EuRBPDB

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PPI

Orthologs

Description

Ensembl ID: ENSLAFG00000028155 (Gene tree)
Gene ID: -
Gene Symbol: NELFE
Alias: D6S45|NELF-E|RD|RDBP|RDP
Full Name: negative elongation factor complex member E
Gene Type: protein_coding
Species: Loxodonta_africana
Status: putative
Strand: Plus strand
Length: 6026 bases
Position: chrscaffold_138:1167549-1173574
Accession: 13974
RBP type: canonical RBP
Summary: -

RNA binding domains(RBDs)

Protein ID	Domain	Pfam ID	E-value	Domain number	Total number
ENSLAFP00000020878	RRM_1	PF00076.22	1.6e-11	1	1
ENSLAFP00000021481	RRM_1	PF00076.22	2.3e-11	1	1

Transcripts

Transcript ID	Name	Length	RefSeq ID	Protein ID	Length	RefSeq ID	UniportKB ID
ENSLAFT00000027833	NELFE-201	1146	-	ENSLAFP00000021481	382 (aa)	-	G3U0X3
ENSLAFT00000029333	NELFE-202	972	-	ENSLAFP00000020878	324 (aa)	-	G3TZ70

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Protein-Protein Interaction (PPI)

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Orthologs

Ensembl ID	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Ortholog	Gene Symbol	Coverage	Identiy	Species
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	96.073	ENSG00000204356	NELFE	100	97.484	Homo_sapiens
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	96.615	ENSAMEG00000002062	NELFE	99	96.615	Ailuropoda_melanoleuca
ENSLAFG00000028155	NELFE	84	75.862	ENSAOCG00000017263	nelfe	99	68.378	Amphiprion_ocellaris
ENSLAFG00000028155	NELFE	81	76.642	ENSATEG00000007587	nelfe	90	67.742	Anabas_testudineus
ENSLAFG00000028155	NELFE	52	72.414	ENSACAG00000011678	NELFE	100	69.149	Anolis_carolinensis
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	97.120	ENSANAG00000038256	NELFE	100	97.105	Aotus_nancymaae
ENSLAFG00000028155	NELFE	84	76.552	ENSAMXG00000011495	nelfe	99	67.209	Astyanax_mexicanus
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	96.316	ENSBTAG00000007453	NELFE	100	95.000	Bos_taurus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	97.644	ENSCJAG00000002368	-	99	97.644	Callithrix_jacchus
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	96.053	ENSCAFG00020000938	NELFE	100	96.053	Canis_lupus_dingo
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	94.737	ENSCHIG00000013713	NELFE	100	94.474	Capra_hircus
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	98.438	ENSTSYG00000012132	-	100	94.615	Carlito_syrichta
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	91.644	ENSCAPG00000015145	NELFE	91	94.236	Cavia_aperea
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	93.979	ENSCPOG00000031829	NELFE	100	94.503	Cavia_porcellus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	96.114	ENSCCAG00000014945	NELFE	100	96.094	Cebus_capucinus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	94.330	ENSCATG00000028969	NELFE	100	95.337	Cercocebus_atys
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	94.211	ENSCLAG00000009684	NELFE	100	94.211	Chinchilla_lanigera
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	95.000	ENSCSAG00000008969	NELFE	100	95.000	Chlorocebus_sabaeus
ENSLAFG00000028155	NELFE	88	66.212	ENSCPBG00000000225	NELFE	97	66.667	Chrysemys_picta_bellii
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	30.595	ENSCING00000005779	-	77	31.469	Ciona_intestinalis
ENSLAFG00000028155	NELFE	86	31.560	ENSCSAVG00000004231	-	86	30.851	Ciona_savignyi
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	100.000	ENSCANG00000022451	NELFE	100	95.000	Colobus_angolensis_palliatus
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	92.042	ENSCGRG00001016608	Nelfe	100	92.042	Cricetulus_griseus_chok1gshd
ENSLAFG00000028155	NELFE	91	91.218	ENSCGRG00000014034	Nelfe	92	91.228	Cricetulus_griseus_crigri
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	64.865	ENSCSEG00000011352	nelfe	99	62.537	Cynoglossus_semilaevis
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	63.307	ENSCVAG00000003087	nelfe	99	62.644	Cyprinodon_variegatus
ENSLAFG00000028155	NELFE	93	82.254	ENSDNOG00000006996	-	97	82.609	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	96.597	ENSDNOG00000041886	-	100	96.597	Dasypus_novemcinctus
ENSLAFG00000028155	NELFE	98	99.174	ENSDORG00000011705	Nelfe	98	73.766	Dipodomys_ordii
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	52.000	ENSEBUG00000017070	nelfe	99	60.656	Eptatretus_burgeri
ENSLAFG00000028155	NELFE	96	97.814	ENSEASG00005015538	NELFE	100	93.384	Equus_asinus_asinus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	96.354	ENSECAG00000012274	NELFE	87	96.354	Equus_caballus
ENSLAFG00000028155	NELFE	82	97.531	ENSEEUG00000005004	NELFE	75	97.778	Erinaceus_europaeus
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	55.276	ENSELUG00000005830	nelfe	99	58.708	Esox_lucius
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	97.105	ENSFCAG00000004518	NELFE	100	97.105	Felis_catus
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	89.218	ENSFDAG00000011589	NELFE	100	86.253	Fukomys_damarensis
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	57.326	ENSGMOG00000005973	nelfe	99	59.664	Gadus_morhua
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	70.958	ENSGALG00000045676	NELFE	97	76.378	Gallus_gallus
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	61.877	ENSGACG00000002935	nelfe	99	67.297	Gasterosteus_aculeatus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	71.733	ENSGAGG00000005411	NELFE	99	70.958	Gopherus_agassizii
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	95.288	ENSGGOG00000002265	NELFE	100	95.263	Gorilla_gorilla
ENSLAFG00000028155	NELFE	72	86.861	ENSHGLG00000016601	NELFE	92	86.282	Heterocephalus_glaber_female
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	72.423	ENSHGLG00100014073	NELFE	97	73.538	Heterocephalus_glaber_male
ENSLAFG00000028155	NELFE	87	74.483	ENSHCOG00000007147	nelfe	97	64.785	Hippocampus_comes
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	94.211	ENSSTOG00000027409	NELFE	100	92.368	Ictidomys_tridecemlineatus
ENSLAFG00000028155	NELFE	93	89.607	ENSJJAG00000014005	Nelfe	93	89.275	Jaculus_jaculus
ENSLAFG00000028155	NELFE	82	77.241	ENSKMAG00000002391	nelfe	73	77.241	Kryptolebias_marmoratus
ENSLAFG00000028155	NELFE	81	75.912	ENSLBEG00000013181	nelfe	100	66.845	Labrus_bergylta
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	96.316	ENSMFAG00000036108	-	100	96.316	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	73.087	ENSMFAG00000031089	-	98	68.732	Macaca_fascicularis
ENSLAFG00000028155	NELFE	98	74.474	ENSMMUG00000041521	-	100	75.375	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	96.316	ENSMMUG00000000735	-	100	96.316	Macaca_mulatta
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	95.596	ENSMNEG00000032542	NELFE	100	95.833	Macaca_nemestrina
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	94.588	ENSMLEG00000030245	NELFE	100	94.737	Mandrillus_leucophaeus
ENSLAFG00000028155	NELFE	88	75.591	ENSMAMG00000003031	nelfe	93	66.146	Mastacembelus_armatus
ENSLAFG00000028155	NELFE	85	58.457	ENSMGAG00000001297	NELFE	74	75.200	Meleagris_gallopavo
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	89.488	ENSMAUG00000016812	Nelfe	100	86.523	Mesocricetus_auratus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	92.932	ENSMICG00000003287	NELFE	100	92.895	Microcebus_murinus
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	93.531	ENSMOCG00000003723	Nelfe	100	93.531	Microtus_ochrogaster
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	60.580	ENSMMOG00000014544	nelfe	99	62.248	Mola_mola
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	88.580	ENSMODG00000015063	NELFE	96	95.429	Monodelphis_domestica
ENSLAFG00000028155	NELFE	93	99.219	MGP_CAROLIEiJ_G0021478	Nelfe	100	92.225	Mus_caroli
ENSLAFG00000028155	NELFE	93	99.219	ENSMUSG00000024369	Nelfe	100	91.644	Mus_musculus
ENSLAFG00000028155	NELFE	93	99.219	MGP_PahariEiJ_G0020473	Nelfe	100	91.914	Mus_pahari
ENSLAFG00000028155	NELFE	93	99.219	MGP_SPRETEiJ_G0022383	Nelfe	100	92.225	Mus_spretus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	96.094	ENSMPUG00000010581	NELFE	99	96.094	Mustela_putorius_furo
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	80.311	ENSMLUG00000028069	-	99	80.570	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000028155	NELFE	94	92.248	ENSMLUG00000028182	-	99	80.779	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000028155	NELFE	98	71.958	ENSMLUG00000028808	-	100	74.339	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	94.531	ENSMLUG00000030380	-	99	81.365	Myotis_lucifugus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	88.385	ENSNGAG00000016248	Nelfe	100	91.375	Nannospalax_galili
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	81.959	ENSNLEG00000006449	NELFE	96	72.654	Nomascus_leucogenys
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	81.510	ENSMEUG00000006053	NELFE	100	81.771	Notamacropus_eugenii
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	98.438	ENSOPRG00000003942	NELFE	100	93.005	Ochotona_princeps
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	95.687	ENSODEG00000017670	NELFE	100	95.687	Octodon_degus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	63.554	ENSONIG00000013513	nelfe	98	63.855	Oreochromis_niloticus
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	99.219	ENSOCUG00000007012	NELFE	100	95.361	Oryctolagus_cuniculus
ENSLAFG00000028155	NELFE	69	74.016	ENSOMEG00000008581	nelfe	99	53.561	Oryzias_melastigma
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	95.288	ENSOGAG00000009574	NELFE	99	95.288	Otolemur_garnettii
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	95.288	ENSOARG00000002616	NELFE	99	94.241	Ovis_aries
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	95.833	ENSPPAG00000039942	NELFE	100	95.812	Pan_paniscus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	96.597	ENSPPRG00000004421	NELFE	100	96.579	Panthera_pardus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	96.597	ENSPTIG00000003753	NELFE	100	96.579	Panthera_tigris_altaica
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	95.312	ENSPTRG00000017996	NELFE	100	95.550	Pan_troglodytes
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	94.588	ENSPANG00000019366	NELFE	100	94.737	Papio_anubis
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	64.341	ENSPKIG00000012048	nelfe	99	62.974	Paramormyrops_kingsleyae
ENSLAFG00000028155	NELFE	94	98.438	ENSPEMG00000015423	Nelfe	100	90.933	Peromyscus_maniculatus_bairdii
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	93.846	ENSPCIG00000018791	NELFE	100	88.832	Phascolarctos_cinereus
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	96.335	ENSPPYG00000016471	NELFE	100	96.335	Pongo_abelii
ENSLAFG00000028155	NELFE	68	93.798	ENSPCAG00000004108	NELFE	68	93.411	Procavia_capensis
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	95.812	ENSPCOG00000024944	NELFE	100	95.000	Propithecus_coquereli
ENSLAFG00000028155	NELFE	84	76.552	ENSPNAG00000011802	nelfe	99	68.548	Pygocentrus_nattereri
ENSLAFG00000028155	NELFE	94	98.450	ENSRNOG00000000420	Nelfe	100	91.375	Rattus_norvegicus
ENSLAFG00000028155	NELFE	98	77.394	ENSRBIG00000028905	-	98	76.276	Rhinopithecus_bieti
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	100.000	ENSRBIG00000028593	-	100	94.359	Rhinopithecus_bieti
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	100.000	ENSRROG00000041993	NELFE	100	95.026	Rhinopithecus_roxellana
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	97.382	ENSSBOG00000035865	NELFE	99	97.382	Saimiri_boliviensis_boliviensis
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	89.175	ENSSHAG00000008908	NELFE	99	89.175	Sarcophilus_harrisii
ENSLAFG00000028155	NELFE	84	75.862	ENSSFOG00015017039	nelfe	99	67.297	Scleropages_formosus
ENSLAFG00000028155	NELFE	84	78.621	ENSSMAG00000020170	nelfe	100	69.086	Scophthalmus_maximus
ENSLAFG00000028155	NELFE	93	91.268	ENSSARG00000003684	NELFE	97	91.014	Sorex_araneus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	70.030	ENSSPUG00000012971	NELFE	99	70.326	Sphenodon_punctatus
ENSLAFG00000028155	NELFE	97	68.011	ENSSPAG00000012953	nelfe	79	68.817	Stegastes_partitus
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	96.579	ENSSSCG00000001423	NELFE	100	96.579	Sus_scrofa
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	96.859	ENSUAMG00000024338	NELFE	100	96.859	Ursus_americanus
ENSLAFG00000028155	NELFE	99	96.859	ENSUMAG00000012674	NELFE	100	96.859	Ursus_maritimus
ENSLAFG00000028155	NELFE	100	60.440	ENSXETG00000010931	nelfe	96	60.440	Xenopus_tropicalis
ENSLAFG00000028155	NELFE	62	76.786	ENSXCOG00000019513	nelfe	99	59.633	Xiphophorus_couchianus