EuRBPDB

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PPI

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Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000021352 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: CELF4
Alias: BRUNOL4
Full Name: CUGBP Elav-like family member 4
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 334982 bases
Position: chrscaffold_4:62911932-63246913
Accession: 100668325
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000017554	RRM_1	PF00076.22	5.3e-54	1	3
ENSLAFP00000017554	RRM_1	PF00076.22	5.3e-54	2	3
ENSLAFP00000017554	RRM_1	PF00076.22	5.3e-54	3	3
ENSLAFP00000019479	RRM_1	PF00076.22	9.9e-37	1	2
ENSLAFP00000019479	RRM_1	PF00076.22	9.9e-37	2	2

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000029839	CELF4-202	1011	-	ENSLAFP00000019479	336 (aa)	-	G3TV71
ENSLAFT00000022162	CELF4-201	1512	XM_023543850	ENSLAFP00000017554	504 (aa)	XP_023399618	G3TPY8

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Paralogs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Paralog	Gene Symbol	Coverage	Identiy
ENSLAFG00000021352	CELF4	87	54.730	ENSLAFG00000026387	CELF5	100	49.639
ENSLAFG00000021352	CELF4	91	35.802	ENSLAFG00000001087	ELAVL4	98	39.506
ENSLAFG00000021352	CELF4	80	65.079	ENSLAFG00000003484	CELF1	96	45.010
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	64.507	ENSLAFG00000020985	-	100	64.069
ENSLAFG00000021352	CELF4	67	41.026	ENSLAFG00000005013	ELAVL3	70	40.741
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	45.312	ENSLAFG00000013612	CELF2	93	45.580
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	35.227	ENSLAFG00000004219	ELAVL1	95	44.444
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	62.228	ENSLAFG00000030147	CELF3	100	64.854
ENSLAFG00000021352	CELF4	60	34.177	ENSLAFG00000003463	TIA1	81	34.177
ENSLAFG00000021352	CELF4	63	30.682	ENSLAFG00000003412	TIAL1	62	32.911
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	37.037	ENSLAFG00000009938	ELAVL2	81	40.741

Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.248	ENSG00000101489	CELF4	100	98.895	Homo_sapiens
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.298	ENSAPOG00000002964	celf4	100	78.004	Acanthochromis_polyacanthus
ENSLAFG00000021352	CELF4	88	97.092	ENSAMEG00000017059	CELF4	100	97.092	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	72.817	ENSACIG00000018097	celf4	100	72.619	Amphilophus_citrinellus
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.298	ENSAOCG00000020590	celf4	100	78.004	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000021352	CELF4	69	67.949	ENSAOCG00000019919	-	80	66.176	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	75.692	ENSAPEG00000002940	celf4	99	75.692	Amphiprion_percula
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	75.595	ENSATEG00000023731	celf4	100	75.595	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	75.819	ENSAPLG00000007830	-	100	81.360	Anas_platyrhynchos
ENSLAFG00000021352	CELF4	65	88.703	ENSACAG00000012428	CELF4	95	98.319	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.059	ENSANAG00000029499	CELF4	100	95.059	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	84.524	ENSACLG00000011828	celf4	100	83.730	Astatotilapia_calliptera
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.815	ENSAMXG00000007935	celf4	100	78.519	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	93.069	ENSBTAG00000004940	CELF4	99	100.000	Bos_taurus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.446	ENSCJAG00000021135	CELF4	100	95.446	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	93.069	ENSCHIG00000007169	CELF4	99	100.000	Capra_hircus
ENSLAFG00000021352	CELF4	93	93.734	ENSTSYG00000000816	CELF4	85	93.734	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	94.444	ENSCPOG00000035956	CELF4	100	94.444	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.059	ENSCCAG00000028373	CELF4	100	95.059	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.446	ENSCATG00000045293	CELF4	100	95.446	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.405	ENSCLAG00000008344	CELF4	100	99.405	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	93.820	ENSCSAG00000017933	CELF4	99	99.153	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	87.115	ENSCPBG00000005237	CELF4	93	92.997	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.059	ENSCANG00000036735	CELF4	100	95.059	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000021352	CELF4	88	91.772	ENSCGRG00001018085	Celf4	89	89.091	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.298	ENSCSEG00000007074	celf4	99	92.857	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	76.087	ENSCVAG00000017617	celf4	100	76.087	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.044	ENSDARG00000070045	celf4	100	79.475	Danio_rerio
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	93.557	ENSDNOG00000032492	CELF4	97	98.056	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.405	ENSDORG00000007169	Celf4	100	99.405	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000021352	CELF4	79	97.987	ENSETEG00000007432	-	63	97.987	Echinops_telfairi
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	93.267	ENSEASG00005016534	CELF4	100	93.267	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.446	ENSECAG00000008810	CELF4	100	95.446	Equus_caballus
ENSLAFG00000021352	CELF4	88	77.928	ENSEEUG00000003763	CELF4	100	78.829	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	93.267	ENSFCAG00000045234	CELF4	100	93.267	Felis_catus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	92.978	ENSFALG00000009188	CELF4	99	97.759	Ficedula_albicollis
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	93.849	ENSFDAG00000010287	CELF4	100	93.849	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	72.709	ENSFHEG00000003431	celf4	99	73.506	Fundulus_heteroclitus
ENSLAFG00000021352	CELF4	81	92.683	ENSGMOG00000011747	-	75	92.683	Gadus_morhua
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	70.229	ENSGMOG00000008703	celf4	100	64.364	Gadus_morhua
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.815	ENSGAFG00000021515	celf4	99	73.913	Gambusia_affinis
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	72.519	ENSGACG00000008752	celf4	100	72.778	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000021352	CELF4	87	84.665	ENSGAGG00000023014	-	98	92.013	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	67.816	ENSGAGG00000017672	-	99	63.004	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.059	ENSGGOG00000013920	CELF4	100	95.059	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	84.551	ENSHBUG00000021618	celf4	100	83.730	Haplochromis_burtoni
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.437	ENSHGLG00000003130	CELF4	100	95.437	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	98.810	ENSHGLG00100006394	CELF4	100	98.810	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	74.853	ENSHCOG00000012195	celf4	100	74.656	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	78.338	ENSIPUG00000010810	celf4	97	75.102	Ictalurus_punctatus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	98.611	ENSJJAG00000016892	Celf4	100	98.611	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.259	ENSKMAG00000019602	celf4	100	77.514	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	75.639	ENSLBEG00000000940	celf4	100	75.639	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	71.608	ENSLOCG00000004792	celf4	80	95.495	Lepisosteus_oculatus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.059	ENSMFAG00000042983	CELF4	100	95.059	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.248	ENSMMUG00000006866	CELF4	100	95.248	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	93.267	ENSMNEG00000033449	CELF4	100	93.267	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000021352	CELF4	92	91.145	ENSMLEG00000028543	CELF4	99	91.145	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	75.197	ENSMAMG00000018573	celf4	99	75.197	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	73.031	ENSMZEG00005026879	celf4	100	72.835	Maylandia_zebra
ENSLAFG00000021352	CELF4	88	71.069	ENSMGAG00000017029	CELF4	100	70.755	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.248	ENSMICG00000006984	CELF4	100	95.248	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.206	ENSMOCG00000011985	Celf4	100	99.206	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	75.397	ENSMMOG00000012281	celf4	100	75.397	Mola_mola
ENSLAFG00000021352	CELF4	82	89.153	ENSMODG00000000306	CELF4	91	88.439	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	84.524	ENSMALG00000001696	celf4	100	83.730	Monopterus_albus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.405	MGP_CAROLIEiJ_G0022058	Celf4	100	99.405	Mus_caroli
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.405	ENSMUSG00000024268	Celf4	100	99.405	Mus_musculus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.405	MGP_PahariEiJ_G0018792	Celf4	100	99.405	Mus_pahari
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.405	MGP_SPRETEiJ_G0022969	Celf4	100	99.405	Mus_spretus
ENSLAFG00000021352	CELF4	93	82.464	ENSMPUG00000001027	CELF4	100	82.464	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	90.169	ENSMLUG00000001755	CELF4	100	94.226	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.405	ENSNGAG00000000761	Celf4	100	99.405	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	73.031	ENSNBRG00000018194	celf4	100	72.835	Neolamprologus_brichardi
ENSLAFG00000021352	CELF4	81	87.500	ENSMEUG00000007202	-	100	87.644	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000021352	CELF4	82	98.795	ENSOPRG00000014415	CELF4	100	80.830	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.603	ENSODEG00000018464	CELF4	100	99.603	Octodon_degus
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	81.176	ENSONIG00000019463	celf4	100	80.980	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000021352	CELF4	88	96.622	ENSOCUG00000024790	CELF4	81	96.622	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.113	ENSORLG00000008913	celf4	100	77.819	Oryzias_latipes
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.113	ENSORLG00020008454	celf4	100	77.819	Oryzias_latipes_hni
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	83.680	ENSORLG00015004115	celf4	100	78.770	Oryzias_latipes_hsok
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	79.113	ENSOMEG00000002391	celf4	100	77.819	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	80.451	ENSOGAG00000010018	CELF4	100	88.000	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000021352	CELF4	87	90.127	ENSOARG00000005276	CELF4	100	97.764	Ovis_aries
ENSLAFG00000021352	CELF4	92	94.816	ENSPPAG00000020644	CELF4	99	94.816	Pan_paniscus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.059	ENSPPRG00000007683	CELF4	100	95.059	Panthera_pardus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.059	ENSPTRG00000009982	CELF4	100	95.059	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.059	ENSPANG00000006365	CELF4	100	95.059	Papio_anubis
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	74.903	ENSPKIG00000017421	celf4	100	74.903	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	92.978	ENSPSIG00000015538	CELF4	99	97.759	Pelodiscus_sinensis
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	99.405	ENSPEMG00000019299	Celf4	100	99.405	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000021352	CELF4	72	83.379	ENSPLAG00000012151	celf4	89	83.379	Poecilia_latipinna
ENSLAFG00000021352	CELF4	84	92.857	ENSPMEG00000015313	celf4	97	92.857	Poecilia_mexicana
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	85.060	ENSPREG00000021231	celf4	100	84.263	Poecilia_reticulata
ENSLAFG00000021352	CELF4	85	98.870	ENSPCAG00000000126	CELF4	83	98.870	Procavia_capensis
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	95.059	ENSPVAG00000009204	CELF4	100	95.059	Pteropus_vampyrus
ENSLAFG00000021352	CELF4	100	73.031	ENSPNYG00000004131	celf4	100	72.835	Pundamilia_nyererei
ENSLAFG00000021352	CELF4	99	85.429	ENSPNAG00000006426	celf4	100	84.631	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000021352	CELF4	98	84.571	ENSRNOG00000014503	Celf4	100	91.977	Rattus_norvegicus
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