EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000014307 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: HTATSF1
Alias: TAT-SF1
Full Name: HIV-1 Tat specific factor 1
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 16970 bases
Position: chrscaffold_89:4812141-4829110
Accession: 5276
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000011978	RRM_1	PF00076.22	3.4e-16	1	2
ENSLAFP00000011978	RRM_1	PF00076.22	3.4e-16	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000014303	HTATSF1-201	2028	-	ENSLAFP00000011978	676 (aa)	-	G3TCZ7

Gene Model

Click here to download ENSLAFG00000014307's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLAFG00000014307's network

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	72.112	ENSG00000102241	HTATSF1	100	92.623	Homo_sapiens
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	61	60.377	ENSAPOG00000009823	htatsf1	92	62.118	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	69.645	ENSAMEG00000002921	HTATSF1	99	71.222	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.266	ENSACIG00000020459	htatsf1	94	59.954	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	62.850	ENSAOCG00000020994	htatsf1	92	59.954	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	62.850	ENSAPEG00000016432	htatsf1	99	55.882	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	54	61.658	ENSATEG00000008903	htatsf1	85	62.953	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	93	66.761	ENSANAG00000025458	-	99	67.660	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	95	58.929	ENSANAG00000027986	-	97	59.254	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	60	57.309	ENSACLG00000008096	htatsf1	94	59.353	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	63.184	ENSAMXG00000008387	htatsf1	83	63.959	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.611	ENSBTAG00000054942	HTATSF1	99	70.221	Bos_taurus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.611	ENSBTAG00000055212	HTATSF1	99	70.221	Bos_taurus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	65.779	ENSBTAG00000032711	HTATSF1	99	67.336	Bos_taurus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.542	ENSCJAG00000003676	HTATSF1	99	70.385	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	71.544	ENSCAFG00000023294	HTATSF1	99	72.349	Canis_familiaris
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	69.685	ENSCAFG00020024635	HTATSF1	99	71.260	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.976	ENSCHIG00000000312	HTATSF1	99	70.712	Capra_hircus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.252	ENSTSYG00000028876	HTATSF1	99	71.049	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	71.272	ENSCCAG00000025329	-	99	73.699	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.767	ENSCCAG00000022701	-	99	71.011	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	71.105	ENSCATG00000029963	HTATSF1	99	71.144	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	65.921	ENSCLAG00000002718	HTATSF1	86	72.154	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	71.238	ENSCSAG00000007505	HTATSF1	99	71.277	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	69.923	ENSCPBG00000026092	HTATSF1	88	68.227	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	54.545	ENSCING00000005914	-	81	54.545	Ciona_intestinalis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.596	ENSCANG00000028495	HTATSF1	99	71.410	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	89	72.857	ENSCGRG00001021602	Htatsf1	99	64.834	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	80	65.079	ENSCGRG00000002085	Htatsf1	99	57.858	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	64.304	ENSCVAG00000014070	htatsf1	86	64.304	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	60.982	ENSDARG00000056649	htatsf1	89	59.367	Danio_rerio
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	89	76.935	ENSDNOG00000002254	HTATSF1	99	70.844	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	75	50.491	ENSETEG00000006377	-	68	50.693	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	58	49.539	ENSEBUG00000001534	htatsf1	83	49.770	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	77.586	ENSEASG00005003440	HTATSF1	99	69.935	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	77.586	ENSECAG00000009156	HTATSF1	99	69.935	Equus_caballus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	62.698	ENSEEUG00000010668	HTATSF1	99	63.228	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	54	62.402	ENSELUG00000005486	htatsf1	73	64.894	Esox_lucius
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	70.533	ENSFCAG00000031924	HTATSF1	99	71.371	Felis_catus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	67.430	ENSFALG00000003728	HTATSF1	87	66.995	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	70.747	ENSFDAG00000008617	HTATSF1	99	64.940	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	62.025	ENSFHEG00000020286	htatsf1	87	64.304	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	51	62.849	ENSGMOG00000016444	htatsf1	98	63.408	Gadus_morhua
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	68.041	ENSGALG00000006410	HTATSF1	84	69.072	Gallus_gallus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	62.972	ENSGAFG00000003041	htatsf1	86	64.232	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	60	59.016	ENSGACG00000020459	htatsf1	94	59.719	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	72.112	ENSGGOG00000026072	HTATSF1	99	72.112	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	60	57.309	ENSHBUG00000004392	htatsf1	94	59.353	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	98	64.343	ENSHGLG00000005328	HTATSF1	99	65.200	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	60.914	ENSHCOG00000009056	htatsf1	90	61.055	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	64.211	ENSIPUG00000017828	htatsf1	80	64.450	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	78.571	ENSSTOG00000012505	HTATSF1	98	69.921	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	62.183	ENSKMAG00000007622	htatsf1	97	59.326	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	54	63.185	ENSLBEG00000001154	htatsf1	83	63.708	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	66.142	ENSLACG00000015989	HTATSF1	84	66.142	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	61	41.995	ENSLOCG00000015118	htatsf1	90	41.628	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	71.105	ENSMFAG00000044705	HTATSF1	99	71.144	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	71.105	ENSMMUG00000006450	HTATSF1	99	71.144	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	73.110	ENSMNEG00000024084	HTATSF1	99	74.133	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.972	ENSMLEG00000035511	HTATSF1	99	71.011	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.131	ENSMAMG00000021225	htatsf1	87	63.889	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	60	57.309	ENSMZEG00005000485	htatsf1	94	59.353	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	51	71.751	ENSMGAG00000003558	HTATSF1	82	72.881	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	65.359	ENSMAUG00000007235	Htatsf1	99	65.572	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.968	ENSMICG00000009348	HTATSF1	99	71.795	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	73.270	ENSMOCG00000023007	-	99	65.150	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	67.901	ENSMOCG00000022370	-	95	68.038	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	62.690	ENSMMOG00000011013	htatsf1	86	63.452	Mola_mola
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	70.573	ENSMODG00000014087	-	84	70.573	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	58	60.922	ENSMALG00000019977	htatsf1	89	61.408	Monopterus_albus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	89	73.430	MGP_CAROLIEiJ_G0033094	Htatsf1	99	68.139	Mus_caroli
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	89	74.472	ENSMUSG00000067873	Htatsf1	99	66.623	Mus_musculus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	89	74.472	MGP_SPRETEiJ_G0034249	Htatsf1	99	66.623	Mus_spretus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	68.970	ENSMPUG00000001901	HTATSF1	99	70.434	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	63.351	ENSMLUG00000028418	-	99	63.351	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	65.793	ENSMLUG00000009234	-	98	67.862	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	98	66.667	ENSNGAG00000017831	Htatsf1	99	68.108	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.209	ENSNBRG00000003818	htatsf1	94	59.677	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	72.170	ENSNLEG00000002746	HTATSF1	99	71.867	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	59	68.657	ENSMEUG00000004133	-	95	69.270	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	60	57.639	ENSONIG00000008638	htatsf1	94	59.770	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	51	73.714	ENSOANG00000011674	-	85	73.714	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	78.150	ENSOCUG00000012570	HTATSF1	99	75.785	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.538	ENSORLG00000002356	htatsf1	84	64.103	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.795	ENSORLG00020017818	htatsf1	81	64.359	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.266	ENSORLG00015002268	htatsf1	84	63.797	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.520	ENSOMEG00000007564	htatsf1	84	64.541	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	89	77.435	ENSOGAG00000005565	HTATSF1	99	69.536	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	67.143	ENSOARG00000000481	-	99	66.579	Ovis_aries
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	70.091	ENSOARG00000011215	-	99	69.831	Ovis_aries
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	72.112	ENSPPAG00000024268	HTATSF1	99	72.112	Pan_paniscus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	70.933	ENSPPRG00000014209	HTATSF1	99	71.774	Panthera_pardus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	92	69.353	ENSPTIG00000016887	HTATSF1	95	70.247	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	72.112	ENSPTRG00000044591	HTATSF1	99	72.112	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	55.673	ENSPANG00000010946	HTATSF1	99	59.259	Papio_anubis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	68.519	ENSPKIG00000024852	htatsf1	83	68.783	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.111	ENSPMGG00000006172	htatsf1	86	63.131	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	74.475	ENSPEMG00000022397	Htatsf1	99	66.798	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	62	65.340	ENSPCIG00000030173	-	96	65.340	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	58	66.835	ENSPCIG00000018896	-	88	66.835	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.307	ENSPFOG00000007871	htatsf1	85	63.819	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.706	ENSPLAG00000007532	htatsf1	86	63.706	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	61.675	ENSPMEG00000000352	htatsf1	86	64.213	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	64.467	ENSPREG00000007811	htatsf1	86	64.467	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	80.064	ENSPPYG00000020765	HTATSF1	85	78.638	Pongo_abelii
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	74.515	ENSPCAG00000010576	HTATSF1	99	75.664	Procavia_capensis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	69.645	ENSPCOG00000021823	HTATSF1	99	71.829	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	69.666	ENSPVAG00000010281	HTATSF1	99	71.449	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	60	58.430	ENSPNYG00000016693	htatsf1	94	60.460	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	64.304	ENSPNAG00000006166	htatsf1	85	65.354	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	89	71.339	ENSRNOG00000027761	Htatsf1	99	64.812	Rattus_norvegicus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	60.985	ENSRBIG00000035486	HTATSF1	99	61.303	Rhinopithecus_bieti
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	71.105	ENSRROG00000021939	HTATSF1	99	71.410	Rhinopithecus_roxellana
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	69.693	ENSSBOG00000027186	-	99	70.972	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	66.623	ENSSBOG00000017914	-	99	67.733	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	69.029	ENSSHAG00000006440	-	99	68.041	Sarcophilus_harrisii
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	60	66.828	ENSSHAG00000018908	-	90	66.828	Sarcophilus_harrisii
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.421	ENSSFOG00015012002	htatsf1	81	64.474	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	54	65.013	ENSSMAG00000002970	htatsf1	92	60.789	Scophthalmus_maximus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	53	60.733	ENSSDUG00000020002	htatsf1	87	62.963	Seriola_dumerili
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	61	57.931	ENSSLDG00000016880	htatsf1	94	60.000	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	98	62.517	ENSSARG00000005193	HTATSF1	97	62.994	Sorex_araneus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	56	67.358	ENSSPUG00000014767	HTATSF1	84	68.394	Sphenodon_punctatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.706	ENSSPAG00000000732	htatsf1	92	61.163	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	89	72.581	ENSSSCG00000023062	HTATSF1	98	66.667	Sus_scrofa
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	67.539	ENSTGUG00000002099	HTATSF1	86	68.354	Taeniopygia_guttata
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	64.377	ENSTRUG00000013383	htatsf1	87	64.631	Takifugu_rubripes
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	64.377	ENSTNIG00000016140	htatsf1	87	64.885	Tetraodon_nigroviridis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	67.712	ENSTTRG00000002269	HTATSF1	96	69.628	Tursiops_truncatus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	70.839	ENSUAMG00000012048	HTATSF1	99	72.349	Ursus_americanus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	100	70.013	ENSUMAG00000010393	HTATSF1	99	71.485	Ursus_maritimus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	90	64.338	ENSVPAG00000004569	HTATSF1	99	64.483	Vicugna_pacos
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	99	69.816	ENSVVUG00000024802	HTATSF1	99	71.260	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	54	67.368	ENSXETG00000019749	htatsf1	71	66.842	Xenopus_tropicalis
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.061	ENSXCOG00000006912	htatsf1	87	65.435	Xiphophorus_couchianus
ENSLAFG00000014307	HTATSF1	55	63.802	ENSXMAG00000000490	htatsf1	86	66.146	Xiphophorus_maculatus