463	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	94	95.107	ENSCSAG00000008650	SMARCA2	99	95.107	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	86	88.704	ENSCHOG00000004316	SMARCA2	86	88.704	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	90.503	ENSCPBG00000025463	SMARCA2	100	90.314	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.358	ENSCANG00000039597	SMARCA2	100	95.358	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	82	89.639	ENSCGRG00001002323	Smarca2	80	93.740	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	75.619	ENSCSEG00000019311	SMARCA2	97	75.032	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	85	79.142	ENSCVAG00000016571	SMARCA2	95	77.368	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	81.250	ENSDARG00000008904	smarca2	97	80.843	Danio_rerio
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	96.093	ENSDNOG00000006402	SMARCA2	100	96.093	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.639	ENSDORG00000014832	Smarca2	100	94.578	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	80	60.247	FBgn0000212	brm	70	63.185	Drosophila_melanogaster
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	94	70.304	ENSEBUG00000011442	-	94	70.197	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	86	62.714	ENSEBUG00000002449	-	95	63.742	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.765	ENSEASG00005010312	SMARCA2	100	95.765	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	66	97.222	ENSEEUG00000015540	-	69	97.222	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	92	80.554	ENSELUG00000010318	smarca2	96	77.755	Esox_lucius
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.704	ENSFCAG00000001568	SMARCA2	100	95.704	Felis_catus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	90.800	ENSFALG00000010416	SMARCA2	100	90.780	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	92.777	ENSFDAG00000010502	SMARCA2	100	92.777	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	80.398	ENSFHEG00000021250	SMARCA2	97	79.719	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	98	77.628	ENSGMOG00000014229	SMARCA2	97	76.819	Gadus_morhua
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	91.414	ENSGALG00000010164	SMARCA2	100	90.467	Gallus_gallus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	95	75.378	ENSGAFG00000001164	SMARCA2	93	74.932	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	78.828	ENSGACG00000014488	SMARCA2	97	78.359	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	90.629	ENSGAGG00000024412	SMARCA2	100	90.189	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	77	98.857	ENSGGOG00000000513	SMARCA2	100	97.049	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.551	ENSHBUG00000006691	SMARCA2	97	79.859	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	82	97.465	ENSHGLG00000005215	SMARCA2	99	93.189	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	92.546	ENSHGLG00100010496	SMARCA2	100	92.984	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	89	74.524	ENSHCOG00000015348	-	88	86.462	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	80.248	ENSIPUG00000011060	smarca2	97	81.020	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.199	ENSSTOG00000006812	SMARCA2	100	95.009	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.717	ENSJJAG00000010867	Smarca2	100	94.403	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.565	ENSKMAG00000015844	-	98	78.947	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	98	83.291	ENSLOCG00000011499	smarca2	98	82.866	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	80	98.502	ENSMFAG00000003814	SMARCA2	100	93.616	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	84.697	ENSMMUG00000015279	SMARCA2	100	95.521	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.021	ENSMNEG00000041069	SMARCA2	100	94.959	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	93	98.650	ENSMLEG00000027418	SMARCA2	100	93.300	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	80.497	ENSMAMG00000003056	SMARCA2	98	80.510	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.812	ENSMZEG00005020709	SMARCA2	97	80.013	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	77	77.689	ENSMGAG00000005160	-	100	76.361	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.214	ENSMICG00000005162	SMARCA2	100	95.268	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.336	ENSMOCG00000001611	Smarca2	100	94.081	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	77.374	ENSMMOG00000014196	SMARCA2	97	77.223	Mola_mola
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	92.943	ENSMODG00000003578	SMARCA2	100	92.018	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	79.414	ENSMALG00000009611	SMARCA2	97	78.359	Monopterus_albus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	93.325	MGP_CAROLIEiJ_G0022841	Smarca2	100	94.069	Mus_caroli
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	94.255	ENSMUSG00000024921	Smarca2	99	99.441	Mus_musculus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	93.196	MGP_PahariEiJ_G0014334	Smarca2	100	94.003	Mus_pahari
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.951	MGP_SPRETEiJ_G0023759	Smarca2	99	97.951	Mus_spretus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	80	97.114	ENSMPUG00000005171	SMARCA2	94	97.114	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	90.756	ENSMLUG00000002342	SMARCA2	99	90.619	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	92.709	ENSNGAG00000000108	Smarca2	99	92.646	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	95	67.103	ENSNBRG00000017998	SMARCA2	94	83.085	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	93	97.943	ENSNLEG00000008575	SMARCA2	82	98.089	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	84.438	ENSMEUG00000009812	SMARCA2	100	83.812	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	92.067	ENSOPRG00000013474	SMARCA2	100	89.723	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	82	96.713	ENSODEG00000005452	SMARCA2	99	93.304	Octodon_degus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	79.899	ENSONIG00000014163	SMARCA2	97	80.064	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.790	ENSOCUG00000006320	SMARCA2	100	93.930	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.203	ENSORLG00000020820	SMARCA2	97	78.978	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.128	ENSORLG00015006289	SMARCA2	97	78.978	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	80.063	ENSOMEG00000009736	-	97	79.153	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	92.915	ENSOGAG00000017053	SMARCA2	99	91.156	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	94.188	ENSOARG00000013265	SMARCA2	100	92.785	Ovis_aries
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	93	98.878	ENSPPAG00000038717	SMARCA2	83	98.798	Pan_paniscus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.768	ENSPPRG00000001879	SMARCA2	100	95.768	Panthera_pardus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	95.765	ENSPTRG00000051168	SMARCA2	100	94.812	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	88.525	ENSPANG00000025121	SMARCA2	100	87.688	Papio_anubis
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	81.990	ENSPKIG00000018469	-	97	81.137	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	90.440	ENSPSIG00000006284	SMARCA2	100	89.679	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	98	73.427	ENSPMGG00000013696	-	97	73.562	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	96.499	ENSPEMG00000019821	Smarca2	100	93.447	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	94	72.290	ENSPMAG00000005337	-	94	71.456	Petromyzon_marinus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	92.817	ENSPCIG00000015658	SMARCA2	100	92.035	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.752	ENSPFOG00000001856	SMARCA2	98	79.299	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	80.227	ENSPLAG00000017829	SMARCA2	94	79.615	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	80.025	ENSPMEG00000001815	-	97	79.172	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	79.764	ENSPREG00000013800	SMARCA2	98	79.313	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	83	97.485	ENSPPYG00000019258	SMARCA2	100	95.016	Pongo_abelii
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	79	84.682	ENSPCAG00000016969	SMARCA2	78	84.548	Procavia_capensis
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	93.145	ENSPCOG00000025709	SMARCA2	100	93.123	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	91	98.276	ENSPVAG00000000901	SMARCA2	94	98.276	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	100	76.482	ENSPNYG00000004533	SMARCA2	97	76.215	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000014061	SMARCA2	99	82.416	ENSPNAG00000014635	smarca2	96	81.994	Pygocentrus_nattereri
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