EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000014231 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: SKIV2L
Alias: 170A|DDX13|HLP|SKI2W|SKIV2|SKIV2L1
Full Name: Ski2 like RNA helicase
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 10906 bases
Position: chrscaffold_138:1155909-1166814
Accession: 100667452
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000011917	rRNA_proc-arch	PF13234.6	5.3e-39	1	1
ENSLAFP00000011917	DEAD	PF00270.29	1.9e-16	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000014233	SKIV2L-201	3741	XM_003422259	ENSLAFP00000011917	1246 (aa)	XP_003422307	G3TCU8

Gene Model

Click here to download ENSLAFG00000014231's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLAFG00000014231's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	77	35.824	ENSLAFG00000010497	MTREX	89	35.824

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.141	ENSG00000204351	SKIV2L	98	96.629	Homo_sapiens
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.569	ENSAPOG00000008257	skiv2l	99	61.928	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.900	ENSAMEG00000002078	SKIV2L	100	93.900	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	59.648	ENSACIG00000016719	skiv2l	99	59.871	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.032	ENSAOCG00000017352	skiv2l	99	60.964	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.873	ENSAPEG00000001055	skiv2l	99	60.803	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.067	ENSATEG00000007601	skiv2l	99	61.093	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	65.361	ENSACAG00000011746	SKIV2L	98	65.523	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.302	ENSANAG00000037992	SKIV2L	100	94.302	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.392	ENSACLG00000006886	skiv2l	99	61.576	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	59.392	ENSAMXG00000011517	skiv2l	99	59.375	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.820	ENSBTAG00000005587	SKIV2L	100	93.820	Bos_taurus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	96	39.860	WBGene00008502	skih-2	99	39.829	Caenorhabditis_elegans
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.900	ENSCJAG00000002263	SKIV2L	100	93.900	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	94.122	ENSCAFG00000000679	SKIV2L	100	93.740	Canis_familiaris
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	94.041	ENSCAFG00020000948	SKIV2L	100	93.660	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.740	ENSCHIG00000012897	SKIV2L	100	93.740	Capra_hircus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.258	ENSTSYG00000012133	SKIV2L	100	93.258	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	91.091	ENSCPOG00000001307	SKIV2L	100	91.091	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.141	ENSCCAG00000026206	SKIV2L	100	94.141	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.740	ENSCATG00000036901	SKIV2L	100	93.740	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	91.894	ENSCLAG00000007678	SKIV2L	100	91.894	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.981	ENSCSAG00000008988	SKIV2L	100	93.981	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	87	64.912	ENSCPBG00000000343	SKIV2L	96	64.912	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	94	51.143	ENSCING00000005576	-	99	51.143	Ciona_intestinalis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	94.137	ENSCANG00000039709	SKIV2L	100	94.137	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.184	ENSCGRG00001008385	Skiv2l	100	93.184	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.146	ENSCSEG00000011326	skiv2l	98	60.968	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.293	ENSCVAG00000003072	skiv2l	99	61.142	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.883	ENSDARG00000062206	skiv2l	99	60.657	Danio_rerio
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	87.590	ENSDNOG00000037590	SKIV2L	100	88.141	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	93	44.416	FBgn0039117	tst	97	44.332	Drosophila_melanogaster
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	72	94.473	ENSETEG00000009522	SKIV2L	72	94.473	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	89	56.745	ENSEBUG00000013680	-	95	57.579	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	93	95.090	ENSEASG00005015534	SKIV2L	99	95.090	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	96	94.034	ENSECAG00000021823	SKIV2L	96	94.661	Equus_caballus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	54	97.233	ENSEEUG00000005049	SKIV2L	57	97.233	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.221	ENSELUG00000000181	skiv2l	94	66.391	Esox_lucius
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.141	ENSFCAG00000004519	SKIV2L	100	94.141	Felis_catus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	88.773	ENSFDAG00000009438	SKIV2L	100	89.103	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.283	ENSFHEG00000008853	skiv2l	99	61.142	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	59.569	ENSGMOG00000005926	skiv2l	98	59.271	Gadus_morhua
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	78	60.856	ENSGALG00000035499	SKIV2L	99	60.958	Gallus_gallus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.599	ENSGAFG00000002382	skiv2l	99	61.464	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.223	ENSGACG00000002927	skiv2l	98	60.405	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.981	ENSGGOG00000002270	SKIV2L	100	93.981	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.234	ENSHBUG00000000726	skiv2l	99	61.415	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	89.984	ENSHGLG00000016596	SKIV2L	100	90.224	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	87.580	ENSHGLG00100014161	SKIV2L	100	87.821	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	59.642	ENSHCOG00000007191	skiv2l	100	59.561	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.190	ENSIPUG00000016263	skiv2l	100	60.305	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.222	ENSSTOG00000014596	SKIV2L	100	94.222	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	67	59.952	ENSLACG00000002986	-	69	59.343	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.061	ENSMFAG00000034235	SKIV2L	100	94.061	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.981	ENSMMUG00000000736	SKIV2L	100	93.981	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.981	ENSMNEG00000044474	SKIV2L	100	93.981	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.740	ENSMLEG00000030512	SKIV2L	100	93.740	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.283	ENSMAMG00000002927	skiv2l	99	61.205	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.234	ENSMZEG00005026415	skiv2l	99	61.415	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	70	51.148	ENSMGAG00000001320	SKIV2L	97	50.728	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	92.221	ENSMAUG00000018613	Skiv2l	100	92.468	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.820	ENSMICG00000046331	SKIV2L	100	93.820	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	91.018	ENSMOCG00000014240	Skiv2l	100	91.179	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.156	ENSMMOG00000014547	skiv2l	98	60.908	Mola_mola
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	88.070	ENSMODG00000015052	SKIV2L	100	88.070	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	59.936	ENSMALG00000010535	skiv2l	98	59.805	Monopterus_albus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	92.462	MGP_CAROLIEiJ_G0021477	Skiv2l	100	92.462	Mus_caroli
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	92.622	ENSMUSG00000040356	Skiv2l	100	92.622	Mus_musculus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	91.901	MGP_PahariEiJ_G0020472	Skiv2l	100	91.901	Mus_pahari
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	92.221	MGP_SPRETEiJ_G0022382	Skiv2l	100	92.221	Mus_spretus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.981	ENSMPUG00000010567	SKIV2L	100	93.981	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	92.376	ENSMLUG00000000628	SKIV2L	100	92.376	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.654	ENSNBRG00000018650	skiv2l	98	60.806	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	90.747	ENSNLEG00000006451	SKIV2L	99	90.747	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	78	92.035	ENSMEUG00000006072	SKIV2L	78	92.035	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.178	ENSOPRG00000003972	SKIV2L	100	93.178	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	90.610	ENSODEG00000017516	SKIV2L	100	90.610	Octodon_degus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.833	ENSONIG00000013500	skiv2l	99	61.943	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.222	ENSOCUG00000007019	SKIV2L	100	94.222	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.472	ENSORLG00000002021	skiv2l	99	61.687	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.472	ENSORLG00020009462	skiv2l	99	61.606	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.234	ENSORLG00015016750	skiv2l	99	61.365	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	62.431	ENSOMEG00000008531	skiv2l	99	62.399	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.981	ENSOGAG00000009578	SKIV2L	100	93.981	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	88.254	ENSOARG00000002411	-	100	88.254	Ovis_aries
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	93.517	ENSPPAG00000040211	SKIV2L	99	93.517	Pan_paniscus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.141	ENSPPRG00000005017	SKIV2L	100	94.141	Panthera_pardus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.660	ENSPTIG00000021656	SKIV2L	100	93.660	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.141	ENSPTRG00000017997	SKIV2L	100	94.141	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	92.782	ENSPANG00000011501	SKIV2L	99	92.782	Papio_anubis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.031	ENSPKIG00000011876	skiv2l	99	60.016	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.740	ENSPMGG00000019707	skiv2l	98	60.732	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	92.863	ENSPEMG00000019001	Skiv2l	100	92.863	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	87.520	ENSPCIG00000018792	SKIV2L	100	87.520	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.520	ENSPFOG00000002424	skiv2l	99	61.334	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.648	ENSPLAG00000018304	skiv2l	99	61.464	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.599	ENSPMEG00000006997	skiv2l	99	61.495	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	59.503	ENSPREG00000002277	skiv2l	98	59.708	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.579	ENSPPYG00000016472	SKIV2L	100	93.579	Pongo_abelii
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	77	96.144	ENSPCAG00000004178	SKIV2L	77	96.144	Procavia_capensis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.543	ENSPCOG00000010308	SKIV2L	100	94.543	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.178	ENSPVAG00000005136	SKIV2L	100	93.178	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	59.518	ENSPNYG00000017853	skiv2l	97	66.426	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	60.606	ENSPNAG00000011823	skiv2l	99	60.964	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	92.783	ENSRNOG00000000421	Skiv2l	100	92.783	Rattus_norvegicus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	91.498	ENSRBIG00000035485	SKIV2L	99	91.498	Rhinopithecus_bieti
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	93.820	ENSRROG00000036429	SKIV2L	100	93.820	Rhinopithecus_roxellana
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	93	37.688	YLR398C	-	93	37.688	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.141	ENSSBOG00000027920	SKIV2L	100	94.141	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	87.590	ENSSHAG00000008963	SKIV2L	100	86.549	Sarcophilus_harrisii
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.006	ENSSFOG00015016930	skiv2l	99	61.182	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.845	ENSSMAG00000020185	skiv2l	99	61.026	Scophthalmus_maximus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.679	ENSSDUG00000019977	skiv2l	99	61.736	Seriola_dumerili
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.499	ENSSLDG00000024382	skiv2l	98	60.049	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.957	ENSSPUG00000012945	SKIV2L	98	61.496	Sphenodon_punctatus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	94	61.204	ENSSPAG00000012904	skiv2l	98	61.271	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.382	ENSSSCG00000001424	SKIV2L	100	94.382	Sus_scrofa
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	85	55.119	ENSTRUG00000000966	skiv2l	100	55.515	Takifugu_rubripes
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	60.319	ENSTNIG00000004382	skiv2l	98	60.129	Tetraodon_nigroviridis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	94	92.761	ENSTBEG00000003462	SKIV2L	94	92.761	Tupaia_belangeri
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	88.844	ENSTTRG00000005931	SKIV2L	100	88.844	Tursiops_truncatus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	94.222	ENSUAMG00000024336	SKIV2L	100	94.222	Ursus_americanus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	93	94.315	ENSUMAG00000012666	SKIV2L	99	94.315	Ursus_maritimus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	98	94.051	ENSVVUG00000022807	SKIV2L	99	93.073	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	100	58.525	ENSXETG00000010932	skiv2l	100	58.525	Xenopus_tropicalis
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.637	ENSXCOG00000019517	skiv2l	96	61.495	Xiphophorus_couchianus
ENSLAFG00000014231	SKIV2L	99	61.124	ENSXMAG00000014079	skiv2l	99	60.901	Xiphophorus_maculatus