EuRBPDB

Description

RBDs

Transcripts

Gene Model

PPI

Paralogs

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000015344 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: EFTUD2
Alias: SNRNP116|Snrp116|Snu114|U5-116KD
Full Name: elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 38162 bases
Position: chrscaffold_31:25971095-26009256
Accession: 30858
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000012857	GTP_EFTU	PF00009.27	2.6e-45	1	1
ENSLAFP00000012857	GTP_EFTU_D2	PF03144.25	1e-12	1	1
ENSLAFP00000012857	EFG_IV	PF03764.18	2.1e-23	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000015348	EFTUD2-201	2925	-	ENSLAFP00000012857	974 (aa)	-	G3TEZ0

Gene Model

Click here to download ENSLAFG00000015344's gene model file

Protein-Protein Interaction (PPI)

Clik here to download ENSLAFG00000015344's network

Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	86	38.946	ENSLAFG00000009159	EEF2	99	38.946
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	80	31.781	ENSLAFG00000012504	EFL1	86	31.781
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	52	31.250	ENSLAFG00000010945	GFM1	64	31.250
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	57	34.074	ENSLAFG00000018575	GFM2	66	34.815

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	ENSG00000108883	EFTUD2	100	100.000	Homo_sapiens
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.770	ENSAPOG00000002433	eftud2	100	91.667	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSAMEG00000018390	EFTUD2	100	99.074	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	88.272	ENSACIG00000009096	eftud2	100	88.169	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	87	88.118	ENSAOCG00000023385	eftud2	100	88.118	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	ENSAPEG00000003321	eftud2	100	91.770	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.387	ENSATEG00000000457	eftud2	100	92.284	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	93.924	ENSAPLG00000011036	EFTUD2	99	93.924	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.222	ENSACAG00000007637	EFTUD2	100	97.222	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSANAG00000025320	EFTUD2	100	99.280	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.975	ENSACLG00000001296	eftud2	100	91.872	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.300	ENSAMXG00000000568	eftud2	100	91.812	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	100	98.871	ENSBTAG00000013526	EFTUD2	100	98.971	Bos_taurus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	70.248	WBGene00001166	eftu-2	99	69.731	Caenorhabditis_elegans
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSCJAG00000012349	EFTUD2	100	99.280	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSCAFG00000014065	EFTUD2	100	99.074	Canis_familiaris
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSCAFG00020009633	EFTUD2	100	99.074	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.971	ENSCHIG00000011603	EFTUD2	100	98.971	Capra_hircus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSTSYG00000013172	EFTUD2	100	99.074	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.457	ENSCAPG00000014639	EFTUD2	100	98.457	Cavia_aperea
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.457	ENSCPOG00000010566	EFTUD2	100	98.457	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSCCAG00000035302	EFTUD2	100	99.280	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSCATG00000035809	EFTUD2	100	99.280	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.354	ENSCLAG00000014733	EFTUD2	100	98.354	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSCSAG00000003614	EFTUD2	100	99.280	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	91	86.712	ENSCHOG00000010031	EFTUD2	99	86.712	Choloepus_hoffmanni
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.251	ENSCPBG00000008904	EFTUD2	100	98.251	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	78.051	ENSCING00000009372	-	100	78.051	Ciona_intestinalis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	78.252	ENSCSAVG00000004985	-	99	79.717	Ciona_savignyi
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSCANG00000026557	EFTUD2	100	99.280	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.383	ENSCGRG00001009904	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.383	ENSCGRG00000003825	Eftud2	100	99.383	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	ENSCSEG00000016775	eftud2	100	91.461	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.975	ENSCVAG00000012537	eftud2	100	91.975	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.741	ENSDARG00000012261	eftud2	100	90.844	Danio_rerio
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.765	ENSDNOG00000008033	EFTUD2	100	98.765	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSDORG00000011566	Eftud2	100	99.074	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	75.077	FBgn0039566	CG4849	100	74.974	Drosophila_melanogaster
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	92	99.457	ENSETEG00000005678	EFTUD2	92	99.457	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	74	93.035	ENSEBUG00000004047	-	96	86.926	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSEASG00005010321	EFTUD2	100	99.074	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.971	ENSECAG00000019363	EFTUD2	93	98.971	Equus_caballus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	83	100.000	ENSEEUG00000011128	EFTUD2	92	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.947	ENSELUG00000017169	eftud2	100	90.844	Esox_lucius
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	ENSFCAG00000005466	EFTUD2	100	99.177	Felis_catus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.634	ENSFALG00000007551	EFTUD2	100	97.634	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSFDAG00000013143	EFTUD2	100	99.074	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.078	ENSFHEG00000013479	eftud2	100	92.078	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.152	ENSGMOG00000014277	eftud2	100	91.564	Gadus_morhua
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.531	ENSGALG00000000988	EFTUD2	100	98.491	Gallus_gallus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.078	ENSGAFG00000002263	eftud2	100	92.078	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	ENSGACG00000009163	eftud2	100	91.461	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSGGOG00000012999	EFTUD2	100	99.280	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	ENSHBUG00000023546	eftud2	100	91.770	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.663	ENSHGLG00000014497	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.663	ENSHGLG00100013432	EFTUD2	100	98.663	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.844	ENSHCOG00000017689	eftud2	100	90.844	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	ENSIPUG00000023182	Eftud2	100	91.872	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	93.416	ENSSTOG00000012188	EFTUD2	100	93.416	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	96	99.679	ENSJJAG00000018268	Eftud2	100	99.679	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.255	ENSKMAG00000021027	eftud2	100	91.152	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	95	91.262	ENSLBEG00000005875	eftud2	100	92.706	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	93.827	ENSLACG00000012918	EFTUD2	100	94.347	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.078	ENSLOCG00000011460	eftud2	100	92.078	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSMFAG00000042655	EFTUD2	100	99.280	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSMMUG00000013118	EFTUD2	100	100.000	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSMNEG00000037895	EFTUD2	100	99.280	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSMLEG00000032960	EFTUD2	100	99.280	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.181	ENSMAMG00000022190	eftud2	100	92.078	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.975	ENSMZEG00005022885	eftud2	100	91.872	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.536	ENSMGAG00000010083	EFTUD2	99	97.536	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.383	ENSMAUG00000021178	Eftud2	100	99.383	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSMICG00000016592	EFTUD2	100	99.280	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.486	ENSMOCG00000009039	-	100	99.486	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	91	81.685	ENSMOCG00000017653	-	90	81.685	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	87	93.882	ENSMMOG00000020811	eftud2	100	93.882	Mola_mola
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSMODG00000011347	EFTUD2	100	99.074	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	87	92.118	ENSMALG00000014501	eftud2	100	92.118	Monopterus_albus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	MGP_CAROLIEiJ_G0017263	Eftud2	100	99.177	Mus_caroli
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	ENSMUSG00000020929	Eftud2	100	99.177	Mus_musculus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	MGP_PahariEiJ_G0018393	Eftud2	100	99.177	Mus_pahari
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	MGP_SPRETEiJ_G0018106	Eftud2	100	99.177	Mus_spretus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	97	99.047	ENSMPUG00000009136	EFTUD2	90	99.047	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	100	99.076	ENSMLUG00000012164	EFTUD2	100	99.076	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.383	ENSNGAG00000017834	Eftud2	100	99.383	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	ENSNBRG00000020081	eftud2	100	91.770	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	97	97.450	ENSNLEG00000005210	EFTUD2	96	97.450	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	95.473	ENSMEUG00000015620	EFTUD2	100	95.473	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.947	ENSOPRG00000016323	EFTUD2	100	90.947	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	93	79.598	ENSODEG00000003385	-	100	79.598	Octodon_degus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	98.663	ENSODEG00000018041	-	100	98.663	Octodon_degus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.975	ENSONIG00000000912	eftud2	100	91.872	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSOCUG00000006879	EFTUD2	100	99.280	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.667	ENSORLG00000003109	eftud2	100	91.667	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	ENSORLG00020009865	eftud2	100	91.564	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	ENSORLG00015002611	eftud2	100	93.573	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.016	ENSOGAG00000012918	EFTUD2	100	97.016	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	100	98.871	ENSOARG00000009078	EFTUD2	98	98.871	Ovis_aries
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	ENSPPAG00000029450	EFTUD2	100	99.177	Pan_paniscus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSPPRG00000010981	EFTUD2	100	99.074	Panthera_pardus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSPTIG00000007703	EFTUD2	100	99.074	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	ENSPTRG00000009287	EFTUD2	100	99.177	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSPANG00000021284	EFTUD2	100	99.280	Papio_anubis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	93	96.582	ENSPSIG00000004505	EFTUD2	99	96.582	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	84.465	ENSPMGG00000007281	eftud2	100	84.465	Periophthalmus_magnuspinnatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.383	ENSPEMG00000005129	Eftud2	100	99.383	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	ENSPCIG00000015027	EFTUD2	100	99.177	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.078	ENSPFOG00000008515	eftud2	100	92.078	Poecilia_formosa
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.078	ENSPLAG00000010393	eftud2	100	92.078	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.078	ENSPMEG00000005087	eftud2	100	92.078	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.840	ENSPPYG00000008320	EFTUD2	100	97.840	Pongo_abelii
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	95.576	ENSPCAG00000000812	EFTUD2	100	95.576	Procavia_capensis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.383	ENSPCOG00000020029	EFTUD2	100	99.383	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	94.342	ENSPVAG00000016155	EFTUD2	100	94.342	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	ENSPNYG00000012448	eftud2	100	91.770	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.770	ENSPNAG00000012490	eftud2	100	92.181	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	ENSRNOG00000002818	Eftud2	100	99.177	Rattus_norvegicus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	ENSRBIG00000043255	EFTUD2	100	99.177	Rhinopithecus_bieti
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.177	ENSRROG00000042925	EFTUD2	100	99.177	Rhinopithecus_roxellana
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	97	34.091	YKL173W	SNU114	97	33.929	Saccharomyces_cerevisiae
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.280	ENSSBOG00000021892	EFTUD2	100	99.280	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	96	99.041	ENSSHAG00000008134	EFTUD2	100	99.041	Sarcophilus_harrisii
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	ENSSFOG00015023272	eftud2	100	91.992	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.564	ENSSMAG00000010174	eftud2	100	91.461	Scophthalmus_maximus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.872	ENSSDUG00000022675	eftud2	100	91.770	Seriola_dumerili
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.975	ENSSLDG00000001595	eftud2	100	91.872	Seriola_lalandi_dorsalis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.844	ENSSARG00000008664	EFTUD2	100	90.844	Sorex_araneus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.222	ENSSPUG00000010249	EFTUD2	100	97.222	Sphenodon_punctatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	100	91.889	ENSSPAG00000016235	eftud2	99	91.786	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSSSCG00000017346	EFTUD2	100	99.074	Sus_scrofa
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	84	96.959	ENSTGUG00000002065	EFTUD2	100	96.959	Taeniopygia_guttata
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	91.152	ENSTRUG00000016422	eftud2	100	91.049	Takifugu_rubripes
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	100	86.605	ENSTNIG00000005346	eftud2	100	86.401	Tetraodon_nigroviridis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	93.621	ENSTBEG00000011337	EFTUD2	100	93.621	Tupaia_belangeri
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	90.741	ENSTTRG00000006230	EFTUD2	100	90.741	Tursiops_truncatus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	97.947	ENSUAMG00000000399	EFTUD2	100	97.947	Ursus_americanus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSUMAG00000014323	EFTUD2	100	99.074	Ursus_maritimus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	88	100.000	ENSVPAG00000002748	EFTUD2	88	100.000	Vicugna_pacos
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	99.074	ENSVVUG00000018113	EFTUD2	100	99.074	Vulpes_vulpes
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	96	94.563	ENSXETG00000003394	eftud2	98	95.865	Xenopus_tropicalis
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	80	93.495	ENSXCOG00000017309	eftud2	96	93.495	Xiphophorus_couchianus
ENSLAFG00000015344	EFTUD2	99	92.078	ENSXMAG00000008494	eftud2	100	92.078	Xiphophorus_maculatus