EuRBPDB

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Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000016666 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: RAB1A
Alias: RAB1|YPT1
Full Name: RAB1A%2C member RAS oncogene family
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Minus strand
Length: 33018 bases
Position: chrscaffold_27:16252749-16285766
Accession: 100667798
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000013988	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-05	1	1
ENSLAFP00000027082	MMR_HSR1	PF01926.23	1.3e-05	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000016664	RAB1A-201	618	-	ENSLAFP00000013988	205 (aa)	-	G3THF3
ENSLAFT00000026610	RAB1A-202	615	-	ENSLAFP00000027082	205 (aa)	XP_003413689	G3UGX4

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000016666	RAB1A	77	40.373	ENSLAFG00000013385	RAB34	62	40.373
ENSLAFG00000016666	RAB1A	76	39.623	ENSLAFG00000000166	RAB9B	79	39.623
ENSLAFG00000016666	RAB1A	80	50.909	ENSLAFG00000023194	RAB15	78	50.909
ENSLAFG00000016666	RAB1A	86	43.820	ENSLAFG00000030959	RAB39B	84	43.820
ENSLAFG00000016666	RAB1A	95	38.579	ENSLAFG00000003688	RAB22A	97	38.579
ENSLAFG00000016666	RAB1A	81	36.095	ENSLAFG00000010809	MRAS	85	34.637
ENSLAFG00000016666	RAB1A	82	32.544	ENSLAFG00000000691	RHEB	91	32.544
ENSLAFG00000016666	RAB1A	57	33.884	ENSLAFG00000020731	-	61	33.884
ENSLAFG00000016666	RAB1A	81	50.602	ENSLAFG00000010711	RAB30	82	50.602
ENSLAFG00000016666	RAB1A	57	31.092	ENSLAFG00000028097	ARL4C	61	31.092
ENSLAFG00000016666	RAB1A	75	39.216	ENSLAFG00000000202	-	87	39.216
ENSLAFG00000016666	RAB1A	96	46.829	ENSLAFG00000011418	RAB11A	95	46.829
ENSLAFG00000016666	RAB1A	88	46.703	ENSLAFG00000015582	RAB18	93	45.361
ENSLAFG00000016666	RAB1A	80	47.619	ENSLAFG00000008832	RAB33A	71	47.619
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	93.069	ENSLAFG00000021408	RAB1B	100	93.069
ENSLAFG00000016666	RAB1A	58	31.667	ENSLAFG00000007764	ARL8B	62	31.667
ENSLAFG00000016666	RAB1A	79	40.373	ENSLAFG00000009905	RAB6B	85	40.373
ENSLAFG00000016666	RAB1A	78	39.264	ENSLAFG00000007945	RAB7A	79	39.264
ENSLAFG00000016666	RAB1A	66	38.298	ENSLAFG00000016780	-	97	38.298
ENSLAFG00000016666	RAB1A	87	33.514	ENSLAFG00000001217	RERG	90	33.514
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	45.581	ENSLAFG00000013598	RAB11B	99	45.581
ENSLAFG00000016666	RAB1A	62	33.077	ENSLAFG00000002606	ARL4D	64	33.077
ENSLAFG00000016666	RAB1A	76	39.623	ENSLAFG00000022900	RAB9A	78	39.623
ENSLAFG00000016666	RAB1A	90	48.108	ENSLAFG00000015567	RAB2A	99	45.714
ENSLAFG00000016666	RAB1A	57	31.933	ENSLAFG00000022094	ARL4A	59	31.933
ENSLAFG00000016666	RAB1A	76	37.500	ENSLAFG00000028984	-	78	37.500
ENSLAFG00000016666	RAB1A	80	38.415	ENSLAFG00000020706	NRAS	86	38.415
ENSLAFG00000016666	RAB1A	57	34.746	ENSLAFG00000015043	ARL8A	61	34.746
ENSLAFG00000016666	RAB1A	59	42.975	ENSLAFG00000009693	RAB36	79	33.488
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	44.554	ENSLAFG00000005250	RAB14	93	44.554
ENSLAFG00000016666	RAB1A	95	42.929	ENSLAFG00000018009	RAB5B	85	42.929
ENSLAFG00000016666	RAB1A	57	32.773	ENSLAFG00000010461	ARL14	59	32.773
ENSLAFG00000016666	RAB1A	95	43.367	ENSLAFG00000008321	RAB5A	90	43.367
ENSLAFG00000016666	RAB1A	83	43.182	ENSLAFG00000022351	RAB33B	77	43.182
ENSLAFG00000016666	RAB1A	84	32.948	ENSLAFG00000007209	RAB23	73	32.948
ENSLAFG00000016666	RAB1A	81	46.386	ENSLAFG00000009222	RAB25	78	46.386
ENSLAFG00000016666	RAB1A	80	37.805	ENSLAFG00000029239	KRAS	95	35.912

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSG00000138069	RAB1A	100	100.000	Homo_sapiens
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	95.545	ENSAPOG00000008143	-	100	95.545	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSAMEG00000001127	RAB1A	100	100.000	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	95.545	ENSAOCG00000020606	-	100	95.545	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	95.545	ENSAPEG00000022488	-	100	95.545	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSANAG00000020929	RAB1A	100	100.000	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	96.040	ENSACLG00000003326	-	100	96.040	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	94.554	ENSAMXG00000034850	-	100	94.554	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSBTAG00000016720	RAB1A	100	100.000	Bos_taurus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSCJAG00000046275	RAB1A	100	100.000	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00000003187	RAB1A	100	100.000	Canis_familiaris
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSCAFG00020026971	RAB1A	100	100.000	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	97.073	ENSCHIG00000014060	RAB1A	97	99.497	Capra_hircus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	98.049	ENSTSYG00000005996	RAB1A	100	100.000	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSCPOG00000015437	RAB1A	100	100.000	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSCCAG00000021869	RAB1A	100	100.000	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSCATG00000030853	RAB1A	100	100.000	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSCLAG00000014766	RAB1A	100	100.000	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	99.512	ENSCPBG00000013243	RAB1A	100	99.512	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	97.561	ENSCANG00000035916	RAB1A	100	97.561	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00001012691	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSCGRG00000008456	-	100	100.000	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSDNOG00000018236	RAB1A	100	100.000	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSDORG00000028628	-	100	100.000	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	84.466	FBgn0285937	Rab1	100	84.466	Drosophila_melanogaster
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	100.000	ENSETEG00000002205	RAB1A	100	100.000	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSEASG00005007298	RAB1A	100	100.000	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSECAG00000009926	RAB1A	100	100.000	Equus_caballus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	100.000	ENSEEUG00000011721	RAB1A	100	100.000	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	95.588	ENSELUG00000012166	RAB1A	96	95.588	Esox_lucius
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSFCAG00000002536	RAB1A	100	100.000	Felis_catus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	97.537	ENSFALG00000013624	RAB1A	99	97.537	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSFDAG00000019505	-	100	100.000	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	94.554	ENSFHEG00000014414	-	100	94.554	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	99.512	ENSGALG00000031582	RAB1A	100	99.512	Gallus_gallus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	94.554	ENSGAFG00000000918	-	100	94.554	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	99.512	ENSGAGG00000006802	RAB1A	100	99.512	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSGGOG00000026603	RAB1A	100	100.000	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSHGLG00000013585	RAB1A	100	100.000	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	97.549	ENSHGLG00100007994	RAB1A	97	100.000	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSSTOG00000020693	-	100	100.000	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	96	100.000	ENSJJAG00000014396	Rab1a	100	100.000	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	96	95.431	ENSKMAG00000014038	-	93	95.431	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	95.050	ENSLBEG00000028426	RAB1A	100	95.050	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	98.537	ENSLACG00000012869	RAB1A	100	98.537	Latimeria_chalumnae
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSMFAG00000046246	RAB1A	100	100.000	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	96.585	ENSMMUG00000021721	RAB1A	95	96.585	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000016666	RAB1A	95	99.485	ENSMNEG00000028414	-	97	99.485	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSMLEG00000042535	RAB1A	100	100.000	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	96.040	ENSMZEG00005013959	-	100	96.040	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000016666	RAB1A	96	99.492	ENSMGAG00000004611	RAB1A	98	99.492	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	99.512	ENSMAUG00000012156	Rab1a	100	99.512	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSMICG00000012587	RAB1A	100	100.000	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	99.512	ENSMOCG00000017022	Rab1a	100	99.512	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	93.564	ENSMMOG00000018709	RAB1A	100	93.564	Mola_mola
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	99.512	ENSMODG00000003340	RAB1A	100	99.512	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	MGP_CAROLIEiJ_G0016115	Rab1a	100	100.000	Mus_caroli
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSMUSG00000020149	Rab1a	100	100.000	Mus_musculus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	MGP_PahariEiJ_G0016776	Rab1a	100	100.000	Mus_pahari
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	MGP_SPRETEiJ_G0016958	Rab1a	100	100.000	Mus_spretus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSMPUG00000006139	RAB1A	82	100.000	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSMLUG00000009489	RAB1A	100	100.000	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSNGAG00000005838	Rab1a	100	100.000	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	96.040	ENSNBRG00000020492	-	100	96.040	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000016666	RAB1A	96	100.000	ENSOPRG00000006595	RAB1A	100	100.000	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000016666	RAB1A	94	100.000	ENSODEG00000011248	-	96	100.000	Octodon_degus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	93.627	ENSONIG00000006819	-	100	93.627	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	99.512	ENSOANG00000012438	RAB1A	100	99.512	Ornithorhynchus_anatinus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSOCUG00000017003	RAB1A	100	100.000	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSOGAG00000026181	RAB1A	100	100.000	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	98.030	ENSOARG00000019997	RAB1A	100	98.030	Ovis_aries
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	100.000	ENSPPAG00000030253	RAB1A	100	100.000	Pan_paniscus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSPPRG00000025077	RAB1A	100	100.000	Panthera_pardus
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	97.059	ENSPTIG00000013471	RAB1A	100	97.059	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSPTRG00000011989	RAB1A	100	100.000	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000016666	RAB1A	100	100.000	ENSPANG00000010485	RAB1A	100	100.000	Papio_anubis
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	96.552	ENSPSIG00000008028	RAB1A	99	96.552	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000016666	RAB1A	99	95.588	ENSPMGG00000021015	-	99	95.588	Periophthalmus_magnuspinnatus
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